单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28027 篇文献，本页显示第 24121 - 24140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24121 | 2024-08-09 |
Mouse totipotent stem cells captured and maintained through spliceosomal repression
2021-05-27, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.04.020
PMID:33991488
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研究论文 | 本研究通过剪接体抑制在鼠胚胎干细胞中实现了从多能态到全能态的状态转变，并成功维持了全能干细胞的体外培养。 | 首次通过剪接体抑制剂pladienolide B实现了鼠胚胎干细胞向全能态的转变，并成功维持了全能干细胞的稳定体外培养。 | NA | 探索并实现鼠胚胎干细胞向全能态的转变及其稳定体外培养。 | 鼠胚胎干细胞及其全能态。 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 24122 | 2024-08-09 |
Imputing single-cell RNA-seq data by combining graph convolution and autoencoder neural networks
2021-May-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102393
PMID:33997678
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研究论文 | 本文开发了一种名为GraphSCI的单细胞RNA测序数据插补方法，结合图卷积网络和自动编码器神经网络来处理数据中的缺失值问题 | GraphSCI能够准确推断基因间关系，并在训练过程中动态地利用这些关系进行插补，这是与其他插补算法相比的关键进步 | NA | 开发一种稳健有效的插补方法来处理日益增长的单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 24123 | 2024-08-09 |
Absence of Batf3 reveals a new dimension of cell state heterogeneity within conventional dendritic cells
2021-May-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102402
PMID:33997687
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研究论文 | 本文研究了Batf3缺失对常规树突状细胞（cDCs）状态异质性的影响 | 揭示了常规树突状细胞中多个细胞状态可以共表达重叠的谱系特征，显示了先前未被重视的cDC可塑性 | NA | 探讨Batf3缺失对常规树突状细胞状态异质性的影响 | 常规树突状细胞（cDCs） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序与整合细胞表面蛋白表达（CITE-seq） | NA | RNA | NA |
| 24124 | 2024-08-09 |
Induced lineage promiscuity undermines the efficiency of all-trans-retinoid-acid-induced differentiation of acute myeloid leukemia
2021-May-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102410
PMID:33997692
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，比较了两种急性髓系白血病（AML）细胞类型在全反式维甲酸（ATRA）治疗下的分化轨迹 | 首次揭示了ATRA在非APL型AML中诱导分化效率低下的机制，即治疗诱导的谱系混杂性 | 研究仅限于两种AML细胞类型，可能需要进一步扩大样本量以验证结果的普遍性 | 探究全反式维甲酸在急性髓系白血病中的分化诱导效率及其机制 | 急性髓系白血病（AML）细胞类型在ATRA治疗下的分化过程 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 两种AML细胞类型（NB4和HL60） |
| 24125 | 2024-08-09 |
Cell-type and fetal-sex-specific targets of prenatal alcohol exposure in developing mouse cerebral cortex
2021-May-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102439
PMID:33997709
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了孕期酒精暴露对发育中的小鼠大脑皮层的细胞类型和胎儿性别特异性影响 | 发现孕期酒精暴露会改变神经成熟和细胞周期，并破坏基因共表达网络，同时诱导胎儿血红蛋白的神经表达，这可能是一种表观遗传压力适应 | NA | 探讨孕期酒精暴露对发育中小鼠大脑皮层的细胞类型和性别特异性影响 | 小鼠胎儿大脑皮层细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 38种不同的神经亚群，来自6次定时妊娠 |
| 24126 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing reveals suppressive transcriptional programs regulated by MIS/AMH in neonatal ovaries
2021-05-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2100920118
PMID:33980714
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了MIS/AMH在新生小鼠卵巢中抑制卵泡发育的转录调控机制 | 首次揭示了MIS处理后卵巢细胞类型的特异性转录特征，以及其在抑制卵泡发育中的具体作用 | NA | 探究MIS抑制卵泡发育的机制 | 新生小鼠卵巢中的卵泡发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠卵巢 |
| 24127 | 2024-08-09 |
Single cell RNA sequencing for breast cancer: present and future
2021-May-14, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00485-1
PMID:33990550
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在乳腺癌研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术为深入理解乳腺癌的生物学行为提供了新的策略 | NA | 深入分析乳腺癌的发生发展机制，识别新的治疗靶点并开发新的治疗途径 | 乳腺癌细胞的异质性、转移、耐药性和预后 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 24128 | 2024-08-09 |
A stem cell population at the anorectal junction maintains homeostasis and participates in tissue regeneration
2021-05-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23034-x
PMID:33980830
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研究论文 | 本文通过体内谱系追踪、单细胞转录组学、计算建模和三维类器官培养系统研究了肛门直肠交界处的过渡区细胞，发现了一群具有多能性的Krt17+基底细胞，这些细胞在正常稳态下维持鳞状上皮，并在组织损伤后参与腺上皮的修复 | 首次揭示了肛门直肠交界处过渡区细胞在组织再生中的作用 | NA | 研究过渡区细胞在正常和损伤状态下的组织再生作用 | 肛门直肠交界处的过渡区细胞 | NA | NA | 体内谱系追踪、单细胞转录组学、计算建模、三维类器官培养系统 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 24129 | 2024-08-09 |
What are the applications of single-cell RNA sequencing in cancer research: a systematic review
2021-May-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-01955-1
PMID:33975628
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在癌症研究中的应用，详细介绍了其准备过程、测序平台以及数据分析的主要步骤和方法 | scRNA-seq技术因其前所未有的高分辨率而被广泛应用于癌症研究，有助于更好地理解癌症细胞生物学和发病机制 | NA | 探讨scRNA-seq在癌症研究中的应用，特别是其在实体肿瘤研究中的发现和成就 | 单细胞RNA测序技术及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24130 | 2024-08-09 |
Resident memory T cells in tumor-distant tissues fortify against metastasis formation
2021-05-11, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109118
PMID:33979626
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研究论文 | 研究使用小鼠乳腺癌模型，探讨了肿瘤远处组织中驻留记忆T细胞（Ts）的形成及其在防止转移形成中的作用 | 首次揭示了肿瘤、对侧乳腺黏膜和前转移肺中Ts的发育过程，并通过单细胞RNA测序分析了Ts的两种表型状态 | NA | 探讨肿瘤远处组织中驻留记忆T细胞的形成及其在防止转移形成中的作用 | 驻留记忆T细胞（Ts）及其在肿瘤远处组织中的发育和功能 | 免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠乳腺癌模型 |
| 24131 | 2024-08-09 |
Pan-cancer analysis reveals tumor-associated macrophage communication in the tumor microenvironment
2021-May-10, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-021-00226-1
PMID:33971970
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组数据，探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在肿瘤微环境（TME）中的分子特征及其与肿瘤细胞的相互作用 | 首次揭示了TAM亚群间的异质性及其在肿瘤进展中的作用，特别是CD86+ TAMs的关键角色，并发现了六个枢纽基因（包括FLI1）在TAM与肿瘤细胞相互作用中的异常表达 | NA | 阐明肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用及其与其他微环境成分的通信模式 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的功能和相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同肿瘤类型的数据 |
| 24132 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling of buffelgrass (Cenchrus ciliaris) eggs unveils apomictic parthenogenesis signatures
2021-05-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-89170-y
PMID:33972603
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研究论文 | 本文通过激光捕获显微切割技术对刺毛草（Cenchrus ciliaris）的性成熟和孤雌生殖卵细胞进行RNA测序，揭示了孤雌生殖卵细胞的转录组特征 | 首次创建了刺毛草卵细胞的从头转录组，并识别了孤雌生殖卵细胞与性成熟卵细胞之间的转录差异 | NA | 旨在揭示孤雌生殖机制，为作物育种中双单倍体生产提供帮助 | 刺毛草的性成熟和孤雌生殖卵细胞 | NA | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 性成熟和孤雌生殖卵细胞 |
| 24133 | 2024-08-09 |
CCR2-dependent monocyte-derived cells restrict SARS-CoV-2 infection
2021-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.05.03.442538
PMID:33972938
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研究论文 | 本文研究了CCR2依赖的单核细胞衍生的细胞在限制SARS-CoV-2感染中的作用 | 首次详细描述了CCR2依赖的单核细胞在SARS-CoV-2感染中的保护作用，并使用scRNA-seq分析和体内抗体标记技术进行了验证 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类免疫反应存在差异 | 探讨SARS-CoV-2感染中先天免疫机制的保护作用 | SARS-CoV-2感染中的CCR2依赖的单核细胞 | NA | 呼吸系统疾病 | scRNA-seq, 体内抗体标记 | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
| 24134 | 2024-08-09 |
Inferring Cell Subtypes and LncRNA Function by a Cell-Specific CeRNA Network in Breast Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.656675
PMID:33987091
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研究论文 | 本文提出了一种基于细胞特异性ceRNA网络（CCN）的新策略，用于推断乳腺癌中的细胞亚型和长非编码RNA（lncRNA）功能 | 本文创新性地构建了细胞特异性ceRNA网络（CCN），通过整合细胞特异性RNA-RNA共表达网络（RCN）和现有的ceRNA网络，用于推断细胞亚型和lncRNA功能 | NA | 研究旨在探索乳腺癌中单细胞水平的细胞亚型和lncRNA功能 | 乳腺癌中的细胞亚型和lncRNA功能 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | NA |
| 24135 | 2024-08-09 |
Identification of Silkworm Hemocyte Subsets and Analysis of Their Response to Baculovirus Infection Based on Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645359
PMID:33995363
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面鉴定了家蚕血细胞亚群，并分析了它们对杆状病毒感染的响应 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分类了家蚕血细胞，并揭示了杆状病毒感染对血细胞类型分布的显著影响 | 研究主要集中在血细胞的分子和细胞特性分析，未涉及更广泛的生理或生态影响 | 揭示家蚕血细胞的多样性及其对杆状病毒感染的响应 | 家蚕血细胞及其对杆状病毒感染的响应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括20个细胞集群及其潜在标记基因 |
| 24136 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome profiling reveals vascular endothelial cell heterogeneity in human skin
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.54917
PMID:33995668
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人皮肤中血管内皮细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上详细描述了皮肤中血管内皮细胞的组织特异性特征和内部异质性 | NA | 探究人皮肤中血管内皮细胞的功能角色和异质性 | 人皮肤中的血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 10名供体的皮肤组织 |
| 24137 | 2024-08-09 |
Endocrine Pancreas Development and Dysfunction Through the Lens of Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.629212
PMID:33996792
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研究论文 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术在内分泌胰腺发育和功能方面的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术，能够捕捉数千个单个细胞的转录组，包括稀有细胞类型、亚型和短暂状态，从而推断细胞转换的发育轨迹和基因调控途径 | NA | 探讨内分泌胰腺发育和功能，以及其在糖尿病病理学中的应用 | 内分泌胰腺的发育和功能，以及糖尿病中的病理胰腺 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 数千个单个细胞 |
| 24138 | 2024-08-09 |
Gene Families With Stochastic Exclusive Gene Choice Underlie Cell Adhesion in Mammalian Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.642212
PMID:33996799
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研究论文 | 本文探讨了基因家族中通过随机独占基因选择机制在哺乳动物细胞中实现细胞粘附的现象 | 本文提出了一种简单的度量方法，通过单细胞RNA测序数据检测基因表达的独占性，发现独占基因选择不仅限于典型家族，还扩展到其他细胞类型中的膜蛋白 | 本文主要依赖于单细胞RNA测序数据进行分析，可能存在数据解读的局限性 | 研究基因家族中随机独占基因选择机制在细胞粘附中的作用 | 研究对象包括T细胞受体、气味受体和原钙粘蛋白等基因家族 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个细胞类型 |
| 24139 | 2024-08-09 |
Evolutionary Multiobjective Clustering Algorithms With Ensemble for Patient Stratification
2022-Oct, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2021.3069434
PMID:33961576
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研究论文 | 本文提出了两种新的基于集合的进化多目标聚类算法（NSGA-II-ECFE和MOEA/D-ECFE），用于解决患者分层问题，通过四个聚类有效性指标作为目标函数 | 开发了一种有效的集合构建方法以增强集合多样性，并提出了集合聚类适应度评估（ECFE）方法来评估集合，通过测量这四个目标函数下的共识聚类 | NA | 解决患者分层中的亚型诊断问题，构建具有高诊断能力和良好泛化能力的分层模型 | 患者分层问题 | 机器学习 | NA | 进化多目标聚类算法 | NSGA-II-ECFE, MOEA/D-ECFE | 数据集 | 55个合成数据集和35个真实患者分层数据集，以及五个癌症相关的单细胞RNA-seq数据集 |
| 24140 | 2024-08-09 |
Single-cell Transcriptomics Uncover a Novel Role of Myeloid Cells and T-lymphocytes in the Fibrotic Microenvironment in Peyronie's Disease
2022-05, European urology focus
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.euf.2021.04.012
PMID:33962884
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术揭示了 Peyronie 病纤维化微环境中髓系细胞和 T 淋巴细胞的新作用 | 首次使用单细胞转录组学技术研究 Peyronie 病的免疫机制 | 单细胞 RNA 测序样本量较小，但由于有较大的历史石蜡包埋样本队列，研究结果具有一定的可靠性 | 探究 Peyronie 病患者斑块的免疫特征 | Peyronie 病患者的阴茎白膜 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 细胞 | 12 名 Peyronie 病患者和 6 名对照组患者 |