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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-11-09 |
Interplay of Molecular Subtypes Associated with Butyrate Metabolism Elucidates Clinical Characteristics and Tumor Microenvironment in Prostate Cancer
2025-Nov-08, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05476-x
PMID:41205043
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研究论文 | 本研究通过分析前列腺癌患者的分子亚型与丁酸盐代谢的相互作用,揭示了其与临床特征和肿瘤微环境的关联 | 首次基于丁酸盐代谢相关基因将前列腺癌分为两个分子亚型,并发现FOS-miR-27b轴在肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明丁酸盐代谢在前列腺癌发生发展中的分子机制及其临床意义 | 前列腺癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组分析,机器学习,荧光素酶报告实验,qRT-PCR,FISH | RSF+GBM集成学习模型 | 转录组数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的前列腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 222 | 2025-11-09 |
Vascular Niches Are the Primary Hotspots in Cardiac Aging
2025-Nov-07, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327060
PMID:41090219
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了血管微环境是心脏衰老过程中的主要热点区域 | 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术系统描绘了心脏衰老过程中的微环境变化,并识别出血管相关细胞生态位作为衰老的关键热点 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类心脏组织中验证 | 探究心脏组织中驱动年龄相关变化的微环境特征 | 3月龄和18月龄小鼠的心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 衰老细胞清除治疗 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 不同年龄阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 223 | 2025-11-09 |
The role of hypothyroidism in cirrhosis pathogenesis: A retrospective cohort study and multi-omics integration analysis
2025-Nov-07, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011947
PMID:41202080
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研究论文 | 本研究通过回顾性队列分析和多组学整合方法,首次揭示了甲状腺功能减退与肝硬化之间的因果关系及潜在分子机制 | 首次通过遗传学证据证实甲状腺功能减退与肝硬化的因果关系,并识别HLA-DQA1和CD27作为潜在治疗靶点 | 基于回顾性数据,需要前瞻性研究验证;分子机制需进一步实验证实 | 探究甲状腺功能减退在肝硬化发病机制中的作用 | 肝硬化患者和甲状腺功能减退患者 | 多组学整合分析 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 分子对接, 全转录组关联研究 | 加权基因共表达网络分析, 连锁不平衡评分回归 | 临床数据, 基因组数据, 转录组数据 | 来自重症监护医学信息集市数据库的纵向数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 224 | 2025-11-09 |
Smoking-Induced STC2+ Tumor Cells Drive Tumor-Vascular Crosstalk in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma via Spatial and Single-Cell Transcriptomics
2025-Nov-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511932
PMID:41203580
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示吸烟相关喉鳞状细胞癌中STC2+肿瘤细胞通过调控血管通透性促进肿瘤进展的机制 | 首次发现STC2在吸烟相关LSCC中的双峰分化特征及其通过TGFBI-ITGA5轴介导肿瘤-血管相互作用的新机制 | 研究样本量有限,机制验证主要依赖体外实验,需要更多临床样本验证 | 探索吸烟相关喉鳞状细胞癌的肿瘤微环境异质性及肿瘤-血管相互作用机制 | 吸烟相关喉鳞状细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 225 | 2025-11-09 |
Monod: model-based discovery and integration through fitting stochastic transcriptional dynamics to single-cell sequencing data
2025-Nov-07, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02832-x
PMID:41203866
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研究论文 | 提出了一种基于物理模型的方法Monod,通过拟合随机转录动力学来分析单细胞测序数据 | 利用单细胞RNA测序数据的随机性、规模和 multimodal 特性,在生物物理转录模型下整合新生和成熟RNA计数 | NA | 揭示基础调控过程并区分单细胞测序数据的生物学和技术层面 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机转录动力学模型 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 226 | 2025-11-09 |
Single cell and spatial transcriptomic profiling of the type 2 diabetic coronary microcirculation and myocardium
2025-Nov-07, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-025-01144-7
PMID:41203872
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了2型糖尿病冠状动脉微循环和心肌组织的转录组特征 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统分析了2型糖尿病冠状动脉微血管疾病的分子特征和基因表达谱 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究2型糖尿病冠状动脉微血管疾病的转录组差异和分子机制 | 2型糖尿病小鼠的冠状动脉微循环和心肌组织 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 227 | 2025-11-09 |
Single-cell transcriptomics of the myeloid milieu reveals an angiogenic niche in triple-negative breast cancer
2025-Nov-07, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01571-5
PMID:41203997
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据揭示三阴性乳腺癌中髓系细胞异质性及其在血管生成微环境形成中的作用 | 首次系统描绘TNBC髓系细胞图谱,发现VEGFA中性粒细胞和SPP1巨噬细胞亚型在缺氧区域共定位形成血管生成微环境 | NA | 阐明三阴性乳腺癌中髓系细胞微环境的组成和功能 | 三阴性乳腺癌患者的髓系细胞(中性粒细胞和单核吞噬细胞) | 单细胞转录组学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 整合内部和公共单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 228 | 2025-11-09 |
Identification of mitochondria-related hub genes and immune associations in acute myocardial infarction: A bioinformatic analysis
2025-Nov-07, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045611
PMID:41204556
|
研究论文 | 通过生物信息学分析识别急性心肌梗死中线粒体相关枢纽基因及其与免疫细胞的关联 | 首次系统识别AMI中线粒体相关枢纽基因并揭示其与免疫细胞的关联机制 | 需要严格的外部验证才能考虑临床应用 | 探索急性心肌梗死中线粒体代谢与免疫反应的相互作用 | 急性心肌梗死患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 差异表达分析、富集分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、实时定量PCR | 列线图模型、分类模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 229 | 2025-11-09 |
RGS Proteins: Potential Regulators of Mouse Melanopsin's Signaling Phototransduction Cascade Across ipRGC Subtypes
2025-Nov-07, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.11.006
PMID:41204666
|
研究论文 | 本研究探讨了RGS蛋白如何调节小鼠黑视蛋白在不同ipRGC亚型中的信号转导级联 | 首次发现ipRGC亚型选择性富集特定RGS蛋白,揭示了单个GPCR在不同细胞类型中启动不同信号转导级联的潜在机制 | 研究主要基于异源表达系统和单细胞转录组分析,需要在更多生理条件下验证 | 探索单个GPCR在不同ipRGC亚型中启动不同信号转导级联的分子机制 | 小鼠视网膜中的内在光敏视网膜神经节细胞(ipRGCs)亚型 | 分子神经生物学 | NA | 单细胞转录组学, RNAscope, 异源表达系统, DREADD技术 | NA | 转录组数据, 图像数据, 电生理数据 | 小鼠视网膜ipRGC细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 230 | 2025-11-09 |
Exploring the prognostic value of T cell exhaustion and mitochondrial dysfunction related genes in breast cancer through bioinformatics analysis and RT-qPCR validation
2025-Nov-06, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01888-5
PMID:41193924
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研究论文 | 通过生物信息学分析和RT-qPCR验证探索T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关基因在乳腺癌中的预后价值 | 首次整合T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关基因构建乳腺癌预后模型,并通过单细胞转录组分析揭示免疫微环境特征 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 识别乳腺癌中与T细胞耗竭和线粒体功能障碍相关的预后基因并构建预后模型 | 乳腺癌患者肿瘤组织和正常组织样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组分析,RT-qPCR,单细胞转录组分析 | 回归分析,Cox回归分析,风险模型 | 转录组数据,临床数据 | 未明确样本数量,基于公共数据库的肿瘤和正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 231 | 2025-11-09 |
Spatial and functional dissection of cancer-associated fibroblasts-mediated immune modulation in H. pylori-associated gastric cancer
2025-Nov-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02490-9
PMID:41194113
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA-seq分析,揭示了幽门螺杆菌相关胃癌中癌症相关成纤维细胞的空间分布和免疫调节功能 | 首次系统解析了幽门螺杆菌阳性胃癌中CAF亚型的空间分布特征及其通过WNT5-FZD相互作用和ZFP36介导的FN1 mRNA稳定性调控免疫抑制的新机制 | 研究样本量相对有限(71例GC患者),且主要基于回顾性队列分析 | 阐明癌症相关成纤维细胞在幽门螺杆菌相关胃癌中的空间组织和免疫调节功能 | 胃癌患者的肿瘤组织样本 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,LACE-seq,CIBERSORT-ABS,Kaplan-Meier分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据,临床数据 | 71例GC患者肿瘤组织,整合三个独立队列(中国、美国、新加坡)数据 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 232 | 2025-11-09 |
Endothelial circadian rhythm genes as prognostic modulators of tumor progression and immune interactions: insights from pan-cancer single-cell rna sequencing
2025-Nov-06, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003848
PMID:41202314
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研究论文 | 通过泛癌单细胞RNA测序分析内皮细胞昼夜节律基因在肿瘤进展和免疫相互作用中的预后调控作用 | 首次系统研究内皮细胞昼夜节律基因在肿瘤微环境中的失调及其临床意义,建立了基于昼夜节律相关基因的预后风险模型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探究内皮细胞昼夜节律基因在多种癌症中的失调及其临床意义 | 多种癌症类型的单细胞RNA测序数据,包括肝细胞癌和乳腺癌 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序,LASSO回归,生存分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据,临床预后数据 | 15个独立数据集,来自Tumor Immune Single-cell Hub数据库 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2025-11-09 |
Single-cell profiling unveils the immuno-favorable tumor microenvironment remodeling after successful neoadjuvant therapy for advanced gallbladder cancer
2025-Nov-06, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003883
PMID:41202319
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示晚期胆囊癌新辅助治疗后肿瘤微环境的免疫有利重塑 | 首次在晚期胆囊癌中系统揭示新辅助 chemo-immunotherapy 通过促进滤泡辅助T细胞和三级淋巴结构形成重塑肿瘤微环境的机制 | 样本量有限,仅分析了成功降期患者的肿瘤微环境 | 评估新辅助 chemo-immunotherapy 在晚期胆囊癌中的疗效并探究肿瘤微环境变化机制 | 晚期胆囊癌患者 | 单细胞分析 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像数据 | 成功降期的晚期胆囊癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 234 | 2025-11-09 |
Dissecting Heterogeneity Reveals Functional Subpopulation of Stem Cells From Human Exfoliated Deciduous Teeth
2025-Nov-06, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104014
PMID:41202532
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定人类脱落乳牙干细胞的功能亚群并分离BAMBI⁺亚群 | 首次在单细胞水平揭示SHEDs的异质性,识别出具有高增殖、软骨形成和血管生成能力的BAMBI⁺功能亚群 | NA | 鉴定人类脱落乳牙干细胞的功能亚群表面标志物,为干细胞精细化应用提供理论基础 | 人类脱落乳牙干细胞(SHEDs) | 单细胞测序分析 | 口腔组织再生 | 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 组织化学染色, 血管生成实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2025-11-09 |
Biallelic BRF2 mutations disrupt redox homeostasis as etiological factors in syndromic immunodeficiency and developmental disorders
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.006
PMID:40781771
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研究论文 | 本研究通过鉴定新型双等位BRF2基因变异,揭示了BRF2功能障碍通过破坏氧化还原稳态导致综合征性免疫缺陷和发育异常的分子机制 | 首次建立BRF2突变与氧化还原稳态失调之间的致病联系,并阐明其对GPX1和GPX4等氧化还原调控基因转录的影响 | 研究仅基于单个家系病例,样本量有限 | 探索BRF2基因突变在综合征性免疫缺陷和发育障碍中的病因学作用 | 携带双等位BRF2变异的家族病例,表现为多系统异常、恶性肿瘤和原发性免疫缺陷 | 遗传学 | 免疫缺陷疾病 | 全外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 1个家族病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 236 | 2025-11-09 |
Galectin-9 inhibition of the MIF-CD74/CD44 pathway suppresses chronic arthritis
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.016
PMID:40798883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现类风湿关节炎中MIF亚群,并证明galectin-9通过抑制MIF-CD74/CD44通路可有效抑制关节炎破坏性表型 | 首次发现MIF亚群在类风湿关节炎中的作用机制,并证实重组galectin-9作为新型抗MIF药物可通过阻断CD44抑制关节炎破坏进程 | 研究主要基于动物模型,尚未进行临床验证 | 探索治疗类风湿关节炎的新靶点和治疗策略 | 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(FLSs) | 单细胞测序 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 237 | 2025-11-09 |
Enhanced hematopoietic stem cell self-renewal and engraftment through human lung exosomal communication
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.020
PMID:40798884
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研究论文 | 本研究通过单细胞外泌体追踪分析揭示了肺细胞通过外泌体通讯调控造血干细胞自我更新和移植能力的新机制 | 首次发现肺细胞通过外泌体通讯参与造血干细胞稳态调控,突破了传统认为造血干细胞仅受骨髓微环境调控的认知 | 研究主要基于实验条件,在人体内的实际生理意义仍需进一步验证 | 探索肺细胞来源外泌体对造血干细胞功能的调控机制 | 造血干细胞,特别是长期造血干细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 外泌体miRNA分析, 蛋白质组学, 体内移植实验 | NA | 单细胞测序数据, miRNA数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 外泌体分析 | NA | NA |
| 238 | 2025-11-09 |
Precision T cell correction platform for inborn errors of immunity
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.018
PMID:40808259
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研究论文 | 开发基于CRISPR-Cas9和同源定向修复的精准T细胞基因编辑平台,用于治疗先天性免疫缺陷病 | 首次建立基于HDR的T细胞单核苷酸变异精准校正平台,实现高达80%的校正效率且未检测到基因组、转录组或蛋白质组异常 | 研究主要针对特定淋巴性先天性免疫缺陷病模型,尚未在更广泛的免疫疾病中进行验证 | 开发精准基因编辑平台用于治疗单基因先天性免疫缺陷病 | T细胞及四种先天性免疫缺陷病模型(STAT1功能获得性突变、软骨毛发发育不全、ADA2缺乏症、自身免疫性多内分泌病-念珠菌病-外胚层营养不良) | 基因编辑与细胞治疗 | 先天性免疫缺陷病 | CRISPR-Cas9基因编辑, 同源定向修复, GUIDE-seq, 单细胞RNA测序, 长读长基因组测序, 蛋白质组学分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 四种先天性免疫缺陷病模型 | NA | 单细胞RNA测序, 基因组测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 239 | 2025-11-09 |
Spatial transcriptomic landscape and cellular neighborhood heterogeneity in cervical cancer: integrative single-cell and spatial RNA sequencing analysis
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03788-2
PMID:41191175
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,构建了首个宫颈癌综合空间分子图谱 | 首次建立宫颈癌综合空间转录组图谱,识别38个具有独特分子特征的细胞邻域,揭示肿瘤微环境的空间组织模式 | NA | 构建宫颈癌空间转录组图谱,解析肿瘤微环境的空间组织和细胞间关系 | 宫颈癌组织样本和HeLa、SiHa细胞系 | 空间转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 定量PCR | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | 公共GEO数据库数据集和实验验证细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 240 | 2025-11-09 |
Exploration of prognosis and immune infiltration characteristics in glioblastoma multiforme based on lipid metabolism related genes
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03865-6
PMID:41191203
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研究论文 | 本研究基于脂代谢相关基因探索多形性胶质母细胞瘤的预后和免疫浸润特征 | 首次基于脂代谢相关基因将GBM患者分为两个预后不同的亚群,并鉴定出四个新的预后相关枢纽基因 | 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 识别GBM中与脂代谢相关的预后生物标志物和治疗靶点 | 多形性胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 多形性胶质母细胞瘤 | 转录组分析,单细胞测序,生物信息学算法 | LASSO-Cox回归分析 | 转录组数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |