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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-06-06 |
Associations Between Immune Senescence and Immune Reconstitution Among People Living With HIV Undergoing Antiretroviral Therapy
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/8683624
PMID:42227661
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研究论文 | 本研究探讨了免疫衰老与HIV感染者接受抗逆转录病毒治疗后免疫重建失败之间的关联 | 首次利用公共单细胞RNA测序数据中SenMayo基因集评分,结合前瞻性队列研究,系统评估了基线免疫衰老特征对ART治疗后免疫重建失败的影响 | 未明确提及,但可能包括样本量有限、观察周期仅为48周、未深入机制验证等 | 探究ART治疗前免疫衰老特征在免疫重建失败中的作用 | 510名开始ART治疗的HIV感染者 | 免疫学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序、免疫表型分析、细胞因子检测、细胞衰老标志物评估 | 逻辑回归 | 基因表达数据、免疫表型数据、细胞因子数据 | 510名HIV感染者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 来源于公共数据库的CD4+ T细胞单细胞RNA测序数据 |
| 222 | 2026-06-06 |
Anti-PD-1 blockade reverses low-intensity electric stimulation-driven pancreatic cancer progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1793161
PMID:42238591
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研究论文 | 探究低强度电刺激(LIES)对胰腺癌肿瘤免疫微环境的影响,并评估抗PD-1阻断疗法与LIES联合的抗肿瘤协同效应 | 首次使用原位胰腺导管腺癌(PDAC)小鼠模型系统评估LIES的免疫调节和巨噬细胞极化效应,并通过单细胞RNA测序揭示联合疗法对CD8+T细胞激活的放大作用 | 仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;LIES的电场分布不均可能影响结果普适性 | 探索LIES驱动的胰腺癌进展机制及抗PD-1阻断疗法的逆转作用 | 小鼠原位胰腺导管腺癌(PDAC)模型及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、多色免疫荧光、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像、细胞活力数据 | 小鼠原位PDAC模型(具体样本数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 223 | 2026-06-06 |
Immune Cell Infiltration and Kynurenine Pathway Activation Define Early Injury and Progression in Diabetic Nephropathy
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.122164
PMID:41608614
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序、体内糖尿病模型和2型糖尿病患者临床样本,研究糖尿病肾病不同阶段免疫炎症动态变化 | 首次揭示CCL4⁺髓源性抑制细胞在早期糖尿病肾病中的主导浸润作用,发现MALAT1维持其功能,并阐明犬尿氨酸途径代谢物与MDSC诱导和不良肾结局的关联 | 未提供明显局限性信息 | 阐明糖尿病肾病进展过程中的免疫炎症动态变化及关键分子机制 | 糖尿病肾病小鼠模型和2型糖尿病患者 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 多个小鼠模型和2型糖尿病患者临床样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 224 | 2026-06-06 |
Integrating network toxicology, machine learning, and single-cell sequencing to reveal the FASN-mediated role of phenolic endocrine disruptors in water in promoting prostate cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0350638
PMID:42228706
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研究论文 | 整合网络毒理学、机器学习和单细胞测序揭示水中酚类内分泌干扰物通过FASN促进前列腺癌的作用 | 首次利用网络毒理学、机器学习和单细胞测序多维框架,系统揭示酚类内分泌干扰物(NP/OP)通过FASN基因促进前列腺癌的潜在分子机制 | 研究基于计算分析和已有数据集,缺乏实验验证;FASN作为分子枢纽的因果关系仍需进一步实验确认 | 探究水中酚类内分泌干扰物(NP/OP)促进前列腺癌的分子机制 | 前列腺癌相关基因和酚类内分泌干扰物靶点 | 机器学习, 生物信息学, 网络毒理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | ANN, LASSO, SVM-RFE, GSVA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE46602数据集(36个肿瘤样本 vs 14个良性样本),GSE137829数据集(6个前列腺癌样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 225 | 2026-06-06 |
The Research Progress of Tumor-Associated Macrophages in Prostate Cancer
2026, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/6287638
PMID:42244152
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综述 | 文章综述了肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中的研究进展,包括其促进肿瘤进展和免疫治疗耐药的机制,以及靶向TAMs的精准治疗策略 | 基于单细胞RNA测序细化了TAMs的经典M1/M2分型,提出增殖性TAM和免疫调节性TAM等新亚型,并探讨了巨噬细胞胞外陷阱在转移中的作用 | 靶向治疗面临肿瘤微环境复杂性、TAM异质性、药物生产和递送障碍以及毒性管理等挑战 | 基于患者肿瘤内TAM亚群的组成、功能状态和信号依赖性开发个性化靶向策略,实现从“一刀切”方法向精准医学的转变 | 肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习教育 | 前列腺癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2026-06-06 |
Multisystem regulation of reward and addiction: beyond the dopaminergic system
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1840096
PMID:42244883
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综述 | 综述了奖赏与成瘾的多系统调控机制,超越了多巴胺能系统的单一视角 | 提出奖赏和厌恶应在一个统一的价处理框架下理解,并鉴定出下丘脑被盖核(SVTg)作为新的脑干节点,整合多系统信号 | 未提供具体实验数据,主要基于现有文献的综合分析 | 阐述奖赏和成瘾的多系统、网络基础模型,强调超越多巴胺能系统的调控机制 | 奖赏与成瘾相关神经环路及分子机制 | 机器学习 | 成瘾 | 单细胞转录组学、实时神经影像学、计算精神病学、药物基因组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 227 | 2026-06-06 |
ecPICK: A deep learning-enabled spatial diagnostic platform for direct ecDNA identification and clinical prognosis across pan-cancer histopathology
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.134316
PMID:42244994
|
研究论文 | 开发深度学习框架ecPICK,从常规H&E染色全切片图像中识别和定位染色体外DNA,实现跨癌种病理诊断与预后预测 | 首次将深度学习应用于常规病理切片的ecDNA检测,无需昂贵测序即可实现空间定位,并揭示ecDNA富集区域的独特微环境特征 | 依赖H&E染色质量,可能与FISH验证存在偏差,计算成本或受限于大规模临床部署 | 建立低成本、可临床转化的ecDNA空间诊断平台,用于泛癌病理分析及预后评估 | 来自20种不同癌症的4280张H&E染色全切片图像及其对应ecDNA数据 | 机器视觉, 数字病理学 | 泛癌 | 深度学习, 荧光原位杂交, 空间转录组学 | ecPICK深度学习框架 | 图像 | 20种癌症类型的4280张全切片图像 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 228 | 2026-06-06 |
Primary Cilium Forces Neuroendocrine Shift in Prostate Cancer through YAP1 Repression and Reduced Mitochondrial Activity
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.126688
PMID:42244995
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研究论文 | 该论文研究了初级纤毛在前列腺癌神经内分泌转化中的作用,通过YAP1抑制和线粒体活性降低促进这一过程 | 首次揭示初级纤毛与前列腺癌神经内分泌表型及代谢重编程之间的关联,并提出初级纤毛不仅是生物标志物,还可能通过结构-代谢轴驱动肿瘤可塑性和治疗脆弱性 | 未指定 | 探讨初级纤毛在神经内分泌前列腺癌中的分布及其在疾病进展中的功能意义 | 神经内分泌前列腺癌细胞、去势抵抗性前列腺癌样本、GLI1+/IFT20+或GLI1+/IFT80+基因特征阳性的纤毛化神经内分泌倾向亚群 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 229 | 2026-06-06 |
Epigenetic subtypes of high-grade T1 bladder cancer reveal intra-tumor heterogeneity and distinct interactions with tumor microenvironment
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.129729
PMID:42244999
|
研究论文 | 该研究通过整合染色质图谱、单核RNA-seq、免疫组化和空间转录组学,定义了高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型,揭示了肿瘤内异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 首次通过整合多种技术定义了高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型,并揭示了其与微环境的特异性相互作用及空间分布特征 | 研究中未提及明显的局限性信息 | 定义高级别T1期膀胱癌的表观遗传亚型,表征异质性,并探索肿瘤-微环境相互作用 | 高级别T1期膀胱癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 批量染色质分析、单核RNA测序、免疫组化、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | 未明确说明具体样本数量,但涉及高级别T1期膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 230 | 2026-06-06 |
Scalable differentiation of human cardiac organoids from iPSCs generates cardiac tissues for cardiac cell therapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.127654
PMID:42245001
|
研究论文 | 本研究提出了一种可扩展的方法,从iPSC分化出心脏类器官,用于心脏细胞治疗,并在猪心肌梗死模型中验证了其移植效果 | 首次在20天内从iPSC分化出含有心肌细胞、心脏成纤维细胞和内皮细胞的成熟心脏类器官,并验证了生物反应器辅助放大策略和猪体内移植可行性 | 仅使用了少量类器官(3500个),且随访时间较短(8-30天),长期效果和安全性需进一步评估 | 开发可扩展的心脏类器官分化技术,用于改善心肌梗死细胞治疗的细胞植入效果 | 人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的心脏类器官 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | 图像 | 3500个心脏类器官,移植到猪心肌梗死模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 231 | 2026-06-06 |
Toll-Like Receptors in Diabetes: Immunometabolic Mechanisms and Emerging Precision Therapeutic Strategies
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S606875
PMID:42245151
|
综述 | 综述Toll样受体在糖尿病中的免疫代谢机制及新兴精准治疗策略 | 提出“特洛伊木马”途径——肠道来源外泌体将炎症配体隐蔽运输至β细胞内体,绕过传统表面受体监控,并利用单细胞转录组学和孟德尔随机化揭示β细胞免疫反应细胞异质性和因果遗传联系 | 未提及具体限制 | 综合梳理Toll样受体在糖尿病中的免疫代谢整合角色,并为精准医学提出框架 | Toll样受体及其在糖尿病中的作用机制 | 机器学习 | 糖尿病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 232 | 2026-06-06 |
Integrated clinical and multi-omics analysis links composite inflammatory indices to macrophage-associated molecular programs in aortic dissection
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1840880
PMID:42245402
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研究论文 | 通过临床数据与多组学分析,探索复合炎症指数与主动脉夹层中巨噬细胞相关分子程序之间的联系 | 首次将常规血液检测衍生的复合炎症指数与单细胞RNA测序、批量转录组数据整合分析,揭示炎症指数与巨噬细胞转录重编程的关联 | 样本量相对有限,炎症指数与分子机制的因果关系尚未完全验证 | 评估复合炎症指数在主动脉夹层疾病评估中的作用,并揭示其与分子机制的整合关系 | 主动脉夹层患者和对照组参与者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 逻辑回归, LASSO, 随机森林, SVM-RFE, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 288名参与者(144名主动脉夹层患者和144名对照组) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2026-06-06 |
Graph Topology Reframes the Coherence of Cell-State Manifold Inference under Heterogeneous Single-Cell Observations
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0087
PMID:42245398
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研究论文 | 该论文讨论了在异质性单细胞观测数据下,图拓扑结构如何重构细胞状态流形推断的一致性 | 提出拓扑稳定性描述符用于评估低维流形骨架的可靠性,识别异质性观测带来的系统性扭曲 | 主要基于模拟数据验证,未在多种真实数据集上充分验证拓扑描述符的普适性 | 研究单细胞观测异质性对基于流形的推断(如图抽象)的影响,并提出解决系统性扭曲的方法 | 异质性单细胞RNA测序数据中的浅层观测细胞与深层观测细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个经验性单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 234 | 2026-06-06 |
Lactylation-driven metabolic reprogramming promotes osteosarcoma malignancy via HDGF-mediated proliferation and immune modulation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1836254
PMID:42245633
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示乳酸化驱动的代谢重编程通过HDGF介导的增殖和免疫调节促进骨肉瘤恶性进程 | 首次发现乳酸化修饰通过调控HDGF驱动骨肉瘤代谢重编程,并结合单细胞测序、空间转录组学和机器学习建模系统解析其机制 | 未在更大规模临床队列中验证HDGF作为生物标志物的预后价值,且虚拟筛选的药物需进一步实验验证 | 揭示乳酸化驱动的代谢重编程在骨肉瘤恶性进展和免疫微环境调控中的作用机制 | 骨肉瘤患者的肿瘤样本及细胞模型 | 机器学习, 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学整合分析 | 机器学习预后模型, SHAP可解释性框架 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 基因表达数据 | 未明确说明样本数量(基于公开数据集和实验样本) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 235 | 2026-06-06 |
Exploring glycerophospholipid metabolism in nasopharyngeal carcinoma: interactions between malignant epithelial cells and CCL11-expressing fibroblasts
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1799551
PMID:42245668
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研究论文 | 通过多组学方法探索鼻咽癌中甘油磷脂代谢以及恶性上皮细胞与表达CCL11的成纤维细胞之间的相互作用 | 首次整合单细胞转录组学、空间转录组学和空间代谢组学揭示鼻咽癌微环境中甘油磷脂代谢的复杂相互作用,并发现AGPAT3、DGAT2、SLC44A1、AGPAT5和LPGAT1作为潜在的诊断和预后标志物 | 尚未明确提及具体局限性 | 阐明甘油磷脂代谢在鼻咽癌中的作用,特别是恶性上皮细胞与成纤维细胞之间的相互作用 | 鼻咽癌组织中的恶性上皮细胞和表达CCL11的成纤维细胞 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、空间代谢组学 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 鼻咽癌组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 236 | 2026-06-06 |
NAMPT orchestrates fibroblast cuproptosis and immune crosstalk during IPF progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1726692
PMID:42245670
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研究论文 | 通过转录组分析揭示NAMPT在特发性肺纤维化(IPF)中调控成纤维细胞铜死亡和免疫互作的关键作用 | 首次将铜死亡机制与IPF病程进展关联,并发现NAMPT作为枢纽基因在调控成纤维细胞铜死亡和免疫微环境重塑中的双重功能 | 研究主要基于转录组数据分析,缺乏体内实验或功能验证机制的直接证据 | 探索NAMPT在IPF中调控成纤维细胞铜死亡及免疫互作的分子机制和潜在治疗靶点 | IPF患者和健康对照的肺组织样本 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | IPF患者和健康对照样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 237 | 2026-06-06 |
The translational paradox of AI in hepatocellular carcinoma: from algorithmic over-engineering to real-world clinical utility
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1848190
PMID:42245726
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综述 | 批判性评述人工智能在肝细胞癌中从算法过度工程化到临床实际应用的转化悖论 | 揭示自监督视觉基础模型、无监督域适应与AI协同空间转录组学等先进算法在真实世界多扫描仪队列中未经验证的转化困境,并挑战多模态叙事范式,证明算法复杂度不等同于临床效用 | 该综述基于近期文献批判性分析,但未提供原始实验数据或具体队列验证结果 | 评估肝细胞癌中人工智能方法从静态模式识别到机制驱动诊断的演变及其临床转化障碍 | 肝细胞癌的人工智能诊断方法(包括视觉基础模型、虚拟分子分析、空间转录组学、大语言模型与概念瓶颈模型) | 机器学习 | 肝细胞癌 | NA | 自监督视觉基础模型、大语言模型、概念瓶颈模型 | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 238 | 2026-06-06 |
Comprehensive analysis of m6A RNA methylation regulators and the immune microenvironment in spinal cord injury
2026, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2026.1759661
PMID:42246043
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研究论文 | 综合分析脊髓损伤中m6A RNA甲基化调控因子与免疫微环境的关系 | 首次系统性地结合多种机器学习算法、单细胞RNA测序和体内实验,识别并验证了FTO和YTHDC1作为脊髓损伤关键调控因子的作用,并探讨其与免疫微环境的关系 | 研究依赖于公共数据集,样本量有限,且未进行功能验证实验以确认FTO和YTHDC1在脊髓损伤中的直接作用机制 | 探索m6A RNA甲基化调控因子在脊髓损伤发病机制中的作用,并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 脊髓损伤组织和细胞(包括人源转录组数据和大鼠模型) | 数字病理学 | 脊髓损伤 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, 免疫荧光染色 | 机器学习算法, ssGSEA, NetworkAnalyst | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的多个脊髓损伤转录组数据集,以及大鼠脊髓损伤模型组织样本 | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 239 | 2026-06-06 |
Revealing the Best Strategies for Rare Cell Type Detection in Multi-Sample Single-Cell Datasets
2025-Dec-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010031
PMID:41595450
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研究论文 | 系统评估多样本单细胞数据中稀有细胞类型检测的最佳分析策略 | 首次在多样本场景下系统比较不同检测策略(单样本、合并样本、批次校正合并样本)和多种工具的性能,并基于批次校正的合并检测策略取得最优效果 | 研究仅提供策略层面的比较,未深入探讨各方法在不同技术平台或更大规模数据集上的适用性 | 评估多样本单细胞RNA测序数据中稀有细胞检测方法的性能,确定最有效的分析策略 | 五款稀有细胞检测工具(CellSIUS、GapClust、GiniClust、scCAD、SCISSORS)以及基于scGPT和Isolation Forest的稀有细胞检测方法 | 自然语言处理、机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Isolation Forest, scGPT | 基因表达数据 | 多个公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 240 | 2026-06-06 |
scSelector: A Flexible Single-Cell Data Analysis Assistant for Biomedical Researchers
2025-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010002
PMID:41595423
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research paper | 开发了一个交互式软件工具包scSelector,允许生物医学研究者基于专业知识灵活选择和分析单细胞数据中的细胞群 | 整合了套索选择工具与大型语言模型(DeepSeek/Gemini)辅助的细胞类型预测,突破了传统聚类依赖方法的刚性限制 | 可能依赖API稳定性,且不同数据集的生物学知识指导可能需要人工调整 | 为生物医学研究者提供灵活的单细胞数据分析工具,提高细胞亚群识别和功能异质性解析的精度 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群,包括稀有细胞亚群和标准质控中丢弃的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 大型语言模型 | 大型语言模型 | 单细胞表达数据 | 多个公共数据集,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |