单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 23921 - 23940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23921 | 2024-08-09 |
Alignment of single-cell RNA-seq samples without overcorrection using kernel density matching
2021-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.261115.120
PMID:33741686
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Dmatch的方法，利用人类初级细胞的外部表达图谱和核密度匹配来对齐多个单细胞RNA测序实验，以便进行下游生物学分析 | Dmatch方法在模拟中与其他对齐方法相比，在减少样本特定聚类和避免过度校正方面表现更优 | NA | 开发一种新的方法来对齐单细胞RNA测序数据，以消除批次效应并促进跨多个实验的整合和比较 | 单细胞RNA测序数据，特别是来自健康个体和自身免疫疾病患者的临床样本 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 核密度匹配 | 基因表达数据 | 来自健康个体和五名自身免疫疾病患者的样本 |
| 23922 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveal temporal dynamics of critical regulators of germ cell fate during mouse sex determination
2021-04, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202002420R
PMID:33749946
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠胚胎期9.0至16.5天的14,914个XX和XY生殖细胞的基因表达动态变化，揭示了性别决定过程中关键调控因子的时序动态 | 首次全面描述了小鼠性别决定过程中生殖细胞分化的基因表达动态，并识别了性别特异性的关键调控基因序列 | NA | 探究小鼠性别决定过程中生殖细胞分化的基因网络 | 小鼠胚胎期9.0至16.5天的XX和XY生殖细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 14,914个XX和XY小鼠生殖细胞 |
| 23923 | 2024-08-09 |
Epiregulin confers EGFR-TKI resistance via EGFR/ErbB2 heterodimer in non-small cell lung cancer
2021-04, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-021-01734-4
PMID:33750895
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研究论文 | 研究分析了七种EGFR配体对NSCLC细胞和患者EGFR-TKI敏感性的影响 | 发现Epiregulin通过诱导EGFR/ErbB2异二聚体形成，减少细胞对TKIs的敏感性，并揭示了肿瘤微环境中由巨噬细胞产生的Epiregulin作为EGFR-TKI治疗的新型调节因子和生物标志物 | 研究中Epiregulin在癌细胞中的过表达或敲低对TKI敏感性的影响较小 | 分析EGFR配体对NSCLC细胞EGFR-TKI敏感性的影响及其机制 | NSCLC细胞和患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫荧光实验 | NA | 基因表达数据 | 涉及NSCLC细胞和患者的数据 |
| 23924 | 2024-08-09 |
PPARγ marks splenic precursors of multiple nonlymphoid-tissue Treg compartments
2021-03-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2025197118
PMID:33753509
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研究论文 | 本文探讨了表达低水平转录因子PPARγ的脾脏Treg细胞作为多个非淋巴组织Treg细胞前体的发现及其功能 | 发现脾脏中表达低水平PPARγ的Treg细胞群是多个非淋巴组织Treg细胞的前体，这一发现为实验或治疗调控非淋巴组织Treg细胞的产生提供了可能 | NA | 研究脾脏Treg细胞在非淋巴组织中的前体作用及其转录异质性 | 脾脏Treg细胞及其在非淋巴组织中的前体作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23925 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of the Drosophila wing disc reveals instructive epithelium-to-myoblast interactions
2021-03-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.61276
PMID:33749594
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术，研究了果蝇翅盘发育过程中的上皮细胞与肌细胞前体之间的相互作用。 | 本文首次生成了翅盘的时序细胞图谱，并识别了介导上皮细胞与成年肌肉前体细胞信号传导的配体-受体对。 | NA | 探讨上皮细胞与肌细胞前体在果蝇翅盘发育中的相互作用。 | 果蝇翅盘的上皮细胞与肌细胞前体。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个发育时间点的翅盘样本 |
| 23926 | 2024-08-09 |
Hedgehog-induced PD-L1 on tumor-associated macrophages is critical for suppression of tumor-infiltrating CD8+ T cell function
2021-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.146707
PMID:33749663
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研究论文 | 本研究使用髓系特异性Pdl1敲除小鼠模型，证明了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）上PD-L1的表达对抑制肿瘤内CD8+ T细胞功能至关重要 | 首次报道了Sonic hedgehog（Shh）通过信号转导子和转录激活子3依赖的途径上调TAMs中PD-L1的表达，从而抑制肿瘤浸润CD8+ T细胞功能 | NA | 探讨肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞上PD-L1表达在抑制抗肿瘤免疫中的精确作用 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和肿瘤内CD8+ T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类肝细胞癌样本 |
| 23927 | 2024-08-09 |
The migratory pathways of the cells that form the endocardium, dorsal aortae, and head vasculature in the mouse embryo
2021-03-22, BMC developmental biology
DOI:10.1186/s12861-021-00239-3
PMID:33752600
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研究论文 | 本文研究了小鼠胚胎中形成心内膜、背主动脉和头部血管的细胞的迁移路径 | 利用新开发的成像技术和Tal1及Flk1报告小鼠系，直接观察并可视化了细胞的三维迁移轨迹 | NA | 探究小鼠胚胎中主要胚胎血管形成的细胞来源及其迁移路径 | 小鼠胚胎中的心内膜、背主动脉和头部血管的细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学和成像技术 | NA | 图像 | NA |
| 23928 | 2024-08-09 |
WASP: a versatile, web-accessible single cell RNA-Seq processing platform
2021-Mar-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07469-6
PMID:33736596
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研究论文 | 本文介绍了一种名为WASP的软件平台，用于处理基于Drop-Seq的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据 | WASP是目前唯一一个免费且结合了ddSEQ和10x数据预处理和后处理的软件包 | NA | 开发一个直观且易于使用的工具来处理和探索scRNA-seq数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达矩阵 | NA |
| 23929 | 2024-08-09 |
Noise regularization removes correlation artifacts in single-cell RNA-seq data preprocessing
2021-Mar-12, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2021.100211
PMID:33748795
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研究论文 | 本研究评估了五种代表性的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据标准化/插补方法对人类细胞图谱骨髓数据中基因-基因关联推断的影响，并提出了一种模型无关的噪声正则化方法来消除相关性伪影 | 提出了一种模型无关的噪声正则化方法，有效消除了数据预处理步骤中引入的虚假相关性 | NA | 评估scRNA-seq数据预处理方法对基因-基因关联推断的影响，并提出改进方法 | scRNA-seq数据预处理方法及其对基因-基因关联的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 模型无关 | 基因表达数据 | 人类细胞图谱骨髓数据 |
| 23930 | 2024-08-09 |
[Advances in research on the development of female germ cells]
2021-Mar-10, Zhonghua yi xue yi chuan xue za zhi = Zhonghua yixue yichuanxue zazhi = Chinese journal of medical genetics
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研究论文 | 本文主要研究女性生殖细胞发育的两个阶段：胎儿期生殖细胞和青春期后的卵泡发生中的卵母细胞，以及关键阶段如有丝分裂-减数分裂转换、减数分裂停滞和重新激活的分子事件。 | 近年来，单细胞转录组研究揭示了卵子发生和卵泡发生过程中基因表达、信号通路和表观遗传修饰的阶段特异性模式。 | NA | 探讨女性生殖细胞发育的关键阶段及其分子机制，为生殖遗传学研究的临床应用提供重要见解。 | 女性生殖细胞的发育过程及其分子事件。 | 生殖生物学 | 生殖细胞相关疾病 | 单细胞转录组 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23931 | 2024-08-09 |
JSOM: Jointly-evolving self-organizing maps for alignment of biological datasets and identification of related clusters
2021-03, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1008804
PMID:33724985
|
研究论文 | 本文提出了一种名为JSOM的算法，用于对齐生物数据集并识别相关集群 | JSOM算法是自组织映射的一种变体，通过构建两个低维离散化表示的数据集映射，使它们根据两个数据集共同演化，从而实现数据集的对齐 | NA | 开发一种计算方法，用于对齐不同的单细胞数据集，以便进行数据集成和解释 | 单细胞数据集，包括流式细胞术、质谱细胞术和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 自组织映射 | 自组织映射 | 单细胞数据 | NA |
| 23932 | 2024-08-09 |
SARS-CoV-2 Infection of Airway Epithelial Cells
2021-Feb, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2021.21.e3
PMID:33728096
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综述 | 本文综述了SARS-CoV-2感染气道上皮细胞的细胞进入、宿主-病毒相互作用及免疫反应 | NA | NA | 探讨SARS-CoV-2在气道上皮细胞中的感染机制及相关治疗选项 | SARS-CoV-2感染的气道上皮细胞 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | NA | NA |
| 23933 | 2024-08-09 |
Single Cell Transcriptomic Re-analysis of Immune Cells in Bronchoalveolar Lavage Fluids Reveals the Correlation of B Cell Characteristics and Disease Severity of Patients with SARS-CoV-2 Infection
2021-Feb, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2021.21.e10
PMID:33728103
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研究论文 | 本研究重新分析了来自COVID-19轻度和重度症状患者的支气管肺泡灌洗液中单细胞RNA测序数据，重点关注抗体产生细胞，揭示了B细胞特征与疾病严重程度的相关性 | 首次揭示了COVID-19患者中B细胞的激活状态与疾病严重程度的相关性，并发现重度患者中巨噬细胞表达更高水平的B细胞激活因子 | NA | 探究COVID-19患者中B细胞特征与疾病严重程度的关系 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自COVID-19轻度和重度症状患者的支气管肺泡灌洗液中的细胞 |
| 23934 | 2024-08-09 |
Lymphoma Heterogeneity Unraveled by Single-Cell Transcriptomics
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.597651
PMID:33732232
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序技术探讨了淋巴瘤的异质性及其在转化淋巴瘤研究中的应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了不同淋巴瘤实体生态系统的内在异质性，并讨论了其在精准医学中的潜在应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在淋巴瘤研究中的应用及其对精准医学的促进作用 | 淋巴瘤的异质性及其在转化研究中的应用 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 23935 | 2024-08-09 |
The Novel Key Genes of Non-obstructive Azoospermia Affect Spermatogenesis: Transcriptomic Analysis Based on RNA-Seq and scRNA-Seq Data
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.608629
PMID:33732283
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研究论文 | 本研究利用RNA-Seq和scRNA-Seq数据，通过转录组学分析，鉴定了非阻塞性无精症中影响精子发生的关键基因。 | 发现了三个与精子发生相关的新基因（C22orf23, TSACC, 和 TTC25），并分析了它们在不同精子细胞类型中的表达模式。 | NA | 旨在识别可能影响精子发生标志物的关键基因。 | 非阻塞性无精症（NOA）中的关键基因及其在精子发生中的作用。 | 数字病理学 | 男性不育症 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 430个差异表达基因 |
| 23936 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Identifies Key Genes in Brain Metastasis from Lung Adenocarcinoma
2021, Current gene therapy
IF:3.8Q2
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学方法，分析了肺腺癌脑转移中的关键基因 | 首次通过单细胞RNA测序分析识别出肺腺癌脑转移的关键基因 | 研究样本仅来自两名肺腺癌患者，可能影响结果的普遍性 | 识别肺腺癌脑转移的关键基因，以改善预后和治疗 | 肺腺癌脑转移中的关键基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两名肺腺癌患者的肿瘤细胞 |
| 23937 | 2024-08-09 |
Bioinformatics analysis of the gene expression profile of retinal pigmental epithelial cells based in single-cell RNA sequencing in myopic mice
2021, Archives of medical science : AMS
IF:3.0Q1
DOI:10.5114/aoms/131835
PMID:33747297
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23938 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome dissection of the toxic impact of Di (2-ethylhexyl) phthalate on primordial follicle assembly
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.55006
PMID:33754040
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯（DEHP）对小鼠原始卵泡组装的影响 | 首次揭示了DEHP暴露对小鼠原始卵泡形成过程中基因表达动态的影响，并通过生物化学实验验证了这些发现 | NA | 探讨DEHP对小鼠原始卵泡形成过程中的生殖毒性 | 小鼠卵巢细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23939 | 2024-08-09 |
Deciphering the autophagy regulatory network via single-cell transcriptome analysis reveals a requirement for autophagy homeostasis in spermatogenesis
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.55645
PMID:33754041
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示自噬调节网络在精子发生中的重要性 | 首次全面分析了人类精子发生过程中自噬相关基因的转录特征，并发现Cst3基因在调节精子干细胞维持和后续男性生殖细胞发育中的作用 | 研究样本量较小，且仅限于特定类型的生殖障碍患者 | 探讨自噬在人类精子发生中的作用及其与男性不育的关联 | 人类精子发生过程中的自噬相关基因 | 数字病理学 | 生殖障碍 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 9名生育控制样本（包括2名正常人和7名阻塞性无精子症患者）和1名非阻塞性无精子症患者 |
| 23940 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing for engineering and studying human islets
2020-Dec, Current opinion in biomedical engineering
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.cobme.2020.06.003
PMID:33738370
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了人胰岛细胞在不同成熟和糖尿病状态下的转录特征 | 利用单细胞RNA测序技术，能够准确评估特定细胞类型和β细胞亚型，揭示胰岛发育和糖尿病病理的深入见解 | NA | 探讨胰岛细胞的成熟过程及其在糖尿病病理中的作用 | 干细胞衍生的和原代人胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及不同成熟和糖尿病状态的干细胞衍生的和原代人胰岛细胞 |