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当前共找到 37368 篇文献，本页显示第 2401 - 2420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2401 | 2026-02-13 |
Organoids for Cancer Research: Advances and Challenges
2024-09, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400056
PMID:38977414
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综述 | 本文综述了癌症类器官作为三维培养技术在癌症研究中的应用、优势、局限性和前景 | 介绍了四种主要癌症类器官类型，并讨论了单细胞RNA测序在探索癌症类器官中的最新应用 | 讨论了癌症类器官模型的局限性，包括其在模拟复杂肿瘤微环境方面的挑战 | 推动基础癌症研究向临床肿瘤治疗的转化，提高肿瘤药物开发成功率 | 癌症类器官模型 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2402 | 2026-02-13 |
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Triptolide-Induced Nephrotoxicity in Mice
2024-09, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400120
PMID:38864263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面描述了雷公藤甲素诱导小鼠肾毒性的转录组图谱和细胞组成 | 首次在单细胞分辨率下系统解析雷公藤甲素诱导肾毒性的机制，揭示了肾单位上皮细胞的异质性反应、血管功能破坏以及免疫细胞损伤等新发现 | 研究仅基于小鼠模型，未在人体中进行验证；样本量相对有限；机制研究仍需进一步功能实验证实 | 阐明雷公藤甲素诱导肾毒性的分子机制和细胞类型特异性反应 | 小鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 肾毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组和雷公藤甲素处理组小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2403 | 2026-02-13 |
The HSP90-MYC-CDK9 network drives therapeutic resistance in mantle cell lymphoma
2024-Feb-07, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-024-00484-9
PMID:38326887
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了套细胞淋巴瘤中HSP90-MYC-CDK9网络是治疗耐药性的主要驱动力 | 首次在套细胞淋巴瘤中通过单细胞RNA测序分析揭示了从BTKi到CAR-T疗法的序贯耐药机制，并识别出HSP90AB1和CDK9作为早期驱动因子 | 样本量相对较小（25名患者的66个样本），且为观察性研究，需要进一步功能验证和临床试验确认 | 剖析套细胞淋巴瘤对BTKi和CAR-T疗法序贯耐药的潜在机制 | 套细胞淋巴瘤患者样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 25名患者的66个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2404 | 2026-02-13 |
Deep learning in spatial transcriptomics: Learning from the next next-generation sequencing
2023-Mar, Biophysics reviews
IF:2.9Q2
DOI:10.1063/5.0091135
PMID:38505815
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综述 | 本文综述了空间转录组学中深度学习模型的应用，探讨了现有工具、挑战及未来方向 | 深入探讨深度学习在空间转录组学数据分析中的新兴应用，包括对齐、空间重建和空间聚类等前沿模型 | 深度学习模型在空间转录组学分析中仍处于早期阶段，应用范围有限且未充分探索 | 综述空间转录组学数据分析的现有工具，特别关注深度学习方法的进展与潜力 | 空间转录组学数据，包括基因表达谱和组织结构信息 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 多模态数据（包括组织学图像、计数矩阵等） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2405 | 2026-02-13 |
Mouse primordial germ-cell-like cells lack piRNAs
2022-12-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2022.11.004
PMID:36473462
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和RT-qPCR技术，发现体外分化的第6天小鼠原始生殖细胞样细胞缺乏piRNA表达，与体内E13.5或更晚的性原细胞不同 | 首次揭示体外分化的mPGCLCs在特定时间点未激活piRNA通路，挑战了先前关于其作为研究胎儿piRNA通路模型的假设 | 研究仅针对第6天的mPGCLCs，未涵盖更长时间点的分化过程，且未深入探讨piRNA缺失的具体分子机制 | 评估体外分化的小鼠原始生殖细胞样细胞是否具备功能性piRNA通路，以验证其作为研究模型的适用性 | 小鼠原始生殖细胞样细胞（mPGCLCs）及其分化过程中的piRNA通路 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 小RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多个第6天mPGCLC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 小RNA-seq | NA | NA |
| 2406 | 2026-02-13 |
Single-cell transcriptomic analysis of bloodstream Trypanosoma brucei reconstructs cell cycle progression and developmental quorum sensing
2021-09-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25607-2
PMID:34489460
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析布氏锥虫血液阶段从增殖型'细长体'向传播型'粗短体'的发育过程，重构了细胞周期进展和发育群体感应 | 首次通过单细胞转录组学在体外模型中系统解析了布氏锥虫异步发育过程中的转录动态和调控因子，并定位了粗短体细胞周期退出的精确阶段 | 研究基于体外诱导分化模型，可能无法完全模拟宿主体内的自然发育环境 | 解析布氏锥虫血液阶段发育分化的转录调控机制和细胞周期动态 | 布氏锥虫（Trypanosoma brucei） | 单细胞组学 | 寄生虫感染（锥虫病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 8,599个寄生虫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2407 | 2026-02-13 |
Application of single-cell transcriptomics to kinetoplastid research
2021-09, Parasitology
IF:2.1Q2
DOI:10.1017/S003118202100041X
PMID:33678213
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的应用，包括技术选择、样本制备和数据分析挑战 | 首次系统性地总结了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的潜力，并提供了实验设计和数据分析的实用指导 | 主要基于现有文献综述，缺乏原创实验数据，且技术应用仍处于早期阶段 | 探讨单细胞转录组学技术在动质体寄生虫研究中的应用潜力和方法学 | 动质体寄生虫（包括利什曼原虫、锥虫等）及其宿主相互作用 | 单细胞组学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2408 | 2026-02-12 |
Consensus machine learning identifies cell death gene signature for carotid artery stenosis diagnosis
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114397
PMID:41660258
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法，开发了一个基于细胞死亡基因的共识诊断分类器，用于颈动脉狭窄的早期检测 | 首次整合了内部RNA-seq队列与八个公共数据集，结合十种机器学习算法构建了105个模型配置，并识别出IRF1、FYCO1和FDFT1组成的诊断签名，通过单细胞测序和功能实验验证了FYCO1的下调及其在自噬和炎症信号中的作用 | 研究依赖于多个公共数据集，可能存在批次效应或数据异质性，且样本量相对有限（共696个样本），需要进一步在独立队列中验证MLDS的临床适用性 | 开发一种分子工具以改善颈动脉狭窄的早期诊断 | 颈动脉狭窄患者样本及相关分子数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 蛋白质组学分析, RT-qPCR, 单细胞测序, 基因沉默实验 | 逻辑回归, 共识机器学习（结合十种算法） | RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 实验验证数据 | 696个样本（整合一个内部队列和八个公共数据集） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学（未明确指定，但涉及单细胞分析） | NA | NA |
| 2409 | 2026-02-12 |
Pre-operative risk assessment of HCC recurrence in liver transplant recipients by non-invasive detection of pre-existing genetic lesions
2026-Feb-11, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2025.1069
PMID:41668289
|
研究论文 | 本研究通过液体活检开发了一种基于无细胞DNA（cfDNA）拷贝数变异（CNA）特征的术前风险分层模型，用于预测肝细胞癌（HCC）患者肝移植后的复发风险 | 整合了cfDNA CNA特征与单细胞转录组数据，揭示了复发相关的cfDNA来源于肿瘤内特定恶性细胞亚群，并开发了结合传统临床因素和cfDNA CNA特征的ZJU Criteria风险预测工具 | 研究样本量相对有限（260例），且依赖于多中心数据，可能存在异质性 | 开发一种基于液体活检的术前风险分层模型，以预测HCC患者肝移植后的复发风险 | 260例HCC患者，包括临床数据、血浆cfDNA、匹配的肿瘤和非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 低覆盖度全基因组测序、全外显子测序、单核RNA测序、空间转录组学 | 风险分层模型（ZJU Criteria） | 基因组数据、转录组数据、空间数据 | 260例HCC患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全基因组测序, 全外显子测序 | NA | NA |
| 2410 | 2026-02-12 |
Osteoarthritis and chondrosarcoma: Bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing and molecular docking
2026-Feb-11, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/205134
PMID:41669898
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术，分析了骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制，以识别潜在的治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序和分子对接方法，首次在单细胞水平上比较骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群分布和基因表达差异，并探索天然化合物与DAP3蛋白的相互作用 | 研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据集，可能受数据质量和样本来源限制；分子对接结果为计算模拟，需实验验证 | 探究骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制，识别潜在治疗靶点 | 骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群，包括神经元、软骨细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 骨关节炎,软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,分子对接 | t-SNE,UMAP | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2411 | 2026-02-12 |
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-Feb-11, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70036
PMID:41670056
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索了子宫颈腺样基底癌向鳞状细胞癌转化的分子机制 | 首次使用数字空间谱分析技术，在混合肿瘤中识别出区分过渡巢与其他亚型的关键差异表达基因CK13和SCCA2，并揭示了BCL-2在基底样细胞中的表达模式 | 样本量有限，仅对4例病例进行了DSP分析，未来需要更大规模的研究来指导临床决策 | 阐明子宫颈腺样基底癌与鳞状细胞癌之间的转化关系，以指导有效的治疗策略 | 20例子宫颈腺样基底癌病例，其中多数伴有鳞状细胞癌、过渡巢和高级别鳞状上皮内病变 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 空间转录组学，免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据，组织学图像 | 20例ABC病例，其中4例进行了DSP分析 | NA | 空间转录组学 | NA | 数字空间谱分析 |
| 2412 | 2026-02-12 |
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05065-7
PMID:41670688
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性网络，并鉴定出SERPINE1和STK3作为预后生物标志物和治疗靶点 | 首次系统整合了机器学习、空间转录组学、单细胞RNA测序和分子对接模拟，全面解析了BaP诱导的毒性分子网络，并识别出核心毒性靶点 | 研究主要基于公共数据库和计算分析，缺乏体内实验验证；样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 阐明苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性机制，并寻找预后生物标志物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌患者样本及相关分子数据 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 分子对接, 分子动力学模拟 | 随机森林, 支持向量机 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE30784数据集和TCGA-HNSC队列（具体样本数未明确说明） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2413 | 2026-02-12 |
Development and validation of an oxidative phosphorylation based prognostic model revealing tumor progression and immune microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-Feb-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04478-3
PMID:41670771
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于氧化磷酸化的预后模型，用于预测肺腺癌的肿瘤进展和免疫微环境 | 首次构建了基于氧化磷酸化相关基因的预后模型，并揭示了UQCC3⁺和RAB5IF⁺上皮细胞在肿瘤增殖和免疫抑制中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证 | 开发肺腺癌的预后预测模型并探索氧化磷酸化在肿瘤进展中的作用机制 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集作为发现队列，多个GEO数据集作为独立验证队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2414 | 2026-02-12 |
Distinct mural cells and fibroblasts drive fibrochondrogenesis in retrodiscal tissue following temporomandibular joint disc displacement
2026-Feb-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196343
PMID:41665948
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研究论文 | 本研究利用猪模型和单细胞RNA测序技术，揭示了颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞和分子机制，并筛选出潜在治疗化合物 | 首次通过单细胞RNA测序识别了盘后组织重塑中的关键成纤维细胞亚群FB2和壁细胞亚群MC4，并揭示了它们通过FGF2/BMP5信号通路的互作机制 | 研究基于猪模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 探究颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞动力学和分子机制 | 猪颞下颌关节盘前移位模型中的盘后组织 | 单细胞组学 | 颞下颌关节疾病 | 单细胞RNA测序 | P-NET, Seurat | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2415 | 2026-02-12 |
Cellular and transcriptional trajectories of neural fate specification in sea anemone uncover two modes of adult neurogenesis
2026-Feb-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68802-9
PMID:41667466
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研究论文 | 本研究结合报告基因追踪和单细胞转录组学，揭示了海葵中成年神经发生的两种不同细胞谱系和转录轨迹 | 首次在海葵中鉴定出成年神经发生的两种独立机制：多能祖细胞直接分化为肽能神经元，以及刺细胞通过转录独特的中间阶段逐步成熟 | 研究仅限于海葵这一特定物种，其发现是否普遍适用于其他刺胞动物或更广泛的动物类群尚需验证 | 探究刺胞动物成年神经发生的细胞谱系和转录调控机制 | 海葵（Nematostella vectensis）的神经细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2416 | 2026-02-12 |
A single-cell transcriptomic dataset profiling traumatic brain injury and NeuroD1-based gene therapy in mice
2026-Feb-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06788-1
PMID:41667502
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠创伤性脑损伤（TBI）及NeuroD1基因治疗后的分子和细胞机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统比较了TBI小鼠模型中车辆治疗与NeuroD1基因治疗对细胞组成和星形胶质细胞亚型的影响，揭示了治疗如何恢复线粒体和代谢功能并抑制异常突触和髓鞘化过程 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；单细胞RNA测序技术本身存在技术限制，如细胞捕获效率和基因检测深度 | 阐明创伤性脑损伤（TBI）的病理机制及NeuroD1基因治疗的潜在作用机制 | 小鼠创伤性脑损伤模型中的脑组织细胞，特别是星形胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及TBI小鼠模型及治疗组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2417 | 2026-02-12 |
The single-cell transcriptional landscape of the pediatric cystic fibrosis lung from minimally invasive respiratory specimens
2026-Feb-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-36125-w
PMID:41667527
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了儿童囊性纤维化肺部存在以中性粒细胞为主的失调性炎症和促炎性气道上皮细胞状态 | 首次在儿童囊性纤维化患者中，利用微创呼吸道标本进行单细胞转录组分析，揭示了疾病早期的共同病理程序 | 样本量较小（仅包含一名婴儿和一名青少年），且为观察性研究，难以确定因果关系 | 探究儿童囊性纤维化肺部的细胞组成、功能和细胞间通讯的异常变化 | 儿童囊性纤维化患者的呼吸道标本 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2名儿童囊性纤维化患者（一名婴儿和一名青少年） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2418 | 2026-02-12 |
Identifying 3D signal overlaps in spatial transcriptomics data with ovrlpy
2026-Feb-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03004-8
PMID:41667711
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ovrlpy的计算工具，用于识别空间转录组学数据中的三维信号重叠，以解决细胞分割中的空间双重问题 | 开发了ovrlpy工具，首次通过分析三维转录本定位来识别重叠细胞、组织折叠和不准确的细胞分割 | NA | 解决成像空间转录组学中细胞分割在垂直维度上的空间双重问题，提高转录本分配的准确性 | 空间转录组学数据中的三维信号重叠 | 空间转录组学 | NA | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2419 | 2026-02-12 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to identify hub pathways and diagnostic biomarkers in active pulmonary tuberculosis
2026-Feb-10, BMC infectious diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12879-026-12805-w
PMID:41667975
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2420 | 2026-02-12 |
A novel integrative machine learning-based prognostic model reveals lactylation regulation in hepatocellular carcinoma progression
2026-Feb-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04203-8
PMID:41668073
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研究论文 | 本研究构建了一个基于乳酸化相关代谢基因的预后模型，用于预测肝细胞癌的进展和治疗效果 | 开发了一种新的整合机器学习框架，生成代谢相关乳酸化指数，并首次在单细胞和空间转录组水平验证其与肿瘤恶性程度和免疫微环境的关联 | 研究主要基于公共数据集，实验验证样本量有限（40例HCC样本），需要进一步扩大临床队列验证 | 探索乳酸化在肝细胞癌进展中的调控机制，并构建预后预测模型 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞分析, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | 整合机器学习框架 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 四个独立HCC队列（具体数量未明确）, 外加40例HCC验证样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞分析, 空间转录组学 | NA | NA |