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当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 2381 - 2400 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2381 2026-05-18
Integrative multi-omics analysis identifies a core ferroptosis signature and validates resveratrol as a novel inducer in pancreatic cancer
2026-May-16, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 通过整合多组学数据识别胰腺导管腺癌的铁死亡核心特征,并验证白藜芦醇作为新型铁死亡诱导剂的作用 首次通过整合转录组学、机器学习和单细胞转录组分析,系统识别胰腺癌铁死亡核心基因网络,并揭示白藜芦醇通过HIF-1/TGF-β信号通路和巨噬细胞串扰诱导铁死亡的机制 主要基于公开数据集和体外实验验证,缺乏大规模临床样本和体内动物模型的进一步确认 探索胰腺导管腺癌中铁死亡的调控机制,并评估白藜芦醇作为新型铁死亡诱导剂的治疗潜力 胰腺导管腺癌患者的转录组数据和肿瘤组织样本 数字病理学 胰腺癌 转录组测序, 单细胞转录组测序, 机器学习, 分子对接 LASSO回归, SVM-RFE, WGCNA 转录组数据, 单细胞转录组数据 整合GSE28735和GSE62452两个数据集,以及单细胞数据集GSE197177,具体样本数量未明确 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2382 2026-05-18
Whole genome methylation profiling of menstrual stem cells identifies novel biomarkers for endometriosis
2026-May-16, Communications medicine IF:5.4Q1
研究论文 通过月经干细胞全基因组甲基化测序,鉴定了子宫内膜异位症的新型生物标志物,并评估其诊断性能 首次利用月经血来源干细胞的DNA甲基化谱作为非侵入性诊断工具,结合机器学习模型实现高准确率分类,并整合单细胞RNA测序数据验证生物学相关性 样本量较小(42例),未提及外部独立验证队列,缺乏纵向随访数据验证早期诊断潜力 开发子宫内膜异位症的非侵入性诊断生物标志物,揭示疾病发病机制的表观遗传学基础 子宫内膜异位症患者和健康对照女性的月经血来源干细胞 机器学习 子宫内膜异位症 全基因组甲基化测序,单细胞RNA测序 机器学习模型(具体类型未指定) 甲基化序列数据,单细胞RNA表达数据 42例女性(19例子宫内膜异位症,23例对照) Illumina 全基因组甲基化测序,单细胞RNA测序 Illumina测序平台(具体产品未指明),单细胞RNA测序平台(未指明) NA
2383 2026-05-18
EPHB2 drives EMT-linked vasculogenic mimicry and cervical cancer progression via an ERK-ETV4 transcriptional program
2026-May-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 发现EPHB2通过ERK-ETV4转录程序驱动宫颈癌中EMT相关的血管生成拟态和癌症进展 首次阐明EPHB2在宫颈癌中通过ERK-ETV4信号轴协调EMT与血管生成拟态机制,并提出其作为侵袭性宫颈癌的生物标志物和治疗靶点 未明确EPHB2-ERK-ETV4模块在临床样本中的直接验证以及与其他信号通路的交叉调控 阐明EPHB2在宫颈癌血管生成拟态和上皮-间充质转化中的功能角色及分子机制 宫颈癌患者组织样本、HeLa细胞、SiHa细胞及异种移植小鼠模型 机器学习 宫颈癌 RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 实时定量PCR, Western blot, 功能获得和缺失实验 NA 转录组数据, 单细胞转录组数据, 临床病理数据 公共转录组队列GSE168244(肿瘤vs正常), GSE138080(癌前vs正常); TCGA-CESC队列; 单细胞RNA-seq数据GSE168652; 机构IHC队列 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina测序平台(通过公共数据来源) NA
2384 2026-05-18
A multi-omics dissection of INHBA+ CAF-mediated epithelial-mesenchymal transition and immune suppression in colorectal cancer
2026-May-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过对结直肠癌组织的单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了INHBA+癌症相关成纤维细胞在促进上皮-间充质转化和免疫抑制中的空间功能分工 首次通过高分辨率Xenium原位转录组学结合单细胞测序,揭示了两种空间隔离的INHBA+ CAF亚群(肌成纤维细胞CAF和炎症CAF)在结直肠癌中分别驱动EMT和免疫抑制的分工机制 未在摘要中明确说明局限性 阐明结直肠癌中特定CAF亚群的空间功能异质性及其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 结直肠癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞亚群 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, Xenium原位转录组学, 空间转录组学, 免疫组化 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 组织图像 结直肠癌组织样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Xenium 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序, 10x Xenium 原位分析平台用于高分辨率空间转录组学
2385 2026-05-18
NPC2 deficiency as a potential target drives malignancy and chemo-resistance in DLBCL
2026-May-16, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,发现NPC2在弥漫大B细胞淋巴瘤中低表达与不良预后和化疗耐药相关,并通过线粒体功能障碍和细胞运动增强促进肿瘤恶性进展 首次揭示NPC2通过调控线粒体功能和细胞运动性驱动弥漫大B细胞淋巴瘤的侵袭性和化疗耐药,并验证其作为潜在治疗靶点的价值 研究中未涉及NPC2的上游调控机制及下游关键信号通路的具体分子细节,且实验仅在两种细胞系和一种小鼠模型中验证 探索弥漫大B细胞淋巴瘤进展和化疗耐药的分子机制,寻找新的治疗靶点 弥漫大B细胞淋巴瘤患者样本数据、SU-DHL-4和SU-DHL-2细胞系、NOD-SCID小鼠移植瘤模型 机器学习 弥漫大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自公共数据库的弥漫大B细胞淋巴瘤单细胞RNA测序数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序
2386 2026-05-18
Inhibition of macrophage migration inhibitory factor attenuates bleomycin-induced murine pulmonary fibrosis via the MAPK pathway
2026-May-16, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和体内外实验,研究巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)通过CD74依赖的MAPK通路促进肺纤维化的分子机制 首次利用单细胞RNA测序揭示MIF-CD74是肺纤维化中巨噬细胞-成纤维细胞的主要通讯轴,并阐明MAPK通路是下游关键信号机制 未提及 探究MIF是否通过CD74受体激活特定下游通路,调控成纤维细胞增殖和基质产生,驱动肺纤维化 特发性肺纤维化患者、C57BL/6J小鼠、Mif基因敲除小鼠、巨噬细胞-成纤维细胞共培养体系 数字病理学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、ELISA、qRT-PCR、Western blotting NA 基因表达数据 特发性肺纤维化患者血清样本和小鼠肺组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2387 2026-05-18
The impact of hypoxia and glycolysis on liver fibrosis
2026-May-16, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 系统分析缺氧、糖酵解和乳酰化相关基因在肝纤维化中的作用,并探索潜在诊断标志物和药物重利用策略 首次系统鉴定了HGLRGs在肝纤维化中的差异表达,并整合单细胞转录组学验证,同时筛选出FDA批准药物作为潜在靶向治疗剂 未提及具体局限性,可能包括样本来源有限、缺乏体外或体内验证实验 阐明缺氧、糖酵解和乳酰化相关基因在肝纤维化进展中的功能及诊断价值 肝纤维化样本的转录组数据及单细胞转录组数据 机器学习 肝纤维化 RNA-seq NA 转录组数据 未明确说明样本数量 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2388 2026-05-18
Targeting CXCR6 suppresses granuloma formation and pulmonary fibrosis through inhibiting Th17 responses in sarcoidosis
2026-May-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究证实靶向CXCR6可抑制结节病中Th17反应,从而减少肉芽肿形成和肺纤维化 首次在结节病中揭示CXCR6+ CD4+ T细胞通过Th17/Th17.1表型驱动肉芽肿形成,并验证抗CXCR6单克隆抗体通过抑制mTORC1信号通路减轻肺纤维化的治疗潜力 未明确说明,但可从实验仅在小鼠模型中进行推断,缺乏人体临床试验验证 探究CXCR6在结节病发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 结节病患者病变组织样本及痤疮丙酸杆菌诱导的结节病样模型小鼠 数字病理学 结节病 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 基因表达数据、细胞表型数据 结节病患者病变组织及模型小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 使用10x Chromium平台进行单细胞RNA测序分析
2389 2026-05-18
Spatial Transcriptomics Reveals Location-Specific Tumor Cell Subtypes and Signaling within Multifocal Small Intestinal Neuroendocrine Tumors
2026-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 通过空间转录组学揭示多灶性小肠神经内分泌肿瘤中位置特异性的肿瘤细胞亚型和信号通路 首次通过空间转录组学揭示多灶性小肠神经内分泌肿瘤在不同解剖位置存在四种转录组学亚型及其独特的配体-受体相互作用网络 需要进一步的验证,样本量有限 表征多灶性小肠神经内分泌肿瘤中肿瘤细胞群在不同解剖部位的细胞表型并识别影响肿瘤发展的局部微环境因素 来自4例多灶性小肠神经内分泌肿瘤患者的72个组织微阵列核心,包括小肠各解剖层的肿瘤和非肿瘤组织以及区域转移部位 空间转录组学 小肠神经内分泌肿瘤 空间转录组学,免疫组织化学,免疫荧光 NA 空间转录组数据 4例患者,72个组织微阵列核心 NA 空间转录组学 NA NA
2390 2026-05-18
In vivo CRISPR screens identify CBX4 as an epigenetic regulator for cancer immunotherapy
2026-May-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过体内CRISPR筛选发现CBX4作为表观遗传调控因子在癌症免疫治疗中发挥作用 首次通过体内CRISPR筛选发现CBX4是免疫肿瘤微环境的关键负调控因子,并揭示其通过表观遗传沉默逆转录转座子调控免疫应答的机制 研究主要在动物模型中进行,对人类患者的直接适用性需进一步验证 探究表观遗传失调如何影响免疫逃逸和免疫检查点阻断治疗抵抗 小鼠肿瘤模型、接受新辅助抗PD-1治疗的肝癌患者 机器学习 肝癌 CRISPR/Cas9筛选,单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 小鼠肿瘤模型及肝癌患者样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序及空间转录组学分析
2391 2026-05-18
Functional targeting of PTTG1 in pericytes restores vascular integrity in diabetic retina
2026-May-15, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和功能研究,发现PTTG1基因在糖尿病视网膜病变周细胞中高表达,敲低该基因可恢复血管完整性 首次识别出PTTG1高表达的周细胞亚群在糖尿病视网膜中富集,并证实其作为代谢稳态调节因子可成为糖尿病微血管并发症的治疗靶点 摘要未提及研究局限性 探究糖尿病视网膜病变中周细胞功能障碍的分子机制及潜在治疗靶点 糖尿病与非糖尿病小鼠视网膜中的周细胞 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9、小干扰RNA、代谢组学、转录组学 NA 单细胞基因表达数据、代谢组数据 37982个细胞(来自糖尿病和非糖尿病小鼠视网膜) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2392 2026-05-18
Stable maintenance of MERVL-positive embryonic stem cells reveals sustained transcriptional programs and enhancer remodeling
2026-May-15, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 该研究展示了MERVL阳性胚胎干细胞的可稳定维持,揭示了持续的转录程序与增强子重塑 首次在体外实现MERVL阳性胚胎干细胞的稳定维持,揭示了其与常规胚胎干细胞不同的持续转录活性及增强子重塑机制 信息不足,无法确定 探究MERVL阳性胚胎干细胞的稳定维持机制及其转录与表观遗传特征 小鼠胚胎干细胞及其MERVL阳性亚群 机器学习, 数字病理学 NA 单细胞RNA测序, 表观基因组分析 机器学习模型 图像, 文本, 视频 涉及多个胚胎干细胞系(包括Red和Mosaic品系) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2393 2026-05-18
Cross-Platform Comparative Spatial Transcriptomics in High-Grade Serous Carcinoma
2026-May-15, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
研究论文 本研究直接比较GeoMx Digital Spatial Profiler与Visium Spatial Gene Expression两种空间转录组学平台在高浆液性癌中的转录组谱可重复性和生物学相关分子特征 首次在同一FFPE队列中直接比较两种空间转录组学平台的转录谱,并利用AI定义的与临床结局相关的肿瘤区域进行跨平台验证 NA 评估不同空间转录组学平台在高级别浆液性癌中转录组谱的再现性和生物学相关性 高级别浆液性癌(HGSC)FFPE样本中AI定义的肿瘤区域 数字病理学 卵巢癌 空间转录组学 NA 基因表达数据 16例FFPE HGSC样本 NanoString Technologies, 10x Genomics 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler, Visium Spatial Gene Expression GeoMx Digital Spatial Profiler与Visium Spatial Gene Expression用于FFPE HGSC样本的AI定义肿瘤区域分析
2394 2026-05-18
Inhibition of RGS1 ameliorates obesity-associated macrophage dysfunction and metaflammation through restoration of PINK1/Parkin-mediated mitophagy
2026-May-13, Molecular and cellular endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 抑制RGS1通过恢复PINK1/Parkin介导的线粒体自噬改善肥胖相关巨噬细胞功能障碍和代谢性炎症 首次揭示RGS1在肥胖条件下脂肪组织巨噬细胞中显著上调,并阐明其通过抑制PINK1/Parkin介导的线粒体自噬驱动巨噬细胞功能紊乱和代谢性炎症 文章未明确提及局限性 研究RGS1在肥胖相关巨噬细胞功能障碍和代谢性炎症中的作用机制 脂肪组织巨噬细胞(ATM)、RAW264.7细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMDM)、高脂饮食诱导的肥胖小鼠 机器学习、数字病理 肥胖相关代谢性炎症 单细胞RNA测序、转录组分析、免疫组化、免疫荧光、Western blot、qPCR、透射电镜、TMRE染色、活性氧检测、ATP检测、氧化磷酸化分析 NA 单细胞RNA测序数据、图像(组织切片、电镜图像) 整合公共人类和小鼠单细胞RNA测序数据;体内实验使用高脂饮食喂养的肥胖小鼠;体外实验使用RAW264.7细胞和BMDM NA 单细胞RNA测序、bulk转录组分析 NA NA
2395 2026-05-18
Age- and tissue-dependent diversity of human plasmacytoid dendritic cells uncovers a cycling subset dominant in early life and cancer
2026-May-12, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人类浆细胞样树突状细胞(pDC)在不同年龄和组织中的转录状态,发现了一个在早期生命和癌症中占主导的循环亚群 首次揭示了pDC在发育阶段和组织背景下的转录异质性,鉴定出以前未描述的循环pDC亚群,该亚群在胎儿和婴儿淋巴组织中丰富,随着年龄增长减少,但在骨髓中终身保留,并与母细胞性浆细胞样树突状细胞肿瘤相关 研究样本主要来自胎儿、婴儿和儿童,成人样本仅包括骨髓,缺乏全面的成人组织比较 探索发育阶段和组织背景如何塑造人类pDC的转录状态 来自血液、胸腺、淋巴结和扁桃体的pDC,跨越胎儿、婴儿和儿童阶段,以及成人的骨髓 单细胞转录组学 母细胞性浆细胞样树突状细胞肿瘤 RNA-seq NA 单细胞转录组数据 多个样本,涵盖血液、胸腺、淋巴结、扁桃体和骨髓,来自胎儿、婴儿、儿童和成人 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
2396 2026-05-18
The crosstalk between SPP1+ macrophages and follicular helper T cells promotes the immune disorder of Graves' disease
2026-May-12, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 利用单细胞和空间转录组学揭示SPP1+巨噬细胞与滤泡辅助T细胞的相互作用在Graves病免疫紊乱中的作用 首次在Graves病甲状腺组织中鉴定出SPP1+巨噬细胞亚群比例增加,并揭示其通过SPP1-CD44互作与CXCL13+ Tfh细胞相互作用,促进免疫微环境失调 未明确说明,但可能包括样本量有限、机制验证不足或临床转化尚需进一步研究 探讨Graves病中免疫细胞表型变化和空间基因表达模式,揭示疾病免疫紊乱机制 正常对照、Graves病患者和缓解期患者的甲状腺组织 数字病理学 Graves病(自身免疫性甲状腺疾病) 单细胞转录组学,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 包括对照个体、Graves病患者和缓解期患者的甲状腺组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学
2397 2026-05-18
Logistic regression for estimating functional effects with spatial transcriptomics
2026-May-05, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 提出一种名为WSP(扭曲S型泊松过程混合效应)模型,用于在空间转录组学数据中进行假设检验,评估因素对基因空间分布功能参数的影响 首个无需复杂预处理即可直接检验空间转录组学中基因空间分布功能参数影响因素的统计工具,采用基于似然的回归方法,减少人工预处理误差 该方法仅适用于已对齐到感兴趣轴的数据,对空间坐标的插值依赖可能引入偏差 开发一种实用且统计严谨的框架,用于量化和检验转录组数据中空间变异的影响因素 小鼠体感皮层的MERFISH数据和小鼠肝小叶的批量测序数据(含外推空间坐标) 机器学习 不适用 空间转录组学 扭曲S型泊松过程混合效应模型 基因表达数据(空间坐标) 未明确样本数量,涉及小鼠体感皮层MERFISH数据和小鼠肝小叶数据 NA 空间转录组学, MERFISH NA MERFISH技术用于小鼠体感皮层数据
2398 2026-05-18
scMarkerGene: an interpretable neural network framework for cell-type-specific marker gene discovery
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出scMarkerGene,一个可解释的神经网络框架,用于从单细胞转录组数据中发现细胞类型特异性标记基因 构建贡献分数矩阵将神经网络预测转化为基因级别的重要性信号,并通过下游特异性过滤稳健捕获细胞类型区分特征 依赖高质量的单细胞转录组数据,可能对极低表达基因的识别存在局限 开发一种高效、准确且可解释的方法来识别细胞类型特异性标记基因 单细胞转录组数据中的基因表达模式和细胞类型 机器学习 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 可解释神经网络 基因表达数据 跨多个物种的scRNA-seq数据集、空间转录组数据和离散伪时间数据 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
2399 2026-05-18
Pathogenic mechanism of extracranial arteriovenous malformations: insights from clinical, pathological, and genetic analyses
2026-May, Virchows Archiv : an international journal of pathology IF:3.4Q1
研究论文 通过对30例颅外动静脉畸形患者的临床、病理和遗传学分析,揭示了RAS/RAF/MAPK通路基因突变与疾病表型的关联,并利用空间转录组学阐明了异常小血管网络中基因表达的变化 首次系统描述了颅外AVMs中MAP2K1、KRAS和BRAF基因突变与临床病理特征的基因型-表型相关性,并利用空间转录组学技术揭示了MAP2K1突变AVMs中异常小血管的基因表达谱,发现MAP4K4作为潜在治疗靶点 样本量较小(仅30例患者),且为回顾性研究,缺乏功能验证实验来确认MAP4K4在AVM发病中的直接作用 阐明颅外动静脉畸形在基因突变背景下的发病机制,特别是异常小血管网络的作用 30例颅外动静脉畸形患者的临床、病理和遗传学数据,以及来自MAP2K1突变AVMs的空间转录组学数据 数字病理学 血管畸形疾病 空间转录组学、免疫组化、基因测序 NA 基因表达数据、病理图像、临床数据 30例颅外AVMs患者(14例MAP2K1突变,1例KRAS突变,1例BRAF突变) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于分析异常小血管的基因表达
2400 2026-05-18
Loop of N2-polarized neutrophils and exhausted CD8 + T cells induces immunotherapy resistance in NSCLC
2026-May, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 揭示N2极化中性粒细胞与耗竭CD8+ T细胞之间的正反馈环路导致非小细胞肺癌免疫治疗耐药 首次发现ICAM1-整合素和CCL5-CCR1轴驱动的N2中性粒细胞与耗竭CD8+ T细胞之间的正反馈环路,并基于此构建深度神经网络模型预测免疫治疗反应 未提及明显局限性 阐明N2极化中性粒细胞在非小细胞肺癌中的免疫抑制功能及其与CD8+ T细胞的相互作用机制,并开发基于这些相互作用的临床预后和免疫治疗反应预测模型 非小细胞肺癌患者肿瘤样本及黑色素瘤样本 machine learning lung cancer 单细胞RNA测序 深度神经网络 基因表达数据 多个独立队列,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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