单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38417 篇文献，本页显示第 24061 - 24080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24061 | 2024-08-05 |
Cellular reprogramming with ATOH1, GFI1, and POU4F3 implicate epigenetic changes and cell-cell signaling as obstacles to hair cell regeneration in mature mammals
2022-11-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.79712
PMID:36445327
|
研究论文 | 该研究探讨了使用ATOH1、GFI1和POU4F3进行耳蜗再编程，以克服在成熟哺乳动物中毛细胞再生的障碍 | 揭示了老年动物毛细胞再编程的表观遗传障碍和细胞间信号传导的影响 | 只在特定的转录因子组合下进行了研究，未充分评估其他可能的因素 | 研究耳蜗中毛细胞特异性转录因子对听力恢复的影响 | 使用Cre诱导小鼠模型来比较不同转录因子的毛细胞再编程效果 | 数字病理学 | 听力损失 | scRNA-seq和ATAC-seq | NA | 细胞 | 新生小鼠与1周龄小鼠的比较 | NA | NA | NA | NA |
| 24062 | 2024-08-05 |
Anti-diabetic drug canagliflozin hinders skeletal muscle regeneration in mice
2022-Oct, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-022-00878-7
PMID:35217814
|
研究论文 | 这篇文章探讨了抗糖尿病药物canagliflozin对小鼠骨骼肌再生的影响 | 首次揭示了canagliflozin在骨骼肌再生中的负面作用以及LARS2在肌肉干细胞中的关键角色 | 主要研究了小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 研究canagliflozin对小鼠缺血性下肢肌肉再生的影响 | 小鼠和C2C12肌母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 肌肉组织和细胞数据 | 小鼠模型和细胞实验的具体样本量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 24063 | 2024-08-05 |
Spatial profiling of chromatin accessibility in mouse and human tissues
2022-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05094-1
PMID:35978191
|
研究论文 | 本文描述了一种通过空间-ATAC-seq方法对组织切片进行空间分辨的染色质可及性分析 | 创新之处在于结合了原位Tn5转座化学和微流体确定性条形码，能够在细胞水平和基因组规模上捕捉组织的空间表观遗传信息 | NA | 研究目的在于改善对细胞身份、状态及命运决策的理解，尤其是与表观遗传基础相关的部分 | 研究对象包括小鼠和人类的脑组织以及扁桃体组织 | 空间生物学 | NA | 下一代测序 | NA | 组织切片 | 使用了小鼠胚胎和扁桃体组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24064 | 2024-08-05 |
Global dynamics and cytokinin participation of salt gland development trajectory in recretohalophyte Limonium bicolor
2024-Jun-28, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiae199
PMID:38588029
|
研究论文 | 本文研究了盐腺的发展轨迹及其相关的分子机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了海熏衣草盐腺的演变及细胞命运的决定机制 | 研究仅基于盐腺发育的特定阶段，可能无法全面反映整个发育过程 | 揭示盐腺的发育轨迹以及细胞命运决定的分子机制 | 研究对象为海熏衣草（Limonium bicolor）中的盐腺及其相关基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24065 | 2024-08-05 |
Breast cancer patient-derived organoids for the investigation of patient-specific tumour evolution
2024-Jun-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-024-03375-5
PMID:38926706
|
研究论文 | 开发了一种可靠的来自乳腺癌患者的类器官模型，以调查肿瘤演变 | 首次利用患者来源的类器官模型研究新辅助化疗和手术前后的肿瘤演变 | 研究基于单一病例，需要更多样本验证普遍性 | 研究患者特异性的肿瘤演变过程 | 69岁乳腺癌女性患者的组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、药物筛选 | 类器官 | 组织培养 | 2个类器官样本（则为治疗前后的组织） | NA | NA | NA | NA |
| 24066 | 2024-08-04 |
MOI is a comprehensive database collecting processed multi-omics data associated with viral infection
2024-06-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-65629-6
PMID:38926513
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为'MOI'的综合数据库，聚合与病毒感染相关的处理过的多组学数据 | MOI数据库填补了缺乏集中存储病毒宿主反应数据的空白，并为病毒宿主相互作用的深入研究提供了宝贵资源 | 本文未提及数据库的持续更新和数据验证过程的具体细节 | 研究病毒宿主相互作用的分子机制，以推动对病毒致病机制的理解及治疗干预的发展 | 涉及3200多个病毒感染样本，包括人类和小鼠感染 | 数字病理学 | NA | RNA测序, ChIP测序, ATAC-seq | NA | 多组学数据 | 3200多个病毒感染样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24067 | 2024-08-05 |
Mobilization and activation of tumor-infiltrating dendritic cells inhibits lymph node metastasis in intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-Jun-26, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-024-02079-z
PMID:38926350
|
研究论文 | 本文研究了肝内胆管癌中肿瘤浸润性树突状细胞的动员与激活对淋巴结转移的抑制作用 | 揭示了肿瘤细胞内源性β-连环蛋白激活作为在肝内胆管癌中逃避树突状细胞介导的抗肿瘤免疫的关键机制 | 尚未探讨FL-pIC疗法或β-连环蛋白抑制剂的临床有效性 | 探讨淋巴结转移的机制及肿瘤免疫控制的潜在治疗方法 | 研究了244例肝内胆管癌样本中的树突状细胞浸润和相关免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | scRNA-seq和bulk RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 219例手术切除的肝内胆管癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24068 | 2024-08-05 |
The Advancement and Application of the Single-Cell Transcriptome in Biological and Medical Research
2024-Jun-19, Biology
DOI:10.3390/biology13060451
PMID:38927331
|
综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序技术的发展及其在生物和医学研究中的应用 | 深入分析了不同单细胞转录组技术的发展过程，并总结其与其他组学分析的整合 | 当前单细胞转录组技术仍不完善，存在一些不足之处 | 帮助更深入理解scRNA-seq技术及其在生物和医学研究中的应用 | 单细胞转录组数据及其在多个研究领域的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24069 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic and Targeted Genomic Profiling Adjusted for Inflammation and Therapy Bias Reveal CRTAM and PLCB1 as Novel Hub Genes for Anti-Tumor Necrosis Factor Alpha Therapy Response in Crohn's Disease
2024-Jun-19, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics16060835
PMID:38931955
|
研究论文 | 该研究揭示了 CRTAM 和 PLCB1 作为克罗恩病抗肿瘤坏死因子 Alpha 治疗反应的新中心基因 | 该研究采用单细胞 RNA 测序探索特定免疫细胞亚群体，为抗 TNFα 生物治疗的生物标志物发现提供了新的视角 | 本研究主要集中于特定细胞类型，可能未能涵盖更广泛的生物标志物探索 | 研究抗肿瘤坏死因子 Alpha 治疗的生物标志物以改善克罗恩病患者的个性化治疗 | 克罗恩病患者的外周血单核细胞基因表达 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞 RNA 测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自不同治疗状态的克罗恩病患者的外周血单核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24070 | 2024-08-04 |
Advances in Single-Cell Transcriptome Sequencing and Spatial Transcriptome Sequencing in Plants
2024-Jun-18, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants13121679
PMID:38931111
|
研究论文 | 文章概述了植物单细胞转录组和空间转录组测序的研究进展以及它们在植物中的应用和挑战 | 介绍了单细胞和空间转录组测序技术的创新以及其对细胞特异性表达的揭示 | 该研究主要集中在植物领域，可能不适用于动物细胞转录组的分析 | 探讨单细胞和空间转录组测序在植物研究中的应用 | 主要研究植物组织中单个细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序与空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24071 | 2024-08-05 |
Integrated Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Metabolic Reprogramming of Liver Cancer and Establishes a Prognostic Risk Model
2024-Jun-08, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060755
PMID:38927691
|
研究论文 | 该文章分析了肝癌的代谢重编程，并建立了预后风险模型 | 通过单细胞转录组分析和代谢视角建立的预后风险模型对于肝癌的精确预防和治疗具有重要意义 | 该研究仅限于所选样本，可能无法广泛适用于所有肝癌患者 | 旨在提供肝癌患者的分层和精确治疗方法 | 研究对象包括105,829个单细胞转录组分析中识别的11种细胞类型 | 数字病理 | 肝癌 | scRNA-Seq和Bulk RNA-Seq | NA | 细胞数据 | 105,829个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 24072 | 2024-08-04 |
Ploidy inference from single-cell data: application to human and mouse cell atlases
2024-06-05, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyae061
PMID:38651869
|
研究论文 | 本研究开发了一种从单细胞ATAC-seq数据推断细胞倍性的统计方法 | 首次将倍性分析集成到单细胞研究中，并能够系统地检测多倍性 | 可能需要额外的测定步骤以测量倍性 | 旨在填补单细胞研究中倍性分析的空白 | 人类和小鼠细胞图谱的数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 人类和小鼠的多个细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 24073 | 2024-08-05 |
M2 Macrophages Guide Periosteal Stromal Cell Recruitment and Initiate Bone Injury Regeneration
2024-May-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12061205
PMID:38927412
|
研究论文 | 这项研究创建了猪颅骨膜的详细细胞图谱，强调了细胞动态与相互作用在颅骨损伤修复中的重要性 | 该研究揭示了M2巨噬细胞在骨膜免疫反应调节和骨再生过程中的关键作用 | 研究仅限于猪颅骨膜，结果的广泛适用性需要进一步验证 | 探讨骨膜在骨损伤修复中的作用 | 猪颅骨膜 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24074 | 2024-08-05 |
scPLAN: a hierarchical computational framework for single transcriptomics data annotation, integration and cell-type label refinement
2024-May-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae305
PMID:38935069
|
研究论文 | scPLAN是一个用于单细胞RNA测序数据分析的层次计算框架 | scPLAN通过层次细胞类型树对未标记的scRNA-seq数据进行注释，系统性识别潜在的新细胞类型 | 现有的整合方法无法整合不同标注深度的数据集，也未能利用更复杂注释的数据集或新生物发现来提升旧数据的标注 | 提高单细胞RNA测序数据的细胞类型注释和整合精确度 | 未标记的scRNA-seq数据和已有标注的数据集 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 层次模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24075 | 2024-08-05 |
Transcriptomic Analyses Reveal the Effects of Walnut Kernel Cake on Adipose Deposition in Pigs
2024-May-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes15060667
PMID:38927603
|
研究论文 | 该研究探讨了核桃仁饼对猪脂肪沉积的影响及其潜在的饲料替代价值 | 首次揭示了核桃仁饼在促进猪脂肪沉积和改善肉质方面的应用潜力 | 对核桃仁饼在猪饲料中的应用研究尚处于起步阶段，缺乏大规模的临床试验数据 | 旨在评估核桃仁饼作为猪饲料中的蛋白质替代品的效果 | 以大迪庆藏猪为研究对象 | 数字病理学 | NA | 转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 大迪庆藏猪的样本数量未明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 24076 | 2024-08-05 |
Activation of CD14+ Monocytes via the IFN-γ Signaling Pathway Is Associated with Immune-Related Adverse Events in Hepatocellular Carcinoma Patients Receiving PD-1 Inhibition Combination Therapy
2024-May-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines12061140
PMID:38927347
|
研究论文 | 研究探讨了HCC患者接受PD-1抑制联合治疗后，CD14+单核细胞通过IFN-γ信号通路激活与免疫相关不良事件之间的关系 | 首次揭示了在PD-1抑制联合治疗中，IFN-γ信号通路诱导的单核细胞激活是HCC患者发生免疫相关不良事件的重要机制 | 该研究的样本量较小，仅包含71名HCC患者，可能影响结果的普遍适用性 | 探明HCC患者在PD-1抑制联合治疗中免疫相关不良事件的机制 | 71名接受PD-1抑制联合治疗的肝癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, Olink蛋白组学 | NA | 血液样本 | 71名HCC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 24077 | 2024-08-05 |
Cystatin M/E ameliorates bone resorption through increasing osteoclastic cell estrogen influx
2024-May-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4313179/v1
PMID:38766009
|
研究论文 | 本研究评估了Cystatin M/E在减缓骨吸收过程中的作用，特别是在多发性骨髓瘤模型中。 | 本研究首次显示Cystatin M/E能够增加骨吸收前体细胞的雌激素浓度，并抑制其成熟。 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床转化需要更多的人体数据支持。 | 探讨Cystatin M/E如何通过改善雌激素受体的表达来减少骨质流失。 | 使用多发性骨髓瘤及卵巢切除小鼠模型进行实验。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 蛋白质和mRNA数组 | 包含多发性骨髓瘤及卵巢切除小鼠模型的实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 24078 | 2024-08-05 |
Beneficial mechanisms of dimethyl fumarate in autoimmune uveitis: insights from single-cell RNA sequencing
2024-Apr-29, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-024-03096-6
PMID:38684986
|
研究论文 | 该研究探讨了二甲基富马酸酯在自身免疫性葡萄膜炎中的作用机制 | 通过单细胞RNA测序，揭示了DMF在自身免疫性葡萄膜炎中影响免疫细胞渗透的潜在机制 | 当前研究缺乏对DMF在自身免疫性葡萄膜炎中全面作用的深入探索 | 研究DMF在自身免疫性葡萄膜炎中的功能及其潜在机制 | 正常小鼠、实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及DMF处理的实验小鼠 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 正常小鼠、实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和DMF处理的实验小鼠的颈部引流淋巴结细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 24079 | 2024-08-04 |
Identification of biomarkers related to angiogenesis in myocardial ischemia-reperfusion injury and prediction of potential drugs
2024, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0300790
PMID:38935597
|
研究论文 | 本研究识别与心肌缺血再灌注损伤相关的血管生成生物标志物并预测潜在药物 | 本研究首次识别Stat3、Rela和Ubb作为心肌缺血再灌注损伤与血管生成的关键基因 | 研究未提及样本的多样性及临床实验证据 | 探索心肌缺血再灌注损伤中的血管生成机制及相关生物标志物 | 心肌缺血再灌注损伤的生物标志物和潜在药物 | 数字病理 | 心血管疾病 | 测序 | WGCNA | 基因序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24080 | 2024-08-04 |
Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Unravels the Molecular Feature of Tumor-Associated Macrophage of Acute Myeloid Leukemia
2024, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/2024/5539065
PMID:38205232
|
研究论文 | 本文探讨了急性髓系白血病及其相关的巨噬细胞分子特征 | 提出了一种巨噬细胞相关指数（MRI）来评估AML患者的预后和免疫特征 | 研究可能受到数据源和样本量的限制，可能需进一步验证 | 深入探索急性髓系白血病与巨噬细胞之间的关联 | 急性髓系白血病患者的基因表达谱和临床变量特征 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | RNA测序 | LASSO和多变量Cox分析 | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA, GEO和TARGET数据库的AML患者数据集 | NA | NA | NA | NA |