单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27986 篇文献，本页显示第 24161 - 24180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24161 | 2024-08-09 |
From Oncogenic Signaling Pathways to Single-Cell Sequencing of Immune Cells: Changing the Landscape of Cancer Immunotherapy
2021-Apr-14, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26082278
PMID:33920054
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综述 | 本文综述了肿瘤发展中的关键信号通路，并探讨了单细胞测序技术在免疫细胞中的应用，以改善癌症免疫治疗 | 结合单细胞测序数据与免疫检查点抑制剂，提高抑制剂的响应率，减少免疫相关不良事件，并促进肿瘤细胞的消除 | 免疫检查点抑制剂在不同癌症患者中的响应率不一，且增加自身免疫疾病的风险 | 旨在回顾肿瘤发展的关键通路，并探讨单细胞测序的应用，以解决免疫检查点抑制剂的不足 | 肿瘤发展中的信号通路及单细胞测序在免疫细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 24162 | 2024-08-09 |
A new era for plant science: spatial single-cell transcriptomics
2021-04, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102041
PMID:33915520
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在植物科学中的最新进展及其应用 | 强调了空间转录组学方法在植物科学中的核心作用 | NA | 探讨如何通过空间转录组学技术全面理解生物体功能 | 植物细胞及其空间关系 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24163 | 2024-08-09 |
An Integrative Single-cell Transcriptomic Atlas of the Post-natal Mouse Mammary Gland Allows Discovery of New Developmental Trajectories in the Luminal Compartment
2021-03, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-021-09488-1
PMID:33913090
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研究论文 | 本文通过整合三个基础报告中的单细胞RNA测序数据，研究了小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性 | 本文通过整合大量单细胞RNA测序数据，提供了对先前检测到的Procr干细胞样亚群的更好分辨率，并识别了一组新的表达免疫样标记的乳腺上皮细胞 | NA | 研究小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性 | 小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 53,686个单细胞 |
| 24164 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas of mouse olfactory bulb chromatin accessibility
2021-02-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.02.007
PMID:33926839
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研究论文 | 本研究利用单细胞转座酶可及染色质测序技术，对小鼠嗅球中的9,549个单细胞的染色质可及性进行了全基因组分析 | 首次对小鼠嗅球的单细胞表观遗传景观进行了详细研究，揭示了不同细胞群特有的潜在调控元件及其功能 | NA | 旨在深入理解嗅球在单细胞水平上的调控机制及其治疗潜力 | 小鼠嗅球的单细胞染色质可及性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 染色质可及性数据 | 9,549个单细胞 |
| 24165 | 2024-08-09 |
Single-Cell Atlas Reveals Fatty Acid Metabolites Regulate the Functional Heterogeneity of Mesenchymal Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.653308
PMID:33912565
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了脂肪酸代谢物在调节间充质干细胞功能异质性中的作用 | 首次发现脂肪酸代谢物通过调节间充质干细胞的谱系承诺和功能异质性，影响其自我更新和分化潜能 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的临床研究验证其治疗潜力 | 探讨代谢物如何调节间充质干细胞的功能异质性 | 骨髓间充质干细胞及其代谢物 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 24166 | 2024-08-09 |
CBA: Cluster-Guided Batch Alignment for Single Cell RNA-seq
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.644211
PMID:33927748
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研究论文 | 本文提出了一种基于聚类的批量对齐方法（CBA），用于单细胞RNA测序数据，通过自动编码器将两个批次的数据嵌入同一空间，并使用特定的损失函数保持细胞间距离，以实现细胞类型的匹配 | CBA方法考虑了细胞类型的身份，通过无监督的方式定义细胞类型为原始批次中的聚类，从而进一步约束了不同批次间的细胞匹配 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题，提高数据整合的准确性和生物学意义 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | 使用了胰腺和鼠细胞图谱数据集 |
| 24167 | 2024-08-09 |
Gene Expression Analysis of T-Cells by Single-Cell RNA-Seq
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1311-5_22
PMID:33928560
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研究论文 | 本文提供了一种优化的单细胞RNA测序技术用于T细胞基因表达分析的实验方案 | 采用滴液数字技术（ddSEQ）进行T细胞的分离和RNA测序文库的制备 | 该技术需要专业设备和专业知识 | 提供一个从样本制备到数据解释的单细胞实验框架 | T细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24168 | 2024-08-09 |
A Partial Picture of the Single-Cell Transcriptomics of Human IgA Nephropathy
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645988
PMID:33936064
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了IgA肾病患者的肾活检样本，揭示了IgA肾病中细胞表达谱的变化 | 首次展示了IgA肾病系膜细胞中多个新基因的高表达，这些基因与细胞增殖和基质积累相关 | 研究结果基于有限数量的细胞和患者样本，需要在未来研究中通过更大规模的细胞和患者样本进行验证 | 旨在揭示IgA肾病的分子机制并识别新的治疗靶点 | IgA肾病患者的肾活检样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 4名IgA肾病患者和3名健康供体的肾组织 |
| 24169 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Immunometabolic Rewiring and Immunopathogenesis of Coronavirus Disease 2019
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.651656
PMID:33936072
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研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，揭示了外周血单个核细胞（PBMCs）中的代谢重编程，以阐明可能导致严重COVID-19进展的代谢机制。 | 研究发现严重COVID-19患者中的单核细胞表达更高水平的糖酵解相关基因和PPP相关基因，可能导致超炎症反应，并且增强的糖酵解或OXPHOS与记忆B细胞向浆母细胞或浆细胞的分化正相关。 | NA | 研究COVID-19中的免疫代谢重编程和免疫病理发生机制。 | COVID-19患者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 24170 | 2024-08-09 |
Comprehensive characterization of tissue-specific chromatin accessibility in L2 Caenorhabditis elegans nematodes
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271791.120
PMID:33888511
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研究论文 | 本文利用sci-ATAC-seq技术在L2阶段的秀丽隐杆线虫中收集单细胞染色质可及性数据，通过改进的潜在狄利克雷分配算法识别了37个细胞簇，对应于线虫的不同细胞类型，提供了新的细胞类型特异性基因调控位点图谱 | 本文采用sci-ATAC-seq技术和改进的潜在狄利克雷分配算法，首次在单细胞分辨率下探索了秀丽隐杆线虫L2阶段个体细胞类型的调控DNA | NA | 探索秀丽隐杆线虫L2阶段个体细胞类型的调控DNA | 秀丽隐杆线虫L2阶段的单细胞染色质可及性 | 基因组学 | NA | sci-ATAC-seq | 潜在狄利克雷分配算法 | 染色质可及性数据 | L2阶段的秀丽隐杆线虫 |
| 24171 | 2024-08-09 |
Osteomorphs as a tool for personalized medicine
2021-09, Trends in endocrinology and metabolism: TEM
DOI:10.1016/j.tem.2021.04.004
PMID:33895074
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研究论文 | 本文报道了由分裂导致的骨形态形成细胞（osteomorphs）的动态机制，这些细胞能够形成骨吸收的破骨细胞，并通过单细胞RNA测序分析揭示了它们在转录水平上与破骨细胞和巨噬细胞的区别，可能与人类罕见和常见骨疾病有关。 | 首次报道了骨形态形成细胞的动态机制及其在转录水平上的独特性，并探讨了其在骨疾病中的潜在作用。 | NA | 探讨骨形态形成细胞在个性化医学中的应用潜力。 | 骨形态形成细胞及其在骨疾病中的作用。 | 数字病理学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 24172 | 2024-08-09 |
Reactivation of the Hedgehog pathway in esophageal progenitors turns on an embryonic-like program to initiate columnar metaplasia
2021-08-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.03.019
PMID:33882290
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研究论文 | 本研究通过转基因小鼠模型、谱系追踪、单细胞RNA测序以及转录组和表观遗传学分析，发现Hedgehog通路在食管细胞中的激活改变了其在体内的分化状态，涉及向胚胎样食管祖细胞的去分化过程，并最终导致鳞状上皮向柱状上皮的完全转换。 | 首次证明食管祖细胞可以成为柱状化生的来源，并揭示了Hedgehog通路激活在食管细胞柱状化生中的作用机制。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探究食管细胞柱状化生的机制。 | 食管祖细胞及Hedgehog通路在柱状化生中的作用。 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和表观遗传学数据 | 转基因小鼠模型 |
| 24173 | 2024-08-09 |
How should we define mammary stem cells?
2021-08, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2021.03.012
PMID:33902986
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research paper | 本文重新审视了乳腺干细胞（MaSCs）的定义，强调了实验方法的创新和现有概念的重新评估。 | 采用了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、表观遗传分析、深层组织和活体成像以及先进的鼠模型等创新实验方法，提供了对干细胞和祖细胞的新见解。 | 关于MaSCs是单能性还是双/多能性的争议仍然存在。 | 重新评估乳腺干细胞的层次概念，并提出新的定义和研究方向。 | 乳腺干细胞（MaSCs）及其在细胞层次中的角色和功能。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、表观遗传分析、深层组织和活体成像 | NA | 细胞 | NA |
| 24174 | 2024-08-09 |
Cell population analysis of the adult murine subependymal neurogenic lineage by flow cytometry
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100425
PMID:33899012
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研究论文 | 本研究提供了一种基于流式细胞术的方法，用于分类和分离成年啮齿动物室管膜下区（SEZ）神经发生谱系的所有细胞 | 该方法无需报告鼠，能够分离出具有与单细胞转录组学一致的分子特征的三种神经干细胞（NSC）亚群，并评估其细胞周期行为 | NA | 开发一种新的流式细胞术方法，用于分类和分离成年啮齿动物室管膜下区的神经发生谱系细胞 | 成年啮齿动物室管膜下区的神经干细胞及其亚群 | NA | NA | 流式细胞术 | NA | 细胞 | 成年啮齿动物室管膜下区的神经发生谱系细胞 |
| 24175 | 2024-08-09 |
STARTRAC analyses of scRNAseq data from tumor models reveal T cell dynamics and therapeutic targets
2021-06-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20201329
PMID:33900375
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研究论文 | 本文通过STARTRAC算法分析了来自多个小鼠肿瘤模型的单细胞RNA测序数据，揭示了T细胞的动态变化和治疗靶点 | 首次使用STARTRAC算法结合TCR追踪，分析了小鼠和人类肿瘤中T细胞亚群的对应关系，并发现了CCR8作为肿瘤相关T调节细胞的标记物 | NA | 研究肿瘤模型中的T细胞动态和治疗靶点 | 小鼠肿瘤模型中的T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA-based subclustering | RNA测序数据 | 多个小鼠肿瘤模型 |
| 24176 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in human lung cancer: Applications, challenges, and pathway towards personalized therapy
2021-06-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000000535
PMID:33883467
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类肺癌研究中的各种应用，并探讨了其面临的挑战及未来在个性化癌症治疗中的潜在应用 | 本文填补了关于scRNA-seq在肺癌研究中应用的全面综述的空白 | NA | 总结scRNA-seq在人类肺癌研究中的应用，并探讨其面临的挑战及未来在个性化癌症治疗中的潜在应用 | 人类肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 24177 | 2024-08-09 |
Platypus: an open-access software for integrating lymphocyte single-cell immune repertoires with transcriptomes
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab023
PMID:33884369
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研究论文 | 本文介绍了Platypus软件，该软件是一个开源平台，用于整合淋巴细胞单细胞免疫库与转录组数据，提供用户友好的界面进行分析 | Platypus填补了市场上缺乏专门用于单细胞免疫库分析软件的空白，同时整合了转录组信息 | NA | 开发一个开源软件平台，用于整合和分析单细胞免疫库与转录组数据 | B细胞和T细胞的单细胞免疫库与转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞免疫库与转录组数据 | 来自康复期COVID-19患者的B细胞和T细胞 |
| 24178 | 2024-08-09 |
Mucosal immunity to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection
2021-06-01, Current opinion in infectious diseases
IF:3.6Q2
DOI:10.1097/QCO.0000000000000724
PMID:33899752
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综述 | 本文综述了黏膜免疫在严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染清除中的作用及其潜在的黏膜保护机制 | 强调了黏膜免疫在呼吸道病毒感染中的关键作用，尤其是在病毒复制早期限制和清除中的作用 | 需要进一步研究以理解系统免疫终点如何在疫苗研究中转化为对SARS-CoV-2感染的黏膜保护 | 探讨黏膜免疫在SARS-CoV-2感染中的作用及其保护机制 | 严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的黏膜免疫反应 | NA | 呼吸系统疾病 | RNA测序 | NA | 生物样本 | 涉及COVID-19患者的鼻咽拭子和支气管肺泡灌洗样本 |
| 24179 | 2024-08-09 |
Aging-dependent regulatory cells emerge in subcutaneous fat to inhibit adipogenesis
2021-05-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.03.026
PMID:33878347
|
research paper | 本研究通过比较年轻和老年小鼠皮下脂肪组织中的总基质血管细胞的scRNA-seq数据，发现了一种与年龄相关的调节细胞（ARC），这种细胞仅在老年小鼠和人类的皮下脂肪组织中出现，并能分泌高水平的促炎趋化因子，抑制邻近脂肪前体的增殖和分化。 | 首次鉴定出一种与年龄相关的调节细胞（ARC），并揭示了其在老年小鼠和人类皮下脂肪组织中的出现及其抑制脂肪前体分化的机制。 | NA | 探究与年龄相关的皮下脂肪组织损失的分子机制。 | 年轻和老年小鼠的皮下脂肪组织中的基质血管细胞。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 年轻和老年小鼠的皮下脂肪组织样本 |
| 24180 | 2024-08-09 |
Adaptive cell invasion maintains lateral line organ homeostasis in response to environmental changes
2021-05-03, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.03.027
PMID:33878346
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研究论文 | 本文通过细胞系标记、活体时间流逝成像和单细胞RNA测序技术，发现zebrafish侧线器官中的高度可移动皮肤衍生细胞能够入侵成熟的机械感觉器官并分化为Neuromast相关（Nm）离子细胞，以响应环境变化，维持器官稳态 | 发现了Nm离子细胞，挑战了侧线器官完全由胚胎衍生而来的观点，并提出Nm离子细胞可能是通过调节离子微环境来调控感觉毛细胞功能的潜在调节因子 | NA | 研究环境变化下侧线器官稳态的维持机制 | zebrafish侧线器官中的感觉毛细胞和Nm离子细胞 | NA | NA | 细胞系标记、活体时间流逝成像、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |