单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
24001 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing of human nail unit defines RSPO4 onychofibroblasts and SPINK6 nail epithelium
2021-06-07, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用多指症标本进行人类指甲单元的单细胞RNA测序,揭示了指甲特异性间充质和上皮细胞群,分别由RSPO4和SPINK6特征化 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了人类指甲单元中的特定细胞类型及其基因表达特征 研究样本来自多指症患者,可能限制了结果的普遍性 探索人类指甲组织的转录组特征及其在疾病中的作用 人类指甲单元的间充质和上皮细胞 数字病理学 先天性无甲症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 11,541个细胞来自4个额外手指
24002 2024-08-08
Cellular Tropism of SARS-CoV-2 across Human Tissues and Age-related Expression of ACE2 and TMPRSS2 in Immune-inflammatory Stromal Cells
2021-Jun, Aging and disease IF:7.0Q1
研究论文 本研究分析了SARS-CoV-2在不同人体组织中的细胞嗜性,并探讨了ACE2和TMPRSS2在免疫炎症间质细胞中的年龄相关表达变化 开发了一种新的分析框架,用于绘制SARS-CoV-2的细胞嗜性,并强调了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在系统解决病毒发病机制中的作用 NA 探讨SARS-CoV-2的细胞嗜性及其在不同细胞类型中的年龄相关表达变化,为临床治疗和病理研究提供指导 SARS-CoV-2的细胞嗜性、ACE2和TMPRSS2的表达 NA COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 不同人体组织和不同细胞类型的样本
24003 2024-08-08
[Regulation of RNA Binding Protein Mbnl1 on Development of Mouse Embryonic Hematopoietic Stem Cells]
2021-Jun, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
研究论文 分析小鼠胚胎造血干细胞发育过程中单细胞RNA结合蛋白(RBPs)的动态分子表达特征,并研究Mbnl1在调节小鼠胚胎造血干细胞发育中的功能 通过生物信息学分析和CRISPR/Cas9技术构建Mbnl1敲除小鼠模型,研究Mbnl1在造血干细胞发育中的作用 NA 阐明Mbnl1在调节小鼠胚胎造血干细胞发育中的功能 小鼠胚胎造血干细胞(HSCs)及其发育过程中的单细胞RNA结合蛋白Mbnl1 生物信息学 NA CRISPR/Cas9技术 NA 单细胞转录组数据 E11.5时期的Mbnl1+/+和Mbnl1-/-两种基因型胚胎的主动脉-性腺-中肾(AGM)和卵黄囊(YS)组织
24004 2024-08-08
Secreted inhibitors drive the loss of regeneration competence in Xenopus limbs
2021-06-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 研究探讨了非洲爪蟾蝌蚪在发育过程中失去肢体再生能力的原因,并识别了关键的抑制因子。 通过单细胞转录组学和体外再生肢体培养,揭示了特殊伤口表皮的形成机制及其在发育过程中失去再生能力的原因。 研究主要集中在非洲爪蟾蝌蚪,可能不完全适用于其他物种或更高等脊椎动物。 研究非洲爪蟾蝌蚪特殊伤口表皮的分子和细胞调节机制及其在发育过程中失去再生能力的原因。 非洲爪蟾蝌蚪的肢体再生能力和特殊伤口表皮的形成。 NA NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 未具体说明样本数量
24005 2024-08-08
Tracing the origin of hair follicle stem cells
2021-06, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文通过结合无标记的长期三维活体成像和单细胞转录组学,追踪了小鼠毛囊上皮细胞在发育过程中的动态谱系进展和转录组变化 本文首次描述了'望远镜模型',这是一种用于外胚层器官发育的通用模型,其中胚胎中的二维同心区域扩展形成三维纵向排列的圆柱形隔室 NA 揭示毛囊干细胞的起源及其在发育过程中的诱导机制 小鼠毛囊上皮细胞的发育过程 NA NA 三维活体成像、单细胞转录组学 NA 图像、转录组数据 涉及小鼠毛囊上皮细胞的整个发育过程
24006 2024-08-08
Multimodal analysis for human ex vivo studies shows extensive molecular changes from delays in blood processing
2021-May-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文研究了血液处理延迟对人类外周血单个核细胞(PBMC)数量、状态及血浆蛋白质组的影响 发现血液处理延迟6小时即可导致单细胞转录组和血浆蛋白质组发生显著变化 研究仅限于血液处理延迟的影响,未涉及其他可能影响因素 探讨血液处理延迟对多组学平台在临床和转化研究中应用的影响 人类外周血单个核细胞(PBMC)及其血浆蛋白质组 NA NA 多组学分析 NA 单细胞转录组、血浆蛋白质组 NA
24007 2024-08-08
A Subpopulation of Schwann Cell-Like Cells With Nerve Regeneration Signatures Is Identified Through Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序技术,研究了人羊膜间充质干细胞衍生的类施万细胞在促进周围神经再生中的异质性和潜在分子机制 首次鉴定出一亚群高度表达与施万细胞增殖、迁移和生存相关基因的类施万细胞,这些细胞可能是在神经再生中的关键群体 NA 探究类施万细胞在治疗周围神经再生中的异质性和潜在分子机制 人羊膜间充质干细胞衍生的类施万细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 6,008个人羊膜间充质干细胞单细胞和5,140个类施万细胞单细胞
24008 2024-08-08
A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis
2021, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文综述了单细胞转录组技术在植物研究中的应用及其通过基于细胞的计算模型在数据分析中的优势和挑战 探讨了单细胞转录组数据与植物形态发生模型结合的新机会,以及显微镜和细胞分辨率成像技术在解决单细胞转录组数据空间问题中的前景 集成转录组到形态发生水平的数据在一个统一系统中仍存在困难 探讨单细胞转录组技术在植物组织结构形成研究中的应用及其计算模型分析方法 植物组织的单细胞转录组数据及其在形态发生中的应用 计算生物学 NA 单细胞转录组技术 基于细胞的计算模型 转录组数据 NA
24009 2024-08-08
Integrating Spatial Transcriptomics and Single-Cell RNA-seq Reveals the Gene Expression Profling of the Human Embryonic Liver
2021, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,对人类胚胎肝脏在不同发育阶段的基因表达进行无偏分析 首次系统地识别了人类胚胎肝脏中的九种细胞类型,并定义了主要细胞类型的发育途径 NA 了解胚胎发育过程中肝脏的复杂发展,以促进功能性肝脏替代组织的工程化及肝脏再生 人类胚胎肝脏在8周至17周的发育过程中的基因表达 数字病理学 肝脏疾病 单细胞RNA测序和空间转录组学 NA 基因表达数据 人类胚胎肝脏在8周至17周的发育阶段样本
24010 2024-08-08
The Intestinal Epithelium - Fluid Fate and Rigid Structure From Crypt Bottom to Villus Tip
2021, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了肠道上皮从隐窝底部到绒毛顶端的流体命运和刚性结构,以及其与肠道功能的相互作用 介绍了单细胞测序、时空分析和类器官技术在揭示肠道上皮复杂微观结构和维持机制中的新发现 讨论了每种方法的优势和局限性,并考虑了这些结果对健康和疾病中肠道理解的影响 探讨近期关于肠道上皮和基质结构的新发现,并强调导致这些发现的技术 肠道上皮及其基质结构 NA NA 单细胞测序、时空分析、类器官技术 NA 细胞 NA
24011 2024-08-08
Single-Cell Transcriptomics Reveals Endothelial Plasticity During Diabetic Atherogenesis
2021, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了糖尿病诱导的动脉粥样硬化中内皮细胞的转录组变化 首次在单细胞水平上揭示了糖尿病相关动脉粥样硬化中内皮细胞的表型和代谢异质性 NA 探究糖尿病相关动脉粥样硬化中内皮细胞的生物学特性 小鼠心脏和主动脉中的内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) NA 转录组数据 来自小鼠心脏和主动脉的富含内皮细胞的单细胞样本
24012 2024-08-08
Cell Heterogeneity Analysis in Single-Cell RNA-seq Data Using Mixture Exponential Graph and Markov Random Field Model
2021, BioMed research international IF:2.6Q3
研究论文 本文介绍了一种新的方案,用于检测单细胞异质性的基因型特征,并将其应用于循环肿瘤细胞(CTCs)和三阴性乳腺癌(TNBC)的单细胞RNA测序数据中 本文引入了混合指数族图模型和马尔可夫随机场模型,用于更灵活地重构细胞网络,并发现不同细胞亚群中的高共表达基因模块 NA 探索细胞异质性,特别是循环肿瘤细胞(CTCs)和三阴性乳腺癌(TNBC)的异质性 单细胞RNA测序数据中的细胞异质性和基因网络关系 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 混合指数族图模型和马尔可夫随机场模型 基因表达数据 具体样本数量未提及
24013 2024-08-08
Single Cell RNA-Seq Analysis Identifies Differentially Expressed Genes of Treg Cell in Early Treatment-Naive Rheumatoid Arthritis By Arsenic Trioxide
2021, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了三氧化二砷(AsO)对早期未治疗类风湿关节炎(RA)中调节性T细胞(Treg细胞)基因表达的影响 这是首个研究AsO对未治疗Treg细胞基因表达全基因组效应的研究,除了明显的抗炎和免疫调节作用外,AsO还影响Treg细胞中的氨基酸和葡萄糖代谢 NA 阐明早期类风湿关节炎中三氧化二砷对Treg细胞在发病机制中的调节作用 早期未治疗的类风湿关节炎中的Treg细胞 数字病理学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 从外周血单个核细胞(PBMCs)中分离并纯化的Treg细胞
24014 2024-08-08
The Presence of Circulating Nucleated Red Blood Cells Is Associated With Disease Severity in Patients of Hemorrhagic Fever With Renal Syndrome
2021, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究探讨了在汉坦病毒感染引起的肾综合征出血热患者中,外周血红细胞的变化及其与疾病严重程度的关系 首次发现肾综合征出血热患者外周血中存在有核红细胞(NRBC),并与其疾病严重程度相关;首次表明汉坦病毒感染阻碍红细胞成熟 NA 探索肾综合征出血热患者外周血红细胞的变化及其与疾病严重程度的关系 肾综合征出血热患者的外周血红细胞 NA 肾综合征出血热 单细胞RNA测序 NA RNA 肾综合征出血热患者的PBMCs
24015 2024-08-08
Expression of Urea Transporter B in Normal and Injured Brain
2021, Frontiers in neuroanatomy IF:2.1Q3
研究论文 研究探讨了尿素转运蛋白B(UT-B)在大脑正常和损伤状态下的表达特征 首次通过单细胞RNA测序和免疫组织化学方法,详细描述了UT-B在大脑不同细胞类型中的分布和表达变化 研究主要集中在UT-B的表达变化,未深入探讨其具体功能和机制 确定UT-B在大脑中的表达特性及其在创伤性脑损伤(TBI)后的变化 UT-B在大脑中的表达及其在TBI后的变化 NA 神经疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学 NA 细胞 涉及多种大脑细胞类型,具体数量未详细说明
24016 2024-08-08
Revealing the Immune Infiltration Landscape and Identifying Diagnostic Biomarkers for Lumbar Disc Herniation
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析,识别了腰椎间盘突出症(LDH)中核软骨(NP)组织免疫浸润的关键基因,并探讨了其作为诊断生物标志物的潜力 首次通过CIBERSORT算法和WGCNA R包分析了LDH与对照组间NP组织的免疫浸润差异,并结合单细胞测序数据进行了深入分析 NA 揭示腰椎间盘突出症的免疫浸润景观并识别诊断生物标志物 腰椎间盘突出症中的核软骨组织 数字病理学 腰椎间盘突出症 CIBERSORT算法, WGCNA R包, 单细胞测序 NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及
24017 2024-08-08
Interaction of long non-coding RNAs and circular RNAs with microRNAs for the regulation of immunological responses in human cancers
2022-04, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1
研究论文 本文探讨了长非编码RNA、环状RNA与微小RNA在人类癌症免疫反应调控中的相互作用 文章揭示了非编码RNA在免疫调节中的新角色,特别是通过外泌体传递非编码RNA重塑接收细胞中的不同通路和蛋白质网络 NA 深入理解非编码RNA在免疫系统中的调控机制,以期将实验室发现转化为临床有效的治疗方法 长非编码RNA、环状RNA和微小RNA在免疫反应中的调控作用 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA RNA NA
24018 2024-08-08
Neoplastic and immune single-cell transcriptomics define subgroup-specific intra-tumoral heterogeneity of childhood medulloblastoma
2022-02-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、免疫组化和转录组数据解卷积,分析了儿童髓母细胞瘤中肿瘤细胞和免疫细胞的异质性。 发现了与特定分子亚型相关的新的髓母细胞瘤亚群,并揭示了这些亚群在神经发育过程中的作用。 NA 旨在确定肿瘤细胞和免疫细胞多样性对髓母细胞瘤生物学的影响。 儿童髓母细胞瘤中的肿瘤细胞和免疫细胞。 数字病理学 儿童疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 包括患者样本和动物模型
24019 2024-08-08
Stress relief: emerging methods to mitigate dissociation-induced artefacts
2021-11, Trends in cell biology IF:13.0Q1
研究论文 本文讨论了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在大规模应用中,传统细胞分离协议对细胞原生组织环境中转录特征捕获的影响,以及为避免这些失真而开发的方法和这些升级方法揭示的生物过程。 本文介绍了为减少分离诱导的伪影而开发的新兴方法。 NA 探讨单细胞RNA测序中细胞分离协议对转录特征的影响及改进方法。 单细胞RNA测序中的细胞分离协议及其对转录特征的影响。 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA
24020 2024-08-08
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals a Hepatic Stellate Cell-Activation Roadmap and Myofibroblast Origin During Liver Fibrosis in Mice
2021-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和谱系追踪技术,分析了HSCs和PFs在CCL4诱导和胆管结扎诱导的肝纤维化小鼠模型中的激活过程 揭示了HSCs和PFs在不同诱因下的肝纤维化中的不同转录特征及其对纤维化肌成纤维细胞的贡献 NA 探讨HSCs和PFs在肝纤维化中的动态基因表达机制及其对纤维化肌成纤维细胞的贡献 HSCs和PFs在肝纤维化中的激活过程 数字病理学 肝纤维化 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 小鼠模型
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