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当前共找到 40356 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2026-06-10
Optimized Preparation of Whole Murine Tumor-Bearing Lung Tissue for Flow Cytometry and Single-Cell RNA-Sequencing
2026-May-22, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 提出一种从荷瘤小鼠肺组织中制备高质量单细胞悬液的优化方案,用于流式细胞术和单细胞RNA测序 针对荷瘤肺组织纤维化和异质性导致的单细胞制备难题,开发了一套包含组织灌注、可控酶解和温和机械解离的标准化流程,成功获得>85%的活细胞率 未说明 建立从健康及荷瘤小鼠肺组织中高效分离活单细胞的实验方案,以支持单细胞RNA测序研究 Kras突变驱动的NSCLC小鼠模型中的tdTomato标记肿瘤细胞及健康肺组织细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术 未说明 单细胞转录组数据 未见明确样本量描述,涉及Kras; tdTomato报告基因小鼠模型的荷瘤及健康肺组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 未说明
222 2026-06-10
Single-cell analysis identifies endothelial venous thromboembolism signatures as predictors of immunotherapy resistance and survival across cancers
2026-May-19, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH IF:5.5Q1
研究论文 通过单细胞分析识别肿瘤相关内皮细胞的静脉血栓栓塞特征,作为癌症免疫治疗耐药和生存预测因子 首次系统性地在多种肿瘤中基于单细胞RNA测序数据定义内皮细胞静脉血栓栓塞转录特征,并构建了具有预后和免疫治疗反应预测价值的Endo.VTM模型 该研究主要基于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性临床验证队列 表征肿瘤微环境中静脉血栓栓塞相关的转录特征,识别内皮特异性风险基因,并建立连接高凝状态、免疫功能障碍和肿瘤进展的预后模型 肿瘤相关内皮细胞 机器学习 肿瘤相关静脉血栓栓塞 单细胞RNA测序、批量RNA测序、CRISPR-Cas9依赖筛选 预后模型(Endo.VTM) 基因表达数据 38个单细胞RNA测序数据集,涵盖多种肿瘤类型;使用TCGA和GEO的批量RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
223 2026-06-10
Integrated transcriptomic analysis reveals lymphatic Icam1-mediated immune dynamics after myocardial infarction
2026-May-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 通过整合转录组分析揭示了心肌梗死后淋巴管内皮细胞中Icam1介导的免疫动态变化 首次使用LEC特异性Icam1条件敲除小鼠模型,并结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统性研究了Icam1在心肌梗死后免疫微环境重塑中的作用 未明确说明限制,但可能包括小鼠模型与人类差异及时间点选择 阐明淋巴管内皮细胞中Icam1如何调控心肌梗死后免疫微环境 心肌梗死后小鼠心脏中的淋巴管内皮细胞和免疫细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 条件敲除小鼠模型 基因表达数据 心肌梗死后3、7、21和42天的小鼠心脏样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
224 2026-06-10
In Silico Reconstruction of Primary and Metastatic Tumor Architecture Using Geographic Information System-Augmented Spatial Transcriptomics
2026-May-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 利用地理信息系统增强的空间转录组学在计算机中重构原发性和转移性肿瘤结构 提出了一种结合通路或细胞类型富集分析与空间自相关测量的生物信息学分析框架(GIS-ROTA),在识别空间域之前考虑生物学功能,提供直接可解释性并减少传统分析方法中聚类结果的主观性 未在摘要中明确说明 开发一种利用地理信息系统增强的空间转录组学分析方法,以揭示肿瘤微环境中的功能性空间域 原发性和转移性雌激素受体阳性乳腺癌肿瘤样本 计算病理学 乳腺癌 空间转录组学 NA 空间转录组学数据 原发性和转移性雌激素受体阳性乳腺癌肿瘤样本(具体数量未提供) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学实验
225 2026-06-10
Serglycin Drives LAG3+ Treg Differentiation and Immunosuppression in Gastric Cancer
2026-May-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 研究肿瘤细胞来源的Serglycin通过CD44-TGFβRI-SMAD3信号通路驱动LAG3阳性调节性T细胞分化,从而促进胃癌免疫抑制的机制 首次揭示SRGN-CD44信号通过糖酵解-氧化-泛素化级联反应调控LAG3蛋白稳定性进而促进Treg分化的新机制,为靶向该通路改善胃癌免疫治疗提供临床前证据 已有研究主要聚焦于胃癌中SRGN促进肿瘤进展的功能,但本研究通过单细胞RNA测序分析进一步阐明其在免疫调节中的具体作用 探究肿瘤细胞来源的Serglycin在胃癌免疫调节中的功能及驱动LAG3阳性Treg分化的分子机制 胃癌患者肿瘤组织及配对邻近正常胃黏膜组织中的CD4+调节性T细胞 machine learning 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组测序数据 23对胃癌组织及相邻正常胃黏膜组织 NA 单细胞RNA-seq NA 整合了已发表的单细胞RNA测序数据集
226 2026-06-10
Glomerular Endothelial Rarefaction Associated With Hypoxic Neutrophils Marks Renal Pathology Activity in Lupus Nephritis
2026-May-15, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究探讨狼疮性肾炎患者肾组织中与低氧中性粒细胞相关的肾小球内皮稀疏化及其在肾病理活动中的标志作用 首次通过空间转录组学和多重循环免疫荧光技术揭示狼疮性肾炎中肾小球低氧微环境与中性粒细胞胞外陷阱形成的关联,并提出尿液中中性粒细胞货物蛋白可作为疾病活动性的无创生物标志物 研究样本量有限,且未进行纵向随访以验证低氧中性粒细胞与肾损伤进展的因果关系 探究狼疮性肾炎患者肾组织中低氧和免疫介导损伤的空间转录组特征 狼疮性肾炎患者肾活检组织及肾移植健康对照组织 数字病理学 狼疮性肾炎 空间转录组学、多重循环免疫荧光、酶联免疫吸附测定 NA 空间基因表达数据、免疫荧光图像 狼疮性肾炎患者和肾移植对照组的肾活检样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学分析
227 2026-06-10
Lense: Optimizing data preprocessing in single-cell omics using LLMs
2026-May-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍一种名为Lense的基于语言模型的方法,用于自动优化单细胞组学数据预处理 利用大语言模型自动选择最优预处理流程,无需手动调参,并整合到Seurat平台中 未在标题和摘要中明确说明局限性 优化单细胞组学数据预处理,提高鲁棒性 单细胞组学数据,尤其是空间转录组学等新兴平台的数据 机器学习 NA 单细胞组学 大语言模型 单细胞组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
228 2026-06-10
Gut-brain axis-mediated mechanisms and immune regulatory pathways in vascular dementia: Insights into microbiota-derived metabolites and novel therapeutic strategies
2026-May-08, Behavioural brain research IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过整合框架分析肠道微生物及其代谢物通过肠脑轴影响血管性痴呆的分子机制,并鉴定PIK3CG为关键致病基因 首次结合多机器学习方法(LASSO、神经网络、SVM-RFE)与SHAP分析、孟德尔随机化、单细胞RNA测序及肠道微生物-代谢物-靶点网络和分子对接,系统揭示血管性痴呆中肠脑轴介导的免疫调节通路及潜在治疗策略 未在独立队列或动物模型中验证PIK3CG的因果关系及代谢物-蛋白质相互作用的体内效果 阐明血管性痴呆中肠脑轴介导的分子机制并探索基于肠道微生物代谢物的新型治疗策略 血管性痴呆相关的差异表达基因、肠道微生物代谢物及免疫调节通路 自然语言处理 血管性痴呆 RNA-seq, 单细胞RNA测序 LASSO, 神经网络, SVM-RFE 基因表达数据, 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
229 2026-06-10
Hepatocyte-targeted Bap1 reduction in the liver primes an inflammatory transcriptional response
2026-May-06, G3 (Bethesda, Md.)
研究论文 通过CRISPR/Cas9技术在小鼠肝细胞特异性敲除Bap1,结合空间转录组学和分析免疫组化,研究Bap1缺失对肝脏生物学和损伤应答的影响 首次在体内小鼠模型中通过AAV8介导的CRISPR/Cas9实现肝细胞特异性Bap1敲除,并结合单细胞分辨率空间转录组学与定量纹理分析,揭示Bap1在肝脏免疫细胞反应中的关键调控作用 未提及 探究Bap1在肝脏中的正常功能及其缺失对肝脏损伤应答和免疫环境的影响 小鼠肝细胞 数字病理学 肝细胞癌 CRISPR/Cas9基因组编辑, 空间转录组学, 免疫组化, 批量RNA测序 NA 基因表达数据, 图像 小鼠肝脏组织样本 NA 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
230 2026-06-10
Lense: optimizing data preprocessing in single-cell omics using large language models
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 介绍Lense,一种利用大语言模型自动优化单细胞组学数据预处理的框架 首次将大语言模型应用于单细胞组学数据预处理流程的自动化选择,替代传统手动调参方式 依赖低维可视化图的质量比较,可能难以处理需要更复杂评估指标的预处理步骤 开发自动化方法提升单细胞组学数据预处理的鲁棒性和效率 单细胞组学数据(包括空间转录组数据)的预处理流程优化 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 大语言模型 单细胞组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
231 2026-06-10
Xenium-based spatial transcriptomic analyses uncover prognosis-associated heterogeneity in the tumor microenvironment (TME) of angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL)
2026-May, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 利用基于Xenium的空间转录组技术分析血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)肿瘤微环境中的预后相关异质性 首次在AITL中鉴定出具有干性特征的NEIL3+滤泡辅助T细胞(Tfh)新亚群,并揭示难治/复发型与治疗响应型肿瘤微环境在免疫细胞组成和组织上的显著差异 未明确提及,但样本量较小(10例临床样本),可能限制结果的普适性 阐明难治/复发型AITL的肿瘤微环境异质性及潜在的预后和治疗靶点 10例血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)临床样本 数字病理学 血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL) 空间转录组学 NA 空间转录组数据 10例临床样本(包括难治/复发型和治疗响应型) 10x Genomics 空间转录组学 Xenium 基于Xenium的空间转录组分析
232 2026-06-10
Decoding the Cardiac Immune Microenvironment and Fibroblast Crosstalk in Radiotherapy Combined with Immunotherapy-Induced Cardiac Fibrosis Based on Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 基于单细胞转录组分析解码放疗联合免疫治疗诱导心脏纤维化中的心脏免疫微环境和成纤维细胞交互作用 首次通过单细胞转录组分析揭示放疗联合免疫治疗(放射免疫治疗)诱导心脏纤维化中成纤维细胞与免疫细胞(特别是IL-6介导的成纤维细胞-巨噬细胞交互作用)的关键机制,并发现托珠单抗(IL-6R抑制剂)具有缓解心脏毒性的治疗潜力 未提及具体局限性,但可能包括临床样本量有限、动物模型与人类病理差异、长期心脏毒性评估不足等 阐明放射免疫治疗诱导心脏纤维化的潜在机制,特别是心脏微环境中成纤维细胞与免疫细胞的交互作用,并探索靶向干预策略 放射免疫治疗诱导心脏纤维化的小鼠模型和接受胸部分次放疗联合免疫治疗的患者 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 临床前小鼠模型(多个时间点:第28天、3个月、5个月)和患者血清样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
233 2026-06-10
Stabilin-1+ lipid-associated macrophages promote lung adenocarcinoma liver metastasis and osimertinib resistance through impairing macrophage phagocytosis via SIRPα-CD47 axis
2026-May, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 研究揭示STAB1+脂质相关巨噬细胞通过SIRPα-CD47轴损害巨噬细胞吞噬功能,促进肺腺癌肝转移和奥希替尼耐药 首次鉴定出STAB1+脂质相关巨噬细胞亚群在肺腺癌肝转移中富集,并阐明其通过SIRPα-CD47信号抑制巨噬细胞吞噬作用的机制 未明确说明局限性 探究脂质相关巨噬细胞在肺腺癌肝转移和奥希替尼耐药中的功能及分子机制 肺腺癌患者原发肿瘤和肝转移肿瘤组织、小鼠异种移植模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、RNA-seq、Luminex多因子检测、免疫共沉淀 NA 基因表达数据、细胞共培养数据 人类原发性和肝转移性肺腺癌肿瘤组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
234 2026-06-10
Single-cell transcriptomics reveals diversity and conservation of chicken lymphocytes
2026-May, Poultry science IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组学构建鸡免疫器官高分辨率图谱,揭示了淋巴细胞的多样性和保守性 首次系统构建鸡胸腺、法氏囊和脾脏三个主要免疫器官的单细胞转录组图谱,鉴定出24种免疫和基质细胞类型,并比较了它们在不同器官中的分布与发育轨迹 未说明 了解禽类免疫防御机制,推进家禽抗病育种,并为脊椎动物免疫学提供进化见解 鸡(Gallus gallus)的三个主要免疫器官:胸腺、法氏囊和脾脏 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
235 2026-06-10
Construction of a multi-tissue immune atlas for Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis) reveals granulocyte functional adaptation and underlying regulatory mechanisms
2026-May, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序数据,构建了半滑舌鳎多组织免疫图谱,揭示了粒细胞功能适应及调控机制 首次在鱼类中系统描述粒细胞亚群的功能适应性和组织特异性分布,发现保守的cd44b介导的通讯模块 信息不足,输出NA 解析鱼类粒细胞在不同组织微环境中的功能适应性及其调控机制 半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)的血液、肝脏、脾脏和头肾中的粒细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多组织样本(血液、肝脏、脾脏、头肾) 信息不足,输出NA 单细胞RNA测序 信息不足,输出NA 信息不足,输出NA
236 2026-06-10
Pancancer Fine-Mapping of Mutational Intolerance Identifies CHEK1 as an Immunosuppressive Driver in Lung Adenocarcinoma
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过泛癌突变不耐受基因精细定位,发现CHEK1在肺腺癌中作为免疫抑制驱动因子的作用 开发了miDriver计算框架,通过泛癌-正常组织突变对比识别突变不耐受基因,并发现CHEK1作为双重治疗靶点,同时破坏肿瘤内在适应性和重塑免疫抑制微环境 未明确提及 识别泛癌中的突变不耐受基因并探索其作为治疗靶点的潜力 突变不耐受基因,特别是CHEK1 机器学习 肺腺癌 单细胞转录组学, 多重免疫荧光, CRISPR筛选 NA 基因组数据, 转录组数据 8,096个肿瘤样本,涵盖13种癌症类型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
237 2026-06-10
Radiotherapy disrupts ferroptosis tolerance by reducing DNMT1 levels and uncouples STING silencing in LKB1-deficient lung tumors
2026-May, Free radical biology & medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示LKB1缺陷肺癌中放疗通过降低DNMT1水平破坏铁死亡耐受并解除STING沉默,联合抗PD-1抗体可有效抑制肿瘤 首次发现LKB1缺陷通过铁死亡耐受导致免疫检查点抑制剂耐药,并阐明放疗通过DNMT1-OSGIN1轴和STING通路双重机制逆转该耐药 主要基于小鼠模型和临床队列分析,尚需更多临床验证及机制深入研究 探究LKB1缺陷非小细胞肺癌对免疫检查点抑制剂原发耐药的机制及放疗逆转策略 LKB1缺陷肺癌细胞、Kras驱动Lkb1条件敲除小鼠模型及多个临床队列样本 生物医学研究 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个临床队列及基因工程小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
238 2026-06-10
Single-cell insights into cisplatin resistance mechanisms in bladder cancer tumor microenvironment
2026-May, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序与体外实验验证,揭示了膀胱癌肿瘤微环境中顺铂耐药性的分子机制和细胞异质性 通过整合顺铂敏感与耐药膀胱癌样本的单细胞测序数据,首次系统鉴定了耐药细胞亚群、代谢重编程特征及MIF信号通路在耐药性形成中的关键作用 未提及体内模型验证及多中心临床试验中的泛化性验证 阐明膀胱癌顺铂耐药性的分子机制并识别潜在治疗靶点 膀胱癌肿瘤微环境中的多个细胞亚群,包括耐药上皮细胞、成纤维细胞、免疫细胞等 机器学习 膀胱癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 整合了顺铂敏感和耐药膀胱癌样本的单细胞RNA测序数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
239 2026-06-10
Intra-Tissue Bacteriome and Cellular Profiles in Periodontal Granulation Tissue From Osseous Defects and Extraction Sockets
2026-May, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1
研究论文 研究牙周肉芽组织在骨缺损和拔牙窝中的组织内菌群和细胞特征,探索其生物学本质和转化潜力 首次系统比较骨缺损区、拔牙窝和牙周袋壁组织的组织内菌群与细胞谱,发现骨缺损区牙周肉芽组织具有健康相关菌群和高间充质干细胞比例 样本量有限(49例患者),需要进一步转化研究以验证牙周肉芽组织作为间充质干细胞替代来源用于牙周再生 阐明牙周肉芽组织在不同临床来源中的菌群和细胞特征,探索其再生医学应用价值 严重牙周炎患者的牙周肉芽组织样本(来自骨缺损、拔牙窝和牙根表面)及对照牙周袋壁组织 数字病理学 牙周病 16S rRNA测序,单细胞测序,组织学分析 NA 基因序列数据,组织图像,细胞计数数据 49例严重牙周炎患者的牙周肉芽组织样本(包括手术区骨缺损组织、拔牙窝组织、牙根表面组织及对照牙周袋壁组织) Illumina 16S rRNA测序,单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 16S rRNA基因测序和单细胞RNA测序均使用Illumina NovaSeq平台
240 2026-06-10
ATP-binding cassette subfamily A member 5 suppresses pancreatic ductal adenocarcinoma progression and chemoresistance by promoting β-catenin ubiquitin-dependent degradation
2026-May, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 该研究首次确定ABCA5在胰腺导管腺癌中作为肿瘤抑制因子,通过促进β-catenin的泛素依赖性降解来抑制肿瘤进展和化疗耐药 首次发现ABCA5通过与BTRC的WD40重复结构域结合诱导β-catenin泛素依赖性降解,抑制WNT通路,并验证了ABCA5过表达联合吉西他滨和PRI-724的治疗效果 研究未明确ABCA5在PDAC中表达下调的机制,且临床样本量有限 探究ABCA5在胰腺导管腺癌中的功能及其分子机制 胰腺导管腺癌肿瘤样本、细胞系、小鼠模型及患者来源类器官 机器学习 胰腺导管腺癌 RNA-seq,单细胞RNA-seq,免疫荧光,质谱分析,免疫共沉淀,泛素化检测 NA 转录组数据 80个临床胰腺导管腺癌样本 Illumina 单细胞RNA-seq,转录组测序 Illumina NovaSeq 批量转录组测序和单细胞RNA测序用于表达分析
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