单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 221 - 240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2026-06-10
Decoding the Cardiac Immune Microenvironment and Fibroblast Crosstalk in Radiotherapy Combined with Immunotherapy-Induced Cardiac Fibrosis Based on Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 基于单细胞转录组分析解码放疗联合免疫治疗诱导心脏纤维化中的心脏免疫微环境和成纤维细胞交互作用 首次通过单细胞转录组分析揭示放疗联合免疫治疗(放射免疫治疗)诱导心脏纤维化中成纤维细胞与免疫细胞(特别是IL-6介导的成纤维细胞-巨噬细胞交互作用)的关键机制,并发现托珠单抗(IL-6R抑制剂)具有缓解心脏毒性的治疗潜力 未提及具体局限性,但可能包括临床样本量有限、动物模型与人类病理差异、长期心脏毒性评估不足等 阐明放射免疫治疗诱导心脏纤维化的潜在机制,特别是心脏微环境中成纤维细胞与免疫细胞的交互作用,并探索靶向干预策略 放射免疫治疗诱导心脏纤维化的小鼠模型和接受胸部分次放疗联合免疫治疗的患者 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 临床前小鼠模型(多个时间点:第28天、3个月、5个月)和患者血清样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
222 2026-06-10
Stabilin-1+ lipid-associated macrophages promote lung adenocarcinoma liver metastasis and osimertinib resistance through impairing macrophage phagocytosis via SIRPα-CD47 axis
2026-May, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 研究揭示STAB1+脂质相关巨噬细胞通过SIRPα-CD47轴损害巨噬细胞吞噬功能,促进肺腺癌肝转移和奥希替尼耐药 首次鉴定出STAB1+脂质相关巨噬细胞亚群在肺腺癌肝转移中富集,并阐明其通过SIRPα-CD47信号抑制巨噬细胞吞噬作用的机制 未明确说明局限性 探究脂质相关巨噬细胞在肺腺癌肝转移和奥希替尼耐药中的功能及分子机制 肺腺癌患者原发肿瘤和肝转移肿瘤组织、小鼠异种移植模型 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、RNA-seq、Luminex多因子检测、免疫共沉淀 NA 基因表达数据、细胞共培养数据 人类原发性和肝转移性肺腺癌肿瘤组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
223 2026-06-10
Single-cell transcriptomics reveals diversity and conservation of chicken lymphocytes
2026-May, Poultry science IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组学构建鸡免疫器官高分辨率图谱,揭示了淋巴细胞的多样性和保守性 首次系统构建鸡胸腺、法氏囊和脾脏三个主要免疫器官的单细胞转录组图谱,鉴定出24种免疫和基质细胞类型,并比较了它们在不同器官中的分布与发育轨迹 未说明 了解禽类免疫防御机制,推进家禽抗病育种,并为脊椎动物免疫学提供进化见解 鸡(Gallus gallus)的三个主要免疫器官:胸腺、法氏囊和脾脏 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
224 2026-06-10
Construction of a multi-tissue immune atlas for Chinese tongue sole (Cynoglossus semilaevis) reveals granulocyte functional adaptation and underlying regulatory mechanisms
2026-May, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序数据,构建了半滑舌鳎多组织免疫图谱,揭示了粒细胞功能适应及调控机制 首次在鱼类中系统描述粒细胞亚群的功能适应性和组织特异性分布,发现保守的cd44b介导的通讯模块 信息不足,输出NA 解析鱼类粒细胞在不同组织微环境中的功能适应性及其调控机制 半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)的血液、肝脏、脾脏和头肾中的粒细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多组织样本(血液、肝脏、脾脏、头肾) 信息不足,输出NA 单细胞RNA测序 信息不足,输出NA 信息不足,输出NA
225 2026-06-10
Pancancer Fine-Mapping of Mutational Intolerance Identifies CHEK1 as an Immunosuppressive Driver in Lung Adenocarcinoma
2026-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过泛癌突变不耐受基因精细定位,发现CHEK1在肺腺癌中作为免疫抑制驱动因子的作用 开发了miDriver计算框架,通过泛癌-正常组织突变对比识别突变不耐受基因,并发现CHEK1作为双重治疗靶点,同时破坏肿瘤内在适应性和重塑免疫抑制微环境 未明确提及 识别泛癌中的突变不耐受基因并探索其作为治疗靶点的潜力 突变不耐受基因,特别是CHEK1 机器学习 肺腺癌 单细胞转录组学, 多重免疫荧光, CRISPR筛选 NA 基因组数据, 转录组数据 8,096个肿瘤样本,涵盖13种癌症类型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
226 2026-06-10
Radiotherapy disrupts ferroptosis tolerance by reducing DNMT1 levels and uncouples STING silencing in LKB1-deficient lung tumors
2026-May, Free radical biology & medicine
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示LKB1缺陷肺癌中放疗通过降低DNMT1水平破坏铁死亡耐受并解除STING沉默,联合抗PD-1抗体可有效抑制肿瘤 首次发现LKB1缺陷通过铁死亡耐受导致免疫检查点抑制剂耐药,并阐明放疗通过DNMT1-OSGIN1轴和STING通路双重机制逆转该耐药 主要基于小鼠模型和临床队列分析,尚需更多临床验证及机制深入研究 探究LKB1缺陷非小细胞肺癌对免疫检查点抑制剂原发耐药的机制及放疗逆转策略 LKB1缺陷肺癌细胞、Kras驱动Lkb1条件敲除小鼠模型及多个临床队列样本 生物医学研究 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个临床队列及基因工程小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'转录组测序
227 2026-06-10
Single-cell insights into cisplatin resistance mechanisms in bladder cancer tumor microenvironment
2026-May, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序与体外实验验证,揭示了膀胱癌肿瘤微环境中顺铂耐药性的分子机制和细胞异质性 通过整合顺铂敏感与耐药膀胱癌样本的单细胞测序数据,首次系统鉴定了耐药细胞亚群、代谢重编程特征及MIF信号通路在耐药性形成中的关键作用 未提及体内模型验证及多中心临床试验中的泛化性验证 阐明膀胱癌顺铂耐药性的分子机制并识别潜在治疗靶点 膀胱癌肿瘤微环境中的多个细胞亚群,包括耐药上皮细胞、成纤维细胞、免疫细胞等 机器学习 膀胱癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 整合了顺铂敏感和耐药膀胱癌样本的单细胞RNA测序数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
228 2026-06-10
Intra-Tissue Bacteriome and Cellular Profiles in Periodontal Granulation Tissue From Osseous Defects and Extraction Sockets
2026-May, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1
研究论文 研究牙周肉芽组织在骨缺损和拔牙窝中的组织内菌群和细胞特征,探索其生物学本质和转化潜力 首次系统比较骨缺损区、拔牙窝和牙周袋壁组织的组织内菌群与细胞谱,发现骨缺损区牙周肉芽组织具有健康相关菌群和高间充质干细胞比例 样本量有限(49例患者),需要进一步转化研究以验证牙周肉芽组织作为间充质干细胞替代来源用于牙周再生 阐明牙周肉芽组织在不同临床来源中的菌群和细胞特征,探索其再生医学应用价值 严重牙周炎患者的牙周肉芽组织样本(来自骨缺损、拔牙窝和牙根表面)及对照牙周袋壁组织 数字病理学 牙周病 16S rRNA测序,单细胞测序,组织学分析 NA 基因序列数据,组织图像,细胞计数数据 49例严重牙周炎患者的牙周肉芽组织样本(包括手术区骨缺损组织、拔牙窝组织、牙根表面组织及对照牙周袋壁组织) Illumina 16S rRNA测序,单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 16S rRNA基因测序和单细胞RNA测序均使用Illumina NovaSeq平台
229 2026-06-10
ATP-binding cassette subfamily A member 5 suppresses pancreatic ductal adenocarcinoma progression and chemoresistance by promoting β-catenin ubiquitin-dependent degradation
2026-May, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 该研究首次确定ABCA5在胰腺导管腺癌中作为肿瘤抑制因子,通过促进β-catenin的泛素依赖性降解来抑制肿瘤进展和化疗耐药 首次发现ABCA5通过与BTRC的WD40重复结构域结合诱导β-catenin泛素依赖性降解,抑制WNT通路,并验证了ABCA5过表达联合吉西他滨和PRI-724的治疗效果 研究未明确ABCA5在PDAC中表达下调的机制,且临床样本量有限 探究ABCA5在胰腺导管腺癌中的功能及其分子机制 胰腺导管腺癌肿瘤样本、细胞系、小鼠模型及患者来源类器官 机器学习 胰腺导管腺癌 RNA-seq,单细胞RNA-seq,免疫荧光,质谱分析,免疫共沉淀,泛素化检测 NA 转录组数据 80个临床胰腺导管腺癌样本 Illumina 单细胞RNA-seq,转录组测序 Illumina NovaSeq 批量转录组测序和单细胞RNA测序用于表达分析
230 2026-06-10
Single cell transcriptomic atlas reveals macrophage polarization dynamics and intercellular communication networks in gingival tissue of periodontitis patients undergoing orthodontic treatment
2026-May, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞转录组图谱揭示牙周炎正畸治疗患者牙龈组织中巨噬细胞极化动态及细胞间通讯网络 首次在单细胞水平解析牙周炎正畸治疗背景下巨噬细胞亚型异质性、极化动态路径及力学-炎症信号整合机制 未提及具体局限性 探究牙周炎患者正畸治疗过程中牙龈组织内巨噬细胞亚型异质性及其极化动态 接受正畸治疗的牙周炎患者的牙龈组织样本 单细胞转录组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
231 2026-06-10
Integrative single-cell and spatial transcriptomic reveals S100A16+ tumor endothelial cells drive angiogenesis and immunosuppression in hepatocellular carcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 整合单细胞与空间转录组学揭示S100A16+肿瘤内皮细胞在肝细胞癌中驱动血管生成与免疫抑制 首次鉴定出S100A16+肿瘤内皮细胞亚群,并阐明其通过协调促进病理性血管生成和免疫抑制驱动肝癌进展的机制 NA 探究肿瘤相关内皮细胞在肝细胞癌中的分子特征及其功能贡献 肝细胞癌患者的肿瘤组织、癌旁正常组织及肿瘤边界区域样本 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RNA测序, 多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 组织芯片数据 49个样本(145,692个高质量单细胞),12个空间转录组样本(49,091个空间点),90对配对肝癌样本组织和免疫治疗晚期肝癌队列 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
232 2026-06-10
Aflatoxin B1 accelerates diabetic nephropathy progression via ITGA11/LTBP1-dependent oxidative and fibrotic pathways: Evidence from multi-omics and molecular simulations
2026-May-01, Chemico-biological interactions IF:4.7Q1
研究论文 通过多组学整合分析揭示黄曲霉毒素B1通过ITGA11/LTBP1依赖的氧化和纤维化通路加速糖尿病肾病进展 首次系统整合bulk转录组、单细胞转录组和空间转录组数据,结合分子模拟,阐明AFB1在糖尿病肾病中的分子机制,并优先鉴定ITGA11和LTBP1作为关键介质 研究基于计算分析和体外模拟,缺乏体内或临床验证实验;分子相互作用的直接实验证据有待进一步确证 明确黄曲霉毒素B1加快糖尿病肾病进展的相关分子通路及关键介质 糖尿病肾病相关转录组数据及AFB1响应分子 计算生物学 糖尿病肾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟 NA 图像, 文本 多队列转录组数据(具体数量未提供) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
233 2026-06-10
MIF-CD74 axis facilitates MDSC infiltration in the tumor microenvironment of pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究探讨了MIF-CD74轴在胰腺导管腺癌肿瘤微环境中促进髓系抑制细胞浸润的机制 首次揭示MIF-CD74轴在PDAC中驱动MDSC与CAF之间的相互作用,并鉴定出MIF CAFs为免疫抑制关键细胞群 NA 研究PDAC肿瘤微环境的免疫抑制特征 胰腺导管腺癌组织、肿瘤浸润白细胞、MDSC、CAF NA 胰腺导管腺癌 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA PDAC手术标本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium NA
234 2026-06-10
SAD: Sparse-Aware Diffusion Model for Single-Cell Gene Expression Completion
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
research paper 提出SAD,一种基于扩散模型的框架,用于单细胞RNA测序的基因补全,纠正稀疏性偏差,并支持超过30k基因的输入 首次针对scRNA-seq开创性地提出基因补全任务,并设计了专门应对极端稀疏数据的扩散模型SAD,可生成原本缺失的基因条目并纠正分布偏差 未明确说明,但可能涉及极端高缺失率场景下的性能边界或计算成本 解决单细胞RNA测序数据中基因覆盖不全和技术性零点问题,为下游任务提供可靠且一致的基因表达数据 单细胞RNA测序表达数据,特别是高缺失率的稀疏数据集 机器学习, 自然语言处理 NA scRNA-seq 扩散模型(Diffusion Model) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
235 2026-06-10
A Novel Low-Dimensional Sparse and Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出一种名为LDSLRR的低维稀疏低秩表示方法,用于单细胞RNA测序数据聚类 创新性地将降维、自表示矩阵构建和聚类过程整合为端到端模型,并同时优化三个模块以提高聚类精度 未明确说明限制,可能涉及高维稀疏数据处理的泛化性或计算复杂度 解决单细胞RNA测序数据中高维稀疏性导致的聚类精度问题 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 机器学习 NA scRNA-seq LDSLRR(低维稀疏低秩表示)、图正则化非负矩阵分解(NMF) 基因表达矩阵 多个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
236 2026-06-10
DyGFormer:Transformer With Resistance-Distance Bias for Semi-Supervised Cell-Type Identification
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出一种名为DyGFormer的半监督模型,通过基于电阻距离的Transformer偏置和自注意力机制,联合建模转录相似性和组织结构,实现单细胞空间转录组学数据的准确细胞类型识别 创新性在于将电阻距离的相对位置偏置引入Transformer,设计邻域交互历史编码器稳定跨层交互,并采用三元组引导的度量监督在小标注子集上提升类别可分性 未明确讨论模型在跨平台异质性或极端稀疏标注场景下的鲁棒性,以及计算复杂度对大型数据集的可扩展性 开发一种半监督细胞类型分类模型,应对单细胞空间转录组数据中的测序噪声、平台异质性和标注限制等挑战 来自不同组织和平台的多个单细胞分辨率空间数据集(如NanoString/CosMx和MERFISH) 机器学习 癌症 单细胞空间转录组学 Transformer 单细胞空间转录组数据 多个单细胞分辨率空间数据集,具体样本量未说明 NA 空间转录组学 NanoString CosMx, MERFISH NA
237 2026-06-10
Multi-Omics Graph Attention Network for Key Gene Prediction in Triple-Negative Breast Cancer
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出基于图注意力网络的多模态框架,整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和影像组学数据,用于预测三阴性乳腺癌关键基因 首次将图注意力网络与多模态数据(转录组、染色质可及性和影像组学)融合,通过典型相关分析对齐特征,并利用转录因子结合引导边和细胞间通讯关系构建多模态图,实现了对三阴性乳腺癌异质性的跨模态调控交互捕捉 未在本文中明确提及局限性,但可能包括依赖外部验证集、计算资源需求高或特征选择偏倚等潜在问题 开发可解释的多模态生物标志物发现框架,以识别三阴性乳腺癌的关键基因和潜在治疗靶点 三阴性乳腺癌患者的单细胞转录组、单细胞染色质可及性和影像组学数据 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、影像组学 图注意力网络、集成多层感知器 转录组数据、染色质可及性数据、影像数据 外部TCGA-TNBC队列 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 NA NA
238 2026-06-10
Epidermal MHC-II-mediated NK cell recruitment triggers keratinocyte pyroptosis, facilitating pathogenesis of psoriasis
2026-May, Experimental & molecular medicine
研究论文 本文研究了表皮MHC-II介导的NK细胞招募诱导角质形成细胞焦亡在银屑病发病机制中的作用 首次揭示表皮MHC-II通过ERK-CREB轴调控CXCL10招募NK细胞,以及NK细胞释放颗粒酶B引发GSDME阳性角质形成细胞焦亡的新机制 本研究主要基于小鼠模型和体外实验,未在人体样本中进行全面验证,且对MHC-II调控角质形成细胞-免疫细胞相互作用的分子机制解析尚不够深入 探讨银屑病发病中角质形成细胞如何招募自然杀伤细胞以及NK细胞参与炎症反应的机制 银屑病患者的皮肤病变组织和小鼠银屑病样皮炎模型 数字病理学 银屑病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 未在摘要中明确说明样本量的具体数字 NA 空间转录组学 NA NA
239 2026-06-10
MeCP2 regulates cell-type-specific functions of depressive-like symptoms in the nucleus accumbens
2026-May, Experimental & molecular medicine
研究论文 本研究利用慢性束缚应激模型,揭示了MeCP2在伏隔核多巴胺D2受体神经元中的细胞类型特异性功能,及其在抑郁样症状调节中的作用 首次发现慢性束缚应激选择性降低伏隔核D2R神经元中的MeCP2蛋白,并通过细胞类型特异性MeCP2恢复实验证明其可减轻应激诱导的抑郁样表型及伴随的回路/转录组特征 腹侧苍白球的下游分子特征未解决投射特异性问题,且未进行全脑范围的分析 探究MeCP2在伏隔核D2R神经元中的细胞类型特异性功能及其在应激反应和抑郁中的作用机制 小鼠伏隔核中的D2R表达中等棘状神经元,以及腹侧苍白球区域 分子神经科学 抑郁症 慢性束缚应激模型、脑片电生理记录、光遗传学刺激、GeoMx数字空间转录组学 NA 空间转录组数据 慢性束缚应激模型小鼠,具体样本数未在摘要中提及 NanoString 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiler GeoMx数字空间转录组学用于病毒标记的NAc D2R神经元的细胞类型解析
240 2026-06-10
LoHi-SSL: A Multi-Level Synergistic Learning Model for Integrating Single-Cell Multi-Omics Data via Low- and High-Order Information Fusion
2026 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出一种多层级协同学习模型LoHi-SSL,通过低阶和高阶信息融合实现单细胞多组学数据高效整合 首次将低阶信息(图自编码器保留组学内细胞相似性)与高阶信息(超图学习捕获跨组学复杂关系)结合,并利用对比学习增强细胞分辨能力 未提及对大规模数据集的计算效率或超大规模细胞图谱的适用性 开发单细胞多组学数据整合方法以解析细胞异质性和状态转变 单细胞多组学数据(如不同分子层的数据集) 机器学习 NA 单细胞多组学测序 图自编码器、超图学习、对比学习 单细胞多组学数据 6个公开数据集 NA 单细胞多组学 NA NA
回到顶部