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当前共找到 40374 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2026-06-11 |
Spatial and cellular composition of lung fibrosis induced by multi-walled carbon nanotubes
2026-Mar-04, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04135-5
PMID:41782027
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研究论文 | 本文通过整合空间转录组学、mRNA测序、代谢组学、微生物组分析和体外验证，研究了多壁碳纳米管暴露如何影响小鼠肺免疫反应和肠道稳态 | 首次通过多组学方法揭示Slamf7-Slamf7相互作用在巨噬细胞过度活化中的关键作用，并提供了肺-肠轴的现代生物医学证据 | NA | 探究吸入多壁碳纳米管引起的肺部免疫机制及其对肠道的影响 | 多壁碳纳米管暴露的小鼠模型 | 计算机视觉 | 肺癌 | 空间转录组学, mRNA测序, 代谢组学, 微生物组分析, 体外验证 | NA | 图像, 文本, 视频 | NA | NA | 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2026-06-11 |
Multi-omics analysis of NEDD1 in hepatocellular carcinoma: biological function, prognostic value, and clinical significance
2026-Mar-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42505-z
PMID:41775913
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研究论文 | 通过多组学分析揭示NEDD1在肝细胞癌中的生物学功能、预后价值和临床意义 | 首次利用单细胞及空间转录组学数据揭示NEDD1-MZT2B功能模块在肿瘤细胞及免疫抑制性巨噬细胞中的细胞环境依赖性异质性 | 多组学分析主要基于公共数据库，临床样本量有限，且NEDD1-MZT2B模块的功能机制仍需进一步验证 | 探索NEDD1在肝细胞癌中的致癌作用、调控机制及肿瘤微环境相互作用 | 肝细胞癌患者组织样本、HCC细胞系及皮下移植瘤模型 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 表达数据, 表观遗传学数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | TCGA、GEO公共数据集及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞数据集GSE140228, 空间转录组数据集HRA000437 |
| 223 | 2026-06-11 |
iAODE for benchmarking and continuum modeling of single-cell chromatin accessibility
2026-Mar-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09768-8
PMID:41775921
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研究论文 | 提出iAODE模型，用于单细胞染色质可及性数据的基准测试和连续建模 | 创新性地结合变分自编码器、零膨胀负二项似然、隐式神经ODE、低权重KL正则化和可解释重构瓶颈，生成时间连续的低维潜空间，并建立包含248个scATAC-seq和123个scRNA-seq数据集的大规模基准及20项评估指标 | 未明确说明 | 开发能更好捕捉单细胞表观遗传连续轨迹的降维和轨迹分析方法 | 单细胞染色质可及性数据（scATAC-seq）和单细胞RNA测序数据（scRNA-seq） | 机器学习 | 未涉及 | scATAC-seq, scRNA-seq | 变分自编码器 (VAE), 神经ODE, 零膨胀负二项模型 | 单细胞测序数据 | 248个scATAC-seq数据集和123个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2026-06-11 |
HIV-seq reveals gene expression differences between HIV-transcribing cells from viremic and suppressed people with HIV
2026-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68797-3
PMID:41776157
|
研究论文 | 通过HIV-seq方法，揭示病毒血症和ART抑制状态下HIV感染者中转录HIV基因的细胞的基因表达差异 | 开发了一种名为HIV-seq的新方法，通过在单细胞RNA-seq中引入针对HIV保守区域的捕获序列，显著提高了对低丰度HIV转录本的检测效率 | 未在摘要中明确说明局限性 | 研究ART抑制期间HIV转录细胞的持久性机制及其基因表达特征 | HIV感染者中的HIV转录细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | HIV-seq方法自定义捕获序列 |
| 225 | 2026-06-11 |
Pharmacological stabilization of hypoxia-inducible factor 1-α dampens the interferon response and promotes glycolysis in Aicardi-Goutières syndrome
2026-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69979-9
PMID:41776196
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和靶向代谢组学分析Aicardi-Goutières综合征患者外周血样本，发现HIF-1α表达和活性缺失与代谢转换相关，药物稳定HIF-1α可逆转代谢转换并减轻干扰素反应 | 首次发现Aicardi-Goutières综合征中HIF-1α表达缺失与能量代谢转换的关联，并证明药物稳定HIF-1α可逆转代谢异常并减轻炎症反应 | 未提及明确的局限性，但可能包括样本量较小和体外模型的适用范围 | 研究Aicardi-Goutières综合征中能量代谢转换对慢性炎症的作用及潜在治疗靶点 | 携带ADAR1、RNASEH2B或SAMHD1致病变异的Aicardi-Goutières综合征患者的外周血样本 | 机器学习 | Aicardi-Goutières综合征 | 单细胞转录组学、靶向代谢组学 | 机器学习、差异基因表达分析 | 文本 | Aicardi-Goutières综合征患者的外周血样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2026-06-11 |
IFN signaling is associated with radiotherapy response in malignant peripheral nerve sheath tumors
2026-Mar-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195652
PMID:41766654
|
研究论文 | 结合大量和单细胞转录组学、全基因组CRISPR干扰筛选及多平台分子分析，探究恶性周围神经鞘瘤放疗反应中的IFN信号传导机制 | 首次揭示I型IFN信号传导在MPNST放疗反应中起功能性介导作用，并证明宿主T细胞和完整肿瘤IFN受体信号对放疗疗效至关重要 | 未提及具体限制 | 解析恶性周围神经鞘瘤放疗反应异质性的生物学机制 | MPNST细胞、小鼠同种异体移植模型及患者样本 | 数字病理学 | 恶性周围神经鞘瘤 | RNA-seq, CRISPR干扰筛选, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未提及具体样本量 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 227 | 2026-06-11 |
Epitope-spanning antigenic variation reprograms immunodominance and broadens immunity in sequential influenza vaccination
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70202-y
PMID:41771913
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研究论文 | 本研究显示在连续流感疫苗接种中，通过针对血凝素头部多个表位进行靶向变异，可以重新编程表位层级，将回忆反应转向保守的亚显性表位，从而扩大免疫宽度并增强交叉保护 | 首次提出通过表位跨越性抗原变异重塑免疫显性层级，将免疫回忆从显性表位转向保守的亚显性表位，从而克服免疫印记对流感疫苗广谱保护的限制 | 研究基于雪貂模型，需进一步在人类临床试验中验证该策略的有效性和安全性 | 探索通过靶向抗原变异重塑表位层级，以克服免疫印记限制并提高流感疫苗的交叉保护能力 | 雪貂模型，用于模拟人类免疫印记样回忆反应的A(H3N2)流感病毒连续疫苗接种 | 计算机视觉 | NA | 单细胞转录组学、ELISpot检测、表位作图、结构分析 | NA | 转录组数据、ELISpot数据 | 雪貂模型中的多个实验组，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组分析用于扩增的生发中心B细胞和Th1反应检测 |
| 228 | 2026-06-11 |
M[Formula: see text]DGAT: Multi-view multi-scale dynamic graph attention network(GAT) based prediction of Parkinson's disease(PD) progression using whole-blood RNA sequencing data
2026-Mar-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40636-x
PMID:41771960
|
研究论文 | 提出一种多视图多尺度动态图注意力网络，基于全血RNA测序数据预测帕金森病进展 | 首次结合多视图、多尺度与动态图注意力网络，并通过计数草图双线性融合策略整合时间和空间视图 | 尚未说明在更大人群或不同疾病中的泛化能力 | 预测神经退行性疾病的疾病进展轨迹 | 帕金森病患者的全血RNA测序数据 | 机器学习和数字病理学 | 帕金森病 | RNA测序 | 动态图注意力网络（DGAT） | 转录组数据（RNA测序数据） | 使用PPMI和PDBP两个队列的数据 | NA | 批量RNA测序 | NA | NA |
| 229 | 2026-06-11 |
Microglial CR3-mediated synaptic pruning in the dmPFC promotes the generation and maintenance of chronic muscle pain via glutamatergic dysfunction
2026-Mar, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01666-7
PMID:41765955
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研究论文 | 该论文通过多种技术手段揭示了慢性肌肉痛大鼠背内侧前额叶皮质中小胶质细胞CR3介导的突触修剪通过谷氨酸能功能障碍促进疼痛的产生和维持 | 首次阐明小胶质细胞CR3依赖的突触修剪抑制谷氨酸能神经元兴奋性和突触可塑性在慢性肌肉痛产生和维持中的关键作用，揭示了小胶质细胞-神经元相互作用新机制 | 研究主要基于大鼠模型，结果向人类转化可能需要进一步验证 | 探究慢性肌肉痛产生和维持的复杂机制 | 慢性肌肉痛大鼠模型 | 神经科学 | 慢性肌肉痛 | 纤维光度法、膜片钳、场电位记录、光遗传化学遗传激活、单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 电生理数据、基因表达数据、荧光成像数据 | 慢性肌肉痛大鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 230 | 2026-06-11 |
Decoding the Mechanisms of Hepatocellular Carcinoma Cancer Stem Cells and Identifying Potential Therapeutic Strategies Based on Single-cell Omics
2026 Mar-Apr, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20577
PMID:41771574
|
研究论文 | 基于单细胞组学解码肝细胞癌癌症干细胞机制并识别潜在治疗策略 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据系统表征肝细胞癌中癌症干细胞的细胞和空间异质性，构建预后模型并预测靶向癌症干细胞的候选药物 | 未提及具体局限性 | 系统表征肝细胞癌相关癌症干细胞，识别预后生物标志物和潜在治疗策略 | 肝细胞癌癌症干细胞及其微环境 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | HCCDB v2.0数据库中的肝细胞癌样本，以及GSE76427和GSE14520生存数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 231 | 2026-06-11 |
Early-activated extracellular matrix proteins shape the metabolic and spatial dynamics of the kidney fibrotic microenvironment
2026-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-026-01458-3
PMID:41776110
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研究论文 | 揭示早期激活的细胞外基质蛋白ECM1通过整合素α2β1-RhoC-YAP信号轴调控肾脏纤维化微环境的代谢和空间动态 | 首次发现ECM1作为早期肾脏重塑调控因子，通过机械-代谢通路（ECM-线粒体串扰）选择性调控成纤维细胞活化而不影响其氧化磷酸化，为抗纤维化治疗提供新靶点 | 未在人类样本验证ECM1的早期调控作用；AAV9介导的敲低策略在临床转化中可能面临递送效率问题；机制研究主要在动物模型中进行 | 阐明早期激活的细胞外基质蛋白在肾脏纤维化微环境中的代谢和空间动态调控作用 | ECM1基因敲除小鼠、慢性肾病模型、肾脏纤维化组织 | 数字病理学 | 肾脏纤维化 | 空间转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 全球ECM1敲除小鼠（数量未明确）及慢性肾病小鼠模型（数量未明确） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于肾脏组织空间基因表达分析 |
| 232 | 2026-06-11 |
Machine Learning Reveals the Association Between Gene Expression and Immune Infiltration in Colorectal Cancer: A Comprehensive Study From Single-Cell to Survival Analysis
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71049
PMID:41772406
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研究论文 | 利用机器学习分析单细胞RNA测序数据，揭示结直肠癌中基因表达与免疫浸润的关联，并识别新型分子亚型和生物标志物 | 首次将机器学习应用于单细胞RNA测序分析，以解析结直肠癌中基因表达谱与免疫细胞浸润之间的复杂相互作用，并识别出两个具有不同预后效果的新型分子亚型以及CD19、MAP2、CALB2和TGFB2作为关键免疫调节生物标志物 | 未提及 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中基因表达与免疫细胞浸润的分子机制，并开发预测性模型以指导临床治疗决策 | 结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、CIBERSORT、ESTIMATE、UMAP、t-SNE | 机器学习模型（含无监督聚类、生存分析、基因集富集分析） | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2026-06-11 |
Immune Microenvironment Dynamics and Therapeutic Targets in GIST Revealed by Multi-Omics and Functional Validation
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71069
PMID:41772383
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研究论文 | 通过多组学分析和功能验证，揭示胃肠道间质瘤免疫微环境动态变化及潜在治疗靶点 | 首次结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和功能实验，系统鉴定出MYBL1和AIF1L作为调节CD8 T细胞功能和PD-1应答的关键介质 | 未提及具体局限性信息 | 阐明胃肠道间质瘤免疫微环境的因果机制及识别治疗靶点 | 胃肠道间质瘤患者肿瘤组织、细胞系（GIST-882）及CD8 T细胞 | 机器学习 | 胃肠道间质瘤 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、批量RNA测序、细胞共培养模型、功能实验（增殖、迁移、侵袭和蛋白摄取追踪） | NA | 基因表达数据、免疫细胞表型数据、血浆代谢物数据 | 731种免疫细胞表型（孟德尔随机化分析）及多个肿瘤样本（scRNA-seq和bulk RNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 234 | 2026-06-11 |
Ventricular assist device unloading reverses microvascular senescence in single ventricle disease
2026-Mar, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-026-00790-x
PMID:41781666
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学，研究了左心发育不全综合征患者右心室微环境中的微血管衰老及其在心室辅助装置卸载后的逆转 | 首次揭示HLHS心肌细胞内在衰老特性，并发现微血管衰老生态位与成人心肌梗死相似但不同于儿童扩张型心肌病，VAD卸载可改善该衰老生态位 | NA | 阐明HLHS右心室微环境的细胞衰老机制及VAD卸载的逆转作用 | HLHS患者右心室组织及诱导多能干细胞来源的心肌细胞 | 数字病理学 | 左心发育不全综合征 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 出生时（心力衰竭前）、术后伴心力衰竭及VAD卸载后的HLHS患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 235 | 2026-06-11 |
Dendritic Cell-Associated MARCKSL1 Regulates Fibroblast Differentiation During Wound Healing
2026 Mar-Apr, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70143
PMID:41782175
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠疤痕组织，发现树突状细胞中的MARCKSL1调节成纤维细胞分化，影响伤口愈合中的疤痕形成 | 首次揭示树突状细胞中的MARCKSL1基因在伤口愈合过程中调控成纤维细胞分化及其在疤痕形成中的关键作用 | 主要基于小鼠模型，人类伤口愈合中的机制有待验证；MARCKSL1抑制剂的安全性和长期效果尚未明确 | 阐明树突状细胞相关MARCKSL1在伤口愈合中调控成纤维细胞分化的机制，探索疤痕预防的新治疗途径 | 成年小鼠疤痕组织 和 小鼠胎儿伤口愈合模型中的树突状细胞和成纤维细胞 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），shRNA转导 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠疤痕组织（具体数目未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2026-06-11 |
The Immune Cell Atlas of "Longevity Molecular Tag": Identification of Principal Immune Cell Subsets and Their Underlying Molecular Regulatory Mechanisms
2026-Mar, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70431
PMID:41784043
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据，识别与长寿表型相关的免疫细胞亚群，并揭示其分子调控机制 | 整合全生命周期单细胞数据与超长寿人群转录组数据，利用Scissor算法构建“长寿分子标签”免疫细胞图谱，发现NK细胞、CD8 T细胞和γδ T细胞等细胞毒性免疫细胞与长寿正相关，而CD4 T细胞、B细胞和树突状细胞与炎症信号通路相关 | NA | 揭示长寿人群中免疫细胞亚群及其分子调控机制，探索免疫衰老调节策略 | 东亚人群全生命周期的单细胞RNA测序数据和广西百岁老人队列的批量转录组数据 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | Scissor算法 | 基因表达数据 | 东亚人群全生命周期样本及广西百岁老人队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2026-06-11 |
scSCCNIA: similarity matrix based contrastive clustering with neighbor information aggregation for single-cell RNA sequencing data
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag094
PMID:41785051
|
研究论文 | 提出一种基于相似性矩阵对比聚类与邻居信息聚合的框架scSCCNIA，用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | 采用拉普拉斯滤波器进行邻居信息聚合，通过特殊非共享参数孪生编码器构建不同图视图进行数据增强，并利用基于相似性矩阵的对比学习学习潜在低维嵌入表示 | 未明确提及局限性 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性，并促进下游分析 | 来自不同平台和不同细胞数量的多个单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 孪生网络 | 基因表达数据 | 多个数据集，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 238 | 2026-06-11 |
Assessment of dispersion metrics for estimating single-cell transcriptional variability
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014030
PMID:41770747
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研究论文 | 系统性比较统计指标在估计单细胞转录变异中的效果，并应用方差均值比（Fano因子）测量单细胞数据集中的转录变异性 | 通过模拟单细胞数据系统比较多种常用统计指标对噪声的响应性，并发现Fano因子是测量转录变异性的合适指标，能揭示平均表达以外的生物学信息 | 研究主要基于模拟数据和特定平台的数据集，结论的普适性有待进一步验证 | 评估不同统计指标在估计单细胞转录变异性中的有效性，并应用最合适的指标分析生物学相关信息 | 单细胞RNA测序数据中的转录变异性 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 使用多个单细胞数据集，代表不同复杂系统和跨平台测量，具体样本数未明确 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 使用10x Chromium进行单细胞捕获，Illumina NovaSeq进行测序，具体细节未提供 |
| 239 | 2026-06-11 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-Feb-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，开发了正弦细胞特异性生物标志物评分，用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 首次从单细胞层面识别肝窦内皮细胞毛细血管化、肝星状细胞活化和巨噬细胞极化的细胞类型特异性特征，并将其整合为三个正弦评分（内皮、间充质和巨噬细胞），用于慢性肝病进展和逆转的生物学通路监测 | 回顾性研究设计，需进行前瞻性验证后才能推广至临床试验实施 | 开发正弦细胞特异性生物标志物评分，用于慢性肝病的诊断和预后预测 | 慢性肝病患者 | machine learning | chronic liver disease | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因表达定量分析 | 逻辑回归（AUROC评分） | 基因表达数据（来自肝活检样本） | 内部队列108例，验证队列1008例（含两年随访数据） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 240 | 2026-06-11 |
scDock: streamlining drug discovery targeting cell-cell communication via scRNA-seq analysis and molecular docking
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag103
PMID:41769845
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研究论文 | 提出scDock管线，整合单细胞RNA测序分析与分子对接，实现靶向细胞间通讯的药物发现 | 首次将单细胞RNA测序数据处理、细胞间通讯推断和基于分子对接的药物发现整合为无需编程技能的一站式管线 | NA | 开发一个用户友好的端到端管线，用于从单细胞数据中发现靶向细胞间通讯的治疗化合物 | 疾病相关的配体-受体相互作用及潜在治疗化合物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(RNA-seq)、分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |