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当前共找到 32106 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-11-02 |
[Single-cell transcriptomic analysis reveals immune dysregula-tion and macrophage reprogramming in diabetic foot ulcers]
2025-Sep-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
DOI:10.3724/zdxbyxb-2025-0464
PMID:41025297
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示糖尿病足溃疡中免疫失调和巨噬细胞重编程机制 | 首次建立糖尿病足溃疡的单细胞图谱，揭示巨噬细胞通过COMPLEMENT和SPP1通路在炎症微环境中的核心作用 | 样本量有限，仅分析了DFU患者和非DFU对照组的皮肤组织 | 阐明糖尿病足溃疡中巨噬细胞介导的炎症和组织损伤的潜在机制 | 糖尿病足溃疡患者的皮肤组织样本 | 单细胞转录组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | Seurat聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 79,272个高质量细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 222 | 2025-11-02 |
Hi-C3: a statistical inference-based model for reconstructing higher-order cell-cell communication networks
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf568
PMID:41159728
|
研究论文 | 提出一种基于统计推断的模型Hi-C3，用于从单细胞RNA测序数据重建高阶细胞-细胞通讯网络 | 首次将网络扩散和流行病动力学原理应用于细胞通讯建模，能够同时推断传统的成对通讯和新的高阶通讯模式 | 模型主要基于配体-受体相互作用的假设，可能无法捕获其他类型的细胞通讯机制 | 开发能够揭示多细胞协调信号传导结构的计算框架 | 拟南芥和结直肠癌数据集中的细胞类型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 统计推断模型, EM算法, PageRank算法 | 单细胞RNA测序数据 | 多个数据集（具体样本数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 223 | 2025-11-02 |
Single-cell multi-omics and machine learning for dissecting stemness in cancer
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf566
PMID:41159730
|
综述 | 探讨单细胞多组学与机器学习在解析癌症干细胞特性中的应用 | 从静态标志物定义转向动态功能视角的癌症干细胞研究范式转变 | NA | 解析癌症干细胞特性并开发精准医疗策略 | 癌症干细胞(CSCs) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序,轨迹推断,空间转录组学,CRISPR筛选 | 人工智能预测模型 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 224 | 2025-11-02 |
Resolving microenvironment complexity and cellular heterogeneity in osteoarthritis via spatial transcriptomics
2025-Jul-14, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.07.007
PMID:40669534
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综述 | 本文探讨空间转录组学技术在解析骨关节炎微环境复杂性和细胞异质性中的应用与进展 | 系统阐述空间转录组学如何突破传统转录组技术的空间分辨率限制，揭示骨关节炎中分区基因表达模式和细胞间相互作用 | 当前技术存在局限性，需要与其他组学和成像技术整合 | 探索空间转录组学在骨关节炎研究中的应用潜力 | 骨关节炎关节组织（软骨、滑膜、软骨下骨、关节周围组织） | 空间转录组学 | 骨关节炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 225 | 2025-11-02 |
Macrophage sensitivity to bexmarilimab-induced reprogramming is shaped by the tumor microenvironment
2025-May-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011292
PMID:40379271
|
研究论文 | 本研究探索了肿瘤微环境对bexmarilimab诱导的巨噬细胞重编程敏感性的影响 | 首次利用乳腺癌患者来源的外植体培养模型，结合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了肿瘤微环境炎症状态是bexmarilimab治疗反应的主要决定因素 | 研究主要基于体外模型，需要在体内环境中进一步验证 | 探索肿瘤微环境对巨噬细胞重编程治疗敏感性的影响机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA测序, 多重细胞因子分析 | 患者来源的外植体培养模型 | 基因表达数据, 细胞因子数据, 空间转录组数据 | 乳腺癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 226 | 2025-11-02 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646238
PMID:40236180
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研究论文 | 提出名为Lloki的新型框架，用于整合不同平台的空间转录组数据 | 无需共享基因面板即可整合基于成像的空间转录组数据，通过最优传输引导的特征传播和批量对齐实现跨平台整合 | NA | 解决不同平台空间转录组数据整合的挑战 | 小鼠脑样本和卵巢癌数据集 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT，图神经网络 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 五个不同技术的小鼠脑样本和五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2025-11-02 |
GTestimate: improving relative gene expression estimation in scRNA-seq using the Good-Turing estimator
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf084
PMID:41159548
|
研究论文 | 提出基于Good-Turing估计器的单细胞RNA测序标准化方法GTestimate，用于改进基因相对表达量估计 | 首次将Good-Turing估计器应用于单细胞RNA测序标准化，并开发了新型细胞靶向PCR扩增方法(cta-seq)进行验证 | 未明确说明方法在特定细胞类型或实验条件下的适用性限制 | 改进单细胞RNA测序中的技术变异问题，提高基因相对表达量估计的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, PCR扩增 | Good-Turing估计器 | 基因表达数据 | 4个示例数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 228 | 2025-11-02 |
Unsupervised multiscale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf111
PMID:41066207
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞转录组数据的多尺度聚类方法，以识别细胞亚型的层次结构 | 提出构建稀疏细胞-细胞相关性网络的无监督多尺度聚类方法，能够在多个分辨率下识别新的细胞类型和亚型 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中的细胞聚类方法，以揭示更精细的细胞景观结构 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多尺度聚类 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 229 | 2025-11-02 |
Integrated machine learning-based establishment of a prognostic model in multicenter cohorts for acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1649594
PMID:41164126
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习方法建立了急性髓系白血病的预后模型MLAPS | 使用10种机器学习算法的101个模型开发预后特征，并通过实验验证CD69在AML恶性进展中的作用 | NA | 评估白血病细胞相关基因的功能和预后意义 | 急性髓系白血病患者 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 集成机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个独立队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 230 | 2025-11-02 |
Integrative modeling of malignant epithelial programs in EGFR-mutant LUAD via single-cell transcriptomics and multi-algorithm machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1661679
PMID:41164195
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和多算法机器学习整合建模EGFR突变肺腺癌中的恶性上皮程序 | 在单细胞水平解析EGFR突变上皮细胞的恶性程序，开发了EGFRmERS预后评分系统并验证其优于现有模型，首次将PERP鉴定为关键功能基因 | 使用公开数据库数据，样本来源可能受限；功能验证仅限于体外实验 | 表征EGFR突变肺腺癌中恶性上皮细胞特征，开发预后预测模型 | EGFR突变肺腺癌患者样本中的恶性上皮细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，qRT-PCR，Transwell迁移/侵袭实验，集落形成实验 | inferCNV，k-means聚类，Monocle2，十种机器学习算法 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 多个独立队列的EGFR突变肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 231 | 2025-11-02 |
Integrative multi-omics reveals energy metabolism-related prognostic signatures and immunogenetic landscapes in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1679464
PMID:41164190
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法开发了能量代谢相关预后模型，用于评估肺腺癌预后并揭示相关免疫遗传通路 | 首次结合孟德尔随机化和机器学习方法构建能量代谢相关基因的预后模型，并通过单细胞RNA测序揭示其在肿瘤微环境中的细胞特异性表达 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探索能量代谢相关基因在肺腺癌中的预后价值和免疫遗传机制 | 肺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学整合分析, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 随机生存森林机器学习算法 | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2025-11-02 |
Ménière's disease and vestibular migraine: a narrative review of pathogenetic insights, diagnostic evolution, and clinical management advances
2025, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2025.1653509
PMID:41164402
|
综述 | 比较分析梅尼埃病与前庭性偏头痛的发病机制、临床特征和诊断标准，总结研究进展并展望未来研究方向 | 提出整合单细胞转录组学、高分辨率内耳MRI、标准化蛋白质组平台和机器学习方法的综合研究框架 | 现有生物标志物研究受限于样本量小和缺乏标准化验证方案 | 阐明梅尼埃病与前庭性偏头痛的发病机制并改进临床诊疗策略 | 梅尼埃病和前庭性偏头痛患者 | 医学研究 | 前庭疾病 | 单细胞转录组学, 高分辨率MRI, 蛋白质组学, 机器学习 | 机器学习 | 临床数据, 影像数据, 分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 233 | 2025-11-02 |
Method of moments framework for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2024-Oct-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.09.044
PMID:39454576
|
研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA测序数据差异表达分析的矩量法框架工具Memento | 开发了可同时分析均值表达、变异性和基因相关性的稳健高效差异分析工具，可扩展至数百万细胞和数千样本 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中区分生物和技术变异源、评估细胞组间定量比较统计显著性的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 矩量法框架 | 基因表达数据 | 70,000气管上皮细胞、160,000 CRISPR-Cas9扰动T细胞、120万外周血单核细胞、5000万细胞CELLxGENE数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2025-11-02 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
|
研究论文 | 介绍了一个名为STimage-1K4M的新型空间转录组学数据集，该数据集将组织病理学图像与基因表达数据相结合 | 首次提供了亚图像切片与高维基因表达数据的配对，实现了前所未有的数据粒度 | NA | 解决现有医学图像-文本数据集中文本描述过于概括、缺乏亚区域细节的问题 | 组织病理学图像和基因表达数据 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | 1,149张图像，4,293,195对亚切片图像-基因表达配对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 235 | 2025-11-01 |
Mechanisms of lactylation-related biomarker in neonatal hypoxic-ischemic brain damage analyzed through multi-omics data
2025-Oct-30, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04538-4
PMID:41168403
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析乳酰化相关生物标志物在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的作用机制 | 首次在新生大鼠缺氧缺血性脑病模型中采用多组学方法，探索乳酸盐代谢相关基因的作用 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 研究乳酰化相关基因在新生儿缺氧缺血性脑损伤中的机制并探索潜在治疗靶点 | SD大鼠新生幼鼠的脑组织 | 多组学分析 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 | 机器学习 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞数据 | SD大鼠脑组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 236 | 2025-11-01 |
Nicheformer: a foundation model for single-cell and spatial omics
2025-Oct-30, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02814-z
PMID:41168487
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研究论文 | 提出基于Transformer的基础模型Nicheformer，用于单细胞和空间组学数据分析 | 首个同时训练于人类和小鼠解离单细胞及靶向空间转录组数据的基础模型，能够学习捕获空间背景的细胞表征 | 未明确说明模型在特定组织类型或疾病状态下的性能限制 | 开发能够整合多尺度数据的机器学习模型，用于空间单细胞分析 | 人类和小鼠的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | Transformer | 单细胞数据，空间转录组数据 | 超过1.1亿个细胞（5700万解离细胞和5300万空间解析细胞），涵盖73种组织 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 237 | 2025-11-01 |
A Dynamic DNA Nano-Antioxidant Targeting Galectin-3 Attenuates Liver Fibrosis via Reducing Macrophage Oxidative Stress
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509977
PMID:41168966
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研究论文 | 开发了一种靶向Galectin-3的动态DNA纳米抗氧化剂，通过减少巨噬细胞氧化应激缓解肝纤维化 | 首次开发动态DNA纳米抗氧化剂实现肝巨噬细胞特异性siRNA递送，并发现Galectin-3与巨噬细胞氧化应激的正相关性 | 研究仅在小鼠模型中进行验证，尚未进行临床前或临床试验 | 开发靶向治疗肝纤维化的新型纳米药物平台 | 肝巨噬细胞和肝纤维化小鼠模型 | 纳米医学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序，siRNA递送，IVIS成像 | NA | 基因表达数据，荧光成像数据，组织学数据 | 四氯化碳诱导的肝纤维化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2025-11-01 |
Spatiotemporal transcriptomic and metabolomic landscapes of wild soybean seed development reveal regulatory mechanisms of nutrient accumulation
2025-Oct-29, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101580
PMID:41169047
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和代谢组学解析野生大豆种子发育过程中的营养积累调控机制 | 首次在野生大豆中整合空间转录组学和代谢组学分析，揭示了胚胎不同区域细胞的代谢分化模式及关键调控因子GsMAPK23-4的功能 | 研究仅聚焦于中成熟期种子，未涵盖整个发育过程的动态变化 | 阐明野生大豆种子发育过程中细胞分化和营养积累的时空调控机制 | 野生大豆(Glycine soja Sieb. et Zucc.)种子 | 植物生物学 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学, 差异表达分析, 伪时间轨迹分析, 细胞间通讯分析 | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 中成熟期野生大豆种子 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 239 | 2025-11-01 |
Kell and Kx blood group systems: an update
2025-Sep-01, Immunohematology
|
综述 | 更新自2015年以来Kell和Kx血型系统的最新研究进展，包括新发现的抗原、等位基因及其与红细胞膜稳定性的关系 | 首次报道婴儿McLeod综合征诊断，发现大量新抗原和等位基因（截至2025年Kell系统已有38种抗原），强调分子诊断在解决血清学模糊性和神经退行性疾病诊断中的作用 | NA | 总结Kell和Kx血型系统的最新研究进展和临床应用 | Kell和Kx血型系统的抗原、等位基因及其与红细胞膜稳定性和疾病的关系 | NA | 血液系统疾病 | 单细胞测序、多组学分析、基因编辑、细胞治疗 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-31 |
Thymic myeloid cells are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250733
PMID:41123595
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺髓系细胞的异质性并鉴定出一种新型过渡性树突状细胞群 | 发现传统认知的DC2实际包含四个不同细胞谱系，并首次鉴定出CX3CR1+过渡性树突状细胞(tDC)这一新型细胞群 | 研究主要基于小鼠模型，人类胸腺髓系细胞的异质性仍需验证 | 解析胸腺髓系细胞的谱系身份、发育和成熟机制 | 胸腺髓系细胞（包括树突状细胞和巨噬细胞） | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组测序，谱系定义小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |