单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 39582 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2026-05-19
Dysregulated landscape of RNA-binding proteins in unexplained recurrent spontaneous abortion revealed by bulk and single-cell transcriptome
2026-Apr-01, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
222 2026-05-19
Single-Cell and Mendelian Randomization Analyses Identify Macrophage Polarization and Efferocytosis Biomarkers in Osteoarthritis and Reveal Their Regulatory Mechanisms
2026-Apr, Iranian journal of biotechnology IF:1.6Q4
研究论文 整合转录组学和单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化分析,鉴定骨关节炎中巨噬细胞极化和胞葬作用相关生物标志物FMO4和GPR65,并揭示其调控机制 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析结合,从巨噬细胞极化和胞葬作用角度系统鉴定骨关节炎的关键生物标志物,并通过人工神经网络模型提升诊断准确性 主要基于公共数据库的二次分析,缺乏独立的临床样本验证和功能实验验证 鉴定骨关节炎中与巨噬细胞极化和胞葬作用相关的关键生物标志物及其调控机制 骨关节炎患者滑膜组织的转录组和单细胞转录组数据 机器学习 骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序 LASSO, SVM-RFE, 人工神经网络 转录组数据, 单细胞转录组数据 三个骨关节炎相关转录组数据集 (GSE89408, GSE55457, GSE152805) 和一个GWAS数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
223 2026-05-19
Genetic Evidence Supports a Potential Role of WTAP-related m6A Regulation in Vascular Dementia: Insights from Mendelian Randomization and Multi-omics Analyses
2026-Mar-24, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 通过孟德尔随机化和多组学分析,探讨WTAP相关m6A调控与血管性痴呆的潜在因果关系 首次系统评估m6A调控基因WTAP在血管性痴呆中的因果作用,结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序、微生物组中介分析和全表型关联研究,提出m6A调控可能通过肠道微生物影响脑血管生物学 研究基于遗传预测和关联分析,仍需功能性实验验证WTAP在VAD中的具体机制 利用人类遗传学和多组学数据揭示WTAP相关m6A修饰在血管性痴呆发病中的潜在因果作用 血管性痴呆患者脑组织样本及遗传变异数据 机器学习 血管性痴呆 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 全表型关联研究, 加权基因共表达网络分析 NA 基因表达数据, 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 GSE122063包含血管性痴呆与对照脑组织样本(具体数量未提供);GSE282111为单细胞测序数据(具体细胞数量未提供);FinnGen GWAS数据(具体样本量未提供) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
224 2026-05-19
Heterogeneity of lymphoid cells in PBMCs in the acute phase of SFTS: Single-cell transcriptome profiling
2026-Mar-19, Journal of biomedical research IF:2.2Q3
研究论文 通过单细胞转录组测序分析急性期发热伴血小板减少综合征患者外周血单个核细胞中淋巴细胞的异质性,并探究糖皮质激素治疗对淋巴细胞的影响 首次在单细胞水平揭示急性期SFTS患者淋巴细胞的异质性及糖皮质激素治疗的免疫调控作用,为优化临床用药提供新见解 样本量较小(3名健康志愿者和13名患者),且仅关注急性期,缺乏纵向动态监测 探究急性期SFTS中淋巴细胞功能异常的机制以及糖皮质激素治疗对淋巴细胞的影响 急性期SFTS患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 单细胞转录组学 发热伴血小板减少综合征 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3名健康志愿者和13名急性期SFTS患者,共120886个淋巴细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞捕获及mRNA 3'端转录本测序
225 2026-05-19
Oligodendrocyte Precursor Cells Shape Retinogeniculate Refinement Via a CHD8-Dependent Phagocytic Pathway
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究揭示了少突胶质前体细胞通过CHD8依赖性吞噬途径在视觉发育关键期内修剪多余突触的机制 首次发现少突胶质前体细胞是视觉发育关键期的主要突触吞噬细胞,并揭示CHD8作为上游调控因子直接促进吞噬相关基因表达 未提及具体局限性 鉴定视觉发育关键期内主要胶质吞噬细胞及其调控机制,并探讨与自闭症病理的关联 小鼠背外侧膝状体中的少突胶质前体细胞及突触修剪过程 数字病理学 自闭症谱系障碍 单细胞测序, 三维成像, 条件性基因敲除, 体内电生理评估 NA 图像, 转录组数据 小鼠模型(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
226 2026-05-19
Spatial transcriptomics maps early B-cell and T-cell activation in hidradenitis suppurativa
2026-Feb-19, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 利用空间转录组学和单细胞转录组学分析揭示化脓性汗腺炎早期B细胞和T细胞激活的时序特征 首次通过整合空间和单细胞转录组学,定义了化脓性汗腺炎早期免疫激活(B细胞富集、17型T细胞通路激活和中性粒细胞浸润)先于皮窦道和三级淋巴结构形成的时序关系,并发现T细胞是早期病变中B细胞趋化因子CXCL13的主要来源 未提及明确的局限性,但可能受限于样本量、区域选择偏差及对早期病变定义的标准性 阐明化脓性汗腺炎早期免疫激活与晚期结构形成之间的时序关系,为早期治疗靶点提供依据 化脓性汗腺炎的早期和晚期病变,并与聚合性痤疮和银屑病进行比较 数字病理学 化脓性汗腺炎 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 156个感兴趣区域(空间转录组学)及单细胞样本 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA测序 10x Visium, 10x Chromium 10x Visium空间转录组学平台用于感兴趣区域分析,10x Chromium单细胞RNA测序平台用于单细胞分析
227 2026-05-19
Ductal epithelial MXD3 promotes disease progression in acute pancreatitis through Wnt/β-catenin-mediated inflammation and injury
2026, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
研究论文 本研究揭示了转录因子MXD3通过Wnt/β-catenin信号通路调控急性胰腺炎上皮损伤和炎症进展的机制 首次鉴定MXD3为急性胰腺炎进展的关键调控因子,并建立MXD3-Wnt/β-catenin轴作为上皮病理的新机制 主要基于大鼠模型,缺乏人类临床样本验证;β-catenin抑制剂ICG-001的体内效果未充分验证 阐明急性胰腺炎中上皮损伤与修复的转录调控机制 急性胰腺炎大鼠胰腺导管上皮细胞 分子生物学 急性胰腺炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 雨蛙素诱导的急性胰腺炎大鼠模型,包含MXD3基因敲除大鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
228 2026-05-19
SpaGene: A Deep Adversarial Framework for Spatial Gene Imputation
2026, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 提出SpaGene深度学习框架,整合单细胞RNA测序数据和空间转录组数据以估算空间基因表达 采用两个编码器-解码器对结合两个转换器和两个判别器的对抗性框架,在空间转录组数据中更准确地恢复被遮蔽的基因表达 未明确提及局限性,但可能受限于基准数据集的多样性和验证的生物学发现仍需进一步实验确认 整合单细胞RNA测序和空间转录组数据以估算空间转录组中缺失的基因表达 空间转录组数据集和单细胞RNA测序数据集 机器学习, 数字病理学 肺癌 深度学习, 空间转录组学 对抗性神经网络(编码器-解码器对、转换器、判别器) 基因表达数据 多个数据集(具体数量未说明),包括肺癌肿瘤组织样本 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
229 2026-05-19
Plasma proteome-wide Mendelian randomization reveals multi-ancestry drug targets for gastric cancer
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
research paper 利用全蛋白质组孟德尔随机化方法,揭示多祖先背景下胃癌的潜在药物靶点 首次在欧洲和东亚人群中系统识别出13个祖先特异性血浆蛋白靶点,其中包括5个新发现;采用双样本孟德尔随机化和共定位方法,并结合单细胞RNA测序及分子对接验证 未明确提及验证样本量及功能机制的具体实验细节;部分靶点在不同祖先中的功能差异需进一步研究 识别不同祖先人群中与胃癌风险相关的血浆蛋白药物靶点 欧洲和东亚人群的胃癌患者及对照样本 machine learning gastric cancer Mendelian randomization, colocalization, single-cell RNA sequencing, molecular docking NA plasma proteomics, single-cell transcriptomics, molecular docking 欧洲和东亚人群的蛋白组学数据,未提供具体样本数量 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
230 2026-05-19
Paired single cell analysis reveals chemotherapy resistance in osteosarcoma
2026, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
研究论文 通过配对单细胞分析揭示骨肉瘤化疗耐药机制,并建立九基因耐药特征 首次利用配对的新辅助化疗前后样本进行单细胞RNA测序,重建耐药轨迹并鉴定九基因耐药模块,发现Pictilisib对耐药肿瘤的潜在治疗价值 配对发现队列样本量小,需进一步验证;耐药特征的临床实用性需前瞻性测试 表征化疗耐药骨肉瘤细胞的转录特征,建立预后耐药特征,并识别治疗弱点 骨肉瘤患者的新辅助化疗前后配对样本 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 伪时间分析 Monocle 3 单细胞转录组数据 3名患者的6个配对样本(16,272个细胞)用于发现队列;独立未配对scRNA-seq队列(5个样本);PKPH bulk RNA-seq队列(70例);TARGET数据库(87例) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
231 2026-05-19
Integrating Bulk and Single-Cell RNA-Seq Reveals Glycolysis-Associated Macrophages and Its Related Tumor Subgroup Signatures to Predict Prognosis and Therapy in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 整合批量与单细胞RNA测序揭示了肾透明细胞癌中糖酵解相关巨噬细胞及其相关肿瘤亚群特征以预测预后和治疗 首次识别出以糖酵解代谢为主的巨噬细胞亚群及其密切相关的肿瘤细胞亚群,并利用101种机器学习方法构建了包含六个基因的预后模型 未提及 探索糖酵解相关巨噬细胞与肾透明细胞癌风险的关联,并建立精准的预后预测模型 肾透明细胞癌患者 机器学习 肾透明细胞癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序 机器学习模型 基因表达数据 肾透明细胞癌患者RNA测序队列 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
232 2026-05-19
A Propionate Metabolism-Based Gene Signature Reveals Immunogenomic and Transcriptomic Determinants of Prognosis in Glioblastoma Through Multiomics Integration
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 基于丙酸代谢相关基因构建的预后特征,通过多组学整合揭示胶质母细胞瘤的免疫基因组和转录组决定因素 首次基于丙酸代谢相关基因构建胶质母细胞瘤预后特征,并整合多组学数据揭示其与免疫抑制微环境及关键驱动突变(RB1和IDH1)的关联 NA 探索丙酸代谢在胶质母细胞瘤预后中的作用,并开发基于该代谢途径的预后模型 胶质母细胞瘤患者的多组学数据,包括TCGA-GBM和GEO数据集 机器学习 胶质母细胞瘤 多组学整合、单细胞RNA测序 LASSO Cox回归 基因表达数据、突变数据、单细胞转录组数据 TCGA-GBM队列(样本数量未明确)、独立GEO数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
233 2026-05-19
New algorithms for unsupervised cell clustering from scRNA-seq data
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文提出了两种新的单细胞RNA测序数据无监督聚类算法:基于-MST图的方法和基于自编码器的高斯混合模型方法 提出了一种无需降维直接从输入数据构建-MST图的聚类算法,以及一种基于自编码器学习高斯混合模型参数的替代方案 测序深度、细胞数量和组织类型对算法性能有重要影响 解决单细胞RNA测序数据无监督聚类中的高维性、稀疏性和技术噪声问题 单细胞RNA测序数据 机器学习 难治性癫痫 单细胞RNA测序 自编码器, 高斯混合模型, Louvain算法 基因表达数据 来自难治性癫痫患者的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
234 2026-05-19
A machine learning-derived hypoxia- and lactylation-associated gene signature for prognostic stratification and immune landscape characterization in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 构建了一个基于缺氧和组蛋白乳酸化相关基因的预后模型,用于肺腺癌患者风险分层和免疫景观分析 首次将缺氧和组蛋白乳酸化相关基因结合,利用LASSO、XGBoost和随机森林算法构建预后模型,并整合单细胞RNA测序数据评估细胞类型特异性表达 NA 建立基于缺氧和乳酸化相关基因的预后模型,以预测肺腺癌患者预后并揭示其免疫相关特征 肺腺癌患者及细胞系 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, CCK-8, 集落形成实验, 伤口愈合实验, Transwell实验 LASSO, XGBoost, 随机森林 基因表达数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
235 2026-05-19
CFD+CD14+ monocytes: potential pathogenic subset in myasthenia gravis uncovered by multi-omics integration and machine learning analysis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学数据和机器学习方法,发现CFD+CD14+单核细胞是重症肌无力发病的关键致病亚群 首次整合转录组全关联分析和单细胞RNA测序技术,在单细胞水平解析重症肌无力发病机制,并利用机器学习算法筛选出CFD等六个特征基因 未提及 解码重症肌无力在细胞层面的发病机制,发现潜在致病细胞亚群和治疗靶点 重症肌无力患者和健康对照的外周血单核细胞 机器学习 重症肌无力 单细胞RNA测序, 转录组全关联分析 CNN, LSTM, GAN 单细胞转录组数据, 基因组关联研究汇总数据, 表达数量性状位点数据 重症肌无力患者和健康对照外周血样本,具体样本量未提及 Illumina 单细胞RNA测序 NA NA
236 2026-05-19
Spatial transcriptomics uncovers TAC-OGEs heterogeneity and FN1/MMP9 signature in ameloblastoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用空间转录组学揭示成釉细胞瘤中TAC-OGEs的异质性和FN1/MMP9特征 首次通过空间组学方法描绘成釉细胞瘤的肿瘤生态系统,发现肿瘤侵袭前沿的TAC-OGEs具有空间梯度分化状态,并鉴定出FN1和MMP9作为潜在标志物 样本量较小,仅涉及15例标本的独立验证,空间转录组结果的临床转化价值需进一步评估 探究成釉细胞瘤肿瘤微环境对其侵袭性、恶性和复发的影响 成釉细胞瘤临床肿瘤标本 数字病理学 成釉细胞瘤 空间转录组测序 NA 基因表达数据 15例成釉细胞瘤标本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium FFPE空间转录组测序
237 2026-05-19
Targeting the TIGIT/CD155-induced metabolic checkpoint in NK cells restores anti-tumor immunity and suppresses hepatocellular carcinoma growth
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 揭示TIGIT/CD155轴通过代谢重编程损害NK细胞抗肿瘤免疫并促进肝细胞癌生长的机制 首次阐明TIGIT/CD155轴通过SHP-2/STAT3/GLUT1通路调控NK细胞糖酵解代谢,从而影响抗肿瘤免疫 主要基于小鼠模型和体外实验,临床验证有限 探讨TIGIT/CD155轴如何通过代谢重编程调节NK细胞功能并影响肝细胞癌进展 肝细胞癌小鼠模型、CD155过表达肿瘤细胞与NK细胞共培养体系 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 共免疫沉淀, 蛋白质印迹, 免疫荧光, 细胞外酸化率检测 NA 基因表达数据, 蛋白质互作数据, 代谢数据 小鼠模型样本数量未具体说明 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
238 2026-05-19
Zone-specific hepatocytes orchestrate the early onset of host immune defenses during Staphylococcus aureus bloodstream infection
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了在金黄色葡萄球菌血流感染期间,肝细胞通过区域特异性转录程序协调早期宿主免疫应答 首次通过单细胞转录组学证明肝细胞在血流感染中沿门静脉-中央静脉轴呈现区域特异性免疫应答,并发现Bmper基因(BMP信号调节因子)此前未报道与细菌感染相关 研究主要基于小鼠模型,缺乏人类样本验证;未深入探究BMPER在急性期反应中的具体分子机制 表征肝脏对血源性金黄色葡萄球菌感染早期免疫应答的区室化特征 血源性金黄色葡萄球菌感染的小鼠肝脏细胞(包括肝细胞、库普弗细胞、肝窦内皮细胞) 机器学习 血流感染 RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA RNA测序数据 小鼠模型,感染后4小时及24小时时间点样本 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq NA
239 2026-05-19
Knowledge mapping of DNGR-1 on dendritic cells in immunotherapy: a review and bibliometric study
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 对树突状细胞上DNGR-1在免疫治疗中的知识图谱进行了文献计量学和综述分析 首次对DNGR-1全球研究进行系统性文献计量分析,揭示了研究趋势、热点和演化轨迹 未明确说明研究的局限性 描绘DNGR-1在免疫治疗中的研究知识结构、热点和演化趋势 DNGR-1(CLEC9A)及其在树突状细胞中的作用 文献计量学 NA NA NA 文本 326篇出版物 NA NA NA NA
240 2026-05-19
Integrative analysis identifies DCBLD2 and immune-related biomarkers for major depressive disorder: evidence from human peripheral blood, post-mortem brain, and rat models
2026, Frontiers in human neuroscience IF:2.4Q2
研究论文 通过整合分析人类外周血、死后脑组织和大鼠模型,鉴定出DCBLD2等与重性抑郁障碍相关的免疫生物标志物 首次结合孟德尔随机化、多种机器学习方法和单细胞RNA测序,系统鉴定出DCBLD2为MDD的潜在关键生物标志物,并在多个数据集和动物模型中验证 研究主要基于公开数据集和动物模型,未在独立大规模临床队列中验证;部分分析依赖已有数据库,可能存在样本异质性和批次效应 识别与重性抑郁障碍发展相关的新型生物标志物,并阐明其潜在的免疫机制 MDD患者的外周血和死后前额叶皮层组织,以及慢性不可预测应激大鼠模型的前额叶皮层 机器学习 重性抑郁障碍 RNA测序, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 逻辑回归, LASSO回归, 随机森林 转录组数据 多个GEO数据集、独立人类队列外周血样本、大鼠模型前额叶皮层组织 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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