单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28135 篇文献，本页显示第 23941 - 23960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23941 | 2024-08-08 |
No evidence that plasmablasts transdifferentiate into developing neutrophils in severe COVID-19 disease
2021, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1308
PMID:34221402
|
研究论文 | 本文探讨了在严重COVID-19疾病中，浆母细胞是否能转化为'发育中的中性粒细胞'的问题 | 本文通过重新分析原始数据和代码，揭示了浆母细胞与发育中的中性粒细胞之间的谱系关系在未回归关键特征时会崩溃 | 在生物信息学分析和数据解释时应谨慎，并应通过正交技术交叉验证 | 验证浆母细胞在严重COVID-19疾病中是否能转化为发育中的中性粒细胞 | 浆母细胞和发育中的中性粒细胞 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 23942 | 2024-08-08 |
Ligand-Receptor Interactions Elucidate Sex-Specific Pathways in the Trajectory From Primordial Germ Cells to Gonia During Human Development
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.661243
PMID:34222234
|
研究论文 | 本文通过分析人类胎儿性腺的单细胞转录组数据，揭示了在人类发育过程中从原始生殖细胞（PGCs）到精原细胞（gonia）的性别特异性分子交互作用 | 首次系统分析了发育中人类性腺的信号环境，并揭示了人类前减数生殖细胞发育中的性别特异性信号通路 | 目前无法在没有性腺组织的情况下模拟PGCs到gonia的转变 | 理解从PGCs到前减数卵原细胞或精原细胞的转变过程，并识别在逐步重建人类配子发生中感兴趣的性别特异性信号通路 | 人类胎儿性腺中的原始生殖细胞及其向精原细胞的性别特异性转变 | NA | NA | 单细胞转录组学 | CellPhoneDB算法 | 转录组数据 | 人类胎儿性腺样本 |
| 23943 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of the zebrafish embryonic trunk
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0254024
PMID:34234366
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术对斑马鱼胚胎躯干区域的20,000多个细胞进行了转录组分析 | 首次详细描述了斑马鱼胚胎发育过程中27种不同细胞类型和亚型的转录特征 | NA | 研究斑马鱼胚胎发育过程中的细胞分化和转录特征 | 斑马鱼胚胎躯干区域的细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20,000多个细胞 |
| 23944 | 2024-08-08 |
Evolution of Developmental Programs for the Midline Structures in Chordates: Insights From Gene Regulation in the Floor Plate and Hypochord Homologues of Ciona Embryos
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.704367
PMID:34235159
|
研究论文 | 本文研究了脊索动物中线结构的发育程序的进化，特别是通过基因调控在Ciona胚胎的底板和同源的腹索中的表达。 | 发现了驱动报告基因在底板中表达的调控区域，并揭示了底板和内胚层带共享部分基因调控程序，以及FoxA.a作为中线基因组的候选转录激活因子。 | NA | 探讨脊索动物中线结构的发育程序的进化起源。 | Ciona胚胎的底板和腹索的基因调控。 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | Ciona尾芽胚胎 |
| 23945 | 2024-08-08 |
CStreet: a computed Cell State trajectory inference method for time-series single-cell RNA sequencing data
2021-11-05, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab488
PMID:34196686
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CStreet的计算方法，用于推断时间序列单细胞RNA测序数据中的细胞状态轨迹 | CStreet利用时间序列信息构建细胞间k近邻连接，并估计细胞状态的连接概率，通过力导向图可视化轨迹，支持多起点和路径 | NA | 旨在解决时间序列单细胞RNA测序数据中细胞状态轨迹的准确推断问题 | 时间序列单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间序列数据 | NA |
| 23946 | 2024-08-08 |
Evaluation of immune status in testis and macrophage polarization associated with testicular damage in patients with nonobstructive azoospermia
2021-11, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13481
PMID:34192390
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化染色等技术，系统评估了非阻塞性无精子症患者睾丸免疫微环境的状态，特别是巨噬细胞的极化情况，并探讨了其与精子发生的关系 | 首次系统分析了非阻塞性无精子症患者睾丸中巨噬细胞的极化状态及其与精子发生的关系 | 研究基于公共微阵列数据集，可能存在样本选择偏倚；未涉及临床干预试验 | 揭示非阻塞性无精子症患者睾丸免疫微环境的机制 | 非阻塞性无精子症患者睾丸中的免疫细胞及其极化状态 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因集富集分析（ssGSEA）、基因集变异分析（GSVA）、免疫组化（IHC） | NA | 基因表达数据 | 使用了四个独立的公共微阵列数据集（GSE45885, GSE45887, GSE9210, 和 GSE145467） |
| 23947 | 2024-08-08 |
Intra-heterogeneity in transcription and chemoresistant property of leukemia-initiating cells in murine Setd2-/- acute myeloid leukemia
2021-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12189
PMID:34196511
|
研究论文 | 本研究探讨了Setd2-/-小鼠急性髓系白血病（AML）中白血病起始细胞（LICs）的转录和化学抗性特性的内在异质性。 | 本研究首次揭示了Setd2-/- AML模型中LICs的转录和功能异质性，并发现了不同类型LICs共存导致的多样药物反应。 | NA | 旨在阐明AML中LICs的内在异质性，以帮助预测白血病行为并开发更有效的治疗方法。 | Setd2-/-小鼠的AML模型中的白血病起始细胞（LICs）。 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 流式细胞术、全基因组测序、RNA测序、限制性稀释分析、小分子抑制剂筛选 | NA | 基因组数据、转录组数据 | Setd2-/- AML小鼠的脾细胞 |
| 23948 | 2024-08-08 |
AP-2α-Mediated Activation of E2F and EZH2 Drives Melanoma Metastasis
2021-09-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-0772
PMID:34210752
|
研究论文 | 本文研究了AP-2α转录因子在黑色素瘤转移中的作用，发现AP-2α通过激活E2F和EZH2途径促进黑色素瘤转移 | 首次揭示了AP-2α通过抑制NuRD抑制复合体来上调E2F途径基因，从而驱动黑色素瘤转移 | NA | 探讨AP-2α在黑色素瘤转移中的作用及其机制 | AP-2α转录因子及其在黑色素瘤转移中的作用 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了转移性黑色素瘤小鼠模型 |
| 23949 | 2024-08-08 |
Dissecting human trophoblast cell transcriptional heterogeneity in preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2021-08, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1730
PMID:34212522
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的转录异质性 | 首次展示了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的发展轨迹，并揭示了其基因表达的改变 | NA | 探讨子痫前期胎盘在病理发生中的作用 | 子痫前期和健康妊娠胎盘中的滋养层细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自子痫前期和健康妊娠的胎盘样本 |
| 23950 | 2024-08-08 |
De novo generation of macrophage from placenta-derived hemogenic endothelium
2021-07-26, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.06.005
PMID:34197725
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠胎盘造血的转录组图谱，并验证了胎盘内皮细胞的一个亚群具有造血潜能，能够产生胎盘巨噬细胞。 | 首次发现并验证了胎盘内皮细胞的一个亚群具有造血潜能，能够产生胎盘巨噬细胞，为胎盘作为巨噬细胞来源提供了新的证据。 | NA | 探究巨噬细胞是否可以从其他胚胎部位产生，特别是胎盘来源的巨噬细胞。 | 小鼠胎盘内皮细胞及其造血潜能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 23951 | 2024-08-08 |
Control of tissue development and cell diversity by cell cycle-dependent transcriptional filtering
2021-07-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.64951
PMID:34212855
|
研究论文 | 本文探讨了细胞周期依赖的转录过滤在组织发育和细胞多样性控制中的作用 | 通过数学模拟细胞增殖，揭示了细胞周期过滤器作为调节基因转录表达、细胞多样性和组织中不同细胞类型数量及比例的机制 | NA | 研究细胞周期动态在多细胞动物中控制基因转录表达和细胞命运的作用 | 细胞周期、基因转录表达、细胞多样性、组织中的细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模拟 | 基因组数据 | NA |
| 23952 | 2024-08-08 |
A Bayesian inference transcription factor activity model for the analysis of single-cell transcriptomes
2021-Jul, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.265595.120
PMID:34193535
|
研究论文 | 本文开发了一种基于贝叶斯推理的转录因子活性模型（BITFAM），用于分析单细胞转录组数据，并整合了ChIP-seq转录因子结合信息。 | BITFAM模型能够从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性，并结合现有的转录因子结合位点生物数据，为理解细胞功能和命运调控提供新视角。 | NA | 开发一种新的方法来推断单细胞转录组数据中的转录因子活性，并揭示其调控机制。 | 单细胞RNA测序数据中的转录因子活性及其调控机制。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），ChIP-seq | 贝叶斯推理模型 | 转录组数据 | NA |
| 23953 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: The triumphs and limitations of computational methods for scRNA-seq
2021-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01223-2
PMID:34194051
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23954 | 2024-08-08 |
A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-06-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02320-w
PMID:34193958
|
研究论文 | 本文介绍了一种优化用于酵母的单细胞转录组学平台yeastDrop-Seq，并使用该平台研究了霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞全局mRNA水平的影响 | 开发了针对酵母细胞优化的yeastDrop-Seq平台，解决了Drop-Seq技术在不同细胞大小和形态特征生物体应用中的挑战 | NA | 研究霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞转录组的影响 | 酵母细胞的转录组 | 生物技术 | NA | Drop-Seq | NA | 转录组数据 | 多个同源酵母细胞 |
| 23955 | 2024-08-08 |
The amniotic fluid cell-free transcriptome in spontaneous preterm labor
2021-06-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-92439-x
PMID:34188072
|
研究论文 | 研究分析了自发早产情况下羊水中的游离RNA转录组，并探讨其在预测自发早产中的价值 | 首次量化了羊水中游离RNA中的已知胎盘单细胞RNA-Seq特征，并应用随机森林模型预测羊水穿刺后的分娩时间 | NA | 探讨羊水中游离RNA在预测自发早产中的应用 | 自发早产情况下羊水中的游离RNA | NA | 早产 | RNA-Seq | 随机森林模型 | RNA | 共分析了38份羊水样本，其中10份来自24小时内分娩的妇女，28份来自24小时后分娩的妇女 |
| 23956 | 2024-08-08 |
NF-Y Subunits Overexpression in HNSCC
2021-Jun-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13123019
PMID:34208636
|
研究论文 | 研究报道了NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的过度表达情况 | 首次分析了TCGA和细胞系中的RNA-seq数据，并利用单细胞RNA-seq数据进行了肿瘤亚型的划分和生存曲线的推导 | NA | 探讨NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其对肿瘤生物学行为的影响 | NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌中的表达情况 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA-seq | NA | RNA序列 | 使用了TCGA数据库和头颈部鳞状细胞癌的细胞系数据 |
| 23957 | 2024-08-08 |
A Literature-Derived Knowledge Graph Augments the Interpretation of Single Cell RNA-seq Datasets
2021-06-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060898
PMID:34200671
|
研究论文 | 本文通过自然语言处理框架量化基因与细胞类型之间的关系，并开发了一种增强型注释算法来提高单细胞RNA测序数据集的注释和解释 | 首次展示了如何系统地应用文献衍生的知识图谱来加速和增强单细胞RNA测序数据的注释和解释 | NA | 开发一种新的方法来增强单细胞RNA测序数据集的注释和解释 | 人类蛋白质编码基因与细胞类型之间的关系，以及单细胞RNA测序数据集的细胞身份预测 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 文本 | 2600万篇生物医学文献，133个细胞集群 |
| 23958 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Transcriptomic Heterogeneity and Post-Traumatic Osteoarthritis-Associated Early Molecular Changes in Mouse Articular Chondrocytes
2021-06-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061462
PMID:34200880
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了健康和受伤小鼠膝关节软骨细胞的转录组异质性及其在创伤后骨关节炎早期分子变化 | 首次对关节软骨细胞进行单细胞分辨率的分子水平全面分析，并识别出九种具有不同分子特征的软骨细胞亚型 | 由于从密集的软骨细胞外基质中分离软骨细胞的技术难度，可能存在一定的技术限制 | 阐明不同软骨细胞亚型的分子和功能特征，以及这些亚型与其他关节细胞类型之间的相互作用，从而加深对关节生物学和骨关节炎病理学的理解 | 小鼠关节软骨细胞及其在创伤后的分子变化 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和受伤的小鼠膝关节软骨细胞 |
| 23959 | 2024-08-08 |
Diversity of Rainbow Trout Blood B Cells Revealed by Single Cell RNA Sequencing
2021-Jun-09, Biology
DOI:10.3390/biology10060511
PMID:34207643
|
研究论文 | 本研究利用10× Genomics单细胞RNA测序技术，首次在硬骨鱼中分析了外周血中单个B细胞的转录模式 | 首次在硬骨鱼中应用单细胞RNA测序技术分析B细胞的转录模式 | 研究主要集中在硬骨鱼中的彩虹鳟，尚未广泛应用于其他非模式生物 | 理解硬骨鱼B细胞的生物学特性并发现潜在的标记物 | 彩虹鳟的外周血B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数十至数千个单个细胞 |
| 23960 | 2024-08-08 |
Exploring Viral Diversity in a Gypsum Karst Lake Ecosystem Using Targeted Single-Cell Genomics
2021-06-08, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060886
PMID:34201311
|
研究论文 | 本研究利用靶向细胞分选结合单细胞测序技术，探索了石膏岩溶湖生态系统中感染绿色硫细菌的病毒的基因内容和基因组潜力 | 本研究发现大多数病毒基因和蛋白质序列与公共数据库中的噬菌体序列相似度很低或无相似性，揭示了先前未描述的绿色硫细菌病毒的巨大多样性 | NA | 研究石膏岩溶湖生态系统中绿色硫细菌病毒的多样性和分布 | 绿色硫细菌及其感染的病毒 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 62个单扩增基因组中鉴定出82个病毒连接体 |