单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27901 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-05-17 |
Comprehensive sequencing of the lung neuroimmune landscape in response to asthmatic induction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518771
PMID:40181989
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序技术探索了哮喘诱导对肺神经免疫转录组的影响 | 首次全面测序了哮喘诱导后肺神经免疫景观的变化，并揭示了特定神经元簇和空间分布模式 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本 | 探究哮喘诱导如何改变肺神经免疫转录组 | 小鼠的迷走神经节(结状/颈静脉神经节)和肺组织 | 神经免疫学 | 哮喘 | 标准RNA测序、单核RNA测序、空间RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，使用naïve小鼠和经链格孢属诱导的哮喘小鼠 |
| 222 | 2025-05-17 |
Temporal and spatial distribution of histone acetylation in mouse molar development
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19215
PMID:40183048
|
研究论文 | 本研究通过小鼠磨牙模型，揭示了组蛋白乙酰化修饰在牙齿发育过程中的时空分布及其作用机制 | 首次系统地描绘了组蛋白H3和H4及其乙酰化位点在牙齿形成过程中的分布模式，并鉴定了关键组蛋白乙酰转移酶和去乙酰化酶 | 研究仅基于小鼠模型，人类牙齿发育中的组蛋白乙酰化机制仍需进一步验证 | 揭示组蛋白乙酰化修饰与牙齿发育之间的关联 | 小鼠磨牙发育过程中的组蛋白乙酰化修饰 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 小鼠磨牙发育不同阶段的样本 |
| 223 | 2025-05-17 |
Characterizing macrophage diversity in colorectal malignancies through single-cell genomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1526668
PMID:40191203
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review | 本文综述了单细胞基因组学在结直肠恶性肿瘤中巨噬细胞多样性研究中的应用 | 通过单细胞RNA测序技术揭示肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其潜在功能分类 | 缺乏对巨噬细胞多样性命名和分子特征的统一解释 | 探讨结直肠恶性肿瘤中巨噬细胞多样性的特征及其在肿瘤微环境中的作用 | 结直肠恶性肿瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞基因组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 224 | 2025-05-17 |
Successful cryopreservation of marine invertebrates immune cells enables long-term studies of common octopus, Octopus vulgaris Cuvier 1797, hemocyte immune functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543587
PMID:40191212
|
研究论文 | 本文研究了普通章鱼血细胞的冷冻保存技术，以支持其免疫功能的长期研究 | 首次展示了冷冻保存的章鱼血细胞的功能性结果，并确定了最佳的冷冻保存介质和程序 | 研究仅针对普通章鱼，未涵盖其他软体动物物种 | 开发冷冻保存技术以支持章鱼免疫细胞的长期功能研究 | 普通章鱼（Octopus vulgaris）的血细胞 | 细胞生物学 | NA | 冷冻保存技术，单细胞测序 | NA | 细胞功能数据，基因表达数据 | 冷冻保存15周后的章鱼血细胞样本 |
| 225 | 2025-05-17 |
Molecular biology of the deadliest cancer - glioblastoma: what do we know?
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530305
PMID:40191211
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review | 本文综述了胶质母细胞瘤的分子生物学特性及其微环境，强调了其生物特性和分子通讯模式 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了胶质母细胞瘤微环境的新见解，提出了个性化多免疫疗法的必要性 | NA | 总结当前关于胶质母细胞瘤及其微环境的知识，探讨个性化治疗的可能性 | 胶质母细胞瘤细胞及其微环境 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 226 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptomics reveals immunosuppressive microenvironment and highlights tumor-promoting macrophage cells in Glioblastoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312764
PMID:40193323
|
research paper | 通过单细胞转录组学揭示胶质母细胞瘤中的免疫抑制微环境，并突出肿瘤促进性巨噬细胞的作用 | 鉴定了五种不同的肿瘤相关巨噬细胞亚型，并发现TAM_MRC1亚型具有明显的M2极化特征，同时发现了一种具有耗竭表型的NK细胞亚型CD56dim_DNAJB1 | 样本量相对较小（24名患者的48个肿瘤片段），可能影响结果的普遍性 | 揭示胶质母细胞瘤微环境中的细胞异质性和复杂性，为免疫治疗提供潜在靶点 | 胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织 | digital pathology | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24名患者的48个肿瘤片段 |
| 227 | 2025-05-17 |
Single-cell analysis reveals potential therapeutic markers of peripheral blood mononuclear cells from bladder cancer patients
2025, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2025e14002
PMID:40367012
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膀胱癌患者外周血单个核细胞，揭示潜在的治疗标志物 | 首次在膀胱癌患者外周血单个核细胞中鉴定出LAG-3和TIM-3等新型潜在免疫检查点抑制剂靶点，并发现多个与肿瘤进展相关的细胞亚群及其特征基因 | 样本量相对较小（仅包括患者和一名健康供体），且未进行功能验证实验 | 探索膀胱癌免疫治疗的潜在新靶点和生物标志物 | 膀胱癌患者和健康供体的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 44,022个细胞（来自膀胱癌患者和一名健康供体的外周血单个核细胞样本） |
| 228 | 2025-05-17 |
The CD38+HLA-DR+ T cells with activation and exhaustion characteristics as predictors of severity and mortality in COVID-19 patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577803
PMID:40370439
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研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了COVID-19患者外周免疫细胞的特征，发现CD38+HLA-DR+ T细胞的扩增与疾病严重程度和死亡率相关 | 首次将CD38+HLA-DR+ T细胞确定为COVID-19预后的新型生物标志物，并揭示了其独特的激活-耗竭表型及对NAD+代谢的影响 | 样本来源仅限于外周血，未评估组织中的免疫细胞特征；研究人群的多样性可能有限 | 寻找COVID-19的新型治疗靶点和早期预测生物标志物 | 健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者的外周免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，但包括健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者三类人群 |
| 229 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptome reveals potential mechanisms for gout in children
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577109
PMID:40370447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了儿童痛风的分子机制 | 揭示了CD14+单核细胞和DN T细胞在儿童痛风中的关键作用，以及与成人痛风的异同 | 样本来源仅限于外周血，未涉及痛风关节组织 | 探索儿童痛风的分子机制 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本 | 生物医学 | 痛风 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本（具体数量未说明） |
| 230 | 2025-05-17 |
Exploration the role of pro-inflammatory fibroblasts and related markers in periodontitis: combing with scRNA-seq and bulk-seq data
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537046
PMID:40370461
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组数据分析，探索了促炎性牙龈成纤维细胞（PIGFs）在牙周炎中的作用及其相关分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与牙周炎发展密切相关的促炎性牙龈成纤维细胞亚群，并发现MME和TSPAN11两个基因作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限，且未在更大人群中验证MME和TSPAN11的临床效果 | 探索促炎性牙龈成纤维细胞在牙周炎发病机制中的作用及其分子机制 | 牙龈成纤维细胞（GFs）及其亚群促炎性牙龈成纤维细胞（PIGFs） | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq, bulk-seq, qPCR, 免疫荧光染色 | 多种机器学习算法 | RNA测序数据 | 来自正常和牙周炎患者的scRNA-seq数据 |
| 231 | 2025-05-17 |
Unraveling the role of histone acetylation in sepsis biomarker discovery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1582181
PMID:40370519
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据，结合机器学习算法，发现了与组蛋白乙酰化相关的脓毒症生物标志物 | 首次将组蛋白乙酰化与脓毒症生物标志物发现联系起来，并利用多种机器学习算法和孟德尔随机化方法进行验证 | 研究样本量未明确说明，且需要进一步临床验证 | 发现脓毒症早期诊断和预后的有效生物标志物 | 脓毒症患者（具体样本信息未提供） | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 基因表达数据 | NA |
| 232 | 2025-05-17 |
Resveratrol targeting MDM2/P53/PUMA axis to inhibit colonocyte apoptosis in DSS-induced ulcerative colitis mice
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1572906
PMID:40371345
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research paper | 该研究探讨了白藜芦醇通过调节MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡，从而治疗DSS诱导的溃疡性结肠炎的潜力 | 揭示了白藜芦醇通过MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡的新机制，并验证了MDM2作为溃疡性结肠炎治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证 | 研究白藜芦醇在溃疡性结肠炎治疗中的作用机制和疗效 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型和体外培养的结肠细胞 | 生物医学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、免疫荧光染色、腺相关病毒系统 | 小鼠溃疡性结肠炎模型 | 实验数据 | 未明确说明样本数量 |
| 233 | 2025-05-17 |
Detecting global and local hierarchical structures in cell-cell communication using CrossChat
2024-12-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54821-x
PMID:39627184
|
研究论文 | 开发了一个名为CrossChat的计算框架，用于检测和分析细胞间通讯的全局和局部层次结构 | 提出了一个新颖的计算框架CrossChat，能够通过多分辨率聚类方法和树检测方法，全面分析细胞间通讯的层次结构 | NA | 理解和分析细胞间通讯的层次结构及其对复杂组织功能的调控作用 | 细胞间通讯的层次结构 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（Spatial Transcriptomics） | 多分辨率聚类方法、树检测方法 | scRNA-seq数据、空间转录组数据 | 两个来自COVID-19患者的非空间scRNA-seq数据集、两个来自小鼠胚胎皮肤的空间转录组数据集 |
| 234 | 2025-05-17 |
Endothelial Pim3 kinase protects the vascular barrier during lung metastasis
2024-12-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54445-1
PMID:39627185
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠肺部黑色素瘤细胞到达后6小时内肺内皮细胞的转录重编程，发现了一个反应性毛细血管内皮细胞簇(rCap)，并揭示了Pim3激酶在保护血管屏障中的作用 | 首次发现反应性毛细血管内皮细胞簇(rCap)及其在转移性微环境中的作用，揭示了Pim3激酶在维持血管屏障功能中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证有限；仅观察了6小时内的早期变化 | 探究转移性微环境中内皮细胞的分子调控机制及其在癌症转移中的作用 | 小鼠肺内皮细胞和黑色素瘤细胞 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 235 | 2025-05-17 |
Granzyme K+CD8+ T cells interact with fibroblasts to promote neutrophilic inflammation in nasal polyps
2024-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54685-1
PMID:39614076
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research paper | 该研究揭示了在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中，GZMK+CD8+ T细胞与成纤维细胞的相互作用如何促进中性粒细胞炎症 | 首次发现GZMK+CD8+ T细胞通过CXCR4/CXCL12轴与成纤维细胞互作，特异性地促进中性粒细胞趋化因子的产生 | 研究主要聚焦于CRSwNP，其他炎症性疾病中的类似机制需要进一步验证 | 阐明CRSwNP中中性粒细胞炎症的分子机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的组织样本 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞分析、空间转录组学、T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 未明确说明样本数量，使用CRSwNP患者组织样本 |
| 236 | 2025-05-17 |
COVID-19 progression and convalescence in common variable immunodeficiency patients show dysregulated adaptive immune responses and persistent type I interferon and inflammasome activation
2024-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54732-x
PMID:39609471
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研究论文 | 研究常见变异型免疫缺陷病（CVID）患者在COVID-19病程和恢复期间的适应性免疫反应失调以及持续的I型干扰素和炎症小体激活 | 首次使用单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析CVID患者在SARS-CoV-2感染前、期间和恢复后的外周血样本，揭示了持续的I型干扰素特征和适应性免疫改变 | 研究样本量未明确说明，可能限制结果的普遍性 | 探究CVID患者长期病毒感染对免疫反应的影响 | 常见变异型免疫缺陷病（CVID）患者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），光谱流式细胞术 | NA | 外周血样本 | NA |
| 237 | 2025-05-17 |
A single-cell transcriptomic census of mammalian olfactory epithelium aging
2024-11-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.020
PMID:39173624
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术对年轻和老年小鼠嗅觉上皮进行了分析，鉴定了与衰老相关的差异表达基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示了嗅觉上皮衰老的细胞和分子框架，并识别了Egr1和Cebpb作为转录网络的核心调控因子 | 研究仅基于小鼠模型，人类嗅觉上皮衰老的机制可能有所不同 | 探究哺乳动物嗅觉上皮衰老的细胞和分子机制 | 年轻和老年小鼠的嗅觉上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 嗅觉功能障碍 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年小鼠的嗅觉上皮细胞（未明确具体数量） |
| 238 | 2025-05-17 |
Long-Term Follow-up of Levonorgestrel Intrauterine Device for Atypical Hyperplasia and Early Endometrial Cancer Reveals Relapse Characterized by Immune Exhaustion
2024-Nov-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-0362
PMID:38922360
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研究论文 | 研究左炔诺孕酮宫内节育器(LIUD)治疗非典型增生(AH)和早期子宫内膜癌(EEC)的长期随访结果，发现复发与免疫耗竭相关 | 首次使用空间转录组学(Nanostring GeoMX数字空间分析)结合计算机细胞类型反卷积和通路分析，揭示了LIUD治疗后的免疫机制变化 | 样本量较小(仅5名患者的纵向活检样本)，可能影响结果的普遍性 | 评估LIUD治疗AH/G1EEC的长期效果并探究复发机制 | 子宫内膜非典型增生(AH)和1级子宫内膜样腺癌(G1EEC)患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学(Nanostring GeoMX数字空间分析)，计算机细胞类型反卷积 | NA | 转录组数据，临床随访数据 | 43名初始响应患者中的41名随访数据，其中5名患者的纵向活检样本 |
| 239 | 2025-05-17 |
Endoluminal Biopsy for Vein of Galen Malformation
2024-Nov-01, Neurosurgery
IF:3.9Q1
DOI:10.1227/neu.0000000000002986
PMID:38747605
|
研究论文 | 本研究探讨了使用腔内组织取样（ETS）对Galen静脉畸形（VOGM）进行原位分析的可行性及其在理解VOGM遗传学、发病机制和维护方面的潜在价值 | 首次应用ETS技术对VOGM病变进行原位分析，结合单细胞RNA测序技术，揭示了VOGM内皮细胞的转录组特征 | 样本量较小（6名患者），且未进行DNA测序以评估体细胞和第二击突变 | 开发VOGM的分子遗传学分类方案，并为个性化药物治疗或基因治疗提供依据 | Galen静脉畸形（VOGM）患者及其家族成员 | 数字病理 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，腔内组织取样（ETS） | NA | RNA测序数据 | 6名患者，共进行10次ETS操作 |
| 240 | 2025-05-17 |
Integrated transcriptomics of human blood vessels defines a spatially controlled niche for early mesenchymal progenitor cells
2024-10-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.06.015
PMID:39025061
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研究论文 | 通过空间和单细胞转录组学，研究人类血管壁中外膜间充质祖细胞的表型、潜力和微解剖分布 | 首次详细研究了人类血管外膜干细胞生态位，并发现CD201高表达的原始细胞在间充质祖细胞层级中的关键作用 | 研究主要关注血管外膜中的间充质祖细胞，可能未涵盖其他潜在的重要细胞类型或机制 | 解析人类血管壁中祖细胞的分布和功能，为细胞治疗提供理论基础 | 人类血管壁中的间充质祖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及人类和小鼠的血管组织 |