单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 23881 - 23900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23881 | 2024-08-08 |
Epigenetics in the Pathogenesis and Treatment of Cutaneous T-Cell Lymphoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.663961
PMID:34249700
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综述 | 本文综述了表观遗传学在皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）的发病机制和治疗中的最新发现 | 揭示了CTCL恶性T细胞的异质性，并描述了HDACi耐药机制，促进了新HDACi靶点的发现 | CTCL疾病的异质性和发病机制仍不明确 | 探讨表观遗传学在CTCL病理作用和治疗中的具体作用 | 皮肤T细胞淋巴瘤及其表观遗传学机制 | NA | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞测序 | NA | 组织和外周血 | NA |
| 23882 | 2024-08-08 |
Identification of Gene Regulatory Networks from Single-Cell Expression Data
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1534-8_9
PMID:34251624
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研究论文 | 本文描述了一种多步骤计算流程，用于整合单细胞RNA测序数据与DAP-seq和ATAC-seq数据，以预测基因调控网络和关键调控基因 | 利用机器学习方法包括特征选择和稳定性选择来识别候选调控基因，并生成基因调控网络 | NA | 预测植物中的基因调控网络和关键调控基因 | 单细胞RNA测序数据、DAP-seq和ATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、DAP-seq、ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23883 | 2024-08-08 |
Inference of Gene Regulatory Network from Single-Cell Transcriptomic Data Using pySCENIC
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1534-8_10
PMID:34251625
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研究论文 | 本文介绍了基于单细胞转录组数据推断基因调控网络的快速Python实现方法pySCENIC | 提出了pySCENIC这一快速且高效的基因调控网络推断工具，集成了GRNBoost2和GENIE3两种算法 | NA | 旨在利用单细胞RNA测序数据推断细胞特异性的基因调控网络 | 单细胞转录组数据中的基因及其调控因子——转录因子 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 23884 | 2024-08-08 |
Single Cell Gene Transcriptome Analysis of Ovarian Mature Teratomas
2021, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2021.604228
PMID:34257564
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了卵巢成熟畸胎瘤的基因转录组 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究卵巢成熟畸胎瘤的基因表达谱 | 研究样本数量较少，仅分析了两个卵巢成熟畸胎瘤样本 | 探讨卵巢成熟畸胎瘤组织与正常组织在基因表达上的相似性或差异性 | 卵巢成熟畸胎瘤的基因转录组 | 数字病理学 | 卵巢肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因转录组数据 | 两个卵巢成熟畸胎瘤样本 |
| 23885 | 2024-08-08 |
Complement C7 is Specifically Expressed in Mesangial Cells and is a Potential Diagnostic Biomarker for Diabetic Nephropathy and is Regulated by miR-494-3p and miR-574-5p
2021, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S311725
PMID:34262312
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和验证，探索糖尿病肾病的关键调控通路和潜在生物标志物 | 首次揭示C7在系膜细胞中特异性表达，是糖尿病肾病的潜在诊断生物标志物，并受miR-494-3p和miR-574-5p调控 | NA | 探索糖尿病肾病的关键调控通路和潜在生物标志物 | 糖尿病肾病的关键调控通路和潜在生物标志物 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），基因本体（GO）注释，基因集富集分析（GSEA），京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用GSE30528和GSE96804数据集的微阵列数据 |
| 23886 | 2024-08-08 |
Visualization and Analysis of Gene Expression in Stanford Type A Aortic Dissection Tissue Section by Spatial Transcriptomics
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.698124
PMID:34262602
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研究论文 | 本文通过空间转录组学技术，对斯坦福A型主动脉夹层组织切片中的基因表达进行了可视化和分析 | 开发了一种针对低细胞和高纤维斯坦福A型主动脉夹层的分子方法，并初步探索和可视化了升主动脉类型的异质性及细胞类型特异性基因表达 | NA | 旨在通过空间转录组学技术深入理解斯坦福A型主动脉夹层的病理发生和异质性 | 斯坦福A型主动脉夹层患者的主动脉样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 15名斯坦福A型主动脉夹层患者和1例升主动脉样本 |
| 23887 | 2024-08-08 |
Specific Transcriptomic Signatures and Dual Regulation of Steroidogenesis Between Fetal and Adult Mouse Leydig Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.695546
PMID:34262907
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研究论文 | 本研究通过bulk RNA测序和单细胞RNA测序，比较了胎鼠和成年鼠莱迪细胞的转录组特征，揭示了两者在类固醇生成方面的双重调控机制 | 首次揭示了胎鼠和成年鼠莱迪细胞在类固醇生成方面的双重调控机制，并识别了特定的基因表达模式 | NA | 研究胎鼠和成年鼠莱迪细胞的转录组特征及其在类固醇生成方面的调控机制 | 胎鼠和成年鼠莱迪细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23888 | 2024-08-08 |
Aneuploidy: An Opportunity Within Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2021, Biocell : official journal of the Sociedades Latinoamericanas de Microscopia Electronica ... et. al
IF:0.8Q4
PMID:34267416
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析中染色体非整倍体（aneuploidy）的生物信息学应用 | 提出在scRNA-seq数据分析中利用生物信息学管道推断染色体非整倍体，特别是在肿瘤学领域 | NA | 提高各领域对所研究疾病理解的能力 | 单细胞RNA测序数据中的染色体非整倍体 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因计数表 | 数百个基因 |
| 23889 | 2024-08-08 |
Similarity and Dissimilarity Regularized Nonnegative Matrix Factorization for Single-Cell RNA-seq Analysis
2022-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00457-0
PMID:34231183
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研究论文 | 本文提出了一种新的聚类方法——相似性与相异性正则化的非负矩阵分解（SDCNMF），用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | SDCNMF方法同时施加相似性和相异性约束于低维表示，既能保持相似细胞在低维空间中更接近，也能将不相似的细胞彼此推开 | NA | 探索单细胞RNA测序数据中的细胞异质性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 五个scRNA-seq数据集 |
| 23890 | 2024-08-08 |
An active learning approach for clustering single-cell RNA-seq data
2022-03, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1038/s41374-021-00639-w
PMID:34244616
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据聚类的主动学习框架 | 该框架采用主动学习算法，能够主动向生物学家查询标签，并仅对部分细胞进行手动标记，从而提高聚类的生物学解释性 | NA | 解决现有单细胞RNA测序数据聚类方法中生物学解释性差的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 主动学习模型 | 数据 | 四个真实单细胞RNA测序数据集，每个数据集少于1000个标记细胞 |
| 23891 | 2024-08-08 |
Extrafollicular PD-1highCXCR5-CD4+ T cells participate in local immunoglobulin production in nasal polyps
2022-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2021.06.023
PMID:34224786
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研究论文 | 本文研究了鼻息肉中非滤泡外的PD-1高表达CXCR5阴性CD4+ T细胞在局部免疫球蛋白产生中的作用 | 发现PD-1高表达CXCR5阴性CD4+ T细胞在鼻息肉中具有独特的表型，与B细胞帮助和组织定居相关，且不同于鼻息肉中的其他CD4+ T细胞亚群 | NA | 旨在识别鼻息肉中独立于异位淋巴组织（eLTs）的局部免疫球蛋白产生相关的T细胞亚群 | 鼻息肉中的CD4+ T细胞亚群及其在局部免疫球蛋白产生中的作用 | 免疫学 | 鼻息肉 | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 鼻息肉组织样本 |
| 23892 | 2024-08-08 |
A novel patient stratification strategy to enhance the therapeutic efficacy of dasatinib in glioblastoma
2022-01-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noab158
PMID:34232320
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研究论文 | 本文研究了一种新的患者分层策略，以提高达沙替尼在胶质母细胞瘤治疗中的疗效 | 提出了一种基于基因表达分型的患者分层策略，以优化达沙替尼在胶质母细胞瘤治疗中的应用 | NA | 探讨不同亚型胶质母细胞瘤对达沙替尼的反应差异，并提出临床试验中的患者富集策略 | 胶质母细胞瘤及其亚型对达沙替尼的敏感性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 来自原发性患者肿瘤的胶质母细胞瘤干细胞样细胞（GSCs） |
| 23893 | 2024-08-08 |
Adipocyte Heterogeneity Underlying Adipose Tissue Functions
2022-01-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqab138
PMID:34223880
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研究论文 | 本文讨论了利用单细胞RNA测序和单核测序技术研究脂肪细胞异质性的策略，以更好地理解不同脂肪库中的脂肪细胞亚型及其与代谢疾病的关系 | 采用了单细胞RNA测序和单核测序技术来揭示脂肪细胞亚型的复杂性，这些技术之前因脂肪细胞的大小、浮力和脆弱性而难以应用 | NA | 深入了解不同脂肪库中的脂肪细胞亚型及其在代谢疾病中的作用 | 脂肪细胞亚型及其在不同脂肪库中的功能 | NA | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 23894 | 2024-08-08 |
Induction of Interferon-γ and Tissue Inflammation by Overexpression of Eosinophil Cationic Protein in T Cells and Exosomes
2022-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.41920
PMID:34224653
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研究论文 | 本研究探讨了T细胞衍生的外泌体蛋白在系统性红斑狼疮（SLE）发病机制中的作用，特别是嗜酸性阳离子蛋白（ECP）的过度表达。 | 首次揭示了ECP在T细胞和T细胞衍生的外泌体中过度表达可能导致SLE相关的肾炎、肝炎和关节炎。 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 研究T细胞衍生的外泌体蛋白在系统性红斑狼疮发病机制中的作用。 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照的T细胞衍生的外泌体蛋白。 | NA | 系统性红斑狼疮 | MACSPlex外泌体分析和蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | T细胞特异性ECP转基因小鼠（每组5只），老年T细胞特异性ECP转基因小鼠（每组3只），接受转移外泌体的小鼠（每组3只） |
| 23895 | 2024-08-08 |
High-dimensional and single-cell transcriptome analysis of the tumor microenvironment in angioimmunoblastic T cell lymphoma (AITL)
2022-01, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-021-01321-2
PMID:34230608
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞转录组分析技术，探讨了血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）肿瘤微环境（TME）中的细胞组成和特征 | 首次详细描述了AITL TME中B细胞和CD8+ T细胞的特定表型和功能状态，揭示了非恶性细胞在AITL生物学中的重要作用 | NA | 深入理解AITL肿瘤微环境中非恶性细胞的作用和特征 | AITL肿瘤微环境中的细胞组成和功能 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 质谱流式细胞术，单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA |
| 23896 | 2024-08-08 |
Ex vivo mass cytometry analysis reveals a profound myeloid proinflammatory signature in psoriatic arthritis synovial fluid
2021-12, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2021-220280
PMID:34226188
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术（CyTOF）结合转录组分析，生成匹配的银屑病关节炎（PsA）滑液（SF）和血液白细胞的高维数据集，旨在识别未刺激淋巴细胞和髓系细胞中的细胞因子产生。 | 本研究首次通过多组学分析，生成了PsA滑液和血液的全面细胞图谱，揭示了PsA中潜在的致病性和治疗重要性的关键扩展髓系促炎模块。 | NA | 识别银屑病关节炎滑液中未刺激淋巴细胞和髓系细胞的细胞因子产生 | 银屑病关节炎（PsA）滑液（SF）和血液白细胞 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 质谱流式细胞术（CyTOF） | NA | 高维数据集 | 新鲜滑液和配对血液样本 |
| 23897 | 2024-08-08 |
Aberrant lung lipids cause respiratory impairment in a Mecp2-deficient mouse model of Rett syndrome
2021-11-01, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddab182
PMID:34230964
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研究论文 | 本文研究了Rett综合征小鼠模型中Mecp2缺陷导致的肺部脂质异常及其对呼吸功能的影响 | 首次揭示了MECP2在肺部的自主缺失与呼吸症状之间的关系，并发现氟伐他汀降低脂质水平可改善呼吸异常 | NA | 探讨Rett综合征中肺部脂质异常与呼吸功能障碍的关系 | Mecp2缺陷小鼠模型中的肺部脂质和呼吸功能 | NA | Rett综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | Mecp2缺陷小鼠 |
| 23898 | 2024-08-08 |
Stratified Test Accurately Identifies Differentially Expressed Genes Under Batch Effects in Single-Cell Data
2021 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3094650
PMID:34232885
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研究论文 | 本文研究了在单细胞测序数据中，通过分层测试准确识别在批次效应下的差异表达基因 | 使用Van Elteren测试，一种分层的Wilcoxon秩和测试版本，有效缓解了批次效应问题，并改进了常见语言效应大小以补充该测试，进一步提高了其效用 | NA | 旨在解决单细胞测序数据分析中由于批次效应导致的差异表达基因识别问题 | 单细胞测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | Van Elteren测试 | 测序数据 | 涉及模拟数据和真实患者数据 |
| 23899 | 2024-08-08 |
T cells and monocyte-derived myeloid cells mediate immunotherapy-related hepatitis in a mouse model
2021-11, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.06.037
PMID:34242700
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研究论文 | 本文通过小鼠模型研究了免疫检查点抑制剂（ICIs）相关肝炎的分子机制，特别是T细胞和单核细胞衍生的髓样细胞在其中的作用。 | 开发了一种新型小鼠模型，有助于深入了解与多种免疫疗法相关的免疫介导的肝毒性机制。 | NA | 阐明免疫检查点抑制剂（ICIs）相关肝炎的分子机制。 | T细胞和单核细胞衍生的髓样细胞在ICIs相关肝炎中的作用。 | NA | 免疫相关肝炎 | 免疫表型分析和分子谱分析 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | Pdcd1-/-小鼠 |
| 23900 | 2024-08-08 |
Single-cell nucleic acid profiling in droplets (SNAPD) enables high-throughput analysis of heterogeneous cell populations
2021-10-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab577
PMID:34233007
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研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞液滴核酸分析（SNAPD）的高通量技术，用于分析大量单个哺乳动物细胞中的转录标志物 | SNAPD技术能够每小时分析超过100,000个细胞，可用于量化异质群体中的不同细胞类型，检测低至0.1%频率的稀有细胞，并通过微流控排序富集特定细胞类型 | NA | 开发一种快速、简单、高通量的方法来基于RNA标志物对细胞样本进行计数 | 单个哺乳动物细胞中的转录标志物 | 生物学 | NA | 单细胞液滴核酸分析（SNAPD） | NA | RNA | 数万个单个哺乳动物细胞 |