单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
221	2025-07-04	Spatial Transcriptome Analysis of B7-H4 in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: A Novel Therapeutic Target for Anti-Immune Checkpoint Inhibitors 2025-Jun-30, Head and neck pathology DOI:10.1007/s12105-025-01815-w PMID:40586978	研究论文	本研究通过免疫组化和空间转录组学分析，探讨了B7-H4在头颈部鳞状细胞癌中的治疗潜力	发现B7-H4与PD-L1在肿瘤细胞中呈现互斥表达模式，并证实B7-H4与低CD8+ T细胞浸润显著相关	样本量较小（空间转录组学仅分析6例HNSCC），且未进行功能验证实验	探索头颈部鳞状细胞癌中B7-H4作为免疫检查点抑制剂耐药治疗靶点的潜力	头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）组织样本	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	免疫组化（IHC）、空间转录组学（ST）	NA	组织微阵列图像、空间转录组数据	94例HNSCC、94例相邻鳞状上皮内瘤变、69例正常口腔黏膜（IHC）；6例HNSCC及其配对的瘤变和正常组织（ST）
222	2025-07-04	Low-dose radiotherapy enhances the efficacy of PD-L1 blockade and induces the abscopal effect 2025-Jun-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011487 PMID:40588370	research paper	该研究探讨了低剂量放疗（RT）如何增强PD-L1阻断的疗效并诱导远隔效应	研究发现低剂量RT与抗PD-L1联合治疗在远隔未照射肿瘤中产生与高剂量RT相当的远隔效应，并揭示了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在此过程中的关键作用	研究仅在免疫健全小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证	探索低剂量RT与免疫检查点抑制剂联合治疗在癌症治疗中的优化策略	携带MC38或CT26小鼠肿瘤模型的免疫健全小鼠	癌症治疗	癌症	单细胞RNA测序	小鼠肿瘤模型	RNA测序数据	使用不同剂量RT处理的小鼠肿瘤模型
223	2025-07-04	The CXCL16/CXCR6 axis is linked to immune effector cell-associated neurotoxicity in chimeric antigen receptor (CAR) T cell therapy 2025-Jun-30, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01498-6 PMID:40588764	research paper	该研究探讨了CAR T细胞疗法中免疫效应细胞相关神经毒性综合征(ICANS)的潜在机制，特别是CXCL16/CXCR6轴在其中的作用	首次揭示了CXCL16/CXCR6轴在招募细胞毒性CAR CD4+T细胞至中枢神经系统中的作用，并发现其与ICANS严重程度相关	样本量较小(n=11)，且部分数据来自单个死亡病例的尸检组织	探究CAR T细胞疗法中ICANS的发病机制	接受CAR T细胞治疗后出现ICANS的患者(11例)及其生物样本	免疫治疗	肿瘤免疫治疗并发症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、多模态空间转录组学、免疫荧光	NA	外周血和脑脊液样本、尸检脑组织	11例ICANS患者(不同严重程度分级)及对照组患者
224	2025-07-04	Prediction and validation based on scRNA-seq: ETS2 targets CEBPB to mediate osteoclast differentiation in osteoarthritis progression 2025-Jun-30, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145639 PMID:40602581	研究论文	本研究通过scRNA-seq分析发现ETS2是促进骨关节炎（OA）进展中破骨细胞（OC）分化的关键基因，并揭示了ETS2通过调控CEBPB表达来影响OC分化的机制	首次发现ETS2通过靶向CEBPB调控OC分化，为OA的发病机制和治疗提供了新的见解	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中进行验证	识别驱动OC介导的OA进展的关键分子靶点并探索其机制	破骨细胞（OC）和骨关节炎（OA）	生物医学	骨关节炎	scRNA-seq, ATAC-seq, Cut&Tag	DMM模型小鼠	基因表达数据	未明确说明样本数量
225	2025-07-04	Peritoneal cavity-derived GATA6+ macrophages inhibit fibrosis through IL33 in endometrium 2025-Jun-29, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.06.088 PMID:40592367	研究论文	本研究通过单细胞测序技术，识别并验证了GATA6+巨噬细胞在子宫内膜损伤修复和抑制纤维化中的关键作用	首次发现腹膜腔来源的GATA6+巨噬细胞通过IL33抑制子宫内膜纤维化的机制	研究样本可能仅限于特定类型的子宫内膜损伤患者，未涉及其他病因的子宫内膜疾病	探究子宫内膜损伤后修复过程中巨噬细胞的来源及其功能机制	正常子宫内膜和宫腔粘连(IUA)患者的子宫内膜组织	生殖医学	宫腔粘连	单细胞测序	NA	单细胞RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但包括正常子宫内膜和IUA患者的样本
226	2025-07-04	The progress and trends of the mechanism of cardiopulmonary bypass-associated acute lung injury: A narrative review 2025-Jun-27, Medicine IF:1.3Q2 DOI:10.1097/MD.0000000000043019 PMID:40587734	综述	本文回顾了心肺转流相关急性肺损伤机制的研究进展与趋势	强调未来研究应聚焦于炎症关键靶点（如中性粒细胞、巨噬细胞和糖萼细胞外衣）以及基因编辑和单细胞测序等先进技术	多年来该领域未取得突破性进展，导致管理策略和临床医学措施停滞不前	揭示心肺转流相关急性肺损伤的潜在机制并寻找有效的预防和治疗策略	心肺转流相关急性肺损伤的机制	临床医学	心血管疾病	基因编辑、单细胞测序	NA	NA	NA
227	2025-07-04	Cardiolipin-mimic lipid nanoparticles without antibody modification delivered senolytic in vivo CAR-T therapy for inflamm-aging 2025-Jun-26, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102209 PMID:40602406	研究论文	本研究开发了一种基于卡迪奥脂类似物的脂质纳米颗粒，用于体内递送senolytic CAR-T疗法，以治疗炎症性衰老相关疾病	首次使用无需抗体修饰的卡迪奥脂类似物脂质纳米颗粒实现体内T细胞转染，并延长mRNA表达时间	未提及临床前研究的样本量及长期安全性数据	开发更高效的体内CAR-T细胞工程递送系统，治疗衰老相关炎症性疾病	T细胞、衰老相关炎症性疾病（如肝纤维化和类风湿关节炎）	生物医学工程	类风湿关节炎、肝纤维化	mRNA递送、单细胞测序	CAR-T	RNA序列数据	NA
228	2025-07-04	Sp140L functions as a herpesvirus restriction factor suppressing viral transcription and activating interferon-stimulated genes 2025-Jun-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2426339122 PMID:40526717	研究论文	该研究揭示了Sp140L作为一种疱疹病毒限制因子，通过抑制病毒转录和激活干扰素刺激基因来发挥作用	首次发现Sp140L作为疱疹病毒的限制因子，并揭示了其在干扰素非依赖性先天免疫反应中的作用	研究主要基于EBV病毒模型，对其他疱疹病毒的普适性需要进一步验证	探究疱疹病毒如何逃避宿主防御机制以及宿主限制因子的作用	EB病毒（EBV）及其与宿主B细胞的相互作用	病毒学	多发性硬化症	单细胞RNA测序	EBNA-LP敲除（LPKO）模型	RNA-seq数据	未明确说明样本数量，使用EBNA-LP敲除感染的B细胞
229	2025-07-04	CRISPR for cystic fibrosis: Advances and insights from a systematic review 2025-Jun-17, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.ymthe.2025.06.021 PMID:40534129	系统综述	本文系统综述了CRISPR技术在囊性纤维化(CF)基因治疗中的应用进展，分析了27篇相关研究文章	通过跨研究比较，分析了多种CRISPR技术对CF致病变异的编辑效果，并提出了标准化报告编辑效率和功能恢复的建议	需要更多单细胞RNA测序和体内研究以达到临床相关结论	为CRISPR基因编辑技术在CF治疗中的进一步探索提供技术见解	囊性纤维化(CF)致病变异	基因编辑	囊性纤维化	CRISPR, 同源定向修复, 碱基编辑, 原始编辑	NA	研究文章	27篇研究文章
230	2025-07-04	Epigenetic Reprogramming of Autophagy Leads to Uncovering a Novel Therapeutic Target for Mutant IDH1 Astrocytomas 2025-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.03.08.584091 PMID:38559270	研究论文	本文揭示了自噬在mIDH1胶质瘤中的关键作用，并提出了通过抑制自噬来增强放射敏感性的新治疗策略	发现自噬是mIDH1胶质瘤生存的关键通路，并证明通过阻断该通路可增强放射敏感性	研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果尚需进一步验证	探索mIDH1胶质瘤的治疗新靶点	人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞	肿瘤学	胶质瘤	RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq	NA	基因表达数据	人类和小鼠的mIDH1胶质瘤细胞及患者样本
231	2025-07-04	A Molecular, Spatial, and Regulatory Atlas of the Hydra vulgaris Nervous System 2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.03.15.531610 PMID:36993575	研究论文	本研究提供了Hydra vulgaris神经系统的最全面分子和空间特征	首次通过单细胞RNA测序鉴定了八种神经元类型，并进一步细分为十五种转录不同的亚型，每种亚型具有独特的空间分布和形态	研究仅针对Hydra vulgaris，结果可能不适用于其他生物	揭示神经系统发育、稳态和再生的分子机制	Hydra vulgaris的神经系统	神经科学	NA	单细胞RNA测序, ATAC-seq	NA	分子数据, 空间数据	NA
232	2025-07-04	Transcriptional landscape of pleural mesothelioma patients in relation to NF2 gene mutational status 2025-Jun-09, Journal of the Egyptian National Cancer Institute IF:2.1Q3 DOI:10.1186/s43046-025-00284-0 PMID:40484892	研究论文	本研究探讨了NF2基因突变状态对胸膜间皮瘤患者转录景观的影响	揭示了NF2突变如何影响肿瘤微环境、免疫浸润、细胞因子信号传导及化疗敏感性	样本量相对较小（82例），且缺乏实验验证	阐明NF2基因突变在胸膜间皮瘤生物学行为和治疗反应中的作用	82例胸膜间皮瘤患者	肿瘤基因组学	胸膜间皮瘤	RNA测序、单细胞RNA测序、生物信息学分析（xCell, Cytosig, pRRophetic）	逻辑回归模型	转录组数据	82例胸膜间皮瘤患者（来自TCGA数据库）
233	2025-07-04	Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts 2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.66.6.83 PMID:40576432	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术构建了兔巩膜发育的单细胞转录组图谱，揭示了成纤维细胞的异质性、分化轨迹、基质组表达模式及细胞间通讯	首次构建兔巩膜发育的单细胞图谱，揭示了成纤维细胞的异质性及跨物种保守特征	研究仅针对新西兰兔，未涉及其他物种或人类样本的直接验证	阐明巩膜成纤维细胞的异质性及发育过程中的分子特征	新西兰兔巩膜组织（胚胎25天及出生后7天、21天、180天）	单细胞转录组学	近视	scRNA-seq	NA	单细胞转录组数据	新西兰兔巩膜组织（E25、P7、P21、P180四个发育阶段）
234	2025-07-04	Elevated Fcy receptor expression augments pro-inflammatory macrophage phagocytosis in systemic sclerosis and associated rheumatic diseases 2025-Jun-01, Rheumatology (Oxford, England) DOI:10.1093/rheumatology/keae688 PMID:39672802	research paper	本研究通过分析系统性硬化症（SSc）和其他风湿性疾病的巨噬细胞激活、信号通路及治疗反应，揭示了增强吞噬作用的机制	发现SSc患者巨噬细胞中FCGR基因表达升高及FcγR介导的吞噬途径富集，并指出FcγRI和FcγRII水平升高是增强吞噬活性和IL-6驱动炎症的关键因素	研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序数据，可能无法完全反映体内复杂的免疫环境	探究SSc及其他风湿性疾病中巨噬细胞的促吞噬表型及其机制	健康对照者及SSc、RA、PsA和axSpA患者的皮肤和肺巨噬细胞	免疫学	系统性硬化症及相关风湿性疾病	scRNA-seq, 流式细胞术, Western blot, RT-qPCR	NA	基因表达数据, 蛋白质数据	来自健康对照者及SSc、RA、PsA和axSpA患者的CD14+单核细胞衍生的巨噬细胞
235	2025-07-04	Lung-resident memory CD4+ T cells are dependent on Batf3 2025-Jun-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.1093/jimmun/vkaf035 PMID:40184040	研究论文	本文研究了Batf3转录因子在肺组织中CD4+记忆T细胞积累中的作用及其对过敏反应的影响	揭示了Batf3通过促进特定CD4+记忆T细胞亚群的发育来调控过敏性反应的分子机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探究肺组织中记忆T细胞积累的细胞和分子机制	小鼠肺组织中的CD4+记忆T细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	小鼠哮喘模型	基因表达数据	Batf3缺陷小鼠和对照小鼠
236	2025-07-04	Establishing the causative link between CFAP221 variants and asthenoteratozoospermia in humans 2025-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s10815-025-03472-y PMID:40272718	研究论文	该研究通过全外显子测序和生物信息学分析，确定了CFAP221基因变异与人类弱畸精子症之间的致病联系	首次发现CFAP221是男性不育的新致病基因，并揭示了其在精子鞭毛发育中的关键作用	研究样本仅来自两个中国家庭，样本量较小	探索男性不育的遗传学病因	两个无关中国家庭的不育患者	遗传学	男性不育症	全外显子测序(WES), Sanger测序, 扫描电镜(SEM), 透射电镜(TEM), 免疫荧光染色, 单细胞RNA测序	NA	基因组数据, 显微图像数据	两个家庭的不育患者及其家族成员
237	2025-07-04	Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations 2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.05.20.594981 PMID:38826475	研究论文	利用单细胞转录组学数据，通过细胞类型特异性网络分析，识别与人类骨矿物质密度GWAS关联的潜在因果基因	结合单细胞转录组学数据和GWAS结果，识别出21个网络驱动基因，这些基因可能通过间充质谱系细胞分化调控骨矿物质密度	研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	解析骨矿物质密度GWAS关联的潜在因果基因及其功能背景	Diversity Outbred小鼠的骨髓基质细胞（BMSC-OBs）	基因组学	骨质疏松症	scRNA-seq, eQTL/sQTL分析	NA	单细胞转录组数据	NA
238	2025-07-04	Cardiac Fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development via the collagen signaling pathway 2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.11.612512 PMID:39314489	研究论文	本研究揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和冠状血管发育的功能	首次系统研究了心脏成纤维细胞与心肌细胞、血管内皮细胞在发育过程中的相互作用，并确定了胶原信号通路的关键调控作用	研究主要基于小鼠模型，人类心脏发育可能存在差异；长期成纤维细胞消融的补偿机制需要进一步研究	探究心脏成纤维细胞在心肌和冠状血管发育中的作用机制	小鼠心脏发育过程中的成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞	发育生物学	心血管疾病	scRNA-seq, RNA染色, Pdgfra-CreER控制的DTA消融系统	NA	单细胞转录组数据	不同发育阶段的小鼠心脏组织样本
239	2025-07-04	Pathological α-synuclein dysregulates epitranscriptomic writer METTL3 to drive neuroinflammation in microglia 2025-May-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115618 PMID:40279247	研究论文	本文研究了m6A甲基转移酶复合物中的METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中的作用	揭示了METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中的新功能，并发现其在阿尔茨海默病、帕金森病和路易体痴呆患者中的上调	研究主要基于体外和动物模型，人类组织样本的验证仍需进一步扩大	探究m6A RNA修饰在神经退行性疾病中的作用机制	人类小胶质细胞、星形胶质细胞、阿尔茨海默病、帕金森病和路易体痴呆患者的死后组织	神经科学	阿尔茨海默病, 帕金森病, 路易体痴呆	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	人类死后组织样本及体外细胞模型
240	2025-07-04	A multi-kingdom genetic barcoding system for precise clone isolation 2025-May-21, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-025-02649-1 PMID:40399693	研究论文	介绍了一种多界遗传条形码系统CloneSelect，用于从复杂细胞群中精确分离目标克隆	开发了CloneSelect系统，通过CRISPR碱基编辑技术触发目标克隆表达报告基因以实现分离，适用于多种细胞类型	未提及该系统在临床应用中的效果或可能存在的技术障碍	开发一种能够从复杂细胞群中精确分离目标克隆的技术	人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞	基因工程	NA	CRISPR碱基编辑、单细胞RNA测序	NA	遗传数据	多种细胞类型（人类胚胎肾293T细胞、小鼠胚胎干细胞、人类多能干细胞、酵母细胞和细菌细胞）