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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2381 - 2400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2381 | 2025-10-06 |
Beyond binary: bridging neutrophil diversity to new therapeutic approaches in NSCLC
2024-05, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2024.01.010
PMID:38360439
|
综述 | 本文总结了非小细胞肺癌中肿瘤相关中性粒细胞的异质性研究，并提出超越传统N1/N2二分法的新分类框架 | 通过整合不同癌症实体的转录组数据，建立了具有明确表型特征的中性粒细胞亚群分类体系，突破了传统的二元分类模式 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证，分类体系需要进一步实验确认 | 探索中性粒细胞在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的异质性及其治疗应用潜力 | 肿瘤相关中性粒细胞(TANs) | 单细胞生物学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2382 | 2025-10-06 |
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
2024-Apr-24, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07221-6
PMID:38658747
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研究论文 | 通过BARseq高通量原位测序技术研究小鼠大脑皮层神经元转录组特征与区域身份的关系 | 首次使用BARseq技术在全皮层范围进行原位测序，揭示了输入依赖性皮层区域身份的形成机制 | 研究仅针对小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索大脑皮层空间组织是否反映在神经元转录组特征中及其发育机制 | 小鼠前脑皮层神经元 | 神经科学 | NA | 原位测序，BARseq技术 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 1030万细胞，包括4,194,658个皮层神经元，覆盖9个小鼠前脑半球 | NA | 原位测序 | BARseq | 高通量原位测序技术，能够以细胞分辨率检测104种细胞类型标记基因的表达 |
| 2383 | 2025-10-06 |
Respiratory viral infection promotes the awakening and outgrowth of dormant metastatic breast cancer cells in lungs
2024-Apr-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4210090/v1
PMID:38645169
|
研究论文 | 本研究揭示呼吸道病毒感染通过IL-6依赖机制唤醒肺内休眠乳腺癌细胞并促进转移灶形成 | 首次证实呼吸道病毒可通过改变肿瘤微环境唤醒休眠癌细胞，并发现CD4 T细胞在维持转移负荷中的新作用 | 主要基于小鼠模型，人类观察数据仅为相关性证据 | 探究呼吸道病毒感染对休眠乳腺癌细胞激活和转移的影响机制 | 小鼠模型中的休眠乳腺癌细胞和人类癌症幸存者 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床观察数据 | 小鼠实验模型及人类癌症幸存者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2384 | 2025-10-06 |
AMPK signaling inhibits the differentiation of myofibroblasts: impact on age-related tissue fibrosis and degeneration
2024-02, Biogerontology
IF:4.4Q1
DOI:10.1007/s10522-023-10072-9
PMID:37917219
|
研究论文 | 本文探讨AMPK信号通路通过抑制肌成纤维细胞分化对年龄相关组织纤维化和退化的影响 | 揭示了AMPK信号通路作为肌成纤维细胞分化的有效抑制剂，并阐明其通过抑制TGF-β、NF-κB、STAT3和YAP/TAZ等信号通路发挥作用 | NA | 研究AMPK信号通路在年龄相关组织纤维化和退化中的作用机制 | 组织成纤维细胞、肌成纤维细胞及间充质细胞和髓系细胞 | 细胞生物学 | 年龄相关疾病 | 单细胞转录组研究 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2385 | 2025-10-06 |
BIOINFORMATICS APPLICATIONS UNDER CONDITION CONTROL: HIGH DIAGNOSTIC VALUE OF DDX47 IN REAL MEDICAL SETTINGS
2024-01-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002199
PMID:37553903
|
研究论文 | 本研究提出基于真实医疗场景的条件控制方法，发现DDX47基因在脓毒症诊断中具有重要价值 | 开发了基于真实医疗场景的条件控制方法，通过逐步放宽限制识别独特的差异基因 | 研究仅包含三个数据集，样本量有限，且缺乏标准诊断金标准 | 探索基因表达谱在脓毒症诊断中的应用价值 | 脓毒症和脓毒性休克患者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基因表达谱分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 三个数据集，包括GEO数据库数据和华西医院2020-2021年ICU患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2386 | 2025-10-06 |
SINGLE-CELL TRANSCRIPTOME ANALYSIS IN HEALTH AND DISEASE
2024-01-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002274
PMID:37962963
|
综述 | 本文概述了单细胞转录组分析在健康和疾病研究中的应用现状 | 全面总结了单细胞转录组分析的技术优势、平台多样性和计算分析方法的发展 | 未涉及具体实验数据或案例研究，仅为方法论概述 | 探讨单细胞转录组分析在揭示健康和疾病状态下组织细胞多样性与复杂性的应用 | 各类生物组织中的单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2387 | 2025-10-06 |
CONSTRUCTION OF SEPSIS DIAGNOSTIC MODELS AND IDENTIFICATION OF MACROPHAGE SUBPOPULATIONS BASED ON PYROPTOSIS-RELATED GENES
2023-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002137
PMID:37179249
|
研究论文 | 基于焦亡相关基因构建脓毒症诊断模型并鉴定巨噬细胞亚群 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据系统分析焦亡相关基因在脓毒症中的作用，并鉴定出与不良预后相关的gasdermin D巨噬细胞亚群 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 研究焦亡在脓毒症中的潜在预后和诊断价值 | 脓毒症患者基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 逻辑回归, LASSO回归, 共识聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2388 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing on PBMCs from patients with HA and HB with inhibitors reveals different immune responses to FVIII and FIX
2025-Aug-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025015799
PMID:40402102
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析血友病A和血友病B伴抑制剂患者外周血单个核细胞的免疫应答差异 | 首次在单细胞水平比较血友病A和血友病B伴抑制剂患者对FVIII和FIX的不同免疫应答机制 | 样本量较小（各5例患者），需更大样本验证 | 探索血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫应答机制 | 血友病A和血友病B伴抑制剂患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 血友病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例HA患者和5例HB患者，共75,051个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2389 | 2025-10-06 |
DARLIN mouse for in vivo lineage tracing at high efficiency and clonal diversity
2025-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01141-z
PMID:40119004
|
研究论文 | 介绍DARLIN小鼠模型用于高效谱系追踪的逐步实验方案 | 整合三个条形码阵列并结合Cas9和TdT提高编辑多样性，理论上可产生10^10个独特谱系条形码 | 需要熟悉测序文库构建和Linux操作，单细胞分析中条形码回收率约70% | 开发高效谱系追踪技术研究组织发育和稳态中的细胞历史与动力学 | 小鼠模型中的细胞谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，bulk测序，CRISPR-Cas9编辑 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2390 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Aging-Related Impairment of Microglial Efferocytosis Contributing to Apoptotic Cells Accumulation After Retinal Injury
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70097
PMID:40374315
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示衰老导致小胶质细胞清除凋亡细胞功能受损，造成视网膜损伤后凋亡细胞积累 | 首次在单细胞水平系统揭示衰老通过影响小胶质细胞清除凋亡细胞功能导致视网膜损伤后凋亡细胞积累的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类视网膜衰老的验证尚需进一步研究 | 阐明衰老对视网膜小胶质细胞清除凋亡细胞功能的影响及其机制 | 年轻和老年小鼠视网膜细胞，BV2小胶质细胞系 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 74,412个视网膜细胞来自年轻和老年小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2391 | 2025-10-06 |
Circadian Gene BMAL1 Regulation of Cellular Senescence in Thyroid Aging
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70119
PMID:40434135
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了昼夜节律基因BMAL1通过调控NFKBIA表达影响甲状腺细胞衰老的机制 | 首次发现昼夜节律核心基因BMAL1在甲状腺衰老过程中的关键作用及其通过NF-κB通路调控细胞衰老的新机制 | 研究样本量有限，机制研究主要基于动物模型和细胞系实验，在人体中的直接验证不足 | 探究甲状腺衰老的分子机制及昼夜节律基因在其中的作用 | 人类甲状腺组织、甲状腺特异性Bmal1敲除小鼠模型、甲状腺细胞系 | 单细胞生物学 | 甲状腺疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 基因敲除 | 动物模型, 细胞系模型 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 年轻、中年和老年组的人类甲状腺样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2392 | 2025-10-06 |
Cross-Analysis of Single-Cell Transcriptomic Datasets Reveals Conserved Neurogenic Gene Signatures and New Insights Into Neural Stem Cell Aging
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70106
PMID:40464165
|
研究论文 | 通过跨分析单细胞转录组数据集揭示神经干细胞保守的神经源性基因特征及其在衰老过程中的变化 | 识别了神经干细胞中保守的基因表达谱，提出了新的标记物作为标准化参考，并利用伪时间推断分析揭示神经干细胞的时间动态 | 依赖公开可用的单细胞RNA测序数据集，可能存在数据质量和注释不一致的问题 | 解决神经干细胞分子分类和功能研究中的挑战，优化其分类框架 | 海马体成人神经干细胞 | 单细胞转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间推断分析 | 单细胞转录组数据 | 多个公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2393 | 2025-10-06 |
Linking single-cell transcriptomes with secretion using SEC-seq
2025-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01112-w
PMID:39979460
|
研究论文 | 开发了一种名为SEC-seq的新方法，能够将单个细胞的转录组与其分泌蛋白量关联起来 | 首次实现了在单细胞水平上同时测量转录组和分泌蛋白量的技术，通过纳米孔技术和寡核苷酸条形码标记系统 | 需要特定的纳米孔技术和设备，可能对某些实验室来说设备要求较高 | 研究细胞分泌表型与基因表达状态之间的关联 | T细胞、间充质基质细胞、浆细胞等分泌型细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，微流控技术 | NA | 单细胞转录组数据，分泌蛋白定量数据 | 数千个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微流控油包水乳液系统 |
| 2394 | 2025-10-06 |
Integration of lipidomics with targeted, single cell, and spatial transcriptomics defines an unresolved pro-inflammatory state in colon cancer
2025-Mar-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332535
PMID:39658263
|
研究论文 | 本研究通过整合脂质组学与靶向、单细胞和空间转录组学，揭示了结肠癌中存在未解决的促炎症状态 | 首次将脂质组学与多种转录组学技术整合，系统揭示了结肠癌中脂质类别转换缺陷导致的促炎症状态持续存在 | 样本量相对有限（40例非靶向分析，81例靶向分析），需要更大规模研究验证 | 探索结直肠癌中脂质失调是否由炎症消退失败驱动 | 人类结直肠癌组织和正常配对样本 | 多组学整合分析 | 结直肠癌 | 液相色谱串联质谱(LC-MS/MS), 定量逆转录PCR, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 脂质组数据, 基因表达数据, 空间转录组数据 | 40对（非靶向分析）和81对（靶向分析）人结直肠癌与正常配对样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 2395 | 2025-10-06 |
TRain: T-cell receptor automated immunoinformatics
2025-Mar-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06074-8
PMID:40050726
|
研究论文 | 开发了一个名为TRain的自动化生物信息学工具，用于简化从T细胞受体序列到三维TCR-pMHC复合物结构预测的流程 | 首次提供了一个整合的自动化流程，将单细胞测序数据转换为完整的TCR氨基酸序列，并自动化进行TCR结构建模和与pMHC的对接预测 | 依赖于现有的TCR特异性建模流程和RosettaDock工具，可能受限于这些工具的准确性和局限性 | 开发自动化工具简化TCR-pMHC复合物结构预测流程 | T细胞受体和肽-MHC复合物 | 生物信息学 | 免疫相关疾病 | 单细胞测序，蛋白质结构建模，分子对接 | RosettaDock | 序列数据，结构数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2396 | 2025-10-06 |
β-Catenin mediated TAM phenotype promotes pancreatic cancer metastasis via the OSM/STAT3/LOXL2 axis
2025-02, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101096
PMID:39740539
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研究论文 | 本研究揭示了β-连环蛋白通过调控肿瘤相关巨噬细胞表型促进胰腺癌转移的新机制 | 首次发现β-连环蛋白信号在TAM中特异性激活，并鉴定出β-连环蛋白/OSM-STAT3/LOXL2信号轴在TAM诱导的胰腺癌进展中的关键作用 | 研究主要基于细胞系和动物模型，需要进一步在临床样本中验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞促进胰腺导管腺癌进展的分子机制 | 胰腺导管腺癌细胞、THP-1来源的巨噬细胞、Panc02肺转移模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外共培养, 体内转移模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2397 | 2025-10-06 |
Experimental and Computational Methods for Allelic Imbalance Analysis from Single-Nucleus RNA-seq Data
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607784
PMID:39185246
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研究论文 | 本文开发了一套用于单细胞和单核RNA测序数据的等位基因特异性表达分析的实验与计算方法 | 发现单核RNA测序中内含子区域读长更适合等位基因失衡分析，并开发了新的计算工具套件 | NA | 改进单细胞水平等位基因特异性表达分析的方法 | 单细胞RNA测序和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 等位基因特异性表达分析 | NA | RNA测序数据 | 94名帕金森病患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 2398 | 2025-10-06 |
Tcf21 as a founder transcription factor in specifying Foxd1 cells to the juxtaglomerular cell lineage
2025-Jan-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00235.2024
PMID:39589156
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Tcf21在Foxd1阳性基质祖细胞向肾小球旁细胞谱系分化过程中的关键作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析，揭示了Tcf21在肾脏发育早期阶段对Foxd1细胞向肾小球旁细胞分化的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾脏发育中的类似机制仍需进一步验证 | 探究Tcf21转录因子在Foxd1阳性基质祖细胞向肾小球旁细胞分化过程中的作用机制 | 小鼠肾脏Foxd1阳性基质祖细胞和肾小球旁细胞 | 发育生物学 | 肾脏发育疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫染色, 原位杂交 | 小鼠基因敲除模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 组织图像数据 | 2,054个细胞（来自E12、E18、P5和P30时间点的GFP阳性基质谱系细胞） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 2399 | 2025-10-06 |
Spatial proteomics and transcriptomics characterization of tissue and multiple cancer types including decalcified marrow
2025-Jan, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/18758592241308757
PMID:40109220
|
研究论文 | 本研究优化了空间生物学技术的前处理方法，开发了适用于多种肿瘤类型和脱钙骨髓样本的空间蛋白质组学和转录组学分析方案 | 开发了分子和蛋白质友好的脱钙方案，建立了系统性的组织质量评估方法，实现了空间蛋白质组学和转录组学平台的相互验证 | 未明确说明样本规模和具体的统计验证方法 | 优化空间生物学技术的前处理方法，解决不同组织和肿瘤类型的技术挑战 | 多癌种组织微阵列和脱钙处理的骨髓核心样本 | 空间生物学 | 多癌种 | 空间蛋白质组学, 空间转录组学, 高重免疫组织化学 | 单细胞分析 | 空间蛋白质表达数据, 空间转录组数据 | 多癌种组织微阵列和骨髓核心样本 | 10x Genomics, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞分析 | Xenium, PhenoCycler-Fusion | Xenium空间转录组学平台, PhenoCycler-Fusion高重空间蛋白质组学平台 |
| 2400 | 2025-10-06 |
Proximity sequencing for the detection of mRNA, extracellular proteins and extracellular protein complexes in single cells
2024-12, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01030-x
PMID:39147984
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研究论文 | 介绍一种能够同时检测单细胞中mRNA、细胞外蛋白和细胞外蛋白复合物的邻近测序方法 | 首次实现单细胞水平上同时测量蛋白质、mRNA和数百种位于细胞外膜的蛋白复合物 | 需要基本的分子生物学和单细胞测序专业知识，实验过程需要数天时间完成 | 开发能够同时检测单细胞中多种生物分子的测序方法 | 单细胞中的mRNA、细胞外蛋白和细胞外蛋白复合物 | 单细胞测序 | NA | 邻近测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |