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当前共找到 38358 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-04-13 |
A benchmark of semi-supervised scRNA-seq integration methods in real-world scenarios
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014008
PMID:41838767
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研究论文 | 本文系统性地比较了半监督与无监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景下的性能 | 首次在真实条件下系统性地基准测试半监督单细胞RNA-seq整合方法，并考虑了多种不完美标签场景 | 研究仅基于六个数据集，且半监督方法在标签质量不确定时优势有限 | 评估半监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景中的性能和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据整合方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | scANVI, ssSTACAS | 单细胞RNA-seq数据 | 六个多样化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 222 | 2026-04-13 |
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69747-9
PMID:41764198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了剖宫产切口愈合不良（niche）的细胞微环境，揭示了LRP1缺陷在成纤维细胞中的作用及其与细胞外基质合成减少的关联 | 首次在单细胞水平上剖析了剖宫产切口愈合不良的微环境，并确定了LRP1缺陷在成纤维细胞中的关键作用，以及CTGF-LRP1轴通过ERK和WNT信号通路影响愈合的机制 | 研究样本量相对有限，且主要基于观察性数据和动物模型，需要进一步临床验证 | 探究剖宫产切口愈合不良（niche）的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 剖宫产切口愈合不良（niche）组织、邻近子宫肌层组织以及愈合良好的剖宫产瘢痕组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 135,793个单细胞（来自48,587个邻近组织细胞、47,653个对照组细胞和39,553个niche组织细胞），以及60个组织样本（30个非愈合组和30个愈合组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 223 | 2026-04-13 |
BrainConnect: processing brain connectivity and spatial transcriptomics data for integrative analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag120
PMID:41808453
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研究论文 | 开发了一个名为BrainConnect的软件，用于处理小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据，以进行整合分析并预测连接强度 | 首次提出一个方法，将不同类型的大脑连接数据与空间转录组学数据在一致的大脑区域格式下处理，利用LSTM网络从空间转录组学预测连接强度，并识别潜在的重要基因 | 方法目前仅应用于小鼠大脑数据，未在其他物种或更广泛的数据集上验证 | 整合大脑连接数据和空间转录组学数据，以预测和理解大脑连接性及其分子基础 | 小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | LSTM | 空间转录组学数据和大脑连接数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 224 | 2026-04-13 |
A tumor-promoting inflammatory SPP1+ macrophage-IL-6-CRP axis drives immune dysfunction in bladder cancer
2026-Feb-27, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1774
PMID:41747249
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研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌中SPP1+巨噬细胞通过IL-6-CRP轴驱动免疫功能障碍的机制 | 首次将系统性炎症标志物（血浆IL-6和CRP）与肿瘤微环境中SPP1+巨噬细胞的免疫抑制功能联系起来，并定义了与免疫检查点阻断耐药相关的巨噬细胞驱动轴 | 未明确说明样本的具体数量或来源细节，且机制研究可能需进一步体内验证 | 探究膀胱癌中炎症如何通过巨噬细胞介导免疫功能障碍和免疫治疗耐药 | 膀胱癌（尿路上皮癌）患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 单细胞组学与空间转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，空间分析 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | 多个免疫检查点阻断治疗队列的患者样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 225 | 2026-04-13 |
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70090-2
PMID:41760664
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CellRefiner的物理模型方法，通过整合单细胞数据集与配对的空间数据集，在空间数据中重建单细胞分辨率 | CellRefiner创新性地将细胞建模为通过力连接的粒子，并利用空间邻近约束、基因表达相似性和细胞间配体-受体相互作用来优化细胞位置，从而从非单细胞分辨率空间数据中恢复单细胞分辨率 | NA | 开发一种方法以从空间转录组数据中重建单细胞分辨率，以支持需要个体细胞分辨率和空间信息的下游分析 | 空间转录组数据，包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集，以及小鼠皮层和淋巴结组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 物理模型 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多种模拟和真实数据集，包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集，以及小鼠皮层和淋巴结组织 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组平台，用于生成空间数据集 |
| 226 | 2026-04-13 |
HDAC1 modulates sepsis-induced immunosuppression by driving the exhaustion of CD8+ T cells
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197224
PMID:41729078
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白去乙酰化酶1（HDAC1）在脓毒症诱导的CD8+ T细胞耗竭中的作用，揭示了其作为免疫抑制关键驱动因子的分子机制 | 首次阐明HDAC1通过调控AP-1与NFAT的平衡，直接促进NFAT1核转位，从而驱动CD8+ T细胞耗竭的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证相对有限，且HDAC1抑制剂的长期安全性未充分评估 | 探究脓毒症诱导免疫抑制的分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 脓毒症患者外周血淋巴细胞、小鼠脓毒症模型中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞过继转移、体外抑制实验 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 脓毒症患者临床样本、小鼠脓毒症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2026-04-13 |
A bone-derived hormone permits rapid visual escape via GPR37 receptor in a subpopulation of VTA GABAergic neurons
2026-Feb-11, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.12.048
PMID:41679312
|
研究论文 | 本研究揭示了骨源性激素骨钙素通过GPR37受体调控VTA GABA能神经元亚群的兴奋性，从而促进快速视觉逃避行为的机制 | 首次发现骨源性激素骨钙素通过GPR37-cAMP-THIK-1信号通路调控中脑腹侧被盖区GABA能神经元兴奋性，为骨-脑代谢轴调控生存行为提供了新机制 | NA | 探究快速视觉逃避行为的神经调控机制 | 小鼠中脑腹侧被盖区GABA能和谷氨酸能神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、电生理学 | NA | 转录组数据、电生理记录 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 228 | 2026-04-13 |
Thymic myeloid cells are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250733
PMID:41123595
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和谱系定义小鼠模型，揭示了胸腺髓系细胞的异质性，并鉴定了一个新的过渡性树突状细胞群体 | 识别了胸腺髓系细胞的九个主要群体，澄清了传统DC2实际上由四个不同谱系组成，并发现了一种新的CX3CR1+过渡性树突状细胞 | NA | 解析胸腺髓系细胞的精确起源、发育和稳态，特别是DC2亚群 | 小鼠胸腺髓系细胞，包括树突状细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学 | 谱系定义小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2026-04-13 |
Utilising Machine Learning and Single-Cell Analysis to Uncover SKCM Metastasis-Related Genes
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70061
PMID:41961982
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习，揭示了皮肤黑色素瘤转移相关的核心基因及其调控机制 | 创新性地构建了结合粒子群优化算法和支持向量机的二元分类模型（PSO-SVM），用于准确预测肿瘤转移，并整合单细胞与转录组数据进行多维度分析 | 未明确说明样本的具体数量及来源，模型在其他癌症中的泛化能力有待进一步验证 | 阐明皮肤黑色素瘤（SKCM）转移的核心分子机制，寻找早期诊断和靶向治疗的潜在生物标志物 | 转移性皮肤黑色素瘤与原发性肿瘤细胞 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | PSO-SVM（粒子群优化-支持向量机） | 单细胞RNA测序数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 230 | 2026-04-13 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09653-0
PMID:41125888
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转换和宿主-寄生虫相互作用 | 首次结合单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术，系统解析了疟原虫在按蚊中肠内的发育过程，并发现了PfSIP2转录因子在子孢子感染人肝细胞中的关键作用 | 研究主要基于实验室模型，尽管验证了野外来源的寄生虫，但实际自然环境中的复杂性可能未被完全覆盖 | 探究疟原虫在按蚊中肠内的发育机制和宿主-寄生虫相互作用，以寻找阻断传播的策略 | 恶性疟原虫和按蚊中肠细胞 | 单细胞组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫和蚊子细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 231 | 2026-04-13 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了健康成年人中年龄相关的免疫动态变化 | 首次结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术，纵向追踪96名成年人两年内的季节性流感疫苗接种反应，构建了包含超过1600万个外周血单个核细胞的单细胞RNA测序数据集，并识别了71种免疫细胞亚群 | 研究样本仅包括健康成年人，未涵盖儿童或患有特定免疫疾病的人群，且纵向追踪时间相对较短（2年） | 探究年龄如何影响免疫系统的生成和维持，以及慢性病毒感染和疫苗接种对免疫细胞组成和状态的调节作用 | 超过300名25至90岁的健康成年人，其中96人进行了为期两年的纵向追踪 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 超过300名健康成年人，包括96名纵向追踪个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 232 | 2026-04-13 |
Keratin 15 Regulates Cell Proliferation in Outer Enamel Epithelium
2025-Oct-16, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251368346
PMID:41103018
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小鼠牙胚发育中外釉上皮（OEE）的基因表达谱和功能，发现角蛋白15（Krt15）作为OEE特异性标记基因，并探讨了其在调控牙上皮细胞增殖和p38 MAPK通路中的作用 | 首次将Krt15鉴定为牙上皮中OEE的特异性标记基因，并揭示了Krt15通过抑制p38 MAPK通路调控牙上皮细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞系，尚未在人类牙胚中进行验证，且对Krt15调控的具体信号通路细节仍需进一步探索 | 探究外釉上皮（OEE）在牙齿发育中的功能角色和分子机制 | 小鼠牙胚（出生后第7天切牙和胚胎第14天第一磨牙）以及牙上皮细胞系CLDE | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、体外器官培养、基因敲低实验 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 小鼠牙胚样本（包括P7切牙和E14 P1磨牙）及CLDE细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 233 | 2026-04-13 |
Single-cell dissection of the genotype-immunophenotype relationship in glioblastoma
2025-Sep-03, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf129
PMID:40215269
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，系统性地解析了胶质母细胞瘤三种分子亚型中基因型与免疫表型之间的关系 | 首次在单细胞水平上，利用基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型，系统地建立了人类相关驱动突变（EGFRvIII、PDGFB、NF1）与肿瘤微环境中免疫表型之间的关联分析平台 | 研究基于小鼠模型，虽然能有效模拟人类肿瘤的异质性，但仍需在人类临床样本中进行进一步验证 | 解析胶质母细胞瘤中基因驱动突变与肿瘤微环境免疫表型之间的因果关系，为个性化治疗提供新靶点 | 携带EGFRvIII、PDGFB和NF1驱动突变的基因工程小鼠胶质母细胞瘤模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2026-04-13 |
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660984
PMID:40666973
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研究论文 | 本文介绍了一个名为EVscope的开源生物信息学流程，专门用于处理细胞外囊泡RNA测序数据，以提高RNA生物标志物和细胞间通信研究的准确性和鲁棒性 | EVscope采用优化的全基因组期望最大化算法，显著提高了单碱基分辨率下的多映射读段分配，并首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析，这是现有工具所不具备的功能 | NA | 开发一个标准化的计算工作流程，以应对细胞外囊泡RNA测序数据分析中的挑战，包括低丰度、片段化及污染问题 | 细胞外囊泡RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 总RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2026-04-13 |
LncRNA MIR181A1HG Deficiency Attenuates Vascular Inflammation and Atherosclerosis
2025-Apr-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325196
PMID:40047069
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研究论文 | 本研究揭示了长链非编码RNA MIR181A1HG通过诱骗Foxp1转录因子并激活NLRP3炎症小体，从而驱动血管炎症和动脉粥样硬化发生的关键作用 | 首次明确了MIR181A1HG在动脉粥样硬化血管炎症中的核心驱动作用，并阐明了其通过诱骗Foxp1（独立于miR-181a1/b1簇）激活NLRP3炎症小体的新分子机制 | 研究主要聚焦于内皮细胞中的机制，尽管排除了髓系细胞的作用，但其他细胞类型（如平滑肌细胞）中MIR181A1HG的功能尚未完全探索 | 探究长链非编码RNA MIR181A1HG在调控血管炎症和动脉粥样硬化中的作用及分子机制 | 人及小鼠的动脉粥样硬化病变组织、内皮细胞、MIR181A1HG-/-ApoE-/-基因敲除小鼠 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、荧光素酶报告基因实验、染色质免疫共沉淀、功能获得与缺失研究、RNA-蛋白质相互作用分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 涉及人及小鼠的动脉粥样硬化病变样本，并使用MIR181A1HG-/-ApoE-/-基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 236 | 2026-04-13 |
Single-cell RNA sequencing combined with proteomics of infected macrophages reveals prothymosin-α as a target for treatment of apical periodontitis
2024-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.01.018
PMID:38237771
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合蛋白质组学，揭示了感染巨噬细胞中prothymosin-α（PTMA）的上调，并验证了其作为根尖周炎治疗靶点的潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学分析根尖周炎中单核/巨噬细胞的异质性，并鉴定出PTMA作为新的治疗靶点 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，尚未进行人体临床试验 | 阐明单核/巨噬细胞在慢性根尖周炎进展中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 慢性根尖周炎患者的根尖周病变组织、健康对照牙周组织、THP-1来源的巨噬细胞、小鼠和大鼠的根尖周炎模型 | 单细胞组学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫荧光染色, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及患者组织样本、细胞系及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2026-04-13 |
Early concentrate starter introduction induces rumen epithelial parakeratosis by blocking keratinocyte differentiation with excessive ruminal butyrate accumulation
2024-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2023.12.016
PMID:38128723
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和代谢组学分析，探讨了早期引入浓缩饲料如何通过过量丁酸积累阻断角质细胞分化，从而诱导瘤胃上皮角化不全 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示了瘤胃上皮细胞异质性和分化轨迹，并建立了瘤胃器官样模型来验证丁酸在角化不全中的作用 | 研究仅基于新生羔羊模型，结果可能无法直接推广到其他反刍动物或不同年龄阶段 | 阐明瘤胃上皮角化过程及导致角化不全的关键瘤胃代谢物 | 24只14日龄羔羊的瘤胃组织和瘤胃液样本 | 单细胞组学 | 瘤胃上皮角化不全 | 单细胞RNA测序, 代谢组学, 免疫荧光, 实时定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据, 基因表达数据 | 24只羔羊分为三组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2026-04-12 |
Dietary conjugated linoleic acid enhances resistance to Salmonella infection by promoting PPARγ-mediated metabolic reprogramming and effector function in CD8⁺ T cells
2026-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2026.2657625
PMID:41964110
|
研究论文 | 本研究揭示了膳食共轭亚油酸通过激活PPARγ信号通路，促进肠道CD8⁺ T细胞的代谢重编程和效应功能，从而增强宿主对鼠伤寒沙门氏菌感染的抵抗力 | 首次阐明膳食共轭亚油酸通过PPARγ介导的代谢重编程增强CD8⁺ T细胞效应功能，从而抵抗肠道感染的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，其在人体中的效果和机制仍需进一步验证 | 探究膳食共轭亚油酸增强宿主对沙门氏菌感染抵抗力的免疫学机制 | 小鼠肠道CD8⁺ T细胞、肠道微生物群、鼠伤寒沙门氏菌感染模型 | 免疫学、微生物学 | 肠道感染 | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、粪便微生物移植、药理学抑制 | 小鼠感染模型 | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、微生物组数据 | 未明确说明，但涉及多组小鼠实验 | NA | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq | NA | NA |
| 239 | 2026-04-12 |
Oxidative stress in neurodegeneration: from a simple insult to a dynamic regulator
2026-Dec-31, Redox report : communications in free radical research
IF:5.2Q1
DOI:10.1080/13510002.2026.2654906
PMID:41964111
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综述 | 本文综述了氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用，将其重新定义为一种复杂的动态调控系统，并探讨了其分子机制及先进的抗氧化干预技术策略 | 将氧化应激重新定义为神经退行性疾病中一个复杂的动态调控系统，而非单一事件，并整合了亚细胞器靶向、纳米载体递送以及单细胞/空间组学等先进技术策略，为开发靶向和个性化治疗提供了新视角 | 本文是一篇综述，主要基于现有文献进行分析和整合，未报告新的原始实验数据或临床研究结果 | 评估氧化应激在神经退行性疾病中的核心作用，探索其动态调控特征、信号通路、分子机制以及先进的抗氧化干预技术策略 | 神经退行性疾病中的氧化应激过程及其调控 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞氧化还原组学，空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 240 | 2026-04-12 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNF-α promotes glioblastoma proliferation and migration via CP-mediated KLF10 upregulation
2026-Apr-11, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01859-3
PMID:41963569
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |