单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
221	2025-04-29	Therapeutic and prognostic values of ferroptosis signature in glioblastoma 2025-May-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114597 PMID:40239336	research paper	探讨铁死亡特征在胶质母细胞瘤中的治疗和预后价值	利用单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤的分子特征及其肿瘤微环境，引入铁死亡相关生物标志物通路和耐药机制	铁死亡与GBM免疫景观的关系复杂，可能产生积极或消极影响	研究铁死亡在胶质母细胞瘤中的影响，以提供肿瘤生物学和潜在治疗策略的重要知识	胶质母细胞瘤细胞及其肿瘤微环境	肿瘤生物学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
222	2025-04-29	Characterization of the Biochemical Recurrence Prediction Ability and Progression Correlation of Peroxiredoxins Family in Prostate Cancer Based on Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Cohorts 2025-May, Cancer medicine IF:2.9Q2 DOI:10.1002/cam4.70855 PMID:40281661	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和大规模RNA测序数据，探讨了过氧化物还原酶家族（PRDXs）在前列腺癌（PCa）中的预后和治疗反应预测能力	首次发现PRDX5与前列腺癌进展密切相关，并开发了一个整合PRDX5表达与临床特征的列线图，用于预测PCa患者的临床结果，优于30个已发表的签名	研究主要基于公共数据集，需要进一步实验验证PRDX5在前列腺癌中的具体作用机制	探讨PRDXs家族在前列腺癌预后和治疗反应中的潜在作用	前列腺癌患者和去势抵抗性前列腺癌（CRPC）细胞系	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、大规模RNA测序（bulk RNA-seq）、免疫组织化学、体外细胞增殖实验、ROS测定实验、凋亡实验	NA	RNA测序数据、临床数据、细胞实验数据	2个单细胞RNA数据集和8个大规模RNA数据集
223	2025-04-29	Role of different Lyl1 transcripts in zebrafish primitive hematopoiesis 2025-May, Yi chuan = Hereditas DOI:10.16288/j.yczz.24-288 PMID:40287790	research paper	本研究探讨了斑马鱼原始造血过程中不同Lyl1转录本的作用	发现了斑马鱼和人类中存在Lyl1的长短转录本，并揭示了它们在原始髓系造血中的不同调控作用	未深入探讨长短转录本调控造血的具体分子机制	阐明Lyl1不同转录本在原始造血过程中的功能差异	斑马鱼原始造血细胞	发育生物学	NA	scRNA-seq, 5'RACE, Morpholino敲低	NA	单细胞RNA测序数据	斑马鱼造血干细胞/祖细胞
224	2025-04-29	Target Screening and Single Cell Analysis of Diabetic Retinopathy and Hepatocarcinoma 2025-May, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70521 PMID:40293350	研究论文	本研究通过单细胞分析筛选糖尿病视网膜病变和肝癌之间的共享基因和通路，以发现潜在的治疗靶点	首次揭示了铁蛋白吞噬相关基因在糖尿病视网膜病变和肝癌中的共同作用机制，并构建了具有高诊断效能的机器学习模型	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证	探索糖尿病视网膜病变和肝癌之间的共同病理调控通路	肝癌和糖尿病视网膜病变患者的单细胞RNA测序数据	生物信息学	肝癌和糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序、qRT-PCR	机器学习模型	单细胞RNA测序数据	GEO数据集GSM7494113、GSE209872和GSE160306
225	2025-04-29	Suppression of the Prostaglandin I2-Type 1 Interferon Axis Induces Extramedullary Hematopoiesis to Promote Cardiac Repair After Myocardial Infarction 2025-Apr-28, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.124.069420 PMID:40289806	研究论文	本研究探讨了前列腺素I2-1型干扰素轴在心肌梗死后脾脏髓外造血中的作用及其对心脏修复的影响	揭示了PGI2-IFN轴在心肌梗死后脾脏髓外造血中的新机制，为治疗缺血性心脏损伤提供了新的治疗靶点	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究脾脏髓外造血在心肌梗死后心脏修复中的作用及其调控机制	心肌梗死小鼠模型及脾脏造血干细胞/祖细胞	心血管疾病	心肌梗死	流式细胞术、液相色谱-串联质谱、单细胞RNA测序	Tcf21CreER Scfflox/flox心肌梗死小鼠模型	转录组数据、脂质组数据	未明确说明具体样本数量，使用eGFP小鼠和Tcf21CreER Scfflox/flox小鼠
226	2025-04-29	Splenic CD169+Tim4+ Marginal Metallophilic Macrophages Are Essential for Wound Healing After Myocardial Infarction 2025-Apr-28, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.124.071772 PMID:40289811	研究论文	本研究揭示了脾脏CD169+Tim4+边缘金属亲和性巨噬细胞在心肌梗死后伤口愈合中的关键作用	首次发现脾脏CD169+Tim4+ MMMs通过循环进入心脏，对中性粒细胞清除、炎症抑制和修复性巨噬细胞表型诱导具有不可或缺的作用	研究主要基于小鼠模型，人类数据仅涉及循环细胞表型分析	阐明心肌梗死后伤口愈合的细胞机制	脾脏CD169+Tim4+边缘金属亲和性巨噬细胞(MMMs)及其在心肌梗死修复中的作用	心血管疾病	心肌梗死	流式细胞术、单细胞RNA测序、谱系追踪、细胞追踪、脾切除术、联体共生、细胞过继转移	小鼠心肌梗死模型	流式细胞数据、单细胞RNA测序数据	人类ST段抬高型心肌梗死患者与稳定型冠心病对照患者
227	2025-04-29	CCR5 + T cells as a potential biomarker for primary Sjögren's disease based on bioinformatics analysis 2025-Apr-28, Clinical rheumatology IF:2.9Q2 DOI:10.1007/s10067-025-07460-6 PMID:40293619	研究论文	通过生物信息学分析识别并验证原发性干燥综合征(pSjD)的潜在生物标志物CCR5 + T细胞，并探讨其分子免疫机制	首次将CCR5 + T细胞鉴定为pSjD的关键生物标志物，并证实其在诊断中的高准确性	研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证	探索原发性干燥综合征的生物标志物及其免疫机制	原发性干燥综合征患者	生物信息学	干燥综合征	生物信息学分析、WGCNA、PPI网络分析、CIBERSORT、scRNA-seq	NA	基因表达数据	从GEO数据库下载的pSjD数据集及患者样本
228	2025-04-29	Comprehensive analysis based on IFN-γ and SASP related genes, bulk RNA and single-cell sequencing to evaluate the prognosis and immune landscape of stomach adenocarcinoma 2025-Apr-28, Genes & genomics IF:1.6Q3 DOI:10.1007/s13258-025-01646-7 PMID:40293675	研究论文	基于IFN-γ和SASP相关基因、批量RNA和单细胞测序的综合分析，评估胃腺癌的预后和免疫景观	首次基于IFN-γ和SASP相关基因对STAD进行分子亚型分类，并开发了预测患者生存、肿瘤免疫微环境和药物反应的风险预后模型	研究依赖于TCGA数据库的数据，可能受限于样本量和数据质量	识别STAD的分子亚型并开发预后模型，以预测患者生存和免疫治疗反应	胃腺癌（STAD）患者	数字病理	胃腺癌	批量RNA测序、单细胞测序	Cox和LASSO回归分析	基因组和临床数据	来自TCGA数据库的STAD患者数据
229	2025-04-29	Combining Spatial Transcriptomics, Pseudotime, and Machine Learning Enables Discovery of Biomarkers for Prostate Cancer 2025-Apr-28, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0269 PMID:40293712	研究论文	结合空间转录组学、伪时间和机器学习技术，发现前列腺癌的生物标志物	利用空间转录组学数据构建伪时间模型，结合机器学习方法识别前列腺癌的生物标志物	需要在前瞻性研究中进一步验证这些生物标志物的诊断潜力	发现可用于早期诊断前列腺癌的生物标志物	前列腺癌患者和对照组的血清、前列腺组织和尿液样本	数字病理学	前列腺癌	空间转录组学、伪时间分析、机器学习	机器学习预测模型	mRNA、免疫组化、蛋白质组学数据	超过2000名前列腺癌患者和对照组的样本
230	2025-04-29	Adhesion-Related Pathways and Functional Polarization of Astrocytes in Traumatic Brain Injury: Insights from Single-cell RNA Sequencing 2025-Apr-27, Neuromolecular medicine IF:3.3Q2 DOI:10.1007/s12017-025-08858-w PMID:40287916	研究论文	通过单细胞RNA测序分析创伤性脑损伤（TBI）中星形胶质细胞的功能异质性及其调控机制	首次在TBI模型中识别出两种主要的反应性星形胶质细胞亚型（A1和A2），并揭示了它们在炎症反应、突触调节、神经退行性疾病相关通路以及脂质代谢、细胞外基质重塑等方面的功能差异	研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类尚需进一步验证	探究创伤性脑损伤中星形胶质细胞的功能异质性及其调控机制	创伤性脑损伤小鼠模型中的星形胶质细胞	单细胞RNA测序	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	创伤性脑损伤小鼠模型的皮质和海马组织
231	2025-04-29	Single-Cell Transcriptome Reveals the Cellular Response to PEG-Induced Stress in Wheat Leaves 2025-Apr-27, Journal of agricultural and food chemistry IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jafc.4c12749 PMID:40287963	研究论文	通过单细胞转录组分析小麦叶片在PEG诱导胁迫下的细胞响应机制	首次构建小麦叶片细胞图谱，并揭示不同类型细胞在干旱胁迫下的异质性响应机制	仅使用PEG模拟干旱胁迫，未涉及真实田间干旱条件	研究小麦干旱响应机制以提高作物抗旱性	抗旱和不抗旱小麦幼苗叶片细胞	植物分子生物学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	抗旱和不抗旱小麦幼苗叶片细胞
232	2025-04-29	Single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal the mechanism by which Xiaozhiling injection treats internal hemorrhoids 2025-Apr-27, World journal of gastrointestinal surgery IF:1.8Q2 DOI:10.4240/wjgs.v17.i4.103494 PMID:40291892	研究论文	本研究通过单核RNA测序和空间转录组学揭示了消痔灵注射液治疗内痔的分子机制	首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了消痔灵注射液通过激活Sphk1-S1P通路促进纤维化的治疗机制	研究仅基于大鼠模型，尚未在人体中进行验证	探究消痔灵注射液治疗内痔的分子机制	内痔模型大鼠的成纤维细胞	分子生物学	内痔	单核RNA测序(Stereo-seq)、空间转录组学、电子显微镜	NA	基因表达数据、亚细胞结构图像	内痔模型大鼠(分为对照组和治疗组)
233	2025-04-29	Deciphering Immunosenescence From Child to Frailty: Transcriptional Changes, Inflammation Dynamics, and Adaptive Immune Alterations 2025-Apr-26, Aging cell IF:8.0Q1 DOI:10.1111/acel.70082 PMID:40285422	研究论文	通过分析从儿童到虚弱老年人的PBMCs的bulk-cell和single-cell RNA-seq数据，研究年龄相关的免疫系统变化	整合bulk-cell和single-cell RNA-seq数据，全面揭示健康衰老和虚弱老年人中免疫细胞的动态变化	研究仅基于PBMCs，可能无法完全反映其他组织或器官中的免疫衰老情况	探究年龄相关的免疫系统变化及其在虚弱老年人中的异常表现	从儿童到虚弱老年人的外周血单核细胞(PBMCs)	免疫学	老年疾病	bulk-cell RNA-seq, single-cell RNA-seq	NA	RNA-seq数据	涵盖从儿童到虚弱老年人的多个年龄段样本
234	2025-04-29	Mas Signaling Potentiates Neutropil Extracellular Traps Formation Induced by Endothelial Cells Derived S1P in Mice with Acute Liver Failure 2025-Apr-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202411428 PMID:40285622	research paper	本研究探讨了Mas信号在急性肝衰竭(ALF)中对中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)形成的影响及其机制	首次揭示了Mas信号通过调节FXR-S1P-NETs轴和抑制SHP2来影响NETs形成的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证	阐明Mas信号在急性肝衰竭中调控NETs形成的分子机制	雄性Mas1基因敲除小鼠和野生型小鼠	分子生物学	急性肝衰竭	单细胞测序、代谢组学分析	小鼠急性肝衰竭模型	动物实验数据、测序数据	6-8周龄雄性小鼠(具体数量未明确说明)
235	2025-04-29	Integrated Analysis of Single-Cell and Transcriptome Data Reveals the Role and Regulatory Mechanisms of Neuroinflammation in Parkinson's Disease 2025-Apr-26, Inflammation IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s10753-025-02306-4 PMID:40285838	研究论文	通过整合单细胞和转录组数据分析，揭示了神经炎症在帕金森病中的作用及其调控机制	首次揭示了转录因子STAT3在帕金森病中作为小胶质细胞促炎激活的核心调控因子的关键作用	研究主要基于数据库数据和动物模型，人类样本的直接验证有限	探索帕金森病中神经炎症的细胞特异性特征和调控机制	人类PD中脑黑质致密部组织、MPTP诱导的PD小鼠模型、MPP+诱导的BV2细胞模型	神经科学	帕金森病	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、微阵列分析、GSVA、GSEA、KEGG和GO分析、轨迹分析、SCENIC分析	动物模型(小鼠)、细胞模型(BV2和SH-SY5Y)	基因表达数据、单细胞数据	来自GEO数据库的人类PD中脑组织数据、MPTP诱导的PD小鼠模型、MPP+诱导的BV2细胞模型
236	2025-04-29	Blockade of TIGAR prevents CD8+ T cell dysfunction and elicits anti-AML immunity 2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-04042-y PMID:40285889	研究论文	研究通过阻断TIGAR来防止CD8+ T细胞功能障碍并激发抗急性髓系白血病（AML）免疫反应	首次证明TIGAR沉默可以增强T细胞功能，改善AML预后，并通过单细胞RNA测序分析揭示了TIGAR高表达与T细胞耗竭标志物的关联	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证	探究TIGAR沉默是否能消除AML细胞并恢复功能失调的T细胞	AML小鼠模型和TIGAR基因敲除小鼠	免疫学	急性髓系白血病	单细胞RNA测序	TIGAR基因敲除小鼠模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但使用了C57BL/6J背景的小鼠和C1498细胞
237	2025-04-29	In silico-based analysis and in vitro experiments identify SIGMAR1 as a potential marker of putative lung cancer stem cells 2025-Apr-26, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02394-6 PMID:40285994	研究论文	通过计算机模拟和体外实验鉴定SIGMAR1作为潜在肺癌干细胞标记物	利用单细胞RNA测序数据识别新的肺癌干细胞标记物SIGMAR1，并通过体外实验验证其表达和功能	未来研究需要进一步探讨SIGMAR1调节肺癌干细胞特性的机制	识别肺癌干细胞的新标记物并验证其功能	A549来源的肿瘤球和人类肺癌组织的单细胞RNA测序数据	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	两个公开的人类肺癌组织scRNA-seq数据集
238	2025-04-29	Perturbing local steroidogenesis to improve breast cancer immunity 2025-Apr-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-59356-3 PMID:40287432	research paper	该研究探讨了通过抑制局部类固醇生成来增强对三阴性乳腺癌（TNBC）的抗肿瘤免疫	揭示了抑制免疫细胞类固醇生成可以限制TNBC肿瘤进展，并通过代谢建模和单细胞转录组学鉴定了主要的类固醇生成细胞	研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的可行性和效果尚需进一步验证	改善三阴性乳腺癌的免疫治疗效果	三阴性乳腺癌（TNBC）患者肿瘤和小鼠模型	肿瘤免疫学	乳腺癌	靶向代谢组学、免疫组织化学、单细胞转录组学	小鼠模型	代谢组数据、转录组数据	TNBC患者肿瘤样本和小鼠模型
239	2025-04-29	Comprehensive single-cell transcriptome analysis of autologous platelet-rich plasma therapy on human thin endometrium 2025-Apr-26, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-99468-w PMID:40287476	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析探讨了自体富血小板血浆（PRP）疗法对人类薄型子宫内膜的影响	首次通过转录组分析研究PRP疗法对薄型子宫内膜的影响，揭示了PRP疗法可能增强高干性、刺激间充质-上皮转化（MET）并增强巨噬细胞功能	样本量较小（仅10名患者），可能影响结果的普遍性	探讨PRP疗法对薄型子宫内膜的治疗效果及其潜在机制	薄型子宫内膜患者	数字病理学	妇科疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、苏木精和伊红染色（HE）、免疫组织化学（IHC）	CytoTRACE、基因集变异分析（GSVA）	RNA测序数据、组织图像	10名薄型子宫内膜患者的配对样本（治疗前后）
240	2025-04-29	Dynamics of tertiary lymphoid structures and immune cross talk in early versus advanced colorectal cancer: potential implications for immunotherapy 2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-04027-x PMID:40287532	research paper	该研究通过分析单细胞RNA测序数据、批量RNA转录数据和病理组织数据，探讨了早期和晚期结直肠癌中肿瘤微环境和三级淋巴结构的动态变化及其对免疫治疗的影响	揭示了CD8+Tex细胞上的CXCL13表达以及CD4+Tfh和BGC细胞之间的CD40-CD40L相互作用可能是三级淋巴结构功能的关键调节因子，并可能影响免疫治疗的响应	研究结果基于三个内部队列，可能需要更大样本量的验证	探讨早期和晚期结直肠癌中肿瘤微环境和三级淋巴结构的差异及其对免疫治疗的影响	早期和晚期结直肠癌患者的肿瘤微环境和三级淋巴结构	肿瘤免疫学	结直肠癌	单细胞RNA测序、批量RNA转录分析、病理组织分析	NA	RNA测序数据、转录数据、病理组织数据	三个内部队列的样本