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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-29 | The NF-κB Signalling Regulates the Abnormal Functions of Neutrophils in Severe Periodontal Disease 
          2025-Oct-25, International dental journal
          
          IF:3.2Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.identj.2025.103973
          PMID:41145025
         | 研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞在严重牙周病中的调控机制,重点关注NF-κB信号通路的作用 | 发现NF-κB信号通路在牙周病中性粒细胞异常功能中的关键调控作用,并证实其抑制剂可降低炎症因子表达 | NA | 探索严重牙周病中中性粒细胞的调控机制 | 牙周病中的中性粒细胞 | 生物信息学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA转录组分析, 实时PCR, 免疫共染色 | hdWGCNA, pySCENIC, ClusterProfiler | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 222 | 2025-10-29 | Mapping Satellite Glial Cell Heterogeneity Reveals Distinct Spatial Organization and Implies Functional Diversity in the Dorsal Root Ganglion 
          2025-Oct-24, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
          
         
          DOI:10.1002/advs.202511569
          PMID:41134052
         | 研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性,并揭示了四种不同亚型的空间分布和功能多样性 | 首次在背根神经节中原位表征卫星胶质细胞异质性,识别并验证了四种功能不同的SGC亚型及其空间分布 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索背根神经节中卫星胶质细胞的异质性及其功能多样性 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 单细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,原位杂交,先进成像技术 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 223 | 2025-10-29 | ARHGAP11A, a member of Rho GTPase activating protein family, as a prognostic biomarker linked to DNA damage response across pan-cancer 
          2025-Oct-24, BMC cancer
          
          IF:3.4Q2
          
         
          DOI:10.1186/s12885-025-15106-8
          PMID:41136949
         | 研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证,发现ARHGAP11A作为RhoGAP家族成员在泛癌中过表达,与DNA损伤反应和免疫调节相关,是潜在的预后标志物 | 首次在泛癌水平系统分析RhoGAP家族基因,鉴定ARHGAP11A为最显著过表达成员,并揭示其与DNA损伤反应和免疫调节的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能机制研究 | 探究RhoGAP家族基因在癌症中的作用,特别关注ARHGAP11A的生物学功能和临床意义 | 33种癌症类型的10,000多个样本,包括肿瘤组织和癌旁正常组织 | 生物信息学 | 泛癌 | 单细胞测序,Western blotting,集落形成实验 | NA | 基因组数据,蛋白质数据,临床数据 | 超过10,000个样本,涵盖33种癌症类型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 
| 224 | 2025-10-29 | Whole-genome sequencing reveals individual and cohort level insights into chromosome 9p syndromes 
          2025-Oct-24, Genome medicine
          
          IF:10.4Q1
          
         
          DOI:10.1186/s13073-025-01563-0
          PMID:41137173
         | 研究论文 | 本研究通过全基因组测序分析100名9号染色体综合征患者,揭示了个体和队列水平的基因组特征 | 首个大规模9号染色体综合征全基因组测序研究,开发了DiamondsDenovo计算工具和机器学习预测模型 | 样本量相对有限,仅针对9号染色体特定区域 | 深入解析9号染色体缺失和重复综合征的基因组结构特征 | 100名来自9号染色体综合征家庭的个体 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序, 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因组序列数据 | 100名个体 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 225 | 2025-10-29 | Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female 
          2025-Oct-22, Nature
          
          IF:50.5Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41586-025-09653-0
          PMID:41125888
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示疟原虫在按蚊中肠内的发育转变及与宿主细胞的相互作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序与共聚焦显微镜技术,系统解析疟原虫-按蚊相互作用网络,发现疟原虫偏好与中肠祖细胞互作的关键现象 | 部分发育阶段的生物学过程仍难以完全解析,需进一步验证 | 阐明疟原虫在按蚊体内的发育转变机制及宿主-寄生虫相互作用 | 恶性疟原虫与按蚊中肠细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊子细胞,包含野外来源寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 226 | 2025-10-29 | Tissue and cellular spatiotemporal dynamics in colon aging 
          2025-Oct-22, Nature biotechnology
          
          IF:33.1Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41587-025-02830-6
          PMID:41125832
         | 研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序构建结肠衰老的细胞和空间图谱 | 开发了cSplotch计算框架,利用组织学特征在组织样本和数据模态间共享信息,学习与年龄、组织区域和性别相关的空间解析细胞表达层次贝叶斯模型 | 研究仅限于小鼠模型,人类结肠衰老的适用性需要进一步验证 | 研究结肠组织结构和分子回路在衰老过程中的时空动态变化 | 小鼠结肠组织 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 层次贝叶斯模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约1,500个小鼠肠道组织, 约400,000个单核RNA测序图谱 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 227 | 2025-10-29 | Multiomics data reveal microglia's promotion for choroidal neovascularization in endothelial cells 
          2025-Oct-22, Experimental eye research
          
          IF:3.0Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.exer.2025.110701
          PMID:41130334
         | 研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了小胶质细胞通过CSRP2基因促进脉络膜新生血管形成的机制 | 首次发现CSRP2在小胶质细胞和内皮细胞中显著上调,并证实其通过VEGF和TGF-β信号通路介导细胞间通讯 | 研究主要基于公共数据库数据,部分发现仍需进一步实验验证 | 阐明脉络膜新生血管形成的细胞类型和分子机制,探索潜在治疗靶点 | 年龄相关性黄斑变性患者的视网膜组织、RPE/脉络膜复合体和血液样本 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,免疫浸润分析,基因集富集分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 湿性AMD患者和健康对照的组织和血液样本(来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 228 | 2025-10-29 | Identification of a distinctive gene signature associated with disease activity in granulomatous myositis 
          2025-Oct-22, Rheumatology (Oxford, England)
          
         
          DOI:10.1093/rheumatology/keaf543
          PMID:41132132
         | 研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肉芽肿性肌炎的独特基因特征及其与疾病活动的相关性 | 首次在肉芽肿性肌炎中鉴定出包含1293个上调基因和256个下调基因的特定基因特征,并发现CHIT1是与疾病严重程度最显著相关的上调基因 | 样本量相对有限(38例GM患者),需要更大规模的研究验证结果 | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制 | 肌肉活检样本(包括GM患者、其他肌病患者和健康对照) | 数字病理学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 | 支持向量机 | RNA序列数据,空间转录组数据,图像数据 | 722例肌肉活检(含38例GM患者) | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 229 | 2025-10-29 | Single-Cell RNA Sequencing Identifies Accumulation of Fcgr2b + Virtual Memory-Like CD8 T Cells With Cytotoxic and Inflammatory Potential in Aged Mouse White Adipose Tissue 
          2025-Oct-21, Aging cell
          
          IF:8.0Q1
          
         
          DOI:10.1111/acel.70278
          PMID:41116748
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定老年小鼠白色脂肪组织中具有细胞毒性和炎症潜能的Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累 | 首次发现生理性衰老(而非高脂饮食诱导的肥胖)与特定表型的Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞在脂肪组织中的积累相关,并揭示其表达颗粒酶M的细胞毒性和促炎特性 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类组织中验证;样本规模相对有限 | 比较生理性衰老和高脂饮食诱导的肥胖对脂肪组织免疫细胞组成的差异影响 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织基质血管组分中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,功能分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 年轻正常饮食小鼠、年轻高脂饮食小鼠和老年正常饮食小鼠的性腺白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 230 | 2025-10-29 | Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Disulphidptosis in Oral Squamous Cell Carcinoma 
          2025-Oct-16, International dental journal
          
          IF:3.2Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.identj.2025.103955
          PMID:41106220
         | 研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 首次系统研究二硫死亡相关基因在口腔鳞癌中的表达模式,发现INF2和DSTN等15个关键基因的表达与患者生存和免疫细胞浸润相关 | 需要进一步的实验室验证和临床试验来探索INF2和DSTN的治疗靶向性及其对免疫微环境的影响 | 研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达水平并评估其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 口腔鳞状细胞癌样本和二硫死亡相关基因 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA测序, 实时PCR, 单细胞RNA测序, 功能富集分析, 生存分析, 免疫细胞浸润分析 | 接收者操作特征分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 231 | 2025-10-29 | Integrating multi-modal omics to identify therapeutic atherosclerosis pathways for coronary heart disease 
          2025-Oct-15, EBioMedicine
          
          IF:9.7Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105966
          PMID:41101252
         | 研究论文 | 通过整合尿液代谢产物、血浆蛋白、动脉粥样斑块组织和单细胞表达数据,识别冠状动脉心脏病的可靶向代谢通路 | 首次将多组学数据(尿液代谢产物、血浆蛋白、斑块组织和单细胞测序)整合应用于冠状动脉心脏病治疗靶点发现 | 研究主要基于欧洲人群数据,可能限制结果的普适性 | 识别冠状动脉心脏病的可靶向代谢通路和治疗靶点 | 尿液代谢产物、血浆蛋白、动脉粥样斑块组织、单细胞表达数据 | 计算医学 | 冠状动脉心脏病 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 单细胞表达数据 | 181,522例冠状动脉心脏病病例,954种尿液代谢产物,1,562种独特蛋白 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 232 | 2025-10-29 | Cell Subtype-specific Analysis of Neuronal Membrane Proteasome in Somatosensory Neurons 
          2025-Oct-10, Journal of visualized experiments : JoVE
          
         
          DOI:10.3791/69061
          PMID:41144432
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞分选技术揭示了神经元膜蛋白酶体在特定感觉神经元亚型中的表达及其在痛觉调节中的关键作用 | 首次在特定外周体感神经元亚群中发现并表征了神经元膜蛋白酶体(NMP),证明其选择性抑制可降低机械和疼痛敏感性而不引起神经病变 | 研究主要基于小鼠模型,在体实验仅限于爪部皮肤,人类相关性尚需进一步验证 | 探究神经元膜蛋白酶体在体感神经元中的细胞亚型特异性表达及其在感觉信号传导中的功能 | 小鼠体感神经元,特别是MrgprA3和Cysltr2神经元亚群 | 神经科学 | 疼痛疾病 | 单细胞RNA测序,荧光激活细胞分选,抗体标记 | NA | 单细胞转录组数据,细胞分选数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 233 | 2025-10-29 | Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female 
          2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2024.11.12.623125
          PMID:39605504
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示疟原虫在按蚊中肠内的发育阶段转换和寄生虫-蚊子相互作用机制 | 首次应用单细胞RNA测序分析疟原虫和蚊子细胞在不同发育阶段和代谢条件下的相互作用,发现SIP2转录因子对子孢子感染人类肝细胞的关键作用 | 研究中涉及的部分生物学过程机制仍需进一步验证 | 研究疟原虫在按蚊体内的发育转换过程和寄生虫-宿主相互作用机制 | 疟原虫和按蚊中肠细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜, 共享条形码分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 多个发育阶段的寄生虫和蚊子细胞,包括野外来源的寄生虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 234 | 2025-10-29 | Identification of a PRDM1-regulated T cell network to regulate atherosclerotic plaque inflammation 
          2025-Oct-02, Genome medicine
          
          IF:10.4Q1
          
         
          DOI:10.1186/s13073-025-01541-6
          PMID:41039608
         | 研究论文 | 本研究通过网络分析方法识别了调控动脉粥样硬化斑块炎症的PRDM1调节T细胞网络 | 首次采用加权基因共表达网络分析和贝叶斯网络推断相结合的方法,识别了区分高低风险斑块的PRDM1调控T细胞网络 | 样本量相对有限(人类斑块样本n=43),且PRDM1靶向药物尚未开发 | 探索人类动脉粥样硬化斑块从低风险向高风险转变过程中的免疫基因调控机制 | 人类颈动脉斑块(稳定型和不稳定型)和Ldlr基因敲除小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 贝叶斯网络推断, 单细胞RNA测序, 计算机药物重定位 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 人类颈动脉斑块样本43例(稳定型16例,不稳定型27例),Ldlr基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA | 
| 235 | 2025-10-29 | Single-Cell Transcriptomics Shows Cellular Heterogeneity, Intercellular Communication, and Extracellular Matrix Remodeling in Corneal Fibrosis In Vivo 
          2025-Oct-01, Investigative ophthalmology & visual science
          
          IF:5.0Q1
          
         
          DOI:10.1167/iovs.66.13.48
          PMID:41147949
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究兔角膜纤维化过程中的细胞异质性、细胞间通讯和细胞外基质重塑 | 首次在体内建立角膜纤维化的整合转录组框架,揭示基质细胞异质性、细胞间信号传导和ECM重塑轨迹 | 研究仅使用新西兰白兔模型,未涉及人类样本 | 表征角膜纤维化过程中的成纤维细胞异质性、细胞轨迹、细胞间通讯和细胞外基质蛋白重塑 | 新西兰白兔的正常和碱损伤纤维化角膜 | 单细胞转录组学 | 角膜纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 无监督聚类、轨迹推断、CellChat细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 新西兰白兔的正常和碱损伤角膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 236 | 2025-10-29 | Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression 
          2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2025.01.17.633673
          PMID:39896558
         | 研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌细胞通过表达白细胞表面受体蛋白进行免疫拟态,从而促进肿瘤进展的新机制 | 首次发现乳腺癌细胞能够表达典型白细胞表面受体蛋白,并将此细胞程序命名为“免疫拟态” | 需要在更多乳腺癌队列中验证其预后价值,并评估与远端转移、生存率和治疗反应的相关性 | 探究乳腺癌细胞免疫拟态现象及其在肿瘤进展中的作用 | 人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、组织病理标本、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺肿瘤模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据、组织病理图像 | 公共人类乳腺癌单细胞RNA-seq数据集、乳腺癌细胞系、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 237 | 2025-10-29 | Single-Cell RNA Sequencing Reveals Granzyme K+ CD8+ T Cells as a Target for Mitigating Plaque Instability Following Radiation 
          2025-Sep-16, Journal of the American Heart Association
          
          IF:5.0Q1
          
         
          DOI:10.1161/JAHA.124.040632
          PMID:40913272
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了颗粒酶K+ CD8+ T细胞在放疗后斑块不稳定性中的关键作用 | 首次发现颗粒酶K+ CD8+ T细胞亚群在放疗诱导的动脉粥样硬化病变进展中的致病功能,并确定GZMB作为放射性心血管损伤的介质 | 研究基于动物模型(兔和小鼠),结果需要在人体中进一步验证 | 探究放疗诱导斑块不稳定性的机制及影像学特征变化 | 兔颈动脉斑块模型和ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化病变 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,光学相干断层扫描-血管内超声双模成像,生物信息学分析,病理染色,流式细胞术,基因敲除,抗体清除 | NA | 单细胞转录组数据,影像数据 | 兔模型和小鼠模型(ApoE-/-小鼠在未照射、早期照射和晚期照射三个阶段) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 238 | 2025-10-29 | Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Dynamic Cell Populations and Immune Infiltration in Moyamoya Disease 
          2025-Sep-16, Journal of the American Heart Association
          
          IF:5.0Q1
          
         
          DOI:10.1161/JAHA.124.041168
          PMID:40913267
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了烟雾病病理动脉中的细胞组成和免疫浸润动态 | 首次构建烟雾病浅表颞动脉的单细胞转录组图谱,发现自然杀伤T细胞在促进血管细胞增殖和迁移中的关键作用 | 样本量较小(2例患者和3例对照),仅使用浅表颞动脉样本 | 全面绘制烟雾病病理动脉的细胞组成和分子改变 | 烟雾病患者和健康对照者的浅表颞动脉样本 | 单细胞生物学 | 烟雾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5个样本(2例患者,3例对照),共26,371个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 239 | 2025-10-29 | Single-Cell Transcriptomics of Human Pericarotid Lymph Nodes Indicating Stability of Carotid Atherosclerotic Plaques 
          2025-Sep-16, Journal of the American Heart Association
          
          IF:5.0Q1
          
         
          DOI:10.1161/JAHA.124.039777
          PMID:40932121
         | 研究论文 | 通过单细胞转录组分析探索颈动脉周围淋巴结与动脉粥样硬化斑块稳定性之间的关系 | 首次在单细胞水平揭示颈动脉周围淋巴结与动脉粥样硬化斑块稳定性的关联,并发现淋巴结肿大可作为斑块不稳定的潜在生物标志物 | 样本仅来自严重颈动脉狭窄患者,结果可能不适用于早期或轻度病例 | 研究淋巴结功能与动脉粥样硬化的关系,特别关注斑块稳定性 | 106例接受颈动脉内膜切除术的严重颈内动脉狭窄患者及其颈动脉周围淋巴结 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,T/B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 106例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 240 | 2025-10-29 | Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations 
          2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
          
          IF:40.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
          PMID:40759634
         | 综述 | 本文综述了癌症干细胞(CSCs)的特性、挑战及新兴治疗策略 | 整合单细胞测序、空间转录组学和多组学数据揭示CSCs异质性和代谢可塑性,提出双代谢抑制、合成生物学干预等创新疗法 | 缺乏普遍可靠的CSCs生物标志物,难以在不影响正常干细胞的前提下靶向CSCs | 探讨癌症干细胞生物学特性及开发靶向治疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学整合, 3D类器官模型, CRISPR筛选, AI驱动分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |