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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2381 | 2026-03-06 |
Integrating computational engines to identify TSPAN6 as a migrasome-associated target for immunotherapy sensitization
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1782717
PMID:41782878
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研究论文 | 本研究通过整合计算引擎识别TSPAN6作为迁移体相关靶点,用于免疫治疗增敏 | 首次将迁移体与癌症免疫治疗抵抗联系起来,并利用大规模计算分析识别TSPAN6作为关键调控因子,同时通过药物筛选发现米托蒽醌作为潜在抑制剂 | 研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内实验验证;样本量相对有限,特别是血清验证队列仅44例患者 | 探索迁移体在癌症免疫治疗抵抗中的作用,并寻找相关治疗靶点 | 癌症患者样本(包括TCGA、ICGC、CPTAC队列数据)和体外共培养模型 | 计算生物学 | 癌症 | 空间转录组学、计算分析、药物筛选 | NA | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 5,957名患者(17种肿瘤类型)、超过440万个细胞、44例配对血清样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2382 | 2026-03-06 |
Inflammatory and neurotoxic risk of atorvastatin in diabetic peripheral neuropathy: TNF-centered evidence integrating network toxicology, scRNA-Seq, and cell validation
2026, Frontiers in chemistry
IF:3.8Q2
DOI:10.3389/fchem.2026.1739085
PMID:41783408
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟和体外实验,探讨了阿托伐他汀在糖尿病周围神经病变中的炎症和神经毒性风险,重点关注TNFα的作用 | 首次整合网络毒理学、单细胞RNA测序和体外验证,系统揭示阿托伐他汀在糖尿病周围神经病变中可能通过TNFα介导的炎症反应导致细胞损伤的机制 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内验证;TNFα与阿托伐他汀毒性之间的因果关系尚未通过阻断或敲除实验证实 | 阐明阿托伐他汀在糖尿病周围神经病变中争议性的神经保护与神经毒性作用,特别是其潜在的炎症和神经毒性风险 | 高糖诱导的RSC 96雪旺细胞 | 生物信息学与计算生物学 | 糖尿病周围神经病变 | 单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟、CCK-8、ELISA | NA | 基因表达数据、分子结构数据、细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2383 | 2026-03-06 |
Single-cell atlas reveals a pro-metastatic RELB+ neutrophil-myeloid subset underlying lymph node metastasis in EGFR-wildtype LUAD
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1766211
PMID:41783590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了EGFR野生型肺腺癌中驱动淋巴结转移的促转移性ELANE阳性中性粒细胞亚群及其关键转录调控因子RELB | 首次在EGFR野生型肺腺癌中鉴定出与淋巴结转移相关的促转移性ELANE阳性中性粒细胞亚群,并发现RELB作为其核心转录调控因子 | 研究主要基于回顾性数据分析,功能验证在体外共培养系统中进行,缺乏体内实验验证 | 阐明EGFR野生型肺腺癌淋巴结转移的细胞驱动因素和分子机制 | EGFR野生型肺腺癌患者样本中的髓系细胞,特别是中性粒细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qPCR,增殖、克隆形成、迁移和侵袭实验 | UCell算法,pySCENIC | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 多队列EGFR野生型肺腺癌患者样本,包括TCGA数据 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2384 | 2026-03-06 |
Encoding functional edges in graphs to model spatially varying relationships in the tumor microenvironment
2026, NPJ artificial intelligence
DOI:10.1038/s44387-026-00075-5
PMID:41783808
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SPIFEE的灵活图深度学习框架,用于建模肿瘤微环境并揭示跨多个生物组织层次的空间洞察 | 通过将空间变化的功能向量直接编码到图边中,增强了基于图的表示的表达能力,并实现了跨模态整合 | 当前方法缺乏灵活性,且为模态特异性,而SPIFEE虽具通用性,但未明确讨论其计算复杂度或可扩展性限制 | 开发一个灵活框架以全面表征肿瘤微环境,促进个性化癌症分析 | 肿瘤微环境中的细胞类型、表型簇和分子通路等实体 | 机器学习 | 癌症 | 图深度学习 | 图注意力网络 | 多模态数据(包括多路免疫荧光、H&E组织病理学和空间转录组学) | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2385 | 2026-03-06 |
Chronic alcohol consumption drives inflammaging and transposon derepression in hematopoietic stem and progenitor cells
2025-Dec-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.25.696246
PMID:41497601
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研究论文 | 本研究探讨了慢性酒精摄入如何通过单细胞转录组和表观基因组分析,揭示其在人类和小鼠造血干细胞祖细胞中引发炎症衰老和转座子去抑制的机制 | 首次在单细胞水平上结合RNA-seq和ATAC-seq,揭示了慢性酒精暴露导致造血干细胞祖细胞中炎症反应增强、转座子去抑制及年龄依赖性表观遗传失调 | 研究主要基于动物模型和异种移植实验,人类样本的直接验证有限,且长期酒精戒断后的恢复机制需进一步探究 | 探究慢性酒精摄入对造血干细胞祖细胞炎症衰老和表观遗传调控的影响 | 人类和小鼠的造血干细胞祖细胞 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 人类和小鼠造血干细胞祖细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2386 | 2026-03-06 |
Dual regulation of Atf3 and Lonp1 as therapeutic targets in cerebral ischaemia-reperfusion injury
2025-Dec-23, Stroke and vascular neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1136/svn-2024-003324
PMID:40044488
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子Atf3和线粒体蛋白酶Lonp1在脑缺血再灌注损伤中的调控作用及其对线粒体功能和神经元存活的影响 | 首次在单细胞水平揭示Atf3通过调控Lonp1表达影响线粒体功能的新机制,为脑缺血损伤提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于转录组和蛋白质组学分析,缺乏体内功能验证实验 | 阐明Atf3和Lonp1在脑缺血再灌注损伤中的分子调控机制 | 脑缺血再灌注损伤模型中的神经元 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2387 | 2026-03-06 |
MDA5-MAVS and interferon-lambda signaling in the intestinal epithelium limit murine astrovirus infection
2025-Dec-21, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.12.002
PMID:41435889
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠星状病毒(muAstV)在肠道上皮细胞中的感染特性,并阐明了MDA5-MAVS通路和干扰素-λ信号在限制病毒感染中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序详细描绘muAstV在多种肠道上皮细胞中的感染趋向性,并明确了MDA5-MAVS通路调控干扰素-λ诱导以控制病毒感染的机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果可能无法完全适用于人类星状病毒感染;且对MDA5-MAVS通路与干扰素-λ信号在肠道上皮细胞中的协同作用机制尚未完全阐明 | 探究小鼠星状病毒的感染机制及宿主先天免疫反应,特别是MDA5-MAVS通路和干扰素-λ信号在病毒控制中的作用 | 小鼠星状病毒(muAstV)及其在肠道上皮细胞(包括杯状细胞和多种肠上皮细胞)中的感染过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2388 | 2026-03-06 |
Multimodal mass spectrometry imaging for plaque- and region-specific neurolipidomics in Alzheimer's disease mouse models
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65956-w
PMID:41365882
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研究论文 | 本研究开发了一种多模态质谱成像框架,用于在阿尔茨海默病小鼠模型中绘制斑块和区域特异性的神经脂质组图谱 | 整合了MALDI-2质谱成像、离子淌度质谱和荧光显微镜的多模态成像框架,提高了检测灵敏度和空间化学分辨率,并建立了多模态图像配准与斑块相关脂质发现的计算流程 | 研究仅使用雌性小鼠模型,未涉及人类样本,且机制验证主要基于与现有空间转录组数据的关联分析 | 探究阿尔茨海默病中淀粉样斑块形成相关的脂质组学变化及其生化机制 | 雌性5xFAD和APP转基因阿尔茨海默病小鼠模型 | 质谱成像与神经科学 | 阿尔茨海默病 | 基质辅助激光解吸/电离后电离质谱成像、离子淌度质谱、荧光显微镜成像 | 多模态图像配准与数据分析流程 | 质谱成像数据、离子淌度数据、荧光图像数据 | 未明确说明样本数量,使用两种转基因小鼠模型 | NA | 质谱成像、空间转录组学 | NA | MALDI-2质谱成像系统与离子淌度质谱联用平台 |
| 2389 | 2026-03-06 |
α -Klotho Promotes Cell Death and Suppresses Inflammation through TNF-Cellular Inhibitor of Apoptosis Protein 1 Signaling in Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease
2025-Dec-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000940
PMID:41563399
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研究论文 | 本研究探讨了α-Klotho蛋白在常染色体显性多囊肾病中的作用机制,发现其通过TNF-细胞凋亡抑制蛋白1信号通路促进细胞死亡并抑制炎症 | 首次揭示了α-Klotho在ADPKD中通过干扰TNF信号通路促进细胞凋亡和抑制炎症的新机制,并利用单细胞RNA测序技术解析了细胞间通讯网络 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;机制研究集中在TNF-CIAP1通路,可能存在其他未被探索的调控途径 | 探究α-Klotho在常染色体显性多囊肾病中的功能和作用机制 | Pkd1突变小鼠肾脏细胞、转基因α-Klotho小鼠模型 | 单细胞组学 | 常染色体显性多囊肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Pkd1突变小鼠和Pkd1-HOMO-KLTg转基因小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2390 | 2026-03-06 |
Distinct senotypes in p16- and p21-positive cells across human and mouse aging tissues
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00601-2
PMID:41162753
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研究论文 | 本研究通过分析人类和小鼠衰老组织的单细胞RNA测序数据,揭示了p21和p16阳性细胞在衰老过程中的异质性及其与衰老相关分泌表型的关系 | 首次在体内系统比较了p21和p16阳性细胞的转录组差异,发现它们具有独立的轨迹动态且缺乏共表达,并识别出组织特异性的衰老相关分泌表型变异 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源为公共数据集,可能存在批次效应;未进行功能实验验证核心SASP因子的具体作用机制 | 阐明p21和p16在细胞衰老过程中的异质性作用及其与衰老相关分泌表型的关系 | 人类和小鼠多种衰老组织中的p21和p16阳性细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | RNA velocity分析、拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 多个公共单细胞RNA测序数据集(未明确具体样本数) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2391 | 2026-03-06 |
DTCFinder: a bench-to-bits toolkit for label-free, whole-spectrum analysis of disseminated and circulating tumor cells in liquid biopsies
2025-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.27.690914
PMID:41409151
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DTCFinder的无标记、全谱分析方法,用于液体活检中播散性和循环肿瘤细胞的检测与分子特征分析 | 整合高通量单细胞RNA测序与机器学习,实现无偏检测、深度分子表征和精确组织来源追踪,即使在外周血中肿瘤细胞极稀少且测序深度低的情况下也能工作 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 开发一种用于液体活检中播散性和循环肿瘤细胞检测与分析的稳健且多功能工具包,以提升癌症转移的理解 | 播散性肿瘤细胞和循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2392 | 2026-03-06 |
Mitochondrial iron transport via MFRN1 is required for erythroid cell cycle progression
2025-Nov-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014887
PMID:40601908
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研究论文 | 本研究开发了体内方法,探讨铁如何调节红细胞生成,并报告了通过mitoferrin-1(MFRN1)的线粒体铁运输对红细胞细胞周期进程至关重要 | 揭示了MFRN1介导的线粒体铁运输在红细胞细胞周期G2/M期进展中的关键作用,并通过铁补充实验验证了其机制 | 研究主要基于斑马鱼胚胎模型,可能需要在其他生物系统中进一步验证 | 探究铁代谢如何调节红细胞生成过程,特别是细胞周期和分化 | 斑马鱼胚胎中的红细胞(erythroid cells) | NA | NA | 单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing),荧光激活流式分选(fluorescence-activated flow sorting) | NA | RNA测序数据,流式细胞术数据 | 斑马鱼胚胎(包括野生型和mfrn1突变体),具体样本数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2393 | 2026-03-06 |
Polymer-based chemo-immunotherapy: Combining immunogenic cell death induction and PD-L1 blockade enhances antitumor immunity in melanoma
2025-Nov-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114193
PMID:40907793
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研究论文 | 本研究探讨了一种基于聚合物的化学免疫疗法策略,结合诱导免疫原性细胞死亡的药物与PD-L1阻断剂,以增强黑色素瘤的抗肿瘤免疫反应 | 开发了一种结合可诱导免疫原性细胞死亡的HPMA共聚物-表柔比星偶联物(KT-1)与多价HPMA共聚物-PD-L1肽拮抗剂(MPPA)的新型聚合物化学免疫疗法,并证明其优于传统免疫检查点抑制剂单药治疗,且安全性更高 | 研究主要在B16F10黑色素瘤模型中进行,尚未在更广泛的肿瘤类型或临床环境中验证 | 开发一种更安全有效的化学免疫疗法,以克服黑色素瘤对传统免疫检查点抑制剂治疗的抵抗 | 黑色素瘤(B16F10模型) | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2394 | 2026-03-06 |
TransST: transfer learning embedded spatial factor modeling of spatial transcriptomics data
2025-Nov-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06099-z
PMID:41199193
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研究论文 | 本文提出了一种名为TransST的新型迁移学习框架,用于从空间转录组学数据中推断细胞水平的异质性 | TransST通过自适应地利用外部来源的细胞标记信息,提高了空间转录组学数据中细胞亚群识别和生物标志物检测的准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种迁移学习框架,以克服空间转录组学技术中分辨率和测序深度的限制,从而更可靠地提取生物信号 | 空间转录组学数据,特别是乳腺癌研究中的细胞亚群 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 迁移学习框架 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2395 | 2026-03-06 |
High-resolution spatial mapping of cell state and lineage dynamics in vivo with PEtracer
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx3800
PMID:40705858
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研究论文 | 本文介绍了一种基于prime editing的进化谱系追踪技术PEtracer,用于高分辨率空间映射细胞状态和谱系动态 | 开发了PEtracer技术,结合单细胞测序和多模态成像,能在组织中高分辨率同时分析细胞状态和谱系 | NA | 研究发育和疾病中细胞命运决定的时空动态 | 小鼠肿瘤转移模型中的细胞 | 数字病理学 | 肿瘤转移 | prime editing, MERFISH空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据, 成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2396 | 2026-03-06 |
Endothelial type I interferon signaling modulates the vascular response to ischemic brain injury
2025-Oct-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.09.675258
PMID:41000728
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞I型干扰素信号在调节缺血性脑损伤后血管正常化中的关键作用 | 首次在人和小鼠缺血性卒中组织中鉴定出独特的脑内皮细胞I型干扰素特征,并证明内皮IFN1信号通过调节VEGF信号促进血管正常化 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且具体分子机制细节有待进一步阐明 | 探究免疫和发育信号通路如何协调缺血性卒中后的血管正常化过程 | 人类和小鼠的缺血性脑卒中组织、脑内皮细胞 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、BBB功能测定 | NA | 转录组数据、功能实验数据 | 未明确指定具体样本数量,涉及人类和小鼠缺血性卒中组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2397 | 2026-03-06 |
Human airway epithelial B-cell activating factor is reduced in early life but is virally induced via JAK/STAT
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.04.034
PMID:40409377
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研究论文 | 本研究探讨了人类气道B细胞在生命早期的发育动态,以及气道上皮细胞(AECs)产生的B细胞活化因子(BAFF)在病毒感染下的诱导机制 | 首次揭示了人类婴儿气道上皮细胞中BAFF的产生受I型和III型干扰素通过JAK/STAT信号通路诱导,并阐明了该机制在病毒感染时对气道B细胞早期成熟的关键作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据分析,体内验证样本可能有限,且未详细探讨不同病毒类型对BAFF诱导的差异性影响 | 探究人类气道B细胞在生命早期的发育动态及其与气道上皮细胞的相互作用,特别是病毒感染如何影响B细胞生存和成熟因子的产生 | 人类气道B细胞和气道上皮细胞(AECs),重点关注婴儿(<12个月)和较大儿童 | 单细胞组学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),PCR,体外病毒刺激实验 | NA | 单细胞转录组数据,体外细胞培养数据,临床样本数据 | 涉及多个儿科年龄组的气道样本,具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2398 | 2026-03-06 |
Single-Cell Transcriptome Patterns of Transposable Elements in Alzheimer's Disease
2025-Oct, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05140-9
PMID:40537665
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研究论文 | 本研究通过分析阿尔茨海默病患者前额叶皮质的单核RNA测序数据,揭示了不同脑细胞类型中转座子转录本的特异性表达模式及其与疾病病理的关联 | 首次在单细胞/单核分辨率下系统描述了阿尔茨海默病大脑中不同细胞类型的转座子转录本动态变化,并发现反转录转座子转录本在兴奋性神经元中随病理进展增加最显著 | 研究主要基于前额叶皮质样本,未涵盖其他脑区;单核RNA测序可能无法完全捕获细胞质中的转座子转录本 | 探究阿尔茨海默病大脑中不同细胞类型转座子转录本的特异性表达模式及其与疾病病理的关联 | 阿尔茨海默病患者前额叶皮质的单核RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序,bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 143,951个细胞 | NA | 单核RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2399 | 2026-03-06 |
The pericardium forms as a distinct structure during heart formation
2025-Sep-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63599-5
PMID:41022776
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研究论文 | 本研究揭示了心包在心脏形成过程中作为一个独立结构起源于侧板中胚层中的特定间皮祖细胞 | 发现心包起源于侧板中胚层中与经典心区不同的特定间皮祖细胞,并证明其形成过程独立于心脏形成 | NA | 探究心包的发育起源及其在心脏形态发生中的作用 | 斑马鱼、哺乳动物和新生大鼠的心包发育过程 | 发育生物学 | 小儿扩张型心肌病 | 单细胞转录组学、光片成像、机器学习支持的细胞追踪 | 机器学习 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2400 | 2026-03-06 |
A Novel Proteoglycan-4 Isoform Drives Skeletal Regeneration
2025-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.15.676417
PMID:41001003
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研究论文 | 本文通过小鼠胫骨骨折模型,揭示了PRG4蛋白在骨骼再生中的新作用,特别是其独特剪接异构体在骨形成中的关键功能 | 发现了PRG4的一个新型剪接异构体(缺失三个编码外显子),并首次证明其在骨骼再生中具有成骨作用,突破了PRG4仅作为关节软骨润滑蛋白的传统认知 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证;局部siRNA递送可能影响其他细胞过程 | 探究PRG4在骨骼再生过程中的功能及其剪接异构体的作用 | 小鼠胫骨骨折模型及骨折骨痂组织 | 数字病理学 | 骨骼疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, siRNA敲低 | NA | RNA序列数据 | 多个骨折后时间点的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |