单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27986 篇文献，本页显示第 24001 - 24020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 24001 | 2024-08-08 |
Characterizing the tumor microenvironment of metastatic ovarian cancer by single-cell transcriptomics
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109165
PMID:34038734
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了转移性卵巢癌肿瘤微环境的细胞组成和细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了转移性卵巢癌肿瘤微环境中9种主要细胞类型的转录特征，并揭示了不同免疫细胞亚群在肿瘤微环境中的分布和功能 | 研究样本仅来自6名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解肿瘤微环境的细胞组成及其在癌症免疫治疗中的作用 | 转移性卵巢癌患者的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 9,885个细胞，来自6名患者 |
| 24002 | 2024-08-09 |
Dissecting the microenvironment around biosynthetic scaffolds in murine skin wound healing
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf0787
PMID:34039601
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研究论文 | 研究了三种不同表面形貌（随机、对齐和格子状）的静电纺丝膜对小鼠和大鼠皮肤伤口愈合及免疫调节特性的影响 | 通过单细胞RNA测序揭示了微环境中不同的细胞异质性，并发现对齐的支架能促进适应性免疫反应 | NA | 探讨生物材料结构特性对细胞行为和免疫反应的影响 | 静电纺丝膜在皮肤伤口愈合中的作用及其对免疫细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和大鼠的皮肤伤口样本 |
| 24003 | 2024-08-09 |
Shared transcriptional profiles of atypical B cells suggest common drivers of expansion and function in malaria, HIV, and autoimmunity
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg8384
PMID:34039612
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研究论文 | 本文通过无偏倚的单细胞RNA测序技术，揭示了在疟疾、HIV和自身免疫疾病中非典型B细胞（ABCs）的转录谱相似性，并探讨了其功能和扩张的共同驱动因素。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了疟疾、HIV和自身免疫疾病中非典型B细胞的相似转录谱，并发现干扰素-γ在这些疾病中驱动ABCs的扩张。 | NA | 探究非典型B细胞在慢性传染病和自身免疫疾病中的扩张和功能。 | 非典型B细胞（ABCs）及其在疟疾、HIV和自身免疫疾病中的转录谱和功能。 | 免疫学 | 疟疾, HIV, 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 24004 | 2024-08-09 |
Isolation of Nuclei from Mammalian Cells and Tissues for Single-Nucleus Molecular Profiling
2021-May, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.132
PMID:34043278
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研究论文 | 本文描述了一种高效、经济且时间有效的方法，用于从哺乳动物细胞和组织中分离核，以进行单核分子分析 | 该方法提高了整体效率，消除了污染物暴露的风险，并减少了昂贵试剂的用量 | NA | 开发一种新的方法来分离哺乳动物细胞和组织的核，以便进行单核RNA测序和单核ATAC-Seq | 哺乳动物细胞和组织的核 | 分子生物学 | NA | 单核RNA测序（snRNAseq），单核ATAC-Seq（snATAC-Seq） | NA | RNA | NA |
| 24005 | 2024-08-09 |
Bile acid synthesis, modulation, and dementia: A metabolomic, transcriptomic, and pharmacoepidemiologic study
2021-05, PLoS medicine
IF:10.5Q1
DOI:10.1371/journal.pmed.1003615
PMID:34043628
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研究论文 | 本研究通过代谢组学、转录组学和药物流行病学的方法，探讨了胆酸合成、调节与痴呆之间的关系 | 首次综合代谢组学、转录组学和药物流行病学方法，揭示胆固醇分解代谢失调与痴呆发病机制的关联 | 研究样本量较小，且初级医疗环境中痴呆亚型的临床诊断可能存在不准确 | 探讨胆固醇分解代谢失调通过转化为初级胆酸与痴呆发病机制的关联 | 初级胆酸（胆酸和鹅去氧胆酸）及其主要生物合成前体7α-羟基胆固醇在痴呆中的作用 | 代谢组学 | 痴呆 | 代谢组学、转录组学、药物流行病学 | NA | 血液、脑组织 | 包括141名参与者的脑部淀粉样蛋白积累、134名参与者的白质病变和脑萎缩，以及29名参与者的脑组织样本 |
| 24006 | 2024-08-09 |
Author Correction: Single-cell RNA sequencing technologies and bioinformatics pipelines
2021-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00615-w
PMID:34045654
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24007 | 2024-08-09 |
[Application prospects of single-cell transcriptome sequencing in traditional Chinese medicine research]
2021-May, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组测序技术在中药研究中的应用前景 | 单细胞转录组测序技术能够分析单个细胞层面的转录组表达特征，发现个体细胞中被“稀释”或平均化的基因表达异质性 | NA | 探讨单细胞转录组测序技术在中药研究中的应用前景 | 单细胞转录组测序技术及其在现代药物研究中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 24008 | 2024-08-09 |
Methods for Characterization of Senescent Circulating and Tumor-Infiltrating T-Cells: An Overview from Multicolor Flow Cytometry to Single-Cell RNA Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1507-2_6
PMID:34053052
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综述 | 本文综述了从多色流式细胞术到单细胞RNA测序等多种方法在衰老循环和肿瘤浸润T细胞表征中的应用 | 提出结合多色流式细胞术、基因表达阵列和单细胞RNA测序的综合分析方法，以揭示衰老CD8+ T细胞的确切分子标志，并探讨免疫衰老与人类衰老的关联 | 现有表征方法可能不足以区分真正的衰老细胞和耗竭T细胞，且衰老个体或肿瘤微环境中T细胞亚群的高度异质性增加了复杂性 | 开发针对特定T细胞亚群的治疗性调节干预措施 | 衰老的循环和肿瘤浸润T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 24009 | 2024-08-09 |
A Cancer-Specific Qualitative Method for Estimating the Proportion of Tumor-Infiltrating Immune Cells
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.672031
PMID:34054849
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Tumor-infiltrating Immune Cell Proportion Estimator (TICPE)的癌症特异性定性方法，用于估计肿瘤浸润免疫细胞的比例 | TICPE方法基于基因对的相对表达顺序（REOs），对批次效应不敏感，且在估计免疫细胞比例的准确性上明显优于其他方法 | NA | 开发一种新的方法来估计特定类型癌症中肿瘤浸润免疫细胞的比例，并探讨免疫细胞浸润对免疫治疗效果和癌症预后的影响 | 结直肠癌（CRC）和黑色素瘤 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | mRNA混合物数据、免疫组织化学数据和模拟的批量RNA测序样本 | 使用了公共表达数据和模拟样本 |
| 24010 | 2024-08-09 |
GPCRomics of Homeostatic and Disease-Associated Human Microglia
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.674189
PMID:34054860
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研究论文 | 本文通过分析公开的RNA测序数据，研究了人类和小鼠大脑中微胶质细胞的G蛋白偶联受体（GPCRs）表达情况 | 首次系统性地揭示了微胶质细胞中GPCRs的表达模式，并探讨了其在脑疾病中的潜在作用 | 研究主要基于公开的RNA测序数据，可能存在样本选择偏差 | 探讨GPCRs在人类微胶质细胞中的表达及其在脑生理和病理过程中的作用 | 人类和小鼠大脑中的微胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和小鼠大脑的批量和单细胞样本 |
| 24011 | 2024-08-09 |
Updating the pathophysiology of arthritic bone destruction: identifying and visualizing pathological osteoclasts in pannus
2021-Dec, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2021.1913883
PMID:34010590
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和活体成像技术在关节炎骨破坏病理生理学中的应用 | 应用单细胞RNA测序技术揭示了炎症滑膜中成熟破骨细胞前体的异质性，并使用活体成像技术实时观察破骨细胞和免疫细胞的动态 | NA | 探讨破骨细胞在关节炎骨侵蚀中的作用及其前体细胞的异质性 | 破骨细胞及其前体细胞在不同组织环境中的起源和特性 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、多光子显微镜活体成像 | NA | RNA序列、图像 | NA |
| 24012 | 2024-08-09 |
Interfacing Seurat with the R tidy universe
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab404
PMID:34028547
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研究论文 | 本文介绍了tidyseurat，一个轻量级的适配器，用于将Seurat对象与tidyverse生态系统接口，以便用户可以使用熟悉的语法进行单细胞RNA测序数据分析 | 开发了tidyseurat适配器，使得Seurat对象能够与tidyverse生态系统无缝对接，提高了数据操作和可视化的效率 | NA | 提供一个面向tidyverse的Seurat接口，以便数据科学社区的用户能够使用熟悉的语法进行操作 | Seurat对象与tidyverse生态系统的接口 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | NA |
| 24013 | 2024-08-09 |
Deep cross-omics cycle attention model for joint analysis of single-cell multi-omics data
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab403
PMID:34028557
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研究论文 | 本文提出了一种深度跨组学生命周期注意力（DCCA）模型，用于单细胞多组学数据的联合分析 | DCCA模型结合了变分自编码器（VAEs）和注意力转移技术，能够利用一种组学数据来微调为另一种组学数据训练的网络 | NA | 旨在解决单细胞多组学数据集成分析中由于稀疏性、异质性和维度差异带来的挑战 | 单细胞转录组学和表观组学数据 | 机器学习 | NA | 变分自编码器（VAEs） | 深度跨组学生命周期注意力（DCCA）模型 | 多组学数据 | 涉及模拟数据和来自不同平台的真实数据 |
| 24014 | 2024-08-09 |
Single cell and spatial transcriptomics in human tendon disease indicate dysregulated immune homeostasis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220256
PMID:34001518
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24015 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing profiling in a patient with discordant primary cutaneous B-cell and T-cell lymphoma reveals micromilieu-driven immune skewing
2021-11, The British journal of dermatology
DOI:10.1111/bjd.20512
PMID:34018188
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对一位同时患有皮肤B细胞和T细胞淋巴瘤的患者进行了分子特征分析 | 首次揭示了肿瘤微环境对免疫偏向的影响，并区分了不同类型淋巴瘤皮肤病变中的特定克隆群体 | NA | 提高复杂类型原发性皮肤淋巴瘤的诊断和分子特征分析 | 原发性皮肤B细胞和T细胞淋巴瘤 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 一位患者 |
| 24016 | 2024-08-09 |
Integrative analysis of the human brain mural cell transcriptome
2021-11, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X211013700
PMID:34027687
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研究论文 | 本文利用多个独立的人脑单细胞RNA测序数据集，构建了人脑壁细胞的转录组数据库，并分析了人鼠壁细胞转录组的物种差异、人脑周细胞的培养诱导去分化及人壁细胞的器官特异性 | 首次综合利用多个独立的人脑单细胞RNA测序数据集，详细分析了人脑壁细胞的分子特征，填补了该领域的知识空白 | NA | 深入了解人脑壁细胞的分子组成，为研究壁细胞功能提供资源，并促进动物模型与人类模型的比较评估 | 人脑壁细胞，包括周细胞和血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个独立的人脑样本 |
| 24017 | 2024-08-09 |
Characterization of the heterogeneity of endothelial cells in bleomycin-induced lung fibrosis using single-cell RNA sequencing
2021-11, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-021-09795-5
PMID:34028626
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了博莱霉素诱导的肺纤维化中内皮细胞的异质性 | 首次详细描述了肺纤维化中内皮细胞亚群的特征及其在病理过程中的作用 | 研究仅限于大鼠模型，可能与人类疾病存在差异 | 探讨内皮细胞亚群在肺纤维化发展中的作用 | 博莱霉素诱导的肺纤维化中的内皮细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大鼠模型中的内皮细胞亚群 |
| 24018 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome analysis identifies skin-specific T-cell responses in systemic sclerosis
2021-11, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220209
PMID:34031030
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别了系统性硬化症（SSc）患者皮肤中特定的T细胞反应 | 首次使用液滴法单细胞转录组分析SSc皮肤活检，揭示了患者特异性的T细胞异质性，并发现了与SSc皮肤疾病严重程度相关的功能通路中的新基因表达 | 研究样本量有限，仅包括27名活动性SSc患者和10名健康捐赠者的皮肤活检样本 | 旨在深入研究系统性硬化症患者受影响皮肤中的T细胞介导的免疫反应 | 系统性硬化症患者和健康个体的皮肤活检样本中的CD3+淋巴细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3729个CD3+淋巴细胞，包括867个来自正常皮肤和2862个来自SSc皮肤样本 |
| 24019 | 2024-08-09 |
Integrated pseudotime analysis of human pre-implantation embryo single-cell transcriptomes reveals the dynamics of lineage specification
2021-09-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.027
PMID:34004179
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据的伪时间分析，重建了早期小鼠和人类胚胎发育过程，并揭示了人类胚胎发育中谱系特化的动态变化 | 本研究首次通过伪时间分析揭示了人类胚胎发育中谱系特化的精确时间点，并识别了转录组特征和细胞命运标记 | NA | 理解人类胚胎植入前发育中的谱系特化过程，以改进辅助生殖技术和干细胞研究 | 人类胚胎植入前发育过程中的谱系特化 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 24020 | 2024-08-09 |
Category encoding method to select feature genes for the classification of bulk and single-cell RNA-seq data
2021-08-15, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.9015
PMID:34028849
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研究论文 | 本文提出了一种类别编码（CAEN）方法，用于选择特征基因以分类批量和单细胞RNA-seq数据 | CAEN方法通过使用每个类别中基因序列样本的排名进行类别编码，并考虑样本排名和新的类别排名的相关系数，选择最高基因相关系数作为特征基因 | NA | 改进批量和单细胞RNA-seq数据的分类性能并节省计算时间 | 批量和单细胞RNA-seq数据中的特征基因选择 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA |