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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-11-14 |
Unraveling the Heterogeneity of Tumor Immune Microenvironment in Hepatocellular Carcinoma by SingleCell RNA Sequencing and its Implications for Prognosis and Therapeutic Response
2024-11-28, The Turkish journal of gastroenterology : the official journal of Turkish Society of Gastroenterology
DOI:10.5152/tjg.2024.24118
PMID:39641225
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综述 | 通过单细胞RNA测序技术解析肝细胞癌肿瘤免疫微环境的异质性及其对预后和治疗反应的影响 | 首次从细胞、转录和标志物三个维度系统阐述肝细胞癌肿瘤免疫微环境异质性,并探讨其在免疫治疗时代的意义 | 对肿瘤免疫微环境异质性在肝细胞癌发展中的作用理解仍有限 | 探索肝细胞癌肿瘤免疫微环境异质性及其临床意义 | 肝细胞癌肿瘤免疫微环境 | 单细胞测序分析 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-11-14 |
Microglia and monocyte-derived macrophages drive progression of pediatric high-grade gliomas and are transcriptionally shaped by histone mutations
2024-11-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.09.007
PMID:39395421
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研究论文 | 本研究揭示了髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的关键作用及其受组蛋白突变调控的机制 | 首次在免疫健全的原位小鼠模型中证实髓系细胞是pHGGs中主要的非肿瘤浸润细胞,并发现组蛋白突变和肿瘤位置共同塑造髓系细胞异质性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩展 | 探究髓系细胞在儿童高级别胶质瘤进展中的作用及潜在治疗靶点 | 儿童高级别胶质瘤(pHGGs)包括半球pHGGs和弥漫中线胶质瘤(DMGs) | 单细胞生物学 | 儿童高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织切片图像 | 小鼠模型和人类pHGG样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2025-11-14 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604718
PMID:39091743
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了心脏咽部祖细胞在细胞周期驱动下获得多谱系能力的转录组成熟机制 | 发现细胞周期驱动的转录组成熟过程,提出'行为能力'概念,揭示细胞周期进程与命运决定之间的耦合机制 | 研究基于海鞘模型,在哺乳动物中的普适性需要进一步验证 | 探究多谱系能力的获得机制及命运决定与细胞周期进程的耦合关系 | 海鞘心脏咽部祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 224 | 2025-11-14 |
CoCo-ST: Comparing and Contrasting Spatial Transcriptomics data sets using graph contrastive learning
2024-May-20, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4359834/v1
PMID:38826463
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研究论文 | 提出一种名为CoCo-ST的图对比学习特征表示方法,用于比较和对比空间转录组数据集 | 通过引入代表正常组织的背景数据集,增强目标数据集中有趣模式的识别,同时减少共享主导模式的影响 | 方法主要针对空间转录组数据,在其他数据类型上的适用性尚未验证 | 开发能够更好识别空间转录组数据中生物学相关特征的方法 | 小鼠癌前肺组织样本 | 空间转录组学 | 肺癌 | 图对比学习 | 图对比学习模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 225 | 2025-11-14 |
Clonally expanded memory CD8+ T cells accumulate in atherosclerotic plaques and are pro-atherogenic in aged mice
2023-12, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00515-w
PMID:37996758
|
研究论文 | 本研究揭示了衰老过程中记忆CD8+ T细胞在动脉粥样硬化斑块中的克隆性扩增及其促动脉粥样硬化作用 | 首次发现衰老相关的记忆CD8+ T细胞亚群在动脉粥样硬化斑块中克隆性扩增并具有促动脉粥样硬化功能 | 研究仅使用雌性小鼠,未涉及雄性动物模型 | 探究衰老对CD8 T细胞在动脉粥样硬化发生过程中的作用机制 | 年轻和年老雌性小鼠的CD8 T细胞及动脉粥样硬化斑块 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,适应性转移实验,细胞清除实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老雌性小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2025-11-14 |
scDiffCom: a tool for differential analysis of cell-cell interactions provides a mouse atlas of aging changes in intercellular communication
2023-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00514-x
PMID:37919434
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研究论文 | 开发了scDiffCom工具和scAgeCom图谱,用于分析细胞间通讯的年龄相关变化 | 提供了首个覆盖23个小鼠组织的细胞间通讯衰老变化图谱,基于约5000个配体-受体相互作用 | 仅基于小鼠单细胞转录组数据,尚未在人类数据中验证 | 量化并探索细胞间通讯在衰老过程中的变化 | 小鼠23个组织的单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 58个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 227 | 2025-11-14 |
Spatial and single-cell profiling of the metabolome, transcriptome and epigenome of the aging mouse liver
2023-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00513-y
PMID:37946043
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学结合单细胞多组学技术揭示了小鼠肝脏中不同区域细胞随年龄变化的代谢、表观遗传和转录组特征 | 首次整合空间转录组学、单细胞ATAC-seq和RNA-seq、脂质组学及功能分析,揭示肝脏微环境对细胞衰老轨迹的空间依赖性影响 | 研究仅针对雄性小鼠肝脏,未涉及雌性个体或其他组织类型 | 探究组织微环境变化如何影响不同空间位置细胞的表观遗传、代谢和表型特征随年龄的变化 | 雄性小鼠肝脏中的肝细胞 | 空间生物学,单细胞多组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学,单细胞ATAC-seq,单细胞RNA-seq,脂质组学,功能分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞表观基因组数据,单细胞转录组数据,代谢组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞ATAC-seq,单细胞RNA-seq,脂质组学 | NA | NA |
| 228 | 2025-11-14 |
CD133+ endothelial-like stem cells restore neovascularization and promote longevity in progeroid and naturally aged mice
2023-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00512-z
PMID:37946040
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞转录组学鉴定出CD133+骨髓源性内皮样细胞,证明其能恢复衰老小鼠的新血管形成并延长寿命 | 首次鉴定CD133+内皮样干细胞作为潜在内皮祖细胞,并发现法尼基二磷酸合酶(FDPS)在衰老过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果仍需验证 | 探索干细胞衰老机制及治疗早衰症和年龄相关疾病的策略 | 早衰模型小鼠和自然衰老小鼠 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 谱系追踪, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 早衰和自然衰老小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2025-11-14 |
Targeting lymphoid-derived IL-17 signaling to delay skin aging
2023-06, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-023-00431-z
PMID:37291218
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现皮肤老化与淋巴源性IL-17信号通路相关,并证明阻断该通路可延缓皮肤衰老特征 | 首次揭示皮肤衰老过程中T细胞、γδ T细胞和先天淋巴样细胞向IL-17表达表型的倾斜,并证明靶向IL-17信号可延缓皮肤老化 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类皮肤中得到验证 | 探究皮肤衰老的炎症机制及干预策略 | 小鼠皮肤真皮层细胞 | 单细胞组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 230 | 2025-11-13 |
Single-cell immune landscape of acute kidney injury after cardiac surgery with cardiopulmonary bypass
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2581506
PMID:41199602
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了心脏手术后急性肾损伤患者的免疫细胞景观 | 首次整合单细胞RNA测序、流式细胞术和蛋白质微阵列技术研究心脏手术相关急性肾损伤 | 单中心研究,样本量较小(4名患者) | 阐明心脏手术后急性肾损伤的免疫细胞机制 | 接受心脏手术的成年患者 | 单细胞分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质微阵列 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质微阵列数据 | 4名患者,42,362个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 231 | 2025-11-13 |
Breaking barriers: epithelial-mesenchymal transition role in melanoma invasion and resistance
2025-Nov-13, Melanoma research
IF:1.5Q4
DOI:10.1097/CMR.0000000000001068
PMID:41222312
|
综述 | 本文综述了上皮间质转化(EMT)在黑色素瘤侵袭和耐药性中的核心作用机制 | 系统整合了EMT在黑色素瘤中的多维度调控网络,包括转录因子、信号通路、表观遗传和非编码RNA等多层次机制,并提出了单细胞分析和空间转录组学等未来研究方向 | 存在EMT异质性和临床前模型不足的局限性 | 探讨EMT在黑色素瘤进展中的分子机制和临床意义 | 黑色素瘤细胞及其微环境 | 肿瘤生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞分析,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 232 | 2025-11-13 |
Cannabidiol Reprograms Glucose Metabolism in Colorectal Adenocarcinoma by Targeting HIF-1α/LDHA Pathway
2025-Nov-12, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X25500958
PMID:41219135
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研究论文 | 本研究探讨大麻二酚通过靶向HIF-1α/LDHA通路重编程结直肠腺癌葡萄糖代谢的抗肿瘤机制 | 首次发现大麻二酚可作为HIF-1α/LDHA驱动糖酵解的新型抑制剂,并揭示其通过代谢重编程克服肿瘤代谢耐药的潜力 | 未明确说明样本量大小及具体实验模型细节 | 研究大麻二酚在结直肠腺癌中的抗肿瘤作用机制 | 结直肠腺癌细胞及组织 | 癌症代谢研究 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、网络药理学、蛋白质组学、代谢分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2025-11-13 |
Integrated ERK-PKA-YAP/TAZ-SHH Signaling Orchestrates Cortical Radial Glia Identity and Lineage Diversification
2025-Nov-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513571
PMID:41221591
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研究论文 | 本研究揭示了ERK-PKA-YAP/TAZ-SHH信号网络如何协调小鼠皮层放射状胶质细胞的命运决定和谱系多样化 | 首次发现ERK和PKA信号通过抑制YAP/TAZ和SHH信号通路来维持皮层放射状胶质细胞的神经发生能力,并鉴定了一个三方信号网络 | 主要基于小鼠遗传模型,人类数据仅为已发表数据的重新分析 | 探索控制皮层放射状胶质细胞谱系进展的信号通路整合机制 | 小鼠皮层放射状胶质细胞和人类皮层外层放射状胶质细胞 | 发育生物学 | NA | 小鼠遗传模型、单细胞RNA测序数据分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 234 | 2025-11-13 |
MCUB Inhibits PRKN-Dependent Mitophagic Degradation of PD-L1 to Promote Immune Evasion in Bladder Cancer
2025-Nov-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514764
PMID:41221601
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研究论文 | 本研究揭示了MCUB通过抑制PRKN依赖性线粒体自噬来稳定PD-L1蛋白,从而促进膀胱癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现MCUB-PRKN-PD-L1轴在膀胱癌免疫逃逸中的关键作用,并提出靶向MCUB-PRKN相互作用可作为精准治疗策略 | NA | 探讨MCUB在肌层浸润性膀胱癌免疫逃逸中的作用机制 | 肌层浸润性膀胱癌组织和细胞 | 癌症免疫学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学分析, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 235 | 2025-11-13 |
Single-Cell Transcriptome Atlas Reveals the Underlying Mechanism of Kynurenic Acid in the Regulation of Tumor Immune Microenvironment in Glioblastoma
2025-Nov-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507705
PMID:41221633
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组图谱揭示了犬尿酸在胶质母细胞瘤中调节肿瘤免疫微环境的潜在机制 | 首次系统阐明犬尿酸通过重塑髓系免疫抑制细胞和逆转T细胞耗竭来增强抗肿瘤免疫反应的作用机制 | 研究主要依赖小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;T细胞缺陷模型虽证实适应性免疫的必要性,但具体机制细节仍需深入探索 | 探究犬尿酸在胶质母细胞瘤免疫微环境调节中的功能机制 | 胶质母细胞瘤组织样本和原位移植小鼠模型 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式细胞术,蛋白质组学,流式细胞术,靶向代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,流式细胞数据 | 临床队列组织样本和原位GBM小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 236 | 2025-11-13 |
Bronchial Epithelial Transcriptome Reveals Dysregulated Interferon and InflammatoryResponses to Rhinovirus in Exacerbation-Prone Pediatric Asthma
2025-Nov-11, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197711
PMID:41217821
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研究论文 | 本研究通过支气管上皮转录组分析揭示了易急性加重儿科哮喘患者对鼻病毒的干扰素和炎症反应失调机制 | 首次在器官型支气管上皮培养模型中结合bulk和单细胞转录组学,揭示了易急性加重哮喘儿童存在基线干扰素活性降低的致病机制 | 研究样本量有限,且为体外培养模型,需在更大队列和体内模型中验证 | 阐明鼻病毒诱发哮喘急性加重的宿主易感因素和分子机制 | 哮喘儿童和健康儿童的器官型支气管上皮细胞培养物 | 单细胞组学 | 哮喘 | bulk转录组测序, 单细胞转录组测序, 靶向蛋白分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 特征明确的哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 237 | 2025-11-13 |
The cervicovaginal microbiome associates with spatially restricted host transcriptional signatures throughout the human ectocervical epithelium and submucosa
2025-Nov-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013677
PMID:41218071
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了宫颈阴道微生物组与人类宫颈上皮和黏膜下区域空间特异性宿主转录特征之间的关联 | 首次使用空间转录组学技术系统揭示微生物组在整个宫颈黏膜组织中的空间转录影响,突破了传统认为微生物定植仅限于腔面表层的认知 | 样本量相对较小(n=21),且研究对象仅限于肯尼亚女性性工作者群体 | 探究宫颈阴道微生物组对宫颈组织转录景观的影响及其与HIV易感性的潜在关联 | 肯尼亚女性性工作者的宫颈组织样本 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学 | 加权基因共表达分析 | 空间转录组数据 | 21例宫颈组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 238 | 2025-11-13 |
High-Resolution Multiplexed Sequencing of Single-Cell Full-length Transcriptome Via Combinational Barcoded Tn5 Transposon Insertion
2025-Nov-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516013
PMID:41218139
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研究论文 | 本文提出了一种名为CBTi-seq的新型单细胞全长转录组测序技术,通过组合条形码Tn5转座子插入实现高分辨率多重测序 | 利用Tn5转座酶介导的组合条形码和UMI分子组装,实现单细胞全长转录组的高分辨率测序,正交组合条形码设计在减少DNA条形码多样性的同时增强多重检测灵活性 | NA | 开发一种能够在单细胞水平实现全长转录组高分辨率测序的新方法 | 基因编辑细胞和人类睾丸细胞 | 单细胞测序技术 | 生殖发育疾病 | 单细胞全长转录组测序,组合条形码Tn5转座子插入测序 | NA | 单细胞转录组数据,空间分辨组织微环境数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | CBTi-seq | 组合条形码Tn5转座子插入测序技术,兼容单细胞和空间分辨组织微环境分析 |
| 239 | 2025-11-13 |
FAM135B Deficiency Inhibits Cytotoxic T-Cell Activity in Triple-negative Breast Cancer by Blocking the IFI16-dependent STING Pathway
2025-Nov-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0310
PMID:41218197
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研究论文 | 本研究揭示FAM135B通过调控IFI16依赖性STING通路激活细胞毒性T细胞,影响三阴性乳腺癌免疫治疗疗效 | 首次发现FAM135B作为抗肿瘤免疫调节因子,通过竞争性阻断TRIM21介导的IFI16泛素化降解来激活STING通路 | NA | 探究三阴性乳腺癌免疫检查点阻断治疗反应差异的分子机制 | 三阴性乳腺癌患者样本和免疫细胞 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序,功能实验 | NA | 单细胞测序数据,分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 240 | 2025-11-13 |
Multimodal learning enables chat-based exploration of single-cell data
2025-Nov-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02857-9
PMID:41219484
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研究论文 | 开发了名为CellWhisperer的人工智能模型和软件工具,用于通过自然语言对话探索单细胞数据 | 建立了转录组与其文本注释的多模态嵌入,通过对比学习连接基因表达与文本描述,实现自然语言交互式探索单细胞数据 | NA | 解决单细胞测序数据解释的挑战,实现交互式单细胞数据探索 | 单细胞RNA测序数据和文本注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序,对比学习 | 多模态嵌入模型,大语言模型 | 基因表达数据,文本数据 | 100万个RNA测序图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |