单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27474 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-05-01 |
Elevated KIF2C Expression Drives Osteosarcoma Progression by Modulating the Wnt/β-Catenin Signaling Pathway and Contributing to an Immunosuppressive Tumor Microenvironment
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70915
PMID:40292920
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研究论文 | 研究KIF2C在骨肉瘤(OS)中的作用及其对肿瘤微环境的影响 | 首次揭示KIF2C通过调节Wnt/β-catenin信号通路和促进免疫抑制性肿瘤微环境来驱动骨肉瘤进展 | 研究主要基于公共数据集和体外/体内实验，需要进一步临床验证 | 探究KIF2C在骨肉瘤发生发展中的作用机制 | 骨肉瘤细胞和肿瘤微环境 | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | KEGG富集分析、GSVA、ssGSEA、ESTIMATE算法、单细胞测序、分子对接和分子动力学 | 体外细胞模型和体内动物模型 | 基因表达数据和蛋白质相互作用数据 | 公共数据集中的骨肉瘤样本和实验模型 |
| 222 | 2025-05-01 |
Single-cell transcriptome unveils mesenchymal cell diversity in endometriosis
2025-Apr-30, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf065
PMID:40302519
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了子宫内膜异位症中间充质细胞的多样性及其在疾病发病机制中的关键作用 | 首次构建了子宫内膜异位症的单细胞图谱，鉴定了六个不同的间充质亚群，并阐明了它们在蛋白质合成、细胞粘附和代谢过程中的功能 | 样本量较小（仅3个子宫内膜异位症卵巢组织和3个正常卵巢组织），可能影响结果的普遍性 | 探究子宫内膜异位症中间充质细胞的多样性和功能 | 子宫内膜异位症和正常卵巢组织中的间充质细胞 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜异位症 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 3个子宫内膜异位症卵巢组织和3个正常卵巢组织 |
| 223 | 2025-05-01 |
Elevating single-particle encapsulation in droplet microfluidics by utilizing surface acoustic wave and flow control
2025-Apr-30, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d4lc00787e
PMID:40302630
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research paper | 提出了一种结合表面声波(SAW)和鞘流控制的微滴微流控系统，以提高单颗粒封装效率 | 通过整合SAW和鞘流控制，显著提高了单颗粒封装效率，最高可达78%，远超传统方法的理论上限和泊松分布 | NA | 提高微滴微流控系统中的单颗粒封装效率，以满足高通量应用如单细胞测序和药物筛选的需求 | 聚苯乙烯微球、磁珠和H22细胞 | 微流控技术 | NA | 表面声波(SAW)和鞘流控制 | NA | NA | NA |
| 224 | 2025-05-01 |
Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness
2025-Apr-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656
PMID:40304034
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research paper | 研究探讨了习惯性运动如何通过调节神经免疫相互作用来减轻主动脉硬化 | 揭示了运动通过调节交感神经与免疫细胞的相互作用来减轻血管纤维化和主动脉硬化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探究运动如何通过神经免疫相互作用减轻主动脉硬化 | C57BL/6小鼠和Ccr2基因敲除/敲入小鼠 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、基因本体分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据、生理参数 | 多组C57BL/6小鼠和Ccr2基因修饰小鼠 |
| 225 | 2025-05-01 |
Overload of Neprilysin in Placental Extracellular Vesicles Disrupts CNP-NPRB-Mediated Communication Between Vascular Endothelial and Smooth Muscle Cells: A Trigger for Symptoms of Preeclampsia
2025-Apr-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325673
PMID:40304042
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research paper | 本研究探讨了胎盘源性细胞外囊泡中NEP的过载如何破坏CNP-NPRB介导的血管内皮和平滑肌细胞间的通讯，从而触发子痫前期症状 | 首次揭示了胎盘源性细胞外囊泡中NEP的过载通过降解CNP影响血管功能，是子痫前期发病的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明子痫前期的发病机制，特别是胎盘与血管功能障碍之间的联系 | 胎盘细胞外囊泡、血管内皮细胞、血管平滑肌细胞 | 生殖医学 | 子痫前期 | LC-MS、单细胞RNA测序、肌动描记术、腺病毒转染 | 小鼠疾病模型 | 蛋白质组学数据、RNA测序数据、生理参数 | 正常和子痫前期胎盘样本、妊娠小鼠模型 |
| 226 | 2025-05-01 |
MEA-seqX: High-Resolution Profiling of Large-Scale Electrophysiological and Transcriptional Network Dynamics
2025-Apr-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412373
PMID:40304297
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research paper | 介绍MEA-seqX平台，用于同时记录和分析分子和电网络活动在介观空间分辨率下的动态 | MEA-seqX平台首次实现了分子和电网络活动在介观空间分辨率下的同时记录和分析，揭示了转录与功能之间增强的嵌套动态 | 研究仅在小鼠海马体模型中进行，尚未在其他脑区或物种中验证 | 解码分子事件与神经元活动之间的相互影响，研究大脑功能 | 小鼠海马体模型中的分子和电网络活动 | 神经科学 | NA | 高密度微电极阵列、空间转录组学、光学成像 | 机器学习算法 | 电生理数据和转录组数据 | NA |
| 227 | 2025-05-01 |
Exploring the Latent Information in Spatial Transcriptomics Data via Multi-View Graph Convolutional Network Based on Implicit Contrastive Learning
2025-Apr-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413545
PMID:40304359
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研究论文 | 本研究提出了一种基于多视图图卷积网络和隐式对比学习的新框架STMIGCL，用于提高空间转录组数据的空间域识别精度 | 结合多视图图卷积网络和隐式对比学习，通过潜在空间对比增强优化低维表示，提升空间域识别的准确性和判别力 | 未明确提及具体局限性 | 提高空间转录组数据的空间域识别精度，增强对组织微环境和生物过程的理解 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 多视图图卷积网络、隐式对比学习、注意力机制 | GCN（图卷积网络） | 空间转录组数据（基因表达与空间坐标） | NA |
| 228 | 2025-05-01 |
Investigation into the Spatial Heterogeneity of Lung Composite Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma Spatial Transcriptomic Analysis of Combined Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma
2025-Apr-30, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2025.0043
PMID:40304569
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research paper | 本研究探讨了肺复合大细胞神经内分泌癌（CoLCNEC）的空间转录组表达模式，并识别了关键基因 | 利用空间转录组技术（ST）分析了CoLCNEC患者的样本，发现了基因SMC1A在肿瘤区域的显著上调及其在癌细胞迁移、侵袭和细胞周期中的作用 | 研究仅基于一个CoLCNEC患者的样本，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探索CoLCNEC的空间转录组表达模式，识别关键基因并验证其作为治疗靶点的潜力 | 肺复合大细胞神经内分泌癌（CoLCNEC）患者的肿瘤组织 | digital pathology | lung cancer | 空间转录组技术（ST）、高通量测序、免疫组化、RT-qPCR、Western blot、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、空间位置数据 | 一个CoLCNEC患者的样本，包含三种不同成分（LCNEC、腺癌和鳞状细胞癌） |
| 229 | 2025-05-01 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Apr-30, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
|
综述 | 本文系统总结了单细胞转录组和表观基因组方法在阿尔茨海默病研究中的应用，重点关注细胞类型和亚型特异性转录组变化的表征 | 利用单细胞测序技术揭示了阿尔茨海默病大脑的细胞和分子异质性，并整合多种组学技术阐明疾病轨迹和细胞通讯网络 | NA | 增强对阿尔茨海默病发病机制的理解，并为精准医学识别新的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病患者大脑中的神经元和胶质细胞亚群 | 数字病理学 | 老年病 | scRNA-seq, ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 230 | 2025-05-01 |
Identification of druggable genetic targets for prostate cancer risk based on mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2025-Apr-30, International urology and nephrology
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11255-025-04525-y
PMID:40304996
|
research paper | 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，识别与前列腺癌风险相关的可药物遗传靶点 | 整合孟德尔随机化分析、共定位分析和单细胞RNA测序技术，提高靶点验证的准确性 | BAK1基因与血小板计数增加相关，可能存在副作用 | 识别与前列腺癌风险相关的可药物遗传靶点，为靶向治疗提供新方向 | 2608个可药物基因 | genetics | prostate cancer | Mendelian Randomization (MR), colocalization analysis, single-cell RNA sequencing, phenome-wide association study (PheWAS) | NA | genetic data, RNA sequencing data | NA |
| 231 | 2025-05-01 |
Perivascular Niche-Resident Alveolar Macrophages Promote Interstitial Pneumonitis Related to Trastuzumab Deruxtecan Treatment
2025-Apr-29, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2021
PMID:40300097
|
research paper | 研究探讨了曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）治疗乳腺癌时引发致命性间质性肺病（ILD）的机制，并提出预防策略 | 揭示了T-DXd通过Fc-FcγR相互作用触发肺泡巨噬细胞（AMs）从免疫抑制状态向促ILD状态的转变，以及通过SPP1通路介导的炎症和免疫激活机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 理解T-DXd诱导的ILD机制并开发预防策略 | 曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）和肺泡巨噬细胞（AMs） | 免疫学 | 乳腺癌和间质性肺病（ILD） | 单细胞RNA测序和活体显微镜技术 | 免疫活性小鼠模型 | 基因表达数据和显微镜图像 | NA |
| 232 | 2025-05-01 |
Integrative Analysis of Lactylation-Associated Features in Abdominal Aortic Aneurysm and Its Immune Microenvironment Utilizing scRNA-seq and Bulk RNA Sequencing
2025-Apr-29, Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society
IF:3.1Q2
DOI:10.1253/circj.CJ-24-0892
PMID:40301103
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，研究腹部主动脉瘤（AAA）中乳酰化与免疫微环境的关系 | 首次揭示了乳酰化在不同免疫细胞类型中的异质性及其与免疫反应的关联，并鉴定了8个与乳酰化相关的核心基因 | 研究结果需要进一步的实验验证，特别是在人类样本中的应用 | 阐明乳酰化与AAA免疫反应之间的相互关系 | 腹部主动脉瘤（AAA）患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, Bulk RNA测序 | 机器学习算法（113种组合） | RNA测序数据 | NA |
| 233 | 2025-05-01 |
Broad rim lesions are a new pathological and imaging biomarker for rapid disease progression in multiple sclerosis
2025-Apr-29, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03625-7
PMID:40301560
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research paper | 该研究通过分析多发性硬化症（MS）尸检队列，发现了一种新型病变类型——宽边缘病变，可作为疾病快速进展的生物标志物 | 首次揭示了宽边缘病变作为MS快速进展的新型病理和影像学生物标志物，并验证了其与疾病进展的关联 | 研究样本来自尸检队列，可能无法完全反映活体患者的动态病理过程 | 探索多发性硬化症疾病进展的潜在机制并寻找相关生物标志物 | 多发性硬化症患者尸检脑组织样本和独立PET研究队列 | digital pathology | multiple sclerosis | 空间转录组学、PET成像 | NA | 组织病理学图像、转录组数据、PET影像数据 | 尸检队列186例，PET研究队列114例 |
| 234 | 2025-05-01 |
Systematic evaluation of the isolated effect of tissue environment on the transcriptome using a single-cell RNA-seq atlas dataset
2025-Apr-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11614-w
PMID:40301713
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研究论文 | 本研究提出了一种名为COSER的新数据分析框架，用于评估组织环境对转录组的独立影响 | 引入了COSER框架，利用图论列举适当的子数据集以减少统计混杂，从而评估离散变量的独立影响 | 研究依赖于Tabula Muris Senis单细胞转录组图谱数据，可能不适用于其他数据集或生物系统 | 评估组织环境对基因表达的独立影响 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | Tabula Muris Senis数据集中的多样本 |
| 235 | 2025-05-01 |
SpaNorm: spatially-aware normalization for spatial transcriptomics data
2025-Apr-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03565-y
PMID:40301877
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研究论文 | 开发了一种名为SpaNorm的空间感知归一化方法，用于处理空间转录组数据 | 首个同时建模文库大小效应和潜在生物学效应、并分离这些效应的空间感知归一化方法 | NA | 解决空间转录组数据归一化中的挑战 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | SpaNorm | 空间转录组数据 | 来自6个数据集的27个组织样本，涵盖4种技术平台 |
| 236 | 2025-05-01 |
Clinical Diagnosis and Treatment System for Neurological Psychological Gastrointestinal Diseases Based on Multimodal Artificial Intelligence and Immunology
2025-Apr-29, Current pharmaceutical biotechnology
IF:2.2Q3
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research paper | 开发了一种基于多模态人工智能和免疫学的神经系统心理胃肠疾病临床诊疗系统，用于预测和辅助治疗结直肠癌 | 结合神经免疫基因调控设计人工智能多模态胃肠疾病临床信息系统，利用单细胞测序技术和分子模拟技术深入分析生存预测系统中的特征选择生物机制 | 未提及具体样本量及模型在更广泛人群中的适用性验证 | 优化结直肠癌的诊疗策略，满足临床定价机构的需求 | 结直肠癌患者 | digital pathology | colorectal cancer | single-cell sequencing, molecular simulation | AI multimodal system | gene expression levels, immune cell status, living habits data | NA |
| 237 | 2025-05-01 |
Autosomal dominant SLURP1 variants cause palmoplantar keratoderma and progressive symmetric erythrokeratoderma
2025-Apr-28, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf049
PMID:39913669
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研究论文 | 该研究通过全外显子测序发现了导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症的SLURP1基因新变异 | 首次发现常染色体显性遗传的SLURP1变异会导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症，并揭示了其作用机制 | 研究样本量较小（仅3个无亲缘关系的家系） | 鉴定导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症的新遗传变异 | 表皮分化障碍患者（包括掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症表型） | 遗传学 | 皮肤疾病 | 全外显子测序、计算机模拟预测、患者角质形成细胞实验、高分辨率空间转录组学、定量细胞因子分析 | NA | 基因序列数据、细胞实验数据 | 3个无亲缘关系的家系 |
| 238 | 2025-05-01 |
LAMA4+ CD90+ eCAFs provide immunosuppressive microenvironment for liver cancer through induction of CD8+ T cell senescence
2025-Apr-28, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02162-7
PMID:40289085
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research paper | 该研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，鉴定了与肝细胞癌预后不良相关的CD90 eCAFs亚型，并揭示了其通过LAMA4诱导CD8+ T细胞衰老的机制 | 首次鉴定了LAMA4+ CD90+ eCAFs亚型，揭示了其通过ITGA6受体介导的DNA损伤信号通路诱导CD8+ T细胞衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证不足 | 探究肝细胞癌中肿瘤微环境与免疫系统的相互作用机制 | 肝细胞癌中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组、siRNA转染、Western blot、流式细胞术 | 自发小鼠肝细胞癌模型(DEN+CCL4诱导) | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、流式细胞数据 | 未明确说明样本数量，包含人类肝细胞癌样本和小鼠模型 |
| 239 | 2025-05-01 |
Transcriptomic characterization of transitioning cell types in the skin of Atlantic salmon
2025-Apr-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02196-w
PMID:40289111
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research paper | 本研究通过单核测序和空间转录组学技术，描述了健康大西洋鲑鱼组织中及伤口愈合过程中间充质基质细胞的转录组特征 | 首次绘制了伤口愈合过程中潜在分化间充质基质细胞亚群的转录组活性，揭示了不同亚群的空间生态位 | 研究仅针对大西洋鲑鱼，结果可能不适用于其他物种 | 探究大西洋鲑鱼皮肤伤口愈合过程中细胞转录组的变化 | 大西洋鲑鱼的间充质基质细胞（成纤维细胞样成体干细胞） | 转录组学 | NA | 单核测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 240 | 2025-05-01 |
NAE1 protein: a prognostic, immunomodulatory, and therapeutic biomarker associated with neddylation in hepatocellular carcinoma
2025-Apr-28, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143539
PMID:40300298
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research paper | 本研究探讨了NAE1蛋白作为肝细胞癌（HCC）预后、免疫调节和治疗生物标志物的潜力 | 首次将NAE1确定为影响HCC患者预后的最重要neddylation相关基因，并揭示了其在免疫细胞浸润和药物敏感性中的作用 | 当前HCC的预测生物标志物不够可靠，NAE1作为预测生物标志物的潜力尚未完全明确 | 探索NAE1蛋白在HCC中的预后、免疫调节和治疗潜力 | 肝细胞癌（HCC）患者和HCC细胞 | 生物医学 | 肝细胞癌 | 加权基因共表达网络（WGCNA）、机器学习、单细胞RNA测序、分子对接 | Cox回归模型、nomogram | 基因表达数据、临床数据 | 未明确提及具体样本数量 |