单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31060 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-09-14 |
CXCL6 Is a Novel Biliary Marker and a Downstream Target of MMP7 in Biliary Atresia
2025-Sep, Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/hepr.14217
PMID:40515742
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术发现CXCL6是MMP7的下游靶点，并证实其作为胆道闭锁新型胆汁标志物的潜力 | 首次发现CXCL6是MMP7在胆道闭锁中的下游靶点，并揭示其在肝纤维化中的潜在病理作用 | 机制研究主要基于体外实验，需进一步体内验证 | 探究MMP7在胆道闭锁发病机制中的下游信号通路 | 胆道上皮细胞及胆道闭锁患者肝组织和血清样本 | 分子病理学 | 胆道闭锁 | scRNA-seq, QRT-PCR, 免疫组化, western blot, ELISA, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 胆道闭锁患者、非胆道闭锁胆汁淤积患者及正常对照的肝组织和血清样本 |
| 222 | 2025-09-14 |
Heterogeneity in Osteosarcoma Revealed by scRNA Sequencing: CLU+ Endothelial Cells as Key Players in Tumor Progression
2025-Sep, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70138
PMID:40623412
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤的空间异质性，发现CLU+内皮细胞在肿瘤进展中的关键作用 | 首次在骨肉瘤中通过空间区域（中心区与周边区）配对样本的单细胞分析揭示CLU+内皮细胞通过ITGB1和Nectin2-TIGIT通路促进转移并诱导T细胞耗竭 | 样本量较小（仅6例患者），需更大队列验证 | 探究骨肉瘤瘤内异质性及其在肿瘤进展中的作用机制 | 骨肉瘤患者的配对肿瘤组织样本（中心区与周边区） | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞转录组数据 | 6例骨肉瘤患者的配对肿瘤样本 |
| 223 | 2025-09-14 |
Investigating cytotoxic and inflammatory human IL-7 receptor low effector memory CD8+ T cells in lupus
2025-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105898
PMID:40857939
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研究论文 | 本研究通过分析狼疮患者中IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞的异质性，探讨其在炎症和组织损伤中的作用 | 发现IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞亚群在狼疮外周血和肾脏中积累，并证实其通过TNF-α和IFN-γ诱导中性粒细胞胞外诱捕网形成 | NA | 探究CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的临床和生物学意义 | 狼疮患者的外周血和肾脏组织样本 | 免疫学 | 狼疮 | scRNA-seq, RNA-seq, 微阵列, Imaging Mass Cytometry (IMC) | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | 来自狼疮患者和正常肾脏组织的样本（具体数量未明确说明） |
| 224 | 2025-09-14 |
From Pathophysiology to Innovative Therapies in Eye Diseases: A Brief Overview
2025-Sep-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178496
PMID:40943417
|
综述 | 本文综述了眼科疾病从病理生理学到创新疗法的进展，重点介绍了分子影像和精准治疗技术 | 整合了高分辨率成像技术、人工智能辅助分析及基因治疗、干细胞疗法等前沿治疗策略 | 这些技术尚未在常规临床实践中广泛应用，需进一步验证、监管批准和长期安全性评估 | 探讨分子影像和精准治疗在眼科疾病中的应用与挑战 | 年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、青光眼和葡萄膜炎等致盲性眼病 | 数字病理学 | 眼科疾病 | OCT, OCT血管成像, MALDI-MSI, 空间转录组学, 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | 机器学习 | 影像 | NA |
| 225 | 2025-09-14 |
Hematopoietic EphA4 Deficiency Alters Microglial Heterogeneity and Improves Chronic Spatial Memory After Brain Injury
2025-Aug-29, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7265717/v1
PMID:40909780
|
研究论文 | 本研究探讨造血细胞中EphA4缺失如何通过调节小胶质细胞异质性改善脑损伤后的长期空间记忆功能 | 首次揭示外周免疫来源的EphA4信号通过调节小胶质细胞动态影响神经免疫重塑和功能恢复的新机制 | 研究局限于小鼠模型，尚未在人类中验证；长期效应机制需进一步探索 | 探究EphA4在调节脑损伤后小胶质细胞反应和功能恢复中的作用 | 造血特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠模型 | 神经免疫学 | 脑损伤 | 单细胞RNA测序，骨髓嵌合模型，控制性皮质撞击(CCI) | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据，行为学数据，形态学数据 | 使用造血特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠进行实验 |
| 226 | 2025-09-14 |
Liposomal Doxorubicin, but Not Platinum-Taxane, Supports MHC-II Expression and Immune Maturation in the Ovarian Tumor Microenvironment
2025-Aug-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172827
PMID:40940927
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和流式细胞术，评估了不同化疗方案对卵巢癌小鼠模型肿瘤生长和肿瘤微环境免疫细胞群的影响 | 发现聚乙二醇化脂质体多柔比星（PLD）能选择性上调肿瘤细胞MHC II类分子表达并促进免疫成熟，而铂类-紫杉烷方案无此效应 | 研究基于小鼠模型和有限体外实验，临床转化价值需进一步验证 | 评估化疗与免疫系统的相互作用，特别是不同化疗方案对卵巢癌免疫微环境的影响 | 卵巢癌小鼠模型、卵巢癌细胞系和患者肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序、流式细胞术 | NA | 转录组数据、流式细胞数据 | 小鼠模型、多个卵巢癌细胞系和患者肿瘤样本 |
| 227 | 2025-09-14 |
Neuromodulatory Signaling in Chronic Pain Patients: A Narrative Review
2025-Aug-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14171320
PMID:40940732
|
综述 | 本文综述了神经调节信号在慢性疼痛病理机制中的作用及潜在治疗靶点 | 整合转录组分析、功能神经影像和单细胞RNA测序等新技术揭示患者特异性神经调节功能障碍模式 | NA | 探讨神经调节系统在慢性疼痛中的作用机制并指导精准治疗策略 | 慢性疼痛患者（如纤维肌痛症患者）的神经调节通路 | 神经科学 | 慢性疼痛 | 转录组分析、功能神经影像、单细胞RNA测序 | NA | 临床观察数据与临床前研究数据 | NA |
| 228 | 2025-09-14 |
Artificial Intelligence in Ocular Transcriptomics: Applications of Unsupervised and Supervised Learning
2025-Aug-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14171315
PMID:40940727
|
综述 | 本文综述了2019至2025年间人工智能在眼科转录组学中的应用，重点探讨无监督与监督学习方法在生物标志物发现、细胞类型分类及眼病模型构建中的进展 | 系统整合了AI在眼科转录组学中的最新应用，涵盖从传统机器学习到深度学习框架的多模态整合方法 | 模型可解释性与标准化存在挑战 | 推动精准眼科医学发展 | 眼组织转录组数据（包括视网膜、角膜等） | 自然语言处理 | 眼科疾病（如黄斑变性、糖尿病视网膜病变、青光眼等） | 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | PCA, t-SNE, UMAP, WGCNA, LASSO, SVM, RF, 变分自编码器, 神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 229 | 2025-09-14 |
Current Role and Future Frontiers of Spatial Transcriptomics in Genitourinary Cancers
2025-Aug-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172774
PMID:40940870
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2025-09-14 |
A fibroblast-centric network drives cold fibrosis in the tumor microenvironment of lung squamous cell carcinoma
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.25.668405
PMID:40909739
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了肺鳞状细胞癌肿瘤微环境中由癌症相关成纤维细胞驱动的冷纤维化结构及其与免疫细胞的相互作用 | 首次将非癌性纤维化中的热/冷纤维化概念应用于癌症研究，发现LUSC中存在独特的冷纤维化结构并由CAF自分泌生长因子环路维持 | 样本量较小（16例患者），且仅限于初治患者 | 探究慢性炎症相关癌症中纤维化基质的组织原则及治疗脆弱性 | 肺鳞状细胞癌患者肿瘤及癌旁正常组织 | 肿瘤微环境研究 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 16例初治肺鳞状细胞癌患者的匹配肿瘤和癌旁组织 |
| 231 | 2025-09-14 |
CCL26 and CXCL12 Promote Release of Insulin-Sensitizing Adipose Tissue Macrophage sEVs from Subcutaneous Adipose Tissue in Obesity
2025-Aug-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.670151
PMID:40894782
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研究论文 | 研究发现皮下脂肪组织中的巨噬细胞通过释放小细胞外囊泡改善胰岛素敏感性，并揭示了CCL26和CXCL12在此过程中的调控机制 | 首次发现皮下脂肪组织巨噬细胞来源的sEVs具有改善胰岛素敏感性的功能，并阐明CCL26和CXCL12调控巨噬细胞亚群分布的机制 | NA | 探究肥胖状态下皮下脂肪组织对抗代谢功能障碍的保护性机制 | 皮下脂肪组织巨噬细胞(sATMs)及其分泌的小细胞外囊泡(sEVs) | 代谢疾病研究 | 代谢功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 细胞生长和迁移测量 | NA | 基因表达数据, 细胞测量数据 | NA |
| 232 | 2025-09-14 |
Genomic Insights into Tumorigenesis in Newly Diagnosed Multiple Myeloma
2025-Aug-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics15172130
PMID:40941618
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤（MM）及其癌前阶段的遗传突变，揭示疾病进展的分子机制 | 发现新诊断MM患者中的新基因，并识别出在癌变中起关键作用的特定基因和基因家族 | NA | 检测导致多发性骨髓瘤进展和肿瘤发生的遗传突变 | MGUS、SMM及新诊断MM患者的样本 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq | NA | 基因组序列数据 | NA |
| 233 | 2025-09-14 |
Dynamic Intercellular Networks in the CNS: Mechanisms of Crosstalk from Homeostasis to Neurodegeneration
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178155
PMID:40943076
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综述 | 本文综述了中枢神经系统中动态细胞间通讯网络在健康稳态、衰老、脱髓鞘疾病和阿尔茨海默病等状态下的作用机制 | 通过比较不同疾病背景下的细胞间信号机制，强调了中枢神经对话不仅作为疾病进展的标志，还作为精准治疗的潜在途径 | NA | 探讨细胞间通讯网络如何维持或破坏中枢神经系统的完整性和功能 | 神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞和其他胶质细胞群体 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 234 | 2025-09-14 |
Deciphering the combinatorial expression pattern and genetic regulatory mechanisms of Beats and Sides in the olfactory circuits of Drosophila
2025-Aug-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.31.657193
PMID:40502011
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转基因驱动线探索果蝇嗅觉电路中Beat和Side基因家族的组合表达模式及其遗传调控机制 | 揭示了ORNs和PNs中类别特异性基因组合表达模式，并发现昆虫间直系同源基因的保守表达规律 | 干扰Beat-IIa-Side-IV相互作用未在测试的两个肾小球中产生显著错误靶向，功能验证有限 | 解析果蝇嗅觉电路中细胞表面蛋白家族的组合表达模式及其在神经环路组装中的作用 | 果蝇的嗅觉受体神经元(ORNs)和投射神经元(PNs) | 神经科学 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因陷阱转基因驱动线 | NA | 基因表达数据 | 公开可用数据集和新生成的转基因品系 |
| 235 | 2025-09-14 |
Immunomodulatory effects of a short-term gluten-free diet on pediatric celiac disease: Findings from a single-cell transcriptomics study
2025-Aug-11, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2025.110063
PMID:40803542
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨短期无麸质饮食对儿童乳糜泻患者免疫细胞的调节作用 | 首次使用scRNA-seq技术分析短期GFD对儿童乳糜泻患者PBMCs的转录组变化，并发现免疫调节基因上调和促炎基因下调等新现象 | 样本量较小（仅5名患者），结果需谨慎解读，需要更大队列研究进一步验证 | 研究无麸质饮食对儿童乳糜泻患者免疫细胞转录调控的影响 | 儿童乳糜泻患者 | 单细胞转录组学 | 乳糜泻 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 转录组数据 | 5名儿童乳糜泻患者（GFD前后配对样本） |
| 236 | 2025-09-14 |
Plasma Proteomics Reveals Dysregulated Pathways Across the Spectrum LMNA Cardiomyopathy
2025-Aug, Circulation. Genomic and precision medicine
DOI:10.1161/CIRCGEN.124.004924
PMID:40509996
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研究论文 | 通过血浆蛋白质组学分析揭示LMNA心肌病发展过程中的失调通路 | 首次在LMNA心肌病中鉴定出EDA2R、MYL4等新型血浆蛋白标志物，并发现26种蛋白与心肌细胞基因表达谱一致 | 样本量有限（LMNA组n=41），需更大队列验证 | 探究LMNA基因致病变异相关的蛋白质和生物学通路 | 遗传性扩张型心肌病队列（含LMNA和肌节蛋白变异携带者）及表型阴性个体 | 蛋白质组学 | 心血管疾病 | OLINK平台蛋白质检测、单细胞测序 | 主成分分析（PCA） | 血浆蛋白质数据、RNA表达数据 | 114例（41例LMNA DCM，18例肌节蛋白DCM，55例表型阴性个体） |
| 237 | 2025-09-14 |
Autophagy-related biomarkers in non-obstructive azoospermia: insights from transcriptomics and single-cell sequencing
2025-Aug, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03559-6
PMID:40587077
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞测序技术筛选出自噬相关基因作为非梗阻性无精子症（NOA）的生物标志物 | 首次结合机器学习算法和单细胞测序技术系统鉴定NOA中自噬相关基因标志物，并揭示其与免疫细胞浸润的关联 | 研究主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 | 探索自噬相关基因在非梗阻性无精子症中的诊断价值和治疗潜力 | 非梗阻性无精子症患者与梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 | 生物信息学 | 男性不育症 | 转录组测序，单细胞测序，RT-qPCR，WGCNA，机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个公共数据集（GSE9210和GSE145467等）的转录组样本 |
| 238 | 2025-09-14 |
Comparative spatial transcriptomics of pancreatic cancer with ductal and acinar origins in mouse models
2025-Aug, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70416
PMID:40717219
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2025-09-14 |
Barcoded monoclonal embryoids are a potential solution to confounding bottlenecks in mosaic organoid screens
2025-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655669
PMID:40475436
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研究论文 | 开发了一种基于单克隆胚胎体和遗传条形码的技术方案，以解决嵌合类器官筛选中的统计瓶颈问题 | 提出单克隆胚胎体结合遗传条形码的方法，有效克服了传统嵌合胚胎体筛选中的克隆复杂性损失和统计效力限制 | 目前仅进行了概念验证实验，尚未在大规模应用中验证其可扩展性和普适性 | 优化CRISPR筛选在胚胎体中的统计效力，准确量化转录因子扰动对细胞命运的影响 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs）和胚胎体（EBs） | 发育生物学 | NA | CRISPR筛选、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、遗传条形码 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及所有转录因子的CRISPR扰动库 |
| 240 | 2025-09-14 |
Antibiotic treatment limits survival of peripheral and bone marrow B cell populations
2025-Jul-16, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024013694
PMID:40668665
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探讨广谱抗生素治疗对骨髓和外周B细胞生存的负面影响及其机制 | 首次发现抗生素通过抑制促生存MYC信号通路导致B细胞凋亡，且该过程独立于干扰素信号 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；体外实验可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明抗生素治疗对造血系统B细胞群体的影响机制 | 小鼠骨髓造血细胞和外周B细胞群体 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，粪便微生物移植 | NA | 基因表达数据，细胞计数数据 | NA |