单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
23901 2024-08-09
CXCL11 Correlates With Antitumor Immunity and an Improved Prognosis in Colon Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究评估了CXCL11在结直肠癌(CRC)中的预后价值及其潜在机制 发现CXCL11在结直肠癌中表达上调与更好的预后相关,并能促进抗肿瘤免疫 研究仅初步评估了CXCL11的预后价值和机制,需要进一步深入研究 探讨CXCL11在结直肠癌中的生物学作用及其预后价值 CXCL11在结直肠癌中的表达及其对患者预后的影响 数字病理学 结直肠癌 mRNA相关分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 NA mRNA、单细胞RNA测序数据、免疫组织化学数据 TCGA数据集451例,GEO单细胞RNA测序数据集GSE146771和GSE132465,Yijishan医院队列108例
23902 2024-08-09
Isolation and characterization of human embryonic stem cell-derived heart field-specific cardiomyocytes unravels new insights into their transcriptional and electrophysiological profiles
2022-02-21, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本文通过使用双报告基因线从人类胚胎干细胞中分离和表征第一和第二心场及节点样心肌细胞,揭示了它们转录和电生理特征的新见解 本文解决了从诱导多能干细胞生成心场特异性心肌细胞的先前工作的不足,并提供了这些三个人群的早期发育转录组和电生理的综合分析 NA 旨在分离和表征人类胚胎干细胞衍生的心场特异性和节点样心肌细胞,以提高基因表达分析的分辨率,并促进针对特定心脏区域疾病的干细胞治疗的发展 人类胚胎干细胞衍生的第一和第二心场及节点样心肌细胞 干细胞 先天性心脏病 RNA测序 NA RNA 多个心肌细胞亚群
23903 2024-08-09
Combining bulk and single-cell RNA-sequencing data to reveal gene expression pattern of chondrocytes in the osteoarthritic knee
2021-12, Bioengineered IF:4.2Q2
研究论文 本文结合批量和单细胞RNA测序数据,揭示了骨关节炎膝关节软骨细胞的基因表达模式 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据,发现了271个在两种数据类型中同时提示的基因,并识别了14个转录因子和8个长非编码RNA,这些可能与骨关节炎的疼痛和血管化有关 NA 旨在通过分析批量和单细胞RNA测序数据,更全面地理解骨关节炎 骨关节炎膝关节软骨细胞的基因表达模式 数字病理学 骨关节炎 RNA测序 NA RNA测序数据 使用了GSE114007和GSE104782两个数据集
23904 2024-08-09
Mixed Distribution Models Based on Single-Cell RNA Sequencing Data
2021-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 本文分析了结直肠癌(CRC)的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,构建了混合稳定-正态分布(MSND)模型和混合稳定-指数分布(MSED)模型来拟合基因表达差异(GED)数据,并通过比较均方根误差和卡方拟合优度检验,发现MSED和MSND的拟合效果优于稳定分布和柯西分布 提出了混合稳定-正态分布(MSND)模型和混合稳定-指数分布(MSED)模型来拟合基因表达差异数据,并能有效识别与肿瘤高度相关的基因 NA 研究基因表达差异数据的分布规律,并识别与肿瘤高度相关的基因 结直肠癌(CRC)的单细胞RNA测序数据 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 混合稳定-正态分布(MSND)模型和混合稳定-指数分布(MSED)模型 基因表达差异数据 NA
23905 2024-08-09
Single-cell RNA sequencing: A new opportunity for retinal research
2021-09, Wiley interdisciplinary reviews. RNA
研究论文 本文探讨了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在视网膜研究中的应用 scRNA-seq技术能够深入分析多种视网膜细胞类型的基因表达特征,揭示细胞异质性 NA 研究视网膜细胞异质性,以更好地理解视网膜疾病 视网膜细胞及其在疾病和发育中的作用 数字病理学 视网膜疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA NA
23906 2024-08-09
Exploring the human lacrimal gland using organoids and single-cell sequencing
2021-07-01, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文描述了使用3D器官培养条件和单细胞测序技术探索人类泪腺的研究 建立了长期3D器官培养条件,并使用CRISPR-Cas9介导的基因编辑揭示了泪腺细胞分化的主要调控因子 NA 研究泪腺的(病)生理学 人类和鼠类的泪腺 NA NA 单细胞测序 CRISPR-Cas9 器官 NA
23907 2024-08-09
Advances and Opportunities in Single-Cell Transcriptomics for Plant Research
2021-06-17, Annual review of plant biology IF:21.3Q1
综述 本文综述了近年来植物单细胞转录组学的主要进展,并提供了一个从样本准备到数据分析的全面指南 介绍了单细胞转录组学在植物生物学领域的最新技术和应用 NA 探讨单细胞转录组学如何影响和加速植物特定研究 植物生物学中的单细胞转录组学技术 NA NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
23908 2024-08-09
Mouse multipotent progenitor 5 cells are located at the interphase between hematopoietic stem and progenitor cells
2021-06-10, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过表型定义和功能特征化MPP5细胞,并使用RNA测序分析来全面分析LSK细胞室,重点关注新定义的MPP5亚群的功能和分子特性 首次定义和功能特征化MPP5细胞,并展示了其在造血干细胞和多能祖细胞网络中的动态和多功能性 NA 研究造血干细胞和多能祖细胞的特性和功能 MPP5细胞及其在造血干细胞和多能祖细胞网络中的作用 NA NA RNA测序 NA RNA LSK细胞
23909 2024-08-09
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Paracrine Functions of the Epicardial-Derived Cells in Arrhythmogenic Cardiomyopathy
2021-06, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了心外膜来源细胞在心律失常性心肌病中的旁分泌功能 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了心外膜来源细胞在心律失常性心肌病中的旁分泌作用,特别是TGFβ1和成纤维细胞生长因子的表达 研究仅在特定的小鼠模型中进行,结果的普遍性和临床相关性需要进一步验证 探讨心外膜在心律失常性心肌病发病机制中的作用 心外膜来源细胞及其在心律失常性心肌病中的功能 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 约18,000个增强绿色荧光蛋白标记的心外膜来源细胞
23910 2024-08-09
TCF7 is not essential for glucose homeostasis in mice
2021-06, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 本研究探讨了转录因子TCF7在小鼠肝细胞和胰岛β细胞中的表达对葡萄糖稳态的相对代谢重要性 发现TCF7表达并非小鼠葡萄糖稳态的关键决定因素,且胰岛中TCF7的表达主要来自与胰岛相关的免疫细胞而非β细胞 NA 研究TCF7在肝细胞和胰岛β细胞中的表达对小鼠葡萄糖稳态的影响 小鼠的肝细胞和胰岛β细胞 NA 糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 使用不同饮食的小鼠进行实验,包括常规饮食和高脂饮食的小鼠
23911 2024-08-09
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular Origin and Evolution of Breast Cancer in BRCA1 Mutation Carriers
2021-05-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源,特别是雌激素受体阳性乳腺癌的起源 研究样本量相对较小,可能需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 探究BRCA1突变携带者中乳腺癌的细胞起源和发展 BRCA1突变携带者的乳腺癌组织及其邻近或预防性正常乳腺组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 82,122个细胞,来自4名BRCA1突变携带者和3名非携带者
23912 2024-08-09
Ex utero mouse embryogenesis from pre-gastrulation to late organogenesis
2021-05, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文介绍了一种高效的体外培养系统,用于从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的鼠胚胎发育 该系统能够精确模拟体内发育过程,并适用于引入各种胚胎扰动和微操作 NA 研究胚胎发育过程,特别是后植入期的形态发生和人工胚胎发生 鼠胚胎从原肠胚形成前到晚期器官发生阶段的发育过程 NA NA 三维旋转瓶培养技术,单细胞RNA测序 NA NA NA
23913 2024-08-09
Angiodiversity and organotypic functions of sinusoidal endothelial cells
2021-05, Angiogenesis IF:9.2Q1
综述 本文综述了血管多样性及器官特异性功能在肝窦内皮细胞(LSEC)中的表现 近年来,通过细胞分离和批量转录组学或单细胞RNA测序技术,识别了LSEC的分子程序和亚群,并发现了LSEC衍生的血管内分泌信号在肝脏稳态和疾病发病机制中的重要作用 NA 总结近年来对肝脏血管多样性的理解及其功能后果 肝窦内皮细胞(LSEC)及其在肝脏中的功能 NA NA 电子显微镜、细胞分离技术、批量转录组学、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA
23914 2024-08-09
Single-cell mRNA profiling reveals changes in solute carrier expression and suggests a metabolic switch during zebrafish pronephros development
2021-05-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了斑马鱼前肾在发育过程中溶质载体表达的变化,揭示了代谢转换的机制 首次揭示了斑马鱼胚胎肾脏在发育过程中葡萄糖转运能力的变化,以及后期对单羧酸和氨基酸转运能力的增强 NA 探究斑马鱼前肾在发育过程中如何响应过滤底物和内在能量需求的变化 斑马鱼前肾的溶质载体表达 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA 斑马鱼前肾的细胞
23915 2024-08-09
A single-cell survey of the human glomerulonephritis
2021-05, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)分析了人类肾小球肾炎的细胞基因表达谱 首次定义了肾小球肾炎的足细胞标记物,并在细胞水平上发现了IgA、膜性肾病和狼疮性肾炎的特异性标记物 研究样本数量有限,可能影响结果的普遍性 揭示肾小球肾炎的细胞基因表达谱,以更好地理解其病理过程 人类肾移植供体样本、肾小球肾炎样本、恶性高血压样本和慢性间质性肾炎样本 数字病理学 肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 共分析了8个样本,包括2个肾移植供体样本、4个肾小球肾炎样本、1个恶性高血压样本和1个慢性间质性肾炎样本
23916 2024-08-09
Correction for New perspectives of the cardiac cellular landscape: mapping cellular mediators of cardiac fibrosis using single-cell transcriptomics
2021-04-30, Biochemical Society transactions IF:3.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
23917 2024-08-09
Obesity results in adipose tissue T cell exhaustion
2021-04-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 研究探讨了肥胖如何影响脂肪组织T细胞的功能,发现肥胖的脂肪组织T细胞表现出炎症特性受损和T细胞耗竭的特征。 首次揭示了肥胖脂肪组织T细胞的功能特异性,以及肥胖通过环境因素和细胞内在因素导致T细胞功能障碍的机制。 研究主要集中在小鼠和人类样本上,可能需要进一步的临床研究来验证这些发现。 旨在理解肥胖如何影响适应性免疫系统,特别是脂肪组织T细胞的功能。 研究对象包括小鼠和人类的脂肪组织T细胞及其在肥胖状态下的功能变化。 NA 肥胖 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 包括小鼠和人类的脂肪组织样本
23918 2024-08-09
A single-cell analysis of the Arabidopsis vegetative shoot apex
2021-04-05, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文利用单细胞RNA测序技术,对拟南芥营养茎顶端进行了转录组水平的细胞分类学分析 本文首次在单细胞分辨率下定义了拟南芥营养茎顶端的细胞分类学,并揭示了表皮细胞、维管组织和叶肉细胞的细胞周期连续性和发育轨迹 NA 研究植物细胞分裂和分化的基本原理 拟南芥营养茎顶端的细胞 植物学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 7个广泛细胞群体和23个转录上不同的细胞集群
23919 2024-08-09
The AIM2 inflammasome exacerbates atherosclerosis in clonal haematopoiesis
2021-04, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文研究了AIM2炎症小体在克隆性造血引起的动脉粥样硬化中的作用 首次揭示了AIM2炎症小体在JAK2突变导致的动脉粥样硬化中的作用,并提出针对特定炎症小体和白细胞介素-1β的治疗策略 NA 探讨AIM2炎症小体在克隆性造血相关动脉粥样硬化中的作用及其机制 小鼠模型中的动脉粥样硬化病变 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型
23920 2024-08-09
B cell-specific XIST complex enforces X-inactivation and restrains atypical B cells
2021-04-01, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文研究了长链非编码RNA XIST在成人B细胞中维持X染色体失活的作用,并揭示了其在特定B细胞类型中的功能和调节机制。 发现了XIST在成人B细胞中持续需要以沉默某些X连锁免疫基因,如TLR7,并揭示了XIST依赖的基因缺乏启动子DNA甲基化,需要持续的XIST依赖的组蛋白去乙酰化。 NA 探讨XIST在成人B细胞中的持续作用及其在特定细胞类型中的功能和调节机制。 长链非编码RNA XIST及其在B细胞中的作用。 NA NA 单细胞转录组测序,CRISPRi筛选 NA 转录组数据 女性系统性红斑狼疮或COVID-19感染患者的单细胞转录组数据
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