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当前共找到 40084 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-06-05 |
Single-cell pseudotime and cell communication analysis of pancreatic cancer
2026-Feb, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/203156
PMID:41662508
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研究论文 | 通过单细胞伪时间轨迹和细胞通讯分析，揭示胰腺癌进展中的细胞和分子机制 | 首次整合单细胞伪时间轨迹和细胞间通讯分析，深入剖析胰腺癌肿瘤微环境中的细胞多样性及相互作用 | 未提及具体限制 | 阐明胰腺癌进展的细胞和分子调控机制 | 胰腺癌组织中的癌细胞、基质成纤维细胞及多种免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2026-06-05 |
SpaLSTF: Diffusion-based generative model with BiLSTM and XCA-Transformer for spatial transcriptomics imputation
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013954
PMID:41666195
|
研究论文 | 提出SpaLSTF方法，利用条件扩散模型结合BiLSTM和XCA-Transformer来增强空间转录组数据中的基因表达 | 首次将双马尔可夫过程与BiLSTM和交叉协方差注意力Transformer结合，用于空间转录组数据的基因表达推断，并通过变分下界和KL散度正则化提升噪声生成的准确性 | 未涉及在实际生物样本中的验证；仅基于现有数据集进行性能比较，缺乏对模型泛化性的深入探讨 | 开发一种新方法以解决空间转录组数据稀疏性和表达覆盖不完整的问题 | 空间转录组数据中的细胞和基因表达模式 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 条件扩散模型、双向长短期记忆网络（BiLSTM）、交叉协方差注意力Transformer（XCA-Transformer） | 基因表达数据（空间转录组和scRNA-seq） | 12个跨平台数据集，涵盖多种组织和器官 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 223 | 2026-06-05 |
Environmental bisphenols hijack the Hmox1 and Cdh1 to trigger premature ovarian insufficiency: A multi-omics investigation
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119789
PMID:41666766
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示环境双酚类化合物通过劫持Hmox1和Cdh1基因引发早发性卵巢功能不全的分子机制 | 首次整合机器学习与单细胞RNA测序解析双酚类化合物致POI关键靶点Hmox1和Cdh1 | 未提供具体样本量及临床验证数据 | 鉴定双酚类化合物诱发早发性卵巢功能不全的关键分子靶点与信号通路 | 双酚A、双酚F、双酚S暴露与早发性卵巢功能不全的分子关联 | 机器学习 | 早发性卵巢功能不全 | 多组学分析、单细胞RNA测序、分子对接 | 三重算法机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | ['10x Genomics'] | ['单细胞RNA测序'] | ['10x Chromium'] | 基于GSE200612数据集的10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 224 | 2026-06-05 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013956
PMID:41671295
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研究论文 | 对空间转录组学中差异表达基因识别的统计方法进行比较研究，提出基于广义估计方程（GEE）的鲁棒方法 | 提出将广义估计方程框架用于空间转录组学差异表达分析，通过纳入空间相关性有效控制假阳性率 | 未明确提及具体局限性 | 开发并验证一种更稳健的统计方法，以替代忽略空间相关性的Wilcoxon秩和检验，提高差异基因鉴定的准确性 | 空间转录组学数据中的基因表达模式，特别是乳腺癌和前列腺癌组织样本 | 机器学习 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学技术 | 广义估计方程（GEE） | 空间转录组学数据 | 来自乳腺癌和前列腺癌的空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 225 | 2026-06-05 |
Environmental flame retardant EHDPP stabilizes EGFR to accelerate lung cancer progression: Integrated network toxicology, bioinformatics, and in vitro evidence
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119854
PMID:41671956
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研究论文 | 整合网络毒理学、生物信息学和体外实验，揭示环境阻燃剂EHDPP通过稳定EGFR加速肺癌进展的分子机制 | 首次在分子层面阐明EHDPP通过结合EGFR并抑制其泛素化降解，稳定EGFR蛋白并激活PI3K-AKT信号通路，从而促进肺癌进展的致癌机制 | 研究主要基于体外细胞模型和计算预测，缺乏体内动物实验和人群流行病学证据的验证 | 阐明有机磷酸酯阻燃剂EHDPP通过吸入暴露促进肺癌进展的分子机制 | EHDPP诱导肺癌的潜在分子靶点及信号通路 | 生物信息学, 毒理学 | 肺癌 | 网络毒理学, 分子对接, scRNA-seq分析, 细胞实验 | NA | 基因表达数据, scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2026-06-05 |
Identification of Mitophagy-Related Genes With Diagnostic Value in Atherosclerosis Using Bioinformatics Analysis and Experiment Validation
2026-Feb, Chemical biology & drug design
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/cbdd.70260
PMID:41652980
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研究论文 | 结合批量与单细胞RNA测序数据，识别动脉粥样硬化中具有诊断价值的线粒体自噬相关基因，并通过实验验证 | 首次整合批量与单细胞RNA测序数据，系统分析动脉粥样硬化斑块中线粒体自噬相关基因的失调，并通过机器学习构建诊断模型，同时揭示了内皮细胞中线粒体自噬的活跃状态及关键调控因子 | 研究主要基于公共数据集，实验验证仅限于RAW264.7巨噬细胞系，缺乏在人体组织或动物模型中的进一步验证 | 识别动脉粥样硬化中与线粒体自噬相关的诊断基因，并阐明其在疾病发病机制中的作用 | 人体动脉粥样硬化斑块样本及ox-LDL处理的RAW264.7巨噬细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 随机森林, SVM-RFE | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 超过106,000个单细胞及相应批量测序样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 227 | 2026-06-05 |
Calcified Artery Preparation and Processing with Preserved Morphology and RNA for Digital Spatial Profiling
2026-Jan-23, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69159
PMID:41662190
|
研究论文 | 提出一种针对钙化动脉组织进行保存形态和RNA质量的空间转录组学制备流程 | 首次详细描述针对钙化动脉的优化工作流程，涵盖组织处理、固定、脱钙及组织微阵列构建，降低了空间转录组学在血管生物学中的应用门槛 | 未提及具体局限性，但可能受限于样本类型（人胫动脉）和平台（NanoString GeoMx DSP）的通用性 | 建立一套针对钙化血管组织的空间转录组学制备和加工协议 | 人胫动脉病变组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NanoString GeoMx DSP | 图像, 转录组数据 | 未明确说明样本量 | NanoString | 空间转录组学 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler (DSP) | 使用组织微阵列（TMA）和感兴趣区域（ROI）选择策略进行空间转录组分析 |
| 228 | 2026-06-05 |
[The consensus of genetic detection in multiple myeloma in China (2026)]
2026-Jan-14, Zhonghua xue ye xue za zhi = Zhonghua xueyexue zazhi
|
共识 | 本文提出了中国多发性骨髓瘤遗传检测的2026年共识，旨在标准化检测流程、优化高风险遗传异常的解读与报告，并更新风险分层框架 | 基于最新证据对2019年共识进行修订，纳入了全基因组测序和单细胞测序等新技术，并考虑了联合治疗方案对遗传病灶预后影响的改变 | 未明确说明 | 标准化中国多发性骨髓瘤遗传检测，提升高风险患者的识别和管理 | 多发性骨髓瘤的遗传异常 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 细胞遗传学核型分析、荧光原位杂交、下一代测序、全基因组测序、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2026-06-05 |
LncRNAs at the frontline of neuroimmune crosstalk in oral cancer
2026-Jan-06, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxag007
PMID:41660801
|
综述 | 长链非编码RNA在口腔癌神经免疫串扰中的前沿作用 | 不同于以往单独研究神经或免疫机制的综述，本文强调了lncRNA可能调控的神经免疫汇聚通路，并提出可检验的假说和未来研究方向 | 缺乏OSCC特异性功能研究、lncRNA活性的空间或单细胞分辨率数据有限、评估lncRNA驱动周围神经浸润的体内模型不足 | 探讨lncRNA在口腔鳞状细胞癌神经免疫相互作用中的调控作用及潜在机制 | 口腔鳞状细胞癌中的长链非编码RNA及其与神经免疫系统的交互作用 | 机器学习 | 口腔癌 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2026-06-05 |
CeLLTra: aligning cell names with gene expression via a pathway-informed transformer
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf655
PMID:41652996
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research paper | 提出了一种名为CeLLTra的对比学习框架，利用基于Transformer的模型整合生物通路信息，将基因分组为超级标记，从而从单细胞RNA测序数据中捕捉全面的基因表达 | 创新性地将通路信息整合到Transformer模型中，结合预训练领域特定语言模型，实现了细胞类型注释与基因表达谱的精准对齐 | 未在文中明确提及局限性 | 开发一种新的细胞类型注释方法，以解决传统方法因数据质量低和参考数据集不完整带来的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | natural language processing | non-small cell lung cancer | scRNA-Seq | Transformer | gene expression data | 大规模人类scRNA-Seq数据集（具体数量未提及） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 231 | 2026-06-05 |
Integration of single-cell sequencing, transcriptome sequencing, and machine learning for constructing and validating histone acetylation-related prognostic risk models in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1624883
PMID:41659855
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研究论文 | 通过整合单细胞测序、转录组测序和机器学习，构建并验证了肝细胞癌中组蛋白乙酰化相关的预后风险模型 | 首次利用101种机器学习算法组合构建基于组蛋白乙酰化相关基因的肝细胞癌风险预测模型，并综合分析了免疫学、化疗敏感性、铁死亡和m6A甲基化等多个维度 | 研究基于公共数据库数据，可能需要更多独立外部验证；NEU1的具体机制仍需进一步体内实验验证 | 构建基于组蛋白乙酰化的肝细胞癌预后风险模型并验证其临床价值 | 肝细胞癌（LIHC）患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, RNA-seq, 定量实时PCR, 蛋白质印迹 | 机器学习组合算法（101种组合） | 单细胞测序数据, 转录组数据, 临床样本数据 | 多份训练和验证队列，包括10种LIHC亚型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 232 | 2026-06-05 |
Epithelial Cell-Specific Prognostic Signature (FTH1, RIT1, WASL, NDRG2, KIFC3) Stratifies Cervical Cancer Patients and Correlates With Immune Infiltration
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4109928
PMID:41660555
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据构建宫颈癌上皮细胞特异性预后基因签名（FTH1、RIT1、WASL、NDRG2、KIFC3），并分析其与免疫浸润及药物敏感性的关联 | 首次从单细胞层面聚焦宫颈癌上皮细胞异质性，通过hdWGCNA鉴定上皮细胞亚群特异性基因模块，构建五基因预后模型，并验证了FTH1在宫颈癌细胞中的功能 | 研究依赖于公开数据集GSE208653，样本量和数据来源有限；预后模型的临床适用性需更大规模前瞻性队列验证；具体基因功能机制未深入探索 | 开发宫颈癌上皮细胞特异性风险模型，改善临床预后评估并揭示肿瘤免疫微环境变化 | 宫颈癌患者的单细胞RNA测序数据、TCGA-CESC和GSE52903队列的转录组数据及临床信息 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO-Cox回归风险模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | GSE208653数据集包含40457个细胞，TCGA-CESC和GSE52903队列的批量转录组样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2026-06-05 |
Integrated multi-omics, spatial profiling and organoid modeling drive transformative advances in chronic liver disease and hepatocellular carcinoma immunomicroenvironment research
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743439
PMID:41668742
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综述 | 系统总结了单细胞测序、空间转录组学和类器官模型在慢性肝病及肝细胞癌免疫微环境研究中的突破性应用，强调多组学整合、空间分析和类器官建模的协同作用推动了从静态描述到时空机制解码的范式转变 | 首次系统性整合单细胞测序、空间转录组学和类器官模型三大前沿技术，揭示其在解析肝免疫微环境时空动态、免疫逃逸机制及个体化治疗方面的协同创新 | 未提及具体技术的局限性，如单细胞测序的覆盖深度、空间转录组学的分辨率限制或类器官模型对体内微环境模拟的不足 | 阐述多组学整合、空间分析和类器官建模在慢性肝病免疫学研究中推动从静态细胞描述到时空机制解码及个体化治疗的范式转变 | 慢性肝病和肝细胞癌的免疫微环境，包括免疫细胞异质性、免疫-基质相互作用、纤维化、脂肪性肝炎及肿瘤免疫逃逸机制 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS,RNA-seq,甲基化测序 | 类器官模型 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 234 | 2026-06-05 |
Molecular crosstalk between MASLD and IVDD revealed through integrated biomarker discovery analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1703972
PMID:41668749
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研究论文 | 通过整合生物标志物发现分析揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）与椎间盘退变（IVDD）之间的分子交互作用 | 首次通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据集，系统揭示MASLD与IVDD之间的共享分子机制和生物标志物 | 研究仅基于有限样本验证，尚未在更大规模队列中进行确认；共病患者的分子变化机制需要进一步功能实验验证 | 探究MASLD与IVDD之间潜在的分子交互作用及共享致病机制 | MASLD患者、IVDD患者及共病患者 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病, 椎间盘退变 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 10,388个NAFLD细胞和35,846个IVDD细胞 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2026-06-05 |
Single cell atlas of the comorbidity mechanism between chronic obstructive pulmonary disease and lung adenocarcinoma: a study of multi-omics combined analysis
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20672
PMID:41669548
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研究论文 | 通过多组学联合分析揭示慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌共病机制的单细胞图谱 | 首次结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和多组学方法，系统揭示COPD与LUAD共享的关键基因（FCRLA、GREM1、MMP9）及其在免疫调节和细胞外基质重塑中的协同作用 | 未明确指出研究的具体局限性，如样本量大小或验证范围的限制 | 阐明慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌共病的共享分子机制，识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 慢性阻塞性肺疾病和肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 全基因组关联研究, 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 实时定量PCR | LASSO回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 血液样本 | 患者血液样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2026-06-05 |
Immunorepertoire-based characterization of adaptive immunity in human malignant pleural effusion
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1825360
PMID:42130624
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和单细胞V(D)J测序全面表征人肺腺癌相关恶性胸腔积液中的适应性免疫特征 | 首次在单细胞水平同时分析恶性胸腔积液中TCR和BCR库的全面特征，揭示调节性T细胞和B细胞偏好特定V(D)J基因片段，以及Th1/17细胞克隆扩增与代谢适应和MPE特异性抗原识别相关 | 未发现BCR库存在显著克隆型或功能变化 | 阐明恶性胸腔积液中适应性免疫细胞（TCR和BCR库）的特征及其在免疫发病机制中的作用 | 人肺腺癌相关性恶性胸腔积液和外周血样本中的适应性免疫细胞 | 单细胞组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞免疫库数据 | 恶性胸腔积液与外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞V(D)J测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序和单细胞V(D)J测序 |
| 237 | 2026-06-05 |
Integrative Multiomics Analysis Reveals Tumor-Associated Macrophage Heterogeneity and a Prognostic Signature in Gastric Cancer
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/6130883
PMID:42211756
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、批量转录组学和空间转录组学数据，系统表征了胃癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并构建了预后标志物 | 首次通过多组学整合分析全面揭示胃癌TAM异质性，并基于CoxBoost模型构建了七基因预后签名，包括UPP1、VCAN等新标志物 | 未明确说明局限性，可能包括样本量有限或验证队列不足 | 系统表征胃癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，并识别预后生物标志物 | 胃癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | CoxBoost模型 | 文本、图像（scRNA-seq、空间转录组数据） | 包含多个队列的转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 238 | 2026-06-05 |
Lactylation-mediated remodelling of the breast cancer microenvironment: single-cell multidimensional analysis and prognostic model construction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1747043
PMID:42212139
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研究论文 | 通过单细胞多维度分析，研究乳酸化修饰在乳腺癌微环境重塑中的作用，并构建预后模型 | 首次在单细胞水平系统解析乳酸化相关转录活性在乳腺癌细胞亚型中的分布，并建立14基因预后模型 | 乳酸化评分作为间接替代指标而非直接测量，需进一步机制和临床验证 | 阐明乳酸化修饰在乳腺癌微环境中的细胞类型分布及其临床意义 | 乳腺癌肿瘤微环境中的细胞群，包括上皮细胞、成纤维细胞、髓系细胞等 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），LASSO-Cox回归 | NA | 单细胞基因表达数据，RNA测序数据 | 26个单细胞RNA测序样本，包含98,572个细胞；TCGA-BRCA、GSE20685、METABRIC数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2026-06-05 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analyses reveal a stem-like epithelial subpopulation in adenocarcinoma of the esophagogastric junction and identify VASN as a novel regulator of tumor stemness
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1817030
PMID:42212140
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研究论文 | 通过整合单细胞与批量转录组分析，鉴定食管胃交界腺癌中的干细胞样上皮亚群，并发现VASN作为肿瘤干性的新型调节因子 | 首次在食管胃交界腺癌中整合单细胞和批量RNA测序，系统鉴定出具有干细胞特性的恶性上皮亚群，并发现VASN作为全新的肿瘤干性调节因子，通过Wnt/β-catenin信号通路影响肿瘤恶性表型 | 未在体内动物模型中进一步验证VASN的功能；所使用单细胞数据集的样本量可能有限，且缺乏外部独立验证队列 | 探究食管胃交界腺癌中干细胞样上皮亚群的特征及其在肿瘤免疫微环境中的作用，并识别潜在的治疗靶点 | 食管胃交界腺癌患者的肿瘤组织样本及癌细胞系 | 数字病理学, 自然语言处理, 机器学习 | 食管胃交界腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 高通量测序 | CNN, LSTM, GAN | 图像, 文本, 视频 | NA | Illumina, 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒, Illumina NovaSeq 6000 测序平台 |
| 240 | 2026-06-05 |
Metabolic reprogramming of cholesterol biosynthesis drives macrophage-mediated immune suppression in HPV-negative cervical adenocarcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1808107
PMID:42212157
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研究论文 | 本研究揭示了HPV阴性宫颈腺癌中胆固醇生物合成代谢重编程驱动巨噬细胞介导的免疫抑制机制 | 首次发现DHCR7-27-HC-SPP1代谢-免疫轴在HPV阴性宫颈腺癌免疫逃逸中的驱动作用，揭示胆固醇代谢作为潜在治疗靶点 | 基于公共单细胞测序数据集的分析，关键发现在体外细胞系实验中验证，缺乏体内动物模型及临床样本的进一步验证 | 探究HPV阴性与HPV阳性宫颈腺癌免疫微环境差异的分子机制 | 宫颈腺癌组织和正常宫颈组织的单细胞转录组数据，宫颈癌细胞系，巨噬细胞，CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 公共数据库中宫颈腺癌及正常宫颈组织单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |