单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30093 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-07-24 |
Identification and validation of the pivotal role of MANF gene in pancreatic β-cell aging using bioinformatics
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102106
PMID:40688493
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研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定并验证MANF基因在胰腺β细胞衰老中的关键作用 | 首次确立MANF作为β细胞蛋白质稳态的守护者，为糖尿病治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未在人体中进行验证 | 探索胰腺β细胞衰老的分子机制及其与糖尿病的关系 | 胰腺β细胞 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA-seq、微阵列分析 | d-半乳糖诱导的衰老小鼠模型、HO处理的MIN6细胞 | RNA-seq数据、微阵列数据 | 年轻和年老的食蟹猴及小鼠的胰腺β细胞数据，D-gal诱导的小鼠模型和HO处理的MIN6细胞 |
| 222 | 2025-07-24 |
Induction of host genes by nested genes during C. elegans development
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113021
PMID:40686608
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研究论文 | 本研究分析了在胚胎发育过程中，相反嵌套配置的基因组拓扑结构对转录的影响 | 揭示了嵌套基因如何影响其宿主基因的表达，特别是在神经元中诱导宿主基因的短版本转录 | 研究仅关注了线虫的胚胎发育，未涉及其他生物或发育阶段 | 探究相反嵌套配置的基因对宿主基因转录的影响 | 线虫（C. elegans）的胚胎发育 | 基因组学 | NA | CRISPR基因组工程、单分子FISH、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 数百个蛋白质编码基因的相反嵌套配置，覆盖线虫胚胎发育的单细胞RNA-seq数据 |
| 223 | 2025-07-24 |
Unraveling asthma through single-cell RNA sequencing in understanding disease mechanisms
2025-Aug, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2025.2472358
PMID:40014380
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的基本原理及其在哮喘研究中的应用，旨在增进对哮喘病理生理学的理解并指导未来研究方向 | 利用scRNA-seq技术揭示了哮喘中免疫细胞亚型的多样性及其在疾病发病机制中的特定作用，为靶向治疗策略的开发提供了理论基础 | 数据整合方法需要进一步优化，当前发现的临床适用性有限，未来研究应关注这些限制的克服、细胞类型注释的改进以及纵向和临床数据的纳入 | 阐明scRNA-seq的基本原理并总结其在哮喘研究中的应用，以增进对哮喘病理生理学的理解 | 哮喘的细胞类型异质性及其功能状态，特别是免疫细胞和气道重塑 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 224 | 2025-07-24 |
A robust diagnostic model for high-risk MASH: integrating clinical parameters and circulating biomarkers through a multi-omics approach
2025-Aug, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-025-10792-9
PMID:40205303
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研究论文 | 本研究通过多组学方法开发了一个用于高风险MASH的稳健诊断模型 | 整合了循环生物标志物和临床参数，开发了ABD-LTyG预测模型，并在独立队列中验证了其效能 | 样本量相对较小，且仅在特定队列中验证 | 开发一个用于高风险MASH的诊断模型 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)患者 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 蛋白质组学分析、转录组分析、scRNA-seq、免疫荧光双标记、LASSO回归 | ABD-LTyG模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据、临床数据 | 发现队列144人，验证队列171人 |
| 225 | 2025-07-24 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals dysregulation of B-cell subset function in patients with chronic hepatitis B
2025-Aug, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-025-10846-y
PMID:40489024
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了慢性乙型肝炎患者B细胞亚群功能的失调 | 首次在慢性乙型肝炎患者中鉴定了肝脏组织中富集的非典型B细胞(ABC)和FCRL1+ B细胞亚群，并揭示了它们在免疫耐受和免疫激活阶段的不同基因表达特征 | 样本量相对较小，特别是慢性恢复期患者仅有3例 | 研究乙型肝炎病毒(HBV)感染不同阶段B细胞亚群的免疫学特征及其临床意义 | 25名个体的46份肝脏和血液样本中的23,967个B细胞(包括1,677个浆细胞) | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 25名个体(6名健康对照，6名免疫耐受期，6名免疫激活期，4名急性恢复期，3名慢性恢复期)，另有验证队列38名个体 |
| 226 | 2025-07-24 |
Bone marrow tumor microenvironment profiling predicts distinct immunosuppressive phenotypes and immunotherapy potential in AML patients
2025-Aug, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118287
PMID:40555045
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研究论文 | 该研究通过分析急性髓性白血病（AML）的骨髓微环境，预测了不同的免疫抑制表型及其免疫治疗潜力 | 提出了基于13基因和16基因的多基因标记物来区分AML的不同免疫表型，并通过单细胞RNA测序和共培养实验验证了这些标记物 | 研究结果需要在大规模临床样本中进一步验证 | 探索AML的免疫微环境特征及其对免疫治疗的影响 | 成人及儿童AML患者样本和AML细胞系 | 肿瘤免疫学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序、xCell算法、TIDE分析、共培养实验 | NA | RNA测序数据、单细胞数据 | 成人及儿童AML患者队列和AML细胞系 |
| 227 | 2025-07-24 |
Melanocytes and photosensory organs share a common ancestry that illuminates the origins of the neural crest
2025-Jul-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08502-0
PMID:40696183
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研究论文 | 探讨脊椎动物中黑色素细胞和视网膜色素上皮细胞的共同祖先及其在神经嵴起源中的作用 | 通过单细胞转录组学、染色质可及性和空间转录组学数据，揭示了黑色素细胞和视网膜色素上皮细胞共同的调控基因表达模块，支持它们同源性的假说 | 研究主要基于转录组学和生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索黑色素细胞和视网膜色素上皮细胞的进化关系及其共同祖先 | 脊椎动物的黑色素细胞、视网膜色素上皮细胞以及被囊动物Ciona的感觉囊中的色素细胞 | 进化生物学 | NA | 单细胞转录组学、染色质可及性分析、空间转录组学、系统转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 228 | 2025-07-24 |
Multi-omic profiling reveals age-specific blood biomarkers and aging-driven B Cell remodeling in osteoarthritis
2025-Jul-23, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003076
PMID:40696927
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研究论文 | 通过多组学分析揭示了骨关节炎中年龄特异性的血液生物标志物及衰老驱动的B细胞重塑 | 发现了五个外周血生物标志物用于区分骨关节炎患者与对照组，并揭示了这些标志物在老年与年轻患者中的年龄特异性表达模式，以及衰老驱动的B细胞重塑在老年骨关节炎发病机制中的关键作用 | 研究样本量虽大，但未明确提及是否覆盖不同种族或地理区域的多样性 | 探索骨关节炎的非侵入性诊断工具及其发病机制 | 骨关节炎患者的外周血和关节组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 转录组分析、WGCNA、scRNA-seq、流式细胞术 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 217,983个关节细胞 |
| 229 | 2025-07-24 |
From Harmony to Discord: Multicellular Coordination in Tissues and Its Rewiring in Cancer
2025-Jul-23, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3155
PMID:40698653
|
研究论文 | 该研究介绍了CoVarNet，一个计算框架，用于通过单细胞和空间转录组学在35个人体组织中绘制可重复的多细胞模块（CMs） | 从细胞中心转向生态系统水平的生物学理解，提供了一个通用的框架来整合多模态数据以解析组织水平的协调 | 未解决的模块化组织生物学问题 | 研究组织功能如何通过多样细胞类型的协调互动产生，以及这些互动在疾病中如何被重构 | 35个人体组织中的多细胞模块（CMs） | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞和空间转录组学 | CoVarNet | 转录组数据 | 35个人体组织 |
| 230 | 2025-07-24 |
Precision Medicine in Surgery: Immunomodulation and Cellular Regeneration Strategies for Immunologic and Surgical Diseases
2025-Jul-23, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006849
PMID:40698837
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research paper | 本文提出了一种研究lacritin肽对β细胞增殖、胰岛存活及免疫调节影响的方法学框架 | 结合体外和体内模型，研究lacritin肽的免疫调节和细胞再生作用，为免疫和外科疾病的精准医疗提供新策略 | 研究仍处于临床前阶段，需要进一步验证lacritin肽的治疗潜力 | 探索lacritin肽在免疫调节和细胞再生中的治疗潜力，为精准医疗策略提供依据 | 胰腺胰岛、免疫细胞、糖尿病小鼠模型 | 精准医疗 | 糖尿病、克罗恩病、心力衰竭、肺纤维化、慢性肾病、神经损伤 | 质谱流式细胞术(CyTOF)、成像质谱流式细胞术(IMC)、单细胞RNA测序(scRNAseq) | NOD小鼠模型 | 体外实验数据、体内实验数据 | 未明确提及具体样本数量，但涉及体外胰岛测试和糖尿病小鼠模型 |
| 231 | 2025-07-24 |
Chlorpromazine induces hyposalivation by inhibiting muscarinic Ca2+ signaling in salivary glands
2025-Jul-23, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04438-8
PMID:40699237
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研究论文 | 本研究探讨了氯丙嗪通过抑制唾液腺中的毒蕈碱Ca2+信号传导诱导唾液分泌减少的分子机制 | 首次揭示了氯丙嗪通过抑制内质网Ca2+释放和储存操纵性Ca2+内流(SOCE)来抑制毒蕈碱受体和组胺受体触发的细胞内Ca2+增加 | 研究主要基于小鼠模型和人类唾液腺细胞的体外实验，尚未在人体内验证 | 阐明氯丙嗪抑制唾液腺分泌功能的分子机制 | 小鼠模型和人类唾液腺细胞 | 分子药理学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据和钙信号数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及小鼠模型和人类唾液腺细胞 |
| 232 | 2025-07-24 |
Pulmonary fibrosis and exosomes: pathways to treatment
2025-Jul-23, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10855-y
PMID:40699390
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化(IPF)的分子机制，重点关注外泌体在纤维化微环境中的作用及其治疗潜力 | 强调了外泌体和小细胞外囊泡(sEVs)作为纤维化微环境关键调节因子的作用，并探讨了工程化纳米颗粒-外泌体杂合体的治疗前景 | 现有动物模型在模拟慢性IPF方面存在局限性 | 探讨IPF的分子机制及外泌体在治疗中的应用潜力 | 特发性肺纤维化(IPF)及其相关分子通路 | 病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 233 | 2025-07-24 |
TNF drives aberrant BMP signaling to induce endothelial and mesenchymal dysregulation in pulmonary hypertension
2025-Jul-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174456
PMID:40569693
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤坏死因子α（TNF）如何通过异常的BMP信号传导导致肺动脉高压（PH）中内皮细胞和间充质细胞的失调 | 揭示了TNF通过内皮NF-κB激活和SMAD2/3信号传导驱动异常BMP信号级联的新机制 | 研究主要基于TNF-Tg小鼠模型，人类PH中的相关性需要进一步验证 | 阐明肺动脉高压发病机制中内皮细胞与间充质细胞间的分子互作 | 野生型和TNF-Tg小鼠的肺内皮细胞和间充质细胞 | 病理生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、配体-受体相互作用分析 | TNF转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量（WT和TNF-Tg小鼠的肺细胞） |
| 234 | 2025-07-24 |
Integrative Single-Cell Analysis Reveals Iron Overload-Induced Senescence and Metabolic Reprogramming in Ovarian Endometriosis-Associated Infertility
2025-Jul-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417528
PMID:40693455
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析探讨了铁过载对卵巢子宫内膜异位症相关不孕症中卵泡功能的影响 | 整合单细胞分析揭示了铁过载诱导的衰老和代谢重编程在卵巢子宫内膜异位症相关不孕症中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类卵巢样本，可能无法完全反映临床患者的复杂情况 | 探究铁过载在卵巢子宫内膜异位症相关不孕症中的作用机制 | 卵巢子宫内膜异位症相关不孕症患者的卵泡液和小鼠卵巢组织 | 数字病理学 | 卵巢子宫内膜异位症 | 单细胞测序、空间转录组学(Stereo-seq) | NA | 单细胞数据、空间转录组数据 | 卵巢子宫内膜异位症相关不孕症患者的卵泡液样本和铁过载小鼠卵巢组织 |
| 235 | 2025-07-24 |
The role of LAMA5 in breast cancer progression and its potential in immunotherapy
2025-Jul-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03113-x
PMID:40694271
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研究论文 | 本研究探讨了LAMA5在乳腺癌进展中的作用及其在免疫治疗中的潜在应用 | 揭示了LAMA5在乳腺癌中的表达模式及其与免疫调节和药物敏感性的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索LAMA5在乳腺癌中的生物学功能和临床意义 | 乳腺癌组织和正常组织 | 肿瘤学 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | DESeq2, Kaplan-Meier, Cox回归模型, CIBERSORT, ESTIMATE | 基因表达数据 | TCGA和GTEx数据集中的样本 |
| 236 | 2025-07-24 |
Microarray and Single-Cell RNA Sequencing Reveals G-Protein Gene Expression Signatures of Spermatogonia Stem Cell
2025-Jul-22, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10942-4
PMID:40694278
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研究论文 | 通过微阵列和单细胞RNA测序技术，研究人类精原干细胞（SSCs）中G蛋白基因的表达特征 | 揭示了G蛋白基因在人类精原干细胞中的表达特征，并提供了关于SSC发育分子机制的新见解 | 样本量较小（仅来自六个人类睾丸），可能影响结果的普遍性 | 研究人类精原干细胞的发育机制，以阐明男性生育的基础 | 人类精原干细胞（SSCs） | 生殖生物学 | NA | 微阵列分析、单细胞RNA测序、生物信息学分析、免疫荧光标记 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 六个人类睾丸的单细胞样本 |
| 237 | 2025-07-24 |
Fibroblast-derived PI16 enhances tumor immune-suppressive microenvironment via inducing Tregs differentiation
2025-Jul-22, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01090-5
PMID:40694273
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研究论文 | 本研究探讨了成纤维细胞来源的PI16在食管鳞状细胞癌（ESCC）肿瘤微环境（TME）中的作用，特别是其通过诱导调节性T细胞（Tregs）分化增强肿瘤免疫抑制微环境的机制 | 揭示了PI16+成纤维细胞通过DOCK2依赖性机制促进Tregs分化的新机制，并提出了PI16+成纤维细胞作为克服肿瘤免疫抑制的新治疗靶点 | 研究主要基于体外和动物模型，临床样本验证有限 | 探究成纤维细胞来源的PI16在ESCC肿瘤微环境中的免疫调节作用 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）的肿瘤微环境及其中成纤维细胞和T细胞 | 肿瘤免疫学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞共培养、免疫沉淀-质谱分析、多重荧光免疫组化（mfIHC） | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、组织图像数据 | 公共scRNA-seq数据集（GSE203115）及实验模型样本 |
| 238 | 2025-07-24 |
Single-cell analysis of gene regulatory networks in the mammary glands of P4HA1-knockout mice
2025-Jul-22, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011505
PMID:40694594
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研究论文 | 通过单细胞分析研究P4HA1基因敲除小鼠乳腺中基因调控网络的作用 | 采用单细胞网络推断方法结合SCENIC流程，构建了基础上皮细胞的基因调控网络，并鉴定了与癌症起始和进展相关的独特亚群 | 单细胞数据固有的挑战性可能影响结果的可靠性 | 探究P4HA1在小鼠乳腺中的作用及其与乳腺癌的关系 | P4HA1基因敲除小鼠和对照组小鼠的基础上皮细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、SCENIC流程 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两组小鼠（5Ht对照组和6Ho P4HA1敲除组） |
| 239 | 2025-07-24 |
Cholinergic waves have a modest influence on the transcriptome of retinal ganglion cells
2025-Jul-22, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0165-25.2025
PMID:40695599
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了野生型和β2KO小鼠视网膜神经节细胞（RGCs）的转录组，探讨胆碱能波对RGCs转录组的有限影响 | 揭示了胆碱能信号在视网膜中的转录组影响有限，且以类型特异性方式微妙调节分子程序 | 未深入探讨转录后机制在自发活动依赖性分子变化中的作用 | 探讨胆碱能波对视网膜神经节细胞转录组的影响 | 野生型和β2KO小鼠的视网膜神经节细胞（RGCs） | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 野生型和β2KO小鼠的RGCs（具体数量未明确说明） |
| 240 | 2025-07-24 |
Targeting Treg-fibroblast interaction to enhance immunotherapy in steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2025-Jul-22, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335084
PMID:40695620
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪性肝病相关肝细胞癌（SLD-HCC）中免疫微环境及其相互作用，揭示了TNFSF14-TNFRSF14信号通路在免疫治疗抵抗中的关键作用 | 首次揭示了TNFSF14-TNFRSF14介导的Treg-CAF相互作用是SLD-HCC免疫治疗抵抗的关键驱动因素，并提出了针对该信号轴的治疗策略 | 样本量相对有限（22例SLD-HCC和31例非SLD-HCC），且主要在实验模型中进行验证 | 研究SLD-HCC中免疫微环境的特征及其对免疫治疗抵抗的影响 | 脂肪性肝病相关肝细胞癌（SLD-HCC）患者的肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组学、飞行时间质谱流式细胞术（CyTOF）、空间转录组学、多重免疫组织化学 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、空间分布数据 | 22例SLD-HCC和31例非SLD-HCC病例，103例患者的独立队列验证 |