单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 30478 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-08-09 |
Distinct mesenchymal cell states mediate prostate cancer progression
2023-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.29.534769
PMID:37034687
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序比较了不同阶段前列腺癌小鼠模型与野生型小鼠的间质细胞，揭示了间质细胞在前列腺癌进展中的作用 | 识别了8个转录和功能上不同的间质细胞群体，并构建了一个能预测前列腺癌转移进展的基因特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证相对有限 | 探究间质细胞在前列腺癌进展中的作用及其分子机制 | 前列腺癌小鼠模型和人类前列腺癌样本 | 癌症研究 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 四种基因工程小鼠模型(GEMMs)及对应野生型小鼠，以及人类肿瘤样本 |
| 222 | 2025-08-09 |
Universal prediction of cell-cycle position using transfer learning
2022-01-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02581-y
PMID:35101061
|
research paper | 介绍了一个名为tricycle的R/Bioconductor包，用于通过单细胞RNA-seq数据高分辨率推断细胞周期位置 | 利用细胞周期的生物学特征、周期性函数主成分分析的数学特性以及迁移学习，开发了一种通用的细胞周期位置预测方法 | NA | 开发一种通用的方法来高分辨率推断细胞周期位置 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 迁移学习 | RNA-seq数据 | NA |
| 223 | 2025-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Retinal Development Identifies NFI Factors as Regulating Mitotic Exit and Late-Born Cell Specification
2019-06-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.04.010
PMID:31128945
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析视网膜发育过程，鉴定NFI转录因子在调控有丝分裂退出和晚期出生细胞命运决定中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术全面解析视网膜神经发生过程中的基因表达变化，并发现NFI转录因子在调控晚期视网膜祖细胞命运决定中的新功能 | 研究仅关注视网膜发育过程，未验证NFI因子在其他神经发育系统中的功能 | 揭示视网膜神经发生过程中的基因调控网络 | 视网膜发育过程中的细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖视网膜神经发生全过程的10个发育阶段样本 |
| 224 | 2025-08-09 |
Decomposing Cell Identity for Transfer Learning across Cellular Measurements, Platforms, Tissues, and Species
2019-05-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.04.004
PMID:31121116
|
研究论文 | 本文介绍了scCoGAPS和projectR工具，用于通过转移学习在单细胞RNA测序数据中分解和验证细胞状态的潜在空间 | 提出了scCoGAPS和projectR工具，通过转移学习在不同数据集间验证潜在空间，避免了批次效应和技术特征的影响 | 潜在空间的解释和验证仍是一个挑战 | 探索单细胞RNA测序数据的潜在空间表示，以比较和识别细胞 | 小鼠视网膜、人视网膜发育时间序列、发育中的脑单细胞RNA测序数据集、染色质可及性数据和小鼠细胞类型图谱 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个数据集，包括小鼠和人的视网膜、脑发育数据等 |
| 225 | 2025-08-08 |
Roadmap for spatial transcriptomics of HIV in tissues
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000961
PMID:40626838
|
review | 本文综述了空间转录组学在HIV组织持久性研究中的应用及其技术平台和工作流程 | 空间转录组学以高分辨率（<1μm）捕获RNA分子，实现近单细胞水平的全基因组分析，并揭示了HIV感染细胞与周围微环境的相互作用 | 靶向RNA捕获在增加目标数量的同时可能降低灵敏度，且需避免报告未知生物学意义的特征 | 探讨HIV在组织中的持久性机制并为治疗策略提供信息 | HIV感染细胞及其周围微环境 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学平台、ATAC-seq、蛋白质捕获、T细胞受体测序 | NA | RNA分子数据 | NA |
| 226 | 2025-08-08 |
Single cell analyses of the HIV reservoir in the CNS and CSF: recent insights and implications
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000958
PMID:40742782
|
review | 本文综述了单细胞组学技术在理解中枢神经系统（CNS）和脑脊液（CSF）中HIV病毒库的最新进展 | 应用单细胞和单核RNA-seq、ATAC-seq、CITE-seq、AIRR-seq、多组学平台和空间转录组学技术，揭示了HIV在CNS中的持续存在机制 | 研究主要基于尸检脑组织和CSF样本，可能无法完全反映活体动态 | 探讨HIV在CNS和CSF中的病毒库特性及其对治疗策略的影响 | 中枢神经系统（CNS）和脑脊液（CSF）中的HIV病毒库 | 生物医学研究 | HIV感染 | 单细胞RNA-seq、ATAC-seq、CITE-seq、AIRR-seq、多组学平台、空间转录组学 | NA | 单细胞组学数据 | 尸检脑组织和CSF样本 |
| 227 | 2025-08-08 |
Single-cell sequencing technologies: a multiomics toolbox for investigating HIV-1 persistence
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000966
PMID:40772512
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2025-08-08 |
HDGF derived from Müller cells enhances the activation of microglia in diabetic retinopathy
2025-Aug-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.38.20240386
PMID:40770862
|
研究论文 | 本研究探讨了肝细胞瘤衍生生长因子（HDGF）在糖尿病视网膜病变（DR）中介导炎症的作用 | 首次揭示了HDGF在DR中主要由Müller细胞产生并靶向小胶质细胞，促进其激活和炎症反应 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行人体临床试验 | 阐明HDGF在糖尿病视网膜病变炎症反应中的作用机制 | Müller细胞和小胶质细胞 | 眼科疾病研究 | 糖尿病视网膜病变 | ELISA、qPCR、western blot、荧光免疫染色 | 动物模型（DR小鼠） | RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及体外培养细胞和DR小鼠模型 |
| 229 | 2025-08-08 |
Coordinated regulation of self-renewal and cell cycle during human lympho-myeloid lineage restriction
2025-Aug-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026936
PMID:40258184
|
研究论文 | 本研究开发了支持早期B淋巴细胞分化的大量和克隆培养系统，揭示了人类淋巴-髓系限制过程中自我更新和细胞周期的协调调控机制 | 开发了新型培养系统支持早期人类淋巴分化，揭示了增殖控制的共享机制及B和NM谱系限制过程中的生物学和转录异质性 | 研究主要基于体外培养系统，可能无法完全反映体内情况 | 阐明人类淋巴-髓系限制过程中自我更新和细胞周期的调控机制 | CD34+人类脐带血细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 人类脐带血CD34+细胞 |
| 230 | 2025-08-08 |
Insight into pericytes in glioblastoma angiogenesis: In vivo tracking by two-photon microscopy and proteomic profiling
2025-Aug-07, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70073
PMID:40772404
|
研究论文 | 本研究通过双光子显微镜和蛋白质组学分析，探讨了胶质母细胞瘤血管生成中周细胞的动态变化和分子重编程 | 揭示了周细胞在胶质母细胞瘤血管生成中的时空角色和分子变化，并开发了集成的成像-蛋白质组学框架 | 研究主要基于转基因小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究胶质母细胞瘤血管生成中周细胞的作用和分子机制 | 胶质母细胞瘤中的周细胞和血管系统 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 双光子显微镜、LC-MS/MS蛋白质组学、scRNA-seq | 转基因小鼠模型 | 图像、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 转基因小鼠模型和人类胶质母细胞瘤样本 |
| 231 | 2025-08-08 |
Single-cell sequencing reveals potential novel insights into appendage-patterning and joint-development in a spider
2025-Aug-07, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70069
PMID:40772585
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究蜘蛛胚胎中附肢模式和关节发育的潜在新遗传因子 | 发现了与附肢模式和关节发育相关的新基因，如dysfusion (dysf)、spätzle3 (spz3)和seven-up (svp)，并研究了这些基因在远缘螯肢动物中的进化起源 | 研究仅基于蜘蛛和螯肢动物的胚胎数据，未涉及其他节肢动物或更广泛的物种比较 | 理解节肢动物附肢模式和关节发育的基因调控网络 | 蜘蛛Parasteatoda tepidariorum和螯肢动物Phalangium opilio的胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序(SCS) | NA | 基因表达数据 | 蜘蛛和螯肢动物的胚胎细胞群 |
| 232 | 2025-08-08 |
Paired single-cell and spatial transcriptional profiling reveals a central osteopontin macrophage response mediating tuberculous granuloma formation
2025-Aug-07, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01559-25
PMID:40772762
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组测序揭示了结核性肉芽肿形成的核心机制，特别是富含骨桥蛋白的巨噬细胞的作用 | 首次结合单细胞和空间转录组技术全面解析结核性肉芽肿的细胞组成、空间结构及关键调控基因SPP1的作用 | 研究主要基于活检样本，可能无法完全反映活体动态过程；斑马鱼模型与人类疾病的直接相关性有待进一步验证 | 阐明结核性肉芽肿的细胞组成和形成机制 | 结核病患者肉芽肿活检样本及斑马鱼感染模型 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 结核病患者肉芽肿活检样本（具体数量未明确）及斑马鱼模型 |
| 233 | 2025-08-08 |
N-Oxide-Driven Heme-Activatable Biomolecule Labeling for Visualization of Labile Heme in Living Cells and Mouse Brain
2025-Aug-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04990
PMID:40720736
|
研究论文 | 开发了一种新型化学探针，用于活细胞、固定样本和体内模型中不稳定血红素的检测 | 利用N-氧化物驱动的血红素可激活生物分子标记策略，首次实现了在活细胞和小鼠脑中对不稳定血红素的荧光成像和3D组织可视化 | 未提及该方法在其它组织或更复杂生物系统中的适用性 | 研究不稳定血红素在生理和病理过程中的作用 | 不稳定血红素（原卟啉IX与铁离子复合物） | 化学生物学 | NA | 荧光成像、3D组织可视化、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、组学数据 | 活细胞和小鼠脑组织 |
| 234 | 2025-08-08 |
Unveiling the Role of Sdc4+ Monocytes in NASH: A Single-Cell RNA Sequencing Study
2025-Aug-06, Immunological investigations
IF:2.9Q3
DOI:10.1080/08820139.2025.2544180
PMID:40768295
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究揭示了Sdc4+单核细胞在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了NASH中单核细胞的异质性和功能转化，特别是Sdc4+单核细胞的促炎作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究NASH中单核细胞的亚群及其在疾病进展中的作用 | NASH小鼠和患者的肝脏非实质细胞，特别是单核细胞亚群 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | scRNA-seq, 转染, 共培养, 免疫荧光, qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | NASH和对照小鼠的肝脏非实质细胞，部分人类样本 |
| 235 | 2025-08-08 |
Regulatory KIR+CD8+ T cells are elevated during human pregnancy
2025-Aug-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adm7697
PMID:40768597
|
研究论文 | 研究探讨了在人类妊娠期间，表达抑制性杀伤细胞免疫球蛋白样受体（KIRs）的CD8 T细胞作为调节性亚群的作用 | 首次发现KIR+CD8+ T细胞在妊娠期间频率增加，尤其是在怀有男性胎儿的孕妇中，并揭示了这些细胞在调节母胎耐受性中的作用 | 研究主要基于外周血和体外实验，对母胎界面KIR+CD8+ T细胞的具体作用机制仍需进一步研究 | 探讨KIR+CD8+ T细胞在妊娠期间的作用及其与妊娠相关疾病的关联 | 孕妇外周血和蜕膜组织中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病（自然流产和子痫前期） | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 孕妇外周血和蜕膜组织样本 |
| 236 | 2025-08-08 |
Microglia-neuron crosstalk via Hex-GM2-MGL2 maintains brain homeostasis
2025-Aug-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09477-y
PMID:40769205
|
research paper | 该研究揭示了小胶质细胞与神经元之间通过Hex-GM2-MGL2途径维持大脑稳态的新机制 | 发现了一种以前未知的小胶质细胞与神经元相互作用模式，即小胶质细胞通过传递溶酶体酶Hex来降解神经元中的GM2神经节苷脂 | 研究主要基于小鼠模型，人类患者数据有限 | 探究小胶质细胞与神经元之间的相互作用机制及其在神经退行性疾病中的作用 | 小胶质细胞、神经元、GM2神经节苷脂 | 神经科学 | 神经退行性疾病（如Sandhoff病） | 无偏脂质组学、高分辨率空间脂质成像、深度单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 脂质组数据、转录组数据、影像数据 | 小鼠模型和部分人类患者数据 |
| 237 | 2025-08-08 |
Function of chemokines in embryo implantation
2025-Aug-06, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.07.092
PMID:40769846
|
综述 | 本文综述了趋化因子在胚胎植入过程中的功能及其在维持母胎免疫稳态中的作用 | 整合了趋化因子网络在关键植入过程中的作用，并强调了单细胞测序、微流控和人工智能在解码趋化因子介导的调控中的应用 | 未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持 | 探讨趋化因子在胚胎植入过程中的功能及其机制 | 胚胎植入过程中的趋化因子网络及其调控机制 | 生殖免疫学 | NA | 单细胞测序、微流控、人工智能 | NA | NA | NA |
| 238 | 2025-08-08 |
A Large-Scale Single-Cell Atlas Reveals the Peripheral Immune Panorama of Bacterial Pneumonia
2025-Aug-04, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202501-0217OC
PMID:40758632
|
研究论文 | 通过大规模单细胞转录组图谱揭示了细菌性肺炎外周免疫的全景 | 首次构建了细菌性肺炎患者外周血免疫细胞的大规模单细胞转录组图谱，揭示了不同疾病严重程度下外周免疫景观的深刻重塑 | 样本量相对有限（100例），且仅关注外周血免疫细胞，未涉及肺部局部免疫反应 | 阐明细菌性肺炎的免疫学机制，识别疾病严重程度的关键细胞和分子驱动因素 | 100名个体（39例重症细菌性肺炎，31例轻症，30例健康对照）的外周血免疫细胞 | 免疫学 | 细菌性肺炎 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞转录组数据 | 100名个体（39重症+31轻症+30对照） |
| 239 | 2025-08-08 |
Multi-omics prediction of axillary treatment response and tumour microenvironment alterations in lymph node-positive luminal breast cancer
2025-Aug-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07877-6
PMID:40759637
|
研究论文 | 本研究通过多组学模型预测淋巴结阳性luminal乳腺癌的腋窝治疗反应及肿瘤微环境变化 | 首次构建多组学模型预测腋窝淋巴结转移luminal乳腺癌患者对新辅助化疗的病理完全缓解，并通过单细胞RNA测序分析揭示不同疗效患者的肿瘤免疫微环境差异 | 样本量较小(14个样本来自5名患者)，且为回顾性研究 | 开发术前评估腋窝淋巴结转移对新辅助化疗反应的方法 | 淋巴结阳性luminal乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多组学预测模型 | 影像学数据、临床数据、病理数据 | 14个样本来自5名患者 |
| 240 | 2025-08-08 |
Optimized summary-statistic-based single-cell eQTL meta-analysis
2025-Aug-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08808-3
PMID:40759673
|
研究论文 | 本文比较了不同的策略，并为跨单细胞RNA测序数据集的eQTL加权荟萃分析提供了最佳实践建议 | 提出了一种联邦加权荟萃分析方法，整合不同数据集的摘要统计量，解决了基因型数据共享的隐私限制和技术差异问题 | 单细胞研究的样本量有限，可能影响细胞类型特异性eQTL的发现 | 提高检测细胞类型特异性eQTL的能力，以更好地解释疾病相关的遗传变异 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | WMA | 基因表达数据 | NA |