单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27864 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-05-15 |
The role of lactate metabolism in retinoblastoma tumorigenesis and ferroptosis resistance
2025-Aug, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2025.102893
PMID:40188688
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸代谢在视网膜母细胞瘤肿瘤发生和抗铁死亡中的作用 | 首次揭示了乳酸代谢通过上调MCT1促进视网膜母细胞瘤细胞存活和抗铁死亡的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证不足 | 阐明乳酸代谢相关基因表达谱对视网膜母细胞瘤发生和抗铁死亡的影响 | 视网膜母细胞瘤细胞系和患者组织样本 | 肿瘤代谢 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠异种移植模型 | 转录组数据 | 患者视网膜组织和视网膜母细胞瘤组织的单细胞RNA测序数据 |
| 222 | 2025-05-15 |
Integrating scRNA-seq to explore offspring neurodevelopmental toxicity induced by Cyfluthrin exposure during pregnancy: A fate decision for NSCs
2025-Jul-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138205
PMID:40209410
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索孕期暴露于Cyfluthrin对后代神经发育的毒性作用及其机制 | 首次构建了孕期暴露于Cyfluthrin的后代大脑海马单细胞图谱，揭示了神经干细胞命运改变是发育毒性的主要原因 | 研究仅在大鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究孕期Cyfluthrin暴露对后代神经发育的毒性机制 | 孕期暴露于Cyfluthrin的大鼠后代 | 神经毒理学 | 神经发育障碍 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 不同年龄阶段的大鼠后代海马组织样本 |
| 223 | 2025-05-15 |
Combining Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization to Explore Novel Drug Targets for Parkinson's Disease
2025-Jun, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04700-3
PMID:39890696
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索帕金森病的新药物靶点 | 首次结合scRNA-Seq和MR方法探索T细胞相关基因对帕金森病风险的因果效应，并识别出五个潜在药物靶点 | 需要进一步的研究和临床试验来验证这些潜在药物靶点的有效性 | 探索帕金森病的致病机制和潜在治疗靶点 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 孟德尔随机化(MR), GWAS | NA | 基因表达数据 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞scRNA-Seq数据集 |
| 224 | 2025-05-15 |
A Case-Driven Multi-Omics Analysis for Longitudinal Ibrutinib Response Evaluation of Patients With Chronic Lymphocytic Leukemia
2025-Jun, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.14397
PMID:39988467
|
研究论文 | 通过多组学方法评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼的长期治疗反应 | 利用单细胞转录组学等多组学方法，首次在分子水平上探索了伊布替尼治疗期间克隆惰性的机制 | 研究样本量较小，仅包含两名患者的数据 | 评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼治疗的长期分子和临床反应 | 两名接受伊布替尼单药治疗的慢性淋巴细胞白血病患者 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | DNA和RNA数据 | 两名患者的血液样本 |
| 225 | 2025-05-15 |
Spatial Multiomics Toward Understanding Neurological Systems
2025-Jun, Journal of mass spectrometry : JMS
IF:1.9Q2
DOI:10.1002/jms.5143
PMID:40360168
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research paper | 该论文探讨了空间多组学技术在理解神经系统动态生物过程中的应用 | 结合代谢组学、转录组学和蛋白质组学，提供更全面的分子景观研究 | 样本制备优化、分子完整性保持以及跨组学数据整合仍存在挑战 | 通过多模态成像技术增强对神经系统和复杂疾病的理解 | 大脑中的细胞类型及其相互作用 | digital pathology | Alzheimer's disease, autism spectrum disorder | mass spectrometry imaging, spatial transcriptomics, spatial proteomics | NA | image, omics data | NA |
| 226 | 2025-05-15 |
Single-cell RNA sequencing reveals SLC31A1-mediated M2 polarization of macrophages promotes malignant progression in triple-negative breast cancer
2025-May-14, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06191-0
PMID:40360897
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示SLC31A1介导的巨噬细胞M2极化促进三阴性乳腺癌的恶性进展 | 首次发现SLC31A1在三阴性乳腺癌髓系细胞中的过表达，并通过功能研究证实其通过诱导巨噬细胞M2极化促进肿瘤恶性表型 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内模型的验证 | 探究三阴性乳腺癌免疫微环境中的关键调控基因及其作用机制 | 三阴性乳腺癌组织样本和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qPCR、流式细胞术、Transwell实验、划痕实验、铜离子和H2O2检测 | NA | 单细胞转录组数据、分子生物学实验数据 | 未明确说明样本数量 |
| 227 | 2025-05-15 |
Comprehensive single-cell transcriptomic reveals different destinies of melanocytes and dynamic changes of immune microenvironment in a psychological stress-induced leukoderma and leukotrichia mouse model
2025-May-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01236-z
PMID:40361040
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research paper | 该研究通过建立慢性不可预测轻度刺激（CUMS）小鼠模型，利用单细胞RNA测序技术揭示了心理压力诱导的白癜风和白发症中黑色素细胞的不同命运及免疫微环境的动态变化 | 发现了两种具有不同命运的黑色素细胞簇（Mel2和Mel3）以及CXCL16-CXCR6轴激活的促炎微环境，为压力诱导的白癜风发病机制提供了新见解 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中进行验证 | 探究心理压力诱导的白癜风和白发症的发病机制 | C57BL/6J小鼠的黑色素细胞和免疫微环境 | digital pathology | vitiligo | single-cell RNA sequencing, immunohistochemistry | CUMS mouse model | RNA-seq data, image | C57BL/6J小鼠模型 |
| 228 | 2025-05-15 |
Novel Aortic Dissection Model Links Endothelial Dysfunction and Immune Infiltration
2025-May-14, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326230
PMID:40365676
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research paper | 该研究通过创建一种新型的自发性主动脉夹层小鼠模型，揭示了内皮功能障碍和免疫浸润在主动脉夹层发病机制中的作用 | 首次将非综合征性家族性主动脉夹层患者的FBN1基因错义变异（p.G234D）通过CRISPR/Cas9系统引入小鼠，创建了新型自发性AD模型 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证相关发现 | 揭示主动脉夹层的分子机制，特别是内皮细胞和免疫细胞在疾病起始中的作用 | 携带Fbn1G234D/G234D突变的小鼠主动脉组织 | 分子病理学 | 心血管疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、免疫荧光染色、同步辐射成像、Western blot分析 | 小鼠疾病模型 | 基因测序数据、影像数据、蛋白质印迹数据 | Fbn1G234D/G234D突变小鼠（具体数量未明确说明） |
| 229 | 2025-05-15 |
Dissection of the global responses of mandarin fish pyloric cecum to an acute ranavirus (MRV) infection reveals the formation of serositis and then ascites
2025-May-14, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.02308-24
PMID:40366173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了急性MRV感染对鳜鱼幽门盲囊的全球响应机制，特别是浆膜炎的形成及其后续腹水症状的病理过程 | 首次在单细胞分辨率水平解析MRV感染诱导鳜鱼幽门盲囊浆膜炎的细胞组成变化及关键免疫细胞亚群的作用 | 研究仅聚焦于急性感染阶段的病理变化，未涉及慢性感染或不同鱼种间的比较分析 | 阐明MRV感染导致鳜鱼特征性腹水症状的分子病理机制 | 感染MRV病毒的鳜鱼幽门盲囊组织 | 鱼类病理学 | 病毒性鱼病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量（鳜鱼个体及幽门盲囊组织） |
| 230 | 2025-05-15 |
Dual oxic-anoxic co-culture enables direct study of anaerobe-host interactions at the airway epithelial interface
2025-May-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01338-24
PMID:40366160
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research paper | 介绍了一种双氧-缺氧共培养（DOAC）方法，用于研究厌氧菌与宿主细胞在气道上皮界面的相互作用 | DOAC方法能够在维持宿主细胞氧供的同时，在上皮界面创造缺氧微环境，从而直接研究厌氧菌与宿主的相互作用 | 研究仅持续了约48小时，可能无法完全模拟长期感染情况 | 探究厌氧菌与宿主细胞在气道疾病病理生理学中的相互作用机制 | 厌氧菌与气道上皮细胞 | 微生物学与细胞生物学 | 气道疾病 | 双氧-缺氧共培养（DOAC）、RNAseq、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 231 | 2025-05-15 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Functional Exhaustion of T Cells in Oral Lichen Planus
2025-May-14, Molecular oral microbiology
IF:2.8Q3
DOI:10.1111/omi.12495
PMID:40366262
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了口腔扁平苔藓中T细胞的功能耗竭状态 | 首次在口腔扁平苔藓中使用单细胞RNA测序技术分析T细胞的组成和异质性，揭示了CD8+耗竭T细胞的关键作用 | 样本量较小（仅3名患者和3名健康对照），且小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 探究口腔扁平苔藓免疫微环境中T细胞的组成和功能状态 | 口腔扁平苔藓患者和小鼠模型的T细胞 | 免疫学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、HE染色、免疫荧光染色 | 小鼠慢性炎症模型 | 单细胞转录组数据、组织病理学数据 | 3名口腔扁平苔藓患者和3名健康对照的口腔黏膜组织 |
| 232 | 2025-05-15 |
Identifying Immunomodulatory Subpopulations of Adipose Stromal Vascular Fraction and Stem/Stromal Cells Through Single-Cell Transcriptomics and Bulk Proteomics
2025-May-14, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10889-6
PMID:40366552
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和批量蛋白质组学技术，识别脂肪基质血管部分和干细胞/基质细胞中具有免疫调节功能的亚群 | 整合单细胞RNA测序和批量蛋白质组学数据，首次识别出脂肪基质血管部分中具有不同免疫调节表型的干细胞亚群 | 研究主要基于体外实验数据，需要进一步体内验证 | 解析脂肪来源干细胞/基质细胞的异质性免疫调节潜能 | 脂肪基质血管部分(SVF)和脂肪来源干细胞/基质细胞(ASCs) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA seq), 批量蛋白质组学 | Scissor算法 | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 233 | 2025-05-15 |
Early multiple sclerosis activity associated with TBX21+CD21loCXCR3+ B cell expansion resembling EBV-induced phenotypes
2025-May-13, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188543
PMID:40359016
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研究论文 | 该研究通过单细胞表达分析探讨了EB病毒感染与多发性硬化症早期活动之间的关联 | 发现TBX21+CD21loCXCR3+非典型B细胞(ABCs)在早期多发性硬化症患者中的扩增与疾病活动相关 | 未检测到EBV直接感染ABCs的证据 | 探讨EBV在多发性硬化症发病机制中的作用 | 早期多发性硬化症患者的外周B细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自ITN STAyCIS试验的纵向收集样本，包括早期MS患者、健康对照和其他疾病对照 |
| 234 | 2025-05-15 |
Combining spatial transcriptomics with tissue morphology
2025-May-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58989-8
PMID:40360467
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综述 | 本文介绍了一种将空间转录组学与组织形态学相结合的框架，重点讨论了将形态学特征转化为或整合到空间转录组学中的方法 | 提出了一种结合空间转录组学和组织形态学的新框架，包括转化和整合两种方法，以增强对组织结构的理解 | 未提及具体实验验证或应用案例，可能缺乏实际操作的详细指导 | 探讨如何将空间转录组学与组织形态学相结合，以更全面地理解组织结构 | 空间转录组学数据和组织形态学特征 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，成像AI | NA | 基因表达数据，图像数据 | NA |
| 235 | 2025-05-15 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals an anti-tumor neutrophil subgroup in microwave thermochemotherapy-treated lip cancer
2025-May-13, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-025-00366-8
PMID:40360503
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research paper | 该研究利用单细胞转录组学和空间转录组学揭示了微波热化疗治疗唇鳞状细胞癌中抗肿瘤中性粒细胞亚群的作用机制 | 发现了具有抗肿瘤活性的MNDA TANs亚群在微波热化疗后的富集现象，并构建了预测预后标志物MX2的深度学习模型 | 研究样本仅针对唇鳞状细胞癌，未验证其他癌症类型的普适性 | 探究微波热化疗治疗唇鳞状细胞癌的分子机制和免疫微环境变化 | 肿瘤相关中性粒细胞(TANs)和肿瘤微环境中的成纤维细胞 | digital pathology | lip cancer | scRNA-seq, ST, 深度学习 | 深度学习 | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、H&E染色图像 | 未明确说明样本数量（唇鳞状细胞癌患者组织样本） |
| 236 | 2025-05-15 |
Smooth muscle cells and fibroblasts in the ascending aorta exhibit minor differences between embryonic origins in angiotensin II-driven transcriptional alterations
2025-May-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99862-4
PMID:40360730
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research paper | 本研究探讨了升主动脉中平滑肌细胞和成纤维细胞在血管紧张素II（AngII）驱动下的转录变化，比较了不同胚胎起源细胞的反应差异 | 首次在AngII诱导的胸主动脉病变前期阶段，比较了第二心区（SHF）和非SHF来源细胞的转录组差异，并发现了一个新的成纤维细胞亚群存在细胞外基质相关基因的谱系特异性差异 | 研究仅关注了AngII诱导的胸主动脉病变前期（3天）的转录变化，未涉及疾病进展后期的变化 | 探究不同胚胎起源的平滑肌细胞和成纤维细胞对AngII的谱系特异性反应 | Mef2c-Cre R26RmT/mG小鼠升主动脉中的平滑肌细胞和成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | AngII输注3天前后的升主动脉细胞 |
| 237 | 2025-05-15 |
TAT-CRE inhalation enables tumor induction corresponding to adenoviral Cre-recombinase in a lung cancer mouse model
2025-May-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08146-0
PMID:40360735
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research paper | 本文比较了TAT-CRE和腺病毒Cre重组酶在诱导肺癌小鼠模型中的效果，发现TAT-CRE是一种安全且有效的替代方法 | 提出TAT-CRE作为一种生物安全级别S1的替代方案，用于癌症诱导，并验证其在肺癌模型中的有效性 | 研究仅针对肺癌模型，未在其他癌症模型中验证TAT-CRE的效果 | 比较TAT-CRE和腺病毒Cre重组酶在诱导肺癌中的效果，寻找更安全的基因工程方法 | 肺癌小鼠模型 | 癌症研究 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、流式细胞术 | 小鼠模型 | 图像、RNA序列数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 238 | 2025-05-15 |
Arginine methylation modulates tumor fate and prognosis in clear cell renal cell carcinoma
2025-May-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02505-3
PMID:40360844
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research paper | 本研究探讨了精氨酸甲基化相关基因作为透明细胞肾细胞癌（ccRCC）预后标志物的潜力 | 开发了一个基于精氨酸甲基化的预后模型（AMS），并在多个外部队列中验证了其稳健性 | 需要进一步的临床验证来确认模型的预测能力 | 评估精氨酸甲基化相关基因在ccRCC中的预后价值 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者 | digital pathology | renal cell carcinoma | RNA-seq, single-cell RNA sequencing | Cox regression model | transcriptomic data | 来自TCGA、E-MTAB-1980和ICGC的公共数据集 |
| 239 | 2025-05-15 |
Profiling triple-negative breast cancer-specific super-enhancers identifies high-risk mesenchymal development subtype and BETi-Targetable vulnerabilities
2025-May-13, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02342-6
PMID:40361105
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research paper | 该研究通过分析三阴性乳腺癌（TNBC）中的超级增强子（SEs）异质性，识别出一个高风险间充质发育亚型，并发现该亚型对BET抑制剂（BETi）更敏感 | 首次在TNBC中鉴定出由SE-VAX2核心转录调控回路驱动的高风险间充质发育亚型，并证实该亚型对BETi的敏感性增强 | 研究主要基于细胞系和临床样本的测序数据，临床前模型的验证仍需进一步扩展 | 阐明TNBC中SEs的异质性及其对BETi疗效的影响，推动BETi精准治疗策略的发展 | 三阴性乳腺癌（TNBC）细胞系和临床样本 | digital pathology | breast cancer | ChIP-Seq, RNA-Seq, scRNA-Seq, stRNA-Seq | bioinformatics algorithms, CERES scoring | genomic sequencing data | TNBC细胞系和临床样本（具体数量未明确说明） |
| 240 | 2025-05-15 |
The immunological age prediction of monocytes indicates that gestational diabetes mellitus accelerates the aging of monocytes in offspring
2025-May-13, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-025-00513-z
PMID:40361109
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探索了妊娠期糖尿病（GDM）对后代单核细胞衰老的影响，并建立了预测单核细胞免疫年龄的随机森林模型 | 首次在单细胞水平上揭示了GDM加速后代单核细胞衰老的分子机制，并开发了单核细胞免疫年龄预测模型 | 样本量相对有限（n=56），且部分数据来自公开数据库，可能存在批次效应 | 探究GDM对后代单核细胞衰老进程的影响 | 人类单核细胞（来自0-100岁健康个体和GDM母亲的后代） | 免疫学 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞测序（scRNA-seq） | 随机森林 | 单细胞转录组数据 | 56个样本（6个自测样本+50个GEO数据库样本） |