单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 23961 - 23980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23961 | 2024-08-09 |
Cell population analysis of the adult murine subependymal neurogenic lineage by flow cytometry
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100425
PMID:33899012
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研究论文 | 本研究提供了一种基于流式细胞术的方法，用于分类和分离成年啮齿动物室管膜下区（SEZ）神经发生谱系的所有细胞 | 该方法无需报告鼠，能够分离出具有与单细胞转录组学一致的分子特征的三种神经干细胞（NSC）亚群，并评估其细胞周期行为 | NA | 开发一种新的流式细胞术方法，用于分类和分离成年啮齿动物室管膜下区的神经发生谱系细胞 | 成年啮齿动物室管膜下区的神经干细胞及其亚群 | NA | NA | 流式细胞术 | NA | 细胞 | 成年啮齿动物室管膜下区的神经发生谱系细胞 |
| 23962 | 2024-08-09 |
STARTRAC analyses of scRNAseq data from tumor models reveal T cell dynamics and therapeutic targets
2021-06-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20201329
PMID:33900375
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研究论文 | 本文通过STARTRAC算法分析了来自多个小鼠肿瘤模型的单细胞RNA测序数据，揭示了T细胞的动态变化和治疗靶点 | 首次使用STARTRAC算法结合TCR追踪，分析了小鼠和人类肿瘤中T细胞亚群的对应关系，并发现了CCR8作为肿瘤相关T调节细胞的标记物 | NA | 研究肿瘤模型中的T细胞动态和治疗靶点 | 小鼠肿瘤模型中的T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA-based subclustering | RNA测序数据 | 多个小鼠肿瘤模型 |
| 23963 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in human lung cancer: Applications, challenges, and pathway towards personalized therapy
2021-06-01, Journal of the Chinese Medical Association : JCMA
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/JCMA.0000000000000535
PMID:33883467
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在人类肺癌研究中的各种应用，并探讨了其面临的挑战及未来在个性化癌症治疗中的潜在应用 | 本文填补了关于scRNA-seq在肺癌研究中应用的全面综述的空白 | NA | 总结scRNA-seq在人类肺癌研究中的应用，并探讨其面临的挑战及未来在个性化癌症治疗中的潜在应用 | 人类肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 23964 | 2024-08-09 |
Platypus: an open-access software for integrating lymphocyte single-cell immune repertoires with transcriptomes
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab023
PMID:33884369
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研究论文 | 本文介绍了Platypus软件，该软件是一个开源平台，用于整合淋巴细胞单细胞免疫库与转录组数据，提供用户友好的界面进行分析 | Platypus填补了市场上缺乏专门用于单细胞免疫库分析软件的空白，同时整合了转录组信息 | NA | 开发一个开源软件平台，用于整合和分析单细胞免疫库与转录组数据 | B细胞和T细胞的单细胞免疫库与转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞免疫库与转录组数据 | 来自康复期COVID-19患者的B细胞和T细胞 |
| 23965 | 2024-08-09 |
Mucosal immunity to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection
2021-06-01, Current opinion in infectious diseases
IF:3.6Q2
DOI:10.1097/QCO.0000000000000724
PMID:33899752
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综述 | 本文综述了黏膜免疫在严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）感染清除中的作用及其潜在的黏膜保护机制 | 强调了黏膜免疫在呼吸道病毒感染中的关键作用，尤其是在病毒复制早期限制和清除中的作用 | 需要进一步研究以理解系统免疫终点如何在疫苗研究中转化为对SARS-CoV-2感染的黏膜保护 | 探讨黏膜免疫在SARS-CoV-2感染中的作用及其保护机制 | 严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的黏膜免疫反应 | NA | 呼吸系统疾病 | RNA测序 | NA | 生物样本 | 涉及COVID-19患者的鼻咽拭子和支气管肺泡灌洗样本 |
| 23966 | 2024-08-09 |
Aging-dependent regulatory cells emerge in subcutaneous fat to inhibit adipogenesis
2021-05-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.03.026
PMID:33878347
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research paper | 本研究通过比较年轻和老年小鼠皮下脂肪组织中的总基质血管细胞的scRNA-seq数据，发现了一种与年龄相关的调节细胞（ARC），这种细胞仅在老年小鼠和人类的皮下脂肪组织中出现，并能分泌高水平的促炎趋化因子，抑制邻近脂肪前体的增殖和分化。 | 首次鉴定出一种与年龄相关的调节细胞（ARC），并揭示了其在老年小鼠和人类皮下脂肪组织中的出现及其抑制脂肪前体分化的机制。 | NA | 探究与年龄相关的皮下脂肪组织损失的分子机制。 | 年轻和老年小鼠的皮下脂肪组织中的基质血管细胞。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 细胞数据 | 年轻和老年小鼠的皮下脂肪组织样本 |
| 23967 | 2024-08-09 |
Adaptive cell invasion maintains lateral line organ homeostasis in response to environmental changes
2021-05-03, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.03.027
PMID:33878346
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研究论文 | 本文通过细胞系标记、活体时间流逝成像和单细胞RNA测序技术，发现zebrafish侧线器官中的高度可移动皮肤衍生细胞能够入侵成熟的机械感觉器官并分化为Neuromast相关（Nm）离子细胞，以响应环境变化，维持器官稳态 | 发现了Nm离子细胞，挑战了侧线器官完全由胚胎衍生而来的观点，并提出Nm离子细胞可能是通过调节离子微环境来调控感觉毛细胞功能的潜在调节因子 | NA | 研究环境变化下侧线器官稳态的维持机制 | zebrafish侧线器官中的感觉毛细胞和Nm离子细胞 | NA | NA | 细胞系标记、活体时间流逝成像、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 23968 | 2024-08-09 |
A subpopulation of embryonic microglia respond to maternal stress and influence nearby neural progenitors
2021-05-03, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.03.018
PMID:33887203
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研究论文 | 研究探讨了胚胎期下丘脑中的小胶质细胞对母体应激的反应及其对邻近神经干细胞的影响 | 发现胚胎期下丘脑中的小胶质细胞能响应母体应激，并通过分泌CCL3和CCL4影响神经干细胞的增殖和分化 | 研究主要集中在雄性胚胎，对雌性的影响未详细探讨 | 探究胚胎期下丘脑小胶质细胞对母体应激的响应及其对神经发育的影响 | 胚胎期下丘脑的小胶质细胞和神经干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及雄性胚胎的小胶质细胞和神经干细胞 |
| 23969 | 2024-08-09 |
Establishing and maintaining fertility: the importance of cell cycle arrest
2021-05-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.348151.120
PMID:33888561
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综述 | 本文综述了Cip/Kip家族的周期素依赖性激酶抑制剂（CKIs）在小鼠性腺发育中的作用，特别强调了单细胞RNA测序研究显示的周期素依赖性激酶抑制剂的异质性 | 强调了单细胞RNA测序研究显示的周期素依赖性激酶抑制剂的异质性，并突出了细胞周期抑制剂在控制和维持雌性生育能力中的新角色 | NA | 探讨细胞周期抑制剂在性腺发育和维持生育能力中的重要性 | 小鼠性腺发育中的Cip/Kip家族周期素依赖性激酶抑制剂 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23970 | 2024-08-09 |
Gremlin 1+ fibroblastic niche maintains dendritic cell homeostasis in lymphoid tissues
2021-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00920-6
PMID:33903764
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，鉴定了在人和小鼠淋巴结中表达Gremlin1的成纤维网状细胞亚群，并发现这些细胞在维持淋巴组织中树突状细胞稳态中起关键作用 | 首次揭示了Gremlin1成纤维细胞在淋巴结中形成的新微环境，该微环境对淋巴组织中树突状细胞的稳态维持至关重要 | NA | 探究成纤维网状细胞在淋巴组织中的功能及其对树突状细胞稳态的影响 | 人和小鼠淋巴结中的成纤维网状细胞及树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人和小鼠的淋巴结样本 |
| 23971 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing of human white adipose tissue identifies new cell states in health and obesity
2021-05, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-021-00922-4
PMID:33907320
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和流式细胞术，揭示了健康和肥胖人体白色脂肪组织中基质血管部分的大规模综合细胞普查，并报告了脂肪组织定居的先天淋巴细胞、树突状细胞和单核细胞衍生巨噬细胞的新亚群和发展轨迹。 | 本文首次揭示了肥胖人体白色脂肪组织中免疫调节机制向炎症网络的转变，并提供了健康人体白色脂肪组织的详细和无偏见的细胞景观。 | NA | 研究健康和肥胖人体白色脂肪组织中的细胞状态和相互作用。 | 人体白色脂肪组织中的细胞亚群和发展轨迹。 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 健康和肥胖的人体白色脂肪组织样本 |
| 23972 | 2024-08-09 |
Comprehensive description of the current breast cancer microenvironment advancements via single-cell analysis
2021-Apr-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-021-01949-z
PMID:33906694
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综述 | 本文综述了通过单细胞分析技术在乳腺癌微环境研究中的最新进展 | 利用单细胞DNA测序、单细胞RNA测序和质谱流式细胞术等技术，深入探讨了乳腺癌肿瘤浸润细胞的表型和功能多样性 | NA | 总结乳腺癌肿瘤生态系统的单细胞特征化进展，并探讨肿瘤内细胞表型多样性及其潜在的预后相关性 | 乳腺癌的肿瘤细胞、免疫细胞、成纤维细胞和血管细胞等组成的复杂微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序（scDNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 23973 | 2024-08-09 |
Single-cell characterization of a model of poly I:C-stimulated peripheral blood mononuclear cells in severe asthma
2021-Apr-26, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-021-01709-9
PMID:33902571
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研究论文 | 本研究使用两种单细胞方法（DropSeq和CyTOF）对严重哮喘患者的PBMCs进行单细胞RNA测序和质谱流式细胞术分析，探讨了Poly I:C刺激后的免疫反应。 | 本研究首次采用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术对严重哮喘患者的PBMCs进行详细分析，揭示了Poly I:C刺激后的免疫反应和细胞亚群的变化。 | 研究样本量较小，仅包括五名严重哮喘患者和三名健康对照者，可能影响结果的普遍性。 | 研究严重哮喘患者PBMCs在Poly I:C刺激下的免疫反应和细胞亚群的变化。 | 严重哮喘患者的PBMCs及其对Poly I:C的免疫反应。 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）和质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 细胞 | 9414个PBMCs，包括6099个来自5名严重哮喘患者和3315个来自3名健康对照者 |
| 23974 | 2024-08-09 |
In silico screening using bulk and single-cell RNA-seq data identifies RIMS2 as a prognostic marker in basal-like breast cancer: A retrospective study
2021-Apr-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000025414
PMID:33879671
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研究论文 | 本研究利用批量和单细胞RNA测序数据，筛选出RIMS2作为基底样乳腺癌的预后标志物，并评估其与单细胞水平上细胞状态的相关性 | 首次通过单细胞RNA测序数据验证RIMS2在基底样乳腺癌中的表达，并发现其与DNA修复能力和上皮-间质转化呈负相关 | 研究为回顾性分析，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在筛选和验证基底样乳腺癌中的预后相关基因 | 基底样乳腺癌肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | Cox回归模型 | RNA测序数据 | 20,530个基因，89个基底样细胞 |
| 23975 | 2024-08-09 |
Barcoded viral tracing of single-cell interactions in central nervous system inflammation
2021-04-23, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abf1230
PMID:33888612
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研究论文 | 本文开发了一种名为RABID-seq的技术，结合条形码病毒追踪和单细胞RNA测序，用于研究中枢神经系统炎症中的星形胶质细胞相互作用 | RABID-seq技术首次结合条形码病毒追踪和单细胞RNA测序，用于在体内研究星形胶质细胞相互作用 | NA | 研究星形胶质细胞在中枢神经系统炎症中的相互作用及其潜在的治疗靶点 | 星形胶质细胞和微胶质细胞的相互作用 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23976 | 2024-08-09 |
A fetal wave of human type 3 effector γδ cells with restricted TCR diversity persists into adulthood
2021-04-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abf0125
PMID:33893173
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研究论文 | 本文通过高通量测序和单细胞RNA测序等技术，研究了人类胎儿和成人血液中γδ T细胞的多样性和功能特性 | 首次揭示了人类胎儿期和成人期存在具有半不变Vγ9Vδ2 TCR的功能性不同的先天样效应γδ T细胞波 | NA | 探究人类胎儿和成人血液中γδ T细胞的多样性和功能特性 | γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 高通量测序, 单细胞RNA测序, 多参数流式细胞术, TCR测序 | NA | 血液样本 | 新生儿和成人血液样本 |
| 23977 | 2024-08-09 |
scSensitiveGeneDefine: sensitive gene detection in single-cell RNA sequencing data by Shannon entropy
2021-Apr-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04136-1
PMID:33888056
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研究论文 | 本研究开发了一种基于变异系数排名和香农熵的方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别敏感基因，并验证了该方法的有效性 | 首次提出使用变异系数排名和香农熵来识别敏感基因，这些基因对环境刺激有高度敏感性，可能对细胞类型注释产生重大影响 | NA | 揭示细胞中随机基因表达模式的普遍性，比较细胞标记基因、管家基因和敏感基因之间的差异，并改进无监督聚类的结果 | 单细胞RNA测序数据中的敏感基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11个来自不同人体组织的单细胞数据集 |
| 23978 | 2024-08-09 |
Two reactive behaviors of chondrocytes in an IL-1β-induced inflammatory environment revealed by the single-cell RNA sequencing
2021-04-20, Aging
DOI:10.18632/aging.202857
PMID:33879632
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了在IL-1β诱导的炎症环境中体外扩增的软骨细胞的异质性反应 | 本研究首次揭示了在IL-1β诱导的炎症环境中，软骨细胞通过两种不同的路径转化为具有骨关节炎表型和促炎特性的终端细胞簇 | 研究仅限于体外实验，尚未在体内环境中验证这些发现 | 探究在IL-1β诱导的炎症环境中体外扩增的软骨细胞的异质性反应 | 人关节软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 体外扩增的人关节软骨细胞，处理时间为0、24和48小时 |
| 23979 | 2024-08-09 |
XYZeq: Spatially resolved single-cell RNA sequencing reveals expression heterogeneity in the tumor microenvironment
2021-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg4755
PMID:33883145
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研究论文 | 本文介绍了XYZeq工作流程，该流程将空间元数据编码到单细胞RNA测序库中，以揭示肿瘤微环境中细胞表达的异质性 | XYZeq工作流程的创新之处在于它能够捕获空间条形码转录组，从而提供细胞在解剖空间中的功能信息 | NA | 研究目的是更好地理解个体细胞在解剖空间中的功能 | 研究对象包括小鼠肿瘤模型中的细胞类型和状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数万个细胞 |
| 23980 | 2024-08-09 |
Single-cell analyses reveal SARS-CoV-2 interference with intrinsic immune response in the human gut
2021-04, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202110232
PMID:33904651
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究，揭示了SARS-CoV-2感染人肠道后对固有免疫反应的干扰 | 发现了SARS-CoV-2感染肠道细胞后抑制自分泌干扰素作用，限制了干扰素刺激基因的表达 | NA | 探究SARS-CoV-2感染人肠道后触发的抗病毒程序 | SARS-CoV-2感染的肠道类器官 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |