单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 24141 - 24160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24141 | 2024-08-09 |
Mixed Distribution Models Based on Single-Cell RNA Sequencing Data
2021-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00427-6
PMID:33754241
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研究论文 | 本文分析了结直肠癌（CRC）的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，构建了混合稳定-正态分布（MSND）模型和混合稳定-指数分布（MSED）模型来拟合基因表达差异（GED）数据，并通过比较均方根误差和卡方拟合优度检验，发现MSED和MSND的拟合效果优于稳定分布和柯西分布 | 提出了混合稳定-正态分布（MSND）模型和混合稳定-指数分布（MSED）模型来拟合基因表达差异数据，并能有效识别与肿瘤高度相关的基因 | NA | 研究基因表达差异数据的分布规律，并识别与肿瘤高度相关的基因 | 结直肠癌（CRC）的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 混合稳定-正态分布（MSND）模型和混合稳定-指数分布（MSED）模型 | 基因表达差异数据 | NA |
| 24142 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing: A new opportunity for retinal research
2021-09, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
DOI:10.1002/wrna.1652
PMID:33754496
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在视网膜研究中的应用 | scRNA-seq技术能够深入分析多种视网膜细胞类型的基因表达特征，揭示细胞异质性 | NA | 研究视网膜细胞异质性，以更好地理解视网膜疾病 | 视网膜细胞及其在疾病和发育中的作用 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 24143 | 2024-08-09 |
Exploring the human lacrimal gland using organoids and single-cell sequencing
2021-07-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.02.024
PMID:33730555
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研究论文 | 本文描述了使用3D器官培养条件和单细胞测序技术探索人类泪腺的研究 | 建立了长期3D器官培养条件，并使用CRISPR-Cas9介导的基因编辑揭示了泪腺细胞分化的主要调控因子 | NA | 研究泪腺的（病）生理学 | 人类和鼠类的泪腺 | NA | NA | 单细胞测序 | CRISPR-Cas9 | 器官 | NA |
| 24144 | 2024-08-09 |
Advances and Opportunities in Single-Cell Transcriptomics for Plant Research
2021-06-17, Annual review of plant biology
IF:21.3Q1
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综述 | 本文综述了近年来植物单细胞转录组学的主要进展，并提供了一个从样本准备到数据分析的全面指南 | 介绍了单细胞转录组学在植物生物学领域的最新技术和应用 | NA | 探讨单细胞转录组学如何影响和加速植物特定研究 | 植物生物学中的单细胞转录组学技术 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24145 | 2024-08-09 |
Mouse multipotent progenitor 5 cells are located at the interphase between hematopoietic stem and progenitor cells
2021-06-10, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020007876
PMID:33754628
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研究论文 | 本研究通过表型定义和功能特征化MPP5细胞，并使用RNA测序分析来全面分析LSK细胞室，重点关注新定义的MPP5亚群的功能和分子特性 | 首次定义和功能特征化MPP5细胞，并展示了其在造血干细胞和多能祖细胞网络中的动态和多功能性 | NA | 研究造血干细胞和多能祖细胞的特性和功能 | MPP5细胞及其在造血干细胞和多能祖细胞网络中的作用 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | LSK细胞 |
| 24146 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Paracrine Functions of the Epicardial-Derived Cells in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2021-06, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了心外膜来源细胞在心律失常性心肌病中的旁分泌功能 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了心外膜来源细胞在心律失常性心肌病中的旁分泌作用，特别是TGFβ1和成纤维细胞生长因子的表达 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行，结果的普遍性和临床相关性需要进一步验证 | 探讨心外膜在心律失常性心肌病发病机制中的作用 | 心外膜来源细胞及其在心律失常性心肌病中的功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约18,000个增强绿色荧光蛋白标记的心外膜来源细胞 |
| 24147 | 2024-08-09 |
TCF7 is not essential for glucose homeostasis in mice
2021-06, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101213
PMID:33741532
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子TCF7在小鼠肝细胞和胰岛β细胞中的表达对葡萄糖稳态的相对代谢重要性 | 发现TCF7表达并非小鼠葡萄糖稳态的关键决定因素，且胰岛中TCF7的表达主要来自与胰岛相关的免疫细胞而非β细胞 | NA | 研究TCF7在肝细胞和胰岛β细胞中的表达对小鼠葡萄糖稳态的影响 | 小鼠的肝细胞和胰岛β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用不同饮食的小鼠进行实验，包括常规饮食和高脂饮食的小鼠 |
| 24148 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Origin and Evolution of Breast Cancer in BRCA1 Mutation Carriers
2021-05-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-2123
PMID:33727227
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源，特别是雌激素受体阳性乳腺癌的起源 | 研究样本量相对较小，可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 探究BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 | BRCA1突变携带者的乳腺癌组织及其邻近或预防性正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 82,122个细胞，来自4名BRCA1突变携带者和3名非携带者 |
| 24149 | 2024-08-09 |
Ex utero mouse embryogenesis from pre-gastrulation to late organogenesis
2021-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03416-3
PMID:33731940
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研究论文 | 本文介绍了一种高效的体外培养系统，用于从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的鼠胚胎发育 | 该系统能够精确模拟体内发育过程，并适用于引入各种胚胎扰动和微操作 | NA | 研究胚胎发育过程，特别是后植入期的形态发生和人工胚胎发生 | 鼠胚胎从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的发育过程 | NA | NA | 三维旋转瓶培养技术，单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 24150 | 2024-08-09 |
Angiodiversity and organotypic functions of sinusoidal endothelial cells
2021-05, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-021-09780-y
PMID:33745018
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综述 | 本文综述了血管多样性及器官特异性功能在肝窦内皮细胞（LSEC）中的表现 | 近年来，通过细胞分离和批量转录组学或单细胞RNA测序技术，识别了LSEC的分子程序和亚群，并发现了LSEC衍生的血管内分泌信号在肝脏稳态和疾病发病机制中的重要作用 | NA | 总结近年来对肝脏血管多样性的理解及其功能后果 | 肝窦内皮细胞（LSEC）及其在肝脏中的功能 | NA | NA | 电子显微镜、细胞分离技术、批量转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24151 | 2024-08-09 |
Single-cell mRNA profiling reveals changes in solute carrier expression and suggests a metabolic switch during zebrafish pronephros development
2021-05-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00610.2020
PMID:33749326
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了斑马鱼前肾在发育过程中溶质载体表达的变化，揭示了代谢转换的机制 | 首次揭示了斑马鱼胚胎肾脏在发育过程中葡萄糖转运能力的变化，以及后期对单羧酸和氨基酸转运能力的增强 | NA | 探究斑马鱼前肾在发育过程中如何响应过滤底物和内在能量需求的变化 | 斑马鱼前肾的溶质载体表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 斑马鱼前肾的细胞 |
| 24152 | 2024-08-09 |
A single-cell survey of the human glomerulonephritis
2021-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.16407
PMID:33754492
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了人类肾小球肾炎的细胞基因表达谱 | 首次定义了肾小球肾炎的足细胞标记物，并在细胞水平上发现了IgA、膜性肾病和狼疮性肾炎的特异性标记物 | 研究样本数量有限，可能影响结果的普遍性 | 揭示肾小球肾炎的细胞基因表达谱，以更好地理解其病理过程 | 人类肾移植供体样本、肾小球肾炎样本、恶性高血压样本和慢性间质性肾炎样本 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 共分析了8个样本，包括2个肾移植供体样本、4个肾小球肾炎样本、1个恶性高血压样本和1个慢性间质性肾炎样本 |
| 24153 | 2024-08-09 |
Correction for New perspectives of the cardiac cellular landscape: mapping cellular mediators of cardiac fibrosis using single-cell transcriptomics
2021-04-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST-2019-1255C_COR
PMID:33729456
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24154 | 2024-08-09 |
Obesity results in adipose tissue T cell exhaustion
2021-04-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.139793
PMID:33724954
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研究论文 | 研究探讨了肥胖如何影响脂肪组织T细胞的功能，发现肥胖的脂肪组织T细胞表现出炎症特性受损和T细胞耗竭的特征。 | 首次揭示了肥胖脂肪组织T细胞的功能特异性，以及肥胖通过环境因素和细胞内在因素导致T细胞功能障碍的机制。 | 研究主要集中在小鼠和人类样本上，可能需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 旨在理解肥胖如何影响适应性免疫系统，特别是脂肪组织T细胞的功能。 | 研究对象包括小鼠和人类的脂肪组织T细胞及其在肥胖状态下的功能变化。 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠和人类的脂肪组织样本 |
| 24155 | 2024-08-09 |
A single-cell analysis of the Arabidopsis vegetative shoot apex
2021-04-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.02.021
PMID:33725481
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，对拟南芥营养茎顶端进行了转录组水平的细胞分类学分析 | 本文首次在单细胞分辨率下定义了拟南芥营养茎顶端的细胞分类学，并揭示了表皮细胞、维管组织和叶肉细胞的细胞周期连续性和发育轨迹 | NA | 研究植物细胞分裂和分化的基本原理 | 拟南芥营养茎顶端的细胞 | 植物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7个广泛细胞群体和23个转录上不同的细胞集群 |
| 24156 | 2024-08-09 |
The AIM2 inflammasome exacerbates atherosclerosis in clonal haematopoiesis
2021-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03341-5
PMID:33731931
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研究论文 | 本文研究了AIM2炎症小体在克隆性造血引起的动脉粥样硬化中的作用 | 首次揭示了AIM2炎症小体在JAK2突变导致的动脉粥样硬化中的作用，并提出针对特定炎症小体和白细胞介素-1β的治疗策略 | NA | 探讨AIM2炎症小体在克隆性造血相关动脉粥样硬化中的作用及其机制 | 小鼠模型中的动脉粥样硬化病变 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 24157 | 2024-08-09 |
B cell-specific XIST complex enforces X-inactivation and restrains atypical B cells
2021-04-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.02.015
PMID:33735607
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研究论文 | 本文研究了长链非编码RNA XIST在成人B细胞中维持X染色体失活的作用，并揭示了其在特定B细胞类型中的功能和调节机制。 | 发现了XIST在成人B细胞中持续需要以沉默某些X连锁免疫基因，如TLR7，并揭示了XIST依赖的基因缺乏启动子DNA甲基化，需要持续的XIST依赖的组蛋白去乙酰化。 | NA | 探讨XIST在成人B细胞中的持续作用及其在特定细胞类型中的功能和调节机制。 | 长链非编码RNA XIST及其在B细胞中的作用。 | NA | NA | 单细胞转录组测序，CRISPRi筛选 | NA | 转录组数据 | 女性系统性红斑狼疮或COVID-19感染患者的单细胞转录组数据 |
| 24158 | 2024-08-09 |
Alignment of single-cell RNA-seq samples without overcorrection using kernel density matching
2021-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.261115.120
PMID:33741686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Dmatch的方法，利用人类初级细胞的外部表达图谱和核密度匹配来对齐多个单细胞RNA测序实验，以便进行下游生物学分析 | Dmatch方法在模拟中与其他对齐方法相比，在减少样本特定聚类和避免过度校正方面表现更优 | NA | 开发一种新的方法来对齐单细胞RNA测序数据，以消除批次效应并促进跨多个实验的整合和比较 | 单细胞RNA测序数据，特别是来自健康个体和自身免疫疾病患者的临床样本 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 核密度匹配 | 基因表达数据 | 来自健康个体和五名自身免疫疾病患者的样本 |
| 24159 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveal temporal dynamics of critical regulators of germ cell fate during mouse sex determination
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002420R
PMID:33749946
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠胚胎期9.0至16.5天的14,914个XX和XY生殖细胞的基因表达动态变化，揭示了性别决定过程中关键调控因子的时序动态 | 首次全面描述了小鼠性别决定过程中生殖细胞分化的基因表达动态，并识别了性别特异性的关键调控基因序列 | NA | 探究小鼠性别决定过程中生殖细胞分化的基因网络 | 小鼠胚胎期9.0至16.5天的XX和XY生殖细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14,914个XX和XY小鼠生殖细胞 |
| 24160 | 2024-08-09 |
Epiregulin confers EGFR-TKI resistance via EGFR/ErbB2 heterodimer in non-small cell lung cancer
2021-04, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-01734-4
PMID:33750895
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研究论文 | 研究分析了七种EGFR配体对NSCLC细胞和患者EGFR-TKI敏感性的影响 | 发现Epiregulin通过诱导EGFR/ErbB2异二聚体形成，减少细胞对TKIs的敏感性，并揭示了肿瘤微环境中由巨噬细胞产生的Epiregulin作为EGFR-TKI治疗的新型调节因子和生物标志物 | 研究中Epiregulin在癌细胞中的过表达或敲低对TKI敏感性的影响较小 | 分析EGFR配体对NSCLC细胞EGFR-TKI敏感性的影响及其机制 | NSCLC细胞和患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫荧光实验 | NA | 基因表达数据 | 涉及NSCLC细胞和患者的数据 |