单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27986 篇文献，本页显示第 23901 - 23920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23901 | 2024-08-08 |
The Epithelial to Mesenchymal Transition Related Gene Calumenin Is an Adverse Prognostic Factor of Bladder Cancer Correlated With Tumor Microenvironment Remodeling, Gene Mutation, and Ferroptosis
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.683951
PMID:34150647
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研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析，探讨了膀胱癌中与上皮间质转化相关的基因calumenin（CALU）的作用及其分子机制 | 首次揭示了CALU在膀胱癌中的独立风险因子作用，及其与肿瘤微环境重塑、基因突变和铁死亡的关联 | 研究主要基于生物信息学分析和实验室验证，未来需更多临床试验验证CALU在膀胱癌治疗中的实际应用 | 探讨CALU在膀胱癌中的作用及其对患者预后的影响 | 膀胱癌患者样本及CALU基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 多组学生物信息学分析、单细胞RNA测序、PCR和免疫组织化学 | NA | 基因表达数据 | 408名TCGA膀胱癌患者 |
| 23902 | 2024-08-08 |
S100A9 Derived From Myeloma Associated Myeloid Cells Promotes TNFSF13B/TNFRSF13B-Dependent Proliferation and Survival of Myeloma Cells
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.691705
PMID:34150664
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研究论文 | 研究探讨了多发性骨髓瘤（MM）中髓系细胞来源的S100A9如何通过TNFSF13B/TNFRSF13B依赖性途径促进骨髓瘤细胞的增殖和生存 | 揭示了髓系细胞通过S100A9促进骨髓瘤细胞增殖和生存的新机制 | NA | 探究髓系细胞在多发性骨髓瘤中的作用机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓细胞及髓系细胞 | NA | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA | 来自多发性骨髓瘤患者的样本 |
| 23903 | 2024-08-08 |
TBX20 Contributes to Balancing the Differentiation of Perivascular Adipose-Derived Stem Cells to Vascular Lineages and Neointimal Hyperplasia
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.662704
PMID:34150759
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研究论文 | 本研究探讨了周围血管脂肪源性干细胞（PVASCs）向平滑肌细胞（SMCs）和内皮细胞（ECs）分化的机制及其在新生内膜增生中的功能 | 发现TBX20在PVASCs中的独特表达，并揭示了TBX20在调控PVASCs向SMCs和ECs分化中的作用 | NA | 研究PVASC分化为SMCs和ECs的机制及其在新生内膜增生中的功能 | 周围血管脂肪源性干细胞（PVASCs） | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序、批量mRNA测序、免疫荧光、定量实时PCR（QPCR）、Western blot | NA | mRNA | NA |
| 23904 | 2024-08-08 |
Exposure to Copper Compromises the Maturational Competency of Porcine Oocytes by Impairing Mitochondrial Function
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.678665
PMID:34150773
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研究论文 | 研究了过量铜对猪卵母细胞成熟和细胞器功能的影响 | 首次探讨了过量铜对母猪生殖性能的影响，并揭示了其对卵母细胞成熟和线粒体功能的损害机制 | NA | 探讨过量铜对猪卵母细胞成熟和细胞器功能的影响 | 猪卵母细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA |
| 23905 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analyses of cardiac immune cells reveal that Rel-driven CD72-positive macrophages induce cardiomyocyte injury
2022-03-25, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab193
PMID:34100920
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了心脏免疫细胞的异质性，特别是识别出与心脏损伤相关的CD72阳性巨噬细胞。 | 首次揭示了Rel驱动的CD72阳性巨噬细胞在心脏损伤中的作用，并提出了这些细胞可能作为多种心血管疾病治疗的新靶点。 | 研究主要基于小鼠模型，尚需在人类中进行进一步验证。 | 研究心脏巨噬细胞的异质性及其在心脏损伤中的作用。 | 心脏巨噬细胞及其在心脏损伤中的作用。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人类心脏组织样本 |
| 23906 | 2024-08-08 |
TIPD: A Probability Distribution-Based Method for Trajectory Inference from Single-Cell RNA-Seq Data
2021-Dec, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00445-4
PMID:34109565
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研究论文 | 本文提出了一种基于概率分布的单细胞RNA测序数据轨迹推断方法TIPD | TIPD方法结合信号熵和基因表达谱的聚类结果来描述细胞群体的异质性概率分布，无需外部知识即可确定分化轨迹的方向 | NA | 开发一种新的轨迹推断方法，以更准确地描述细胞分化和发育过程中的生物异质性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 最小生成树（MST） | 基因表达数据 | 四个已发表的单细胞RNA测序数据集 |
| 23907 | 2024-08-08 |
Single-cell immune checkpoint landscape of PBMCs stimulated with Candida albicans
2021-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2021.1942228
PMID:34120578
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研究论文 | 本研究重新分析了单细胞RNA测序数据，探讨了在白色念珠菌感染后外周血单个核细胞中免疫检查点的表达模式 | 首次详细描述了在真菌感染中不同免疫细胞亚群的免疫检查点活动异质性 | NA | 探索在真菌感染后免疫检查点的表达模式及其在治疗中的潜在应用 | 外周血单个核细胞在白色念珠菌刺激后的免疫检查点表达 | 免疫学 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 23908 | 2024-08-08 |
DevOmics: an integrated multi-omics database of human and mouse early embryo
2021-11-05, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab208
PMID:34097004
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研究论文 | 介绍了一个名为DevOmics的综合多组学数据库，该数据库整合了人类和小鼠早期胚胎的基因表达、DNA甲基化、组蛋白修饰等多种数据 | DevOmics提供了统一的数据分析流程和用户友好的界面，便于生物学家和临床医生解析人类和小鼠早期胚胎的分子调控机制 | NA | 建立一个整合人类和小鼠早期胚胎调控信息的数据库，以促进辅助生殖技术和植入前遗传测试的研究 | 人类和小鼠早期胚胎的基因表达、DNA甲基化、组蛋白修饰等 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 基因表达、DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性和3D染色质结构 | 涵盖六个发育阶段的人类和小鼠早期胚胎样本 |
| 23909 | 2024-08-08 |
MET Amplification Attenuates Lung Tumor Response to Immunotherapy by Inhibiting STING
2021-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-1500
PMID:34099454
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研究论文 | 研究探讨了MET基因扩增如何通过抑制STING影响肺癌患者对免疫检查点阻断疗法的反应 | 首次揭示了MET信号通过磷酸化UPF1并调节STING的3'-UTR长度来下调STING表达，从而影响免疫疗法效果的机制 | 研究样本仅限于81名肺癌患者，可能需要更大规模的研究来验证结果 | 探究MET扩增对肺癌免疫疗法反应的影响及其机制 | 肺癌患者及其免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 81名肺癌患者，超过20,000个单个免疫细胞 |
| 23910 | 2024-08-08 |
Interleukin-10 and Transforming Growth Factor-β Cytokines Decrease Immune Activation During Normothermic Ex Vivo Machine Perfusion of the Rat Liver
2021-11, Liver transplantation : official publication of the American Association for the Study of Liver Diseases and the International Liver Transplantation Society
IF:4.7Q1
DOI:10.1002/lt.26206
PMID:34118129
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研究论文 | 研究了在常温离体机器灌注条件下，白细胞介素10（IL10）和转化生长因子β（TGF-β）对大鼠肝脏免疫细胞活化的影响 | 首次证明肝脏常驻免疫细胞在常温离体肝脏灌注期间获得激活表型，并可通过IL10和TGF-β的治疗干预减少这种激活 | 研究未观察到IL10和TGF-β处理对炎症细胞因子产生的变化 | 探讨常温离体肝脏灌注对肝脏常驻免疫细胞活化的影响及抗炎细胞因子改善器官功能和减少免疫激活的能力 | 大鼠肝脏的免疫细胞活化及器官功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验 | NA | 基因表达、细胞表面标记、细胞因子 | 实验组7只大鼠肝脏，对照组4只 |
| 23911 | 2024-08-08 |
Potentials of single-cell genomics in deciphering cellular phenotypes
2021-10, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102059
PMID:34116424
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学，特别是通过RNA测序的单细胞转录组分析，在解析细胞表型方面的潜力 | 单细胞基因组学使我们能够观察每个细胞转录组的变化及其邻域，询问转录事件的序列，并评估它们对后续事件的影响，从而在生物学中实现范式转变 | 需要进一步研究和发展计算方法等领域的技术 | 探讨单细胞基因组学在解析细胞表型方面的应用 | 植物细胞的表型及其转录组过程 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 23912 | 2024-08-08 |
Nkx2-2 expressing taste cells in endoderm-derived taste papillae are committed to the type III lineage
2021-09, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2021.05.020
PMID:34097879
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，发现转录因子Nkx2-2在哺乳动物味觉细胞中的表达情况，并探讨其在味觉细胞发育和再生中的作用 | 首次揭示Nkx2-2在味觉细胞中的特异性表达及其对类型III味觉细胞发育的关键作用 | NA | 探讨转录因子Nkx2-2在味觉细胞发育和再生中的作用及其对不同类型味觉细胞的影响 | 小鼠的味觉细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23913 | 2024-08-08 |
Progress in cardiac research: from rebooting cardiac regeneration to a complete cell atlas of the heart
2021-08-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab200
PMID:34114614
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综述 | 本文回顾了2020年在基础和转化心脏病学研究中的一些重要发现和进展 | 介绍了新的研究方法，如糖萼模拟物和3D生物打印技术，以及单细胞测序技术在心脏细胞异质性研究中的应用 | NA | 回顾和总结心脏病学领域的最新研究进展 | 心脏病学中的心肌梗死、细胞间通讯、干细胞分化、线粒体功能和癌症治疗诱导的心脏毒性等 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 23914 | 2024-08-08 |
Network biology to uncover functional and structural properties of the plant immune system
2021-08, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102057
PMID:34102601
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综述 | 本文综述了网络科学在植物免疫系统功能和结构特性发现中的应用 | 探讨了单细胞测序和多组学数据整合在揭示植物免疫系统复杂性中的新前沿 | NA | 旨在通过网络分析和多维数据整合全面理解植物-病原体相互作用 | 植物免疫系统的功能和结构特性 | 生物信息学 | NA | 网络科学 | 动态网络模型 | 多组学数据 | NA |
| 23915 | 2024-08-08 |
SC1: A Tool for Interactive Web-Based Single-Cell RNA-Seq Data Analysis
2021-08, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0051
PMID:34115950
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research paper | 本文介绍了一种基于网络的高度交互式单细胞RNA测序（scRNA-Seq）数据分析工具SC1 | 该工具实现了一种基于词频逆文档频率得分的新方法来选择信息基因，并提供了一系列的聚类、差异表达分析、基因富集、交互式可视化和细胞周期分析方法 | NA | 开发一种交互式的网络工具，用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA |
| 23916 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of the Pan-Cancer Immune Microenvironment and scTIME Portal
2021-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-20-1026
PMID:34117085
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术构建了泛癌症免疫微环境（TIME）的单细胞参考图谱，并开发了scTIME门户网站，用于分析和展示TIME的特征及其在免疫治疗中的潜在机制 | 首次进行了泛癌症的单细胞免疫微环境分析，识别了新的细胞类型特异性转录因子，并开发了scTIME门户网站，提供特定的分析模块和统一的细胞注释 | NA | 研究泛癌症免疫微环境的特征及其在免疫治疗中的分子和细胞机制 | 泛癌症免疫微环境中的细胞类型、细胞状态和细胞间通信 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 涉及多种肿瘤类型的患者样本 |
| 23917 | 2024-08-08 |
LncRNA PCBP1-AS1 correlated with the functional states of cancer cells and inhibited lung adenocarcinoma metastasis by suppressing the EMT progression
2021-07-16, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgab047
PMID:34107009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别与肺腺癌功能状态相关的长非编码RNA，并探讨其在肺腺癌转移中的作用 | 首次发现长非编码RNA PCBP1-AS1通过抑制上皮-间质转化过程抑制肺腺癌转移 | NA | 探讨长非编码RNA在肺腺癌功能状态及转移中的作用 | 长非编码RNA PCBP1-AS1及其在肺腺癌中的功能 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共识别出849个长非编码RNA，其中11个与肺腺癌预后显著相关 |
| 23918 | 2024-08-08 |
Comprehensive aptamer-based screen of 1317 proteins uncovers improved stool protein markers of colorectal cancer
2021-07, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-021-01795-y
PMID:34117903
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研究论文 | 本文通过基于适配体的1317种蛋白质筛选，发现并验证了新的结直肠癌粪便蛋白质标志物。 | 首次使用基于适配体的蛋白质筛选方法，发现并验证了结直肠癌的新型粪便蛋白质标志物。 | 需要纵向研究来评估这些新型标志物在早期诊断结直肠癌中的临床效用。 | 筛选和验证结直肠癌的新型粪便蛋白质标志物。 | 结直肠癌患者的粪便蛋白质标志物。 | NA | 结直肠癌 | 基于适配体的蛋白质筛选，ELISA验证，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质数据，单细胞RNA-seq数据 | 发现队列中包括结直肠癌患者和健康对照，验证队列包括76名结直肠癌患者，15名腺瘤患者和63名健康对照。 |
| 23919 | 2024-08-08 |
Single-cell analyses of renal cell cancers reveal insights into tumor microenvironment, cell of origin, and therapy response
2021-06-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2103240118
PMID:34099557
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肾细胞癌，揭示了肿瘤微环境、细胞起源及治疗反应的相关信息 | 首次通过单细胞RNA测序构建了良性和恶性肾细胞图谱，并预测了多种肾细胞癌亚型的潜在细胞起源 | NA | 阐明不同肾细胞癌亚型的细胞起源及其在肿瘤微环境和治疗反应中的作用 | 肾细胞癌及其亚型 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林模型 | RNA | 超过10种肾细胞癌亚型 |
| 23920 | 2024-08-08 |
Applications of single-cell sequencing in cancer research: progress and perspectives
2021-06-09, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-021-01105-2
PMID:34108022
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在癌症研究中的应用进展和前景 | 单细胞测序技术能够解析单个细胞层面的细胞和分子景观，与提供平均数据的批量测序不同 | NA | 总结单细胞测序技术及其在癌症研究中的最新进展 | 恶性细胞、免疫细胞的景观、肿瘤异质性、循环肿瘤细胞及肿瘤生物行为的潜在机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组学、转录组学、表观基因组学、蛋白质组学和代谢组学数据 | NA |