单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 23881 - 23900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23881 | 2024-08-09 |
scGNN is a novel graph neural network framework for single-cell RNA-Seq analyses
2021-03-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22197-x
PMID:33767197
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGNN的图神经网络框架，用于单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析 | scGNN框架通过图神经网络形式化和聚合细胞间关系，并使用左截断混合高斯模型模拟异质基因表达模式，集成了三种迭代多模态自编码器 | NA | 提供一个无假设的深度学习框架，用于scRNA-Seq分析 | 单细胞RNA测序数据，特别是基因表达的稀疏性和复杂差异模式 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-Seq | 图神经网络 | 基因表达数据 | 13,214个来自尸检脑组织中的单核细胞 |
| 23882 | 2024-08-09 |
ModularBoost: an efficient network inference algorithm based on module decomposition
2021-Mar-24, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04074-y
PMID:33761871
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研究论文 | 本研究提出了一种基于模块分解的高效基因调控网络（GRN）推断算法ModularBoost | 该方法通过数据驱动的模块检测，引入拓扑约束，提高了推断网络的生物物理意义 | NA | 提高基因调控网络推断的准确性和效率 | 基因调控网络的推断 | 生物信息学 | NA | ICA-decomposition | ModularBoost | 转录组数据 | 涉及时间序列表达数据、精选数据和单细胞RNA测序数据 |
| 23883 | 2024-08-09 |
Cell-type identity of the avian cochlea
2021-03-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108900
PMID:33761346
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，对鸟类耳蜗的细胞类型进行了鉴定和描述 | 发现了鸟类耳蜗中一种先前未知的感音毛细胞亚群，称为superior tall hair cells，并鉴定了与之相关的支持细胞的标记物 | NA | 研究鸟类耳蜗的细胞类型，为内耳再生研究提供基础 | 鸟类耳蜗的感音毛细胞和支持细胞 | 神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 23884 | 2024-08-09 |
Transcriptomic characterization of dying hair cells in the avian cochlea
2021-03-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.108902
PMID:33761357
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和轨迹分析，研究了鸟类耳蜗中因氨基糖苷类抗生素处理而死亡的毛细胞的转录组特征 | 首次揭示了鸟类耳蜗中高毛细胞和矮毛细胞在死亡过程中基因表达的差异，特别是钾离子通道相关基因的显著上调 | NA | 研究鸟类耳蜗中毛细胞的死亡和再生机制，为哺乳动物毛细胞保护和再生提供资源 | 鸟类耳蜗中的毛细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过15,000个基因在鸟类耳蜗毛细胞中的表达 |
| 23885 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas of the healthy breast tissues reveals clinically relevant clusters of breast epithelial cells
2021-03-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100219
PMID:33763657
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研究论文 | 本文通过快速组织收集/处理协议对健康女性乳腺活检样本进行单细胞RNA测序，识别了23个乳腺上皮细胞簇，并分析了这些细胞簇在乳腺癌中的表达模式 | 开发了一种快速组织收集/处理协议，用于对健康女性乳腺组织进行单细胞RNA测序，并首次在健康乳腺组织中识别出23个上皮细胞簇 | NA | 揭示成人器官的细胞结构，并分析这些细胞簇在乳腺癌中的表达模式 | 健康女性乳腺组织和乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 约3,000个乳腺癌样本和超过550个ER+乳腺癌样本 |
| 23886 | 2024-08-09 |
Fabrication of 3D Cardiac Microtissue Arrays using Human iPSC-Derived Cardiomyocytes, Cardiac Fibroblasts, and Endothelial Cells
2021-03-14, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/61879
PMID:33779590
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研究论文 | 本文介绍了一种使用人类诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的心肌细胞、心脏成纤维细胞和内皮细胞制造3D心脏微组织阵列的技术 | 该技术采用简便的复制成型技术，允许在标准的多孔细胞培养板中培养心脏微组织数周，且能在3天内自组装形成可观察的心脏微组织收缩 | 该系统在制造过程中需要微制造专业知识，且目前缺乏血管细胞和心脏成纤维细胞 | 旨在研究不同心血管细胞类型之间的复杂相互作用，推动药物发现和疾病模型的验证研究 | 研究对象包括心肌细胞、心脏成纤维细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 涉及多种细胞类型，具体数量未详述 |
| 23887 | 2024-08-09 |
Integrative genomic analysis of early neurogenesis reveals a temporal genetic program for differentiation and specification of preplate and Cajal-Retzius neurons
2021-03, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009355
PMID:33760820
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研究论文 | 本研究利用Ebf2-EGFP转基因小鼠，揭示了早期神经发生和Cajal-Retzius细胞分化的动态转录组特征 | 发现了早期神经分化过程中涉及的新编码基因和长非编码RNA，并通过体外和体内功能实验进行了验证 | 单细胞测序分析未发现具有不同区域起源的细胞明显聚类 | 揭示早期神经发生和Cajal-Retzius细胞分化的分子机制 | 早期神经发生和Cajal-Retzius细胞的分化过程 | 神经科学 | NA | RNA-seq, ChIP-seq, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个早期神经发生阶段的小鼠样本 |
| 23888 | 2024-08-09 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing data reveals key cell types and regulators in traumatic brain injury
2021-01-14, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2021065
PMID:33757183
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，揭示了创伤性脑损伤中的关键细胞类型和调控因子 | 首次通过单细胞RNA测序技术，成功鉴定和表征了13种细胞群体，并分析了它们在创伤性脑损伤中的差异表达和相互作用 | NA | 揭示创伤性脑损伤中的特定细胞类型和关键调控因子 | 创伤性脑损伤中的细胞类型和调控因子 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自创伤性脑损伤小鼠的单细胞RNA测序数据 |
| 23889 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing, an Advanced Technology in Lung Cancer Research
2021, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S295102
PMID:33758510
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肺癌研究中的应用及其研究成果 | 单细胞测序技术具有前所未有的高分辨率，为癌症研究提供了先进的技术手段 | NA | 进一步理解肺癌的异质性、转移、耐药性、肿瘤微环境等问题 | 肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 23890 | 2024-08-09 |
Altered Monocyte Subsets in Kawasaki Disease Revealed by Single-cell RNA-Sequencing
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S293993
PMID:33758528
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了健康婴儿与川崎病婴儿中不同单核细胞亚群的异质性及其在疾病中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描绘了健康与川崎病婴儿中单核细胞的异质性，并揭示了川崎病中特定单核细胞亚群的变化 | 研究样本量较小，仅包括两名健康婴儿和两名川崎病婴儿 | 旨在全面描绘健康与川崎病婴儿中单核细胞的异质性，并揭示川崎病的潜在机制 | 健康婴儿和川崎病婴儿的外周单核细胞 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名健康婴儿和两名川崎病婴儿的外周血样本 |
| 23891 | 2024-08-09 |
Function of Macrophages in Disease: Current Understanding on Molecular Mechanisms
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.620510
PMID:33763066
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综述 | 本文综述了组织驻留巨噬细胞（TRMs）在疾病中的作用及其分子机制的最新理解 | 探讨了较少为人知的分子及已知分子的新功能，这些分子可能成为新的巨噬细胞介导治疗或诊断方法的潜在标志物 | NA | 旨在理解这些分子在巨噬细胞中的机制，以开发新的巨噬细胞介导的治疗或诊断方法 | 组织驻留巨噬细胞及其在疾病中的作用和分子机制 | NA | NA | 命运图谱和单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23892 | 2024-08-09 |
Leveraging Single-Cell RNA-seq Data to Uncover the Association Between Cell Type and Chronic Liver Diseases
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.637322
PMID:33763117
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研究论文 | 本文通过综合分析慢性肝病（CLD）的GWAS和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，揭示了与CLD相关的细胞类型 | 利用scRNA-seq技术以高分辨率探索肝脏组织的细胞多样性和功能，并结合GWAS数据进行综合分析 | 在特异性分析中未发现与肝细胞癌（HCC）显著相关的细胞类型，且未发现与肝硬化显著相关的细胞类型 | 揭示慢性肝病的病理机制，特别是与特定细胞类型的关联 | 慢性肝病及其相关细胞类型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 约19,002-32,200个细胞，识别出10-17种细胞类型 |
| 23893 | 2024-08-09 |
Deciphering Tumor Heterogeneity in Hepatocellular Carcinoma (HCC)-Multi-Omic and Singulomic Approaches
2021-01, Seminars in liver disease
IF:4.3Q1
DOI:10.1055/s-0040-1722261
PMID:33764481
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综述 | 本文综述了多组学和单细胞测序技术在解析肝细胞癌（HCC）肿瘤异质性方面的进展 | 结合多区域靶向采样策略与深度测序技术，揭示了HCC肿瘤起始和进展的新机制，并展示了液体活检在避免组织采样需求方面的潜力 | NA | 探讨多组学和单细胞测序技术如何增进我们对HCC肿瘤异质性的理解 | 肝细胞癌（HCC）的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 下一代测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | NA |
| 23894 | 2024-08-09 |
Slowpoke functions in circadian output cells to regulate rest:activity rhythms
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0249215
PMID:33765072
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和细胞特异性RNA干扰技术，探讨了果蝇间脑(PI)细胞中slowpoke钾通道在调节昼夜节律行为中的作用 | 首次揭示了slowpoke钾通道在非中枢时钟细胞中的表达对于昼夜节律行为的重要性，并提出了其在多个昼夜节律回路组件中发挥作用的可能性 | 研究主要集中在果蝇模型上，可能需要进一步的人类或其他动物模型验证 | 探究昼夜节律系统中输出途径的细胞和分子机制 | 果蝇的间脑(PI)细胞和slowpoke钾通道 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 约40个候选基因在PI细胞子集中进行RNAi敲降 |
| 23895 | 2024-08-09 |
In vitro and ex vivo functional characterization of human HLA-DRB1∗04 restricted T cell receptors
2021, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2021.100087
PMID:33768201
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研究论文 | 本文介绍了一种生成'人工'T细胞的流程，用于研究特定抗原和患者来源的免疫反应 | 开发了一种新的方法来验证和表征患者来源的TCR数据，并建立了相关的模型系统以支持开发诱导抗原特异性耐受的药物 | NA | 验证和表征患者来源的TCR数据，并开发支持抗原特异性耐受诱导药物的模型系统 | 人HLA-DRB1*04限制的T细胞受体 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞测序技术 | NA | TCR序列 | 涉及人类HLA-DRB1*04:01限制的TCR序列，特定于I型糖尿病相关GAD肽和流感衍生HA肽 |
| 23896 | 2024-08-09 |
Deciphering the Prognostic Implications of the Components and Signatures in the Immune Microenvironment of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.648917
PMID:33777046
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和批量测序数据，系统探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境中各组分对预后的影响 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了PDAC肿瘤微环境中不同细胞类型及其分子标志物与患者生存期的关联 | 研究主要基于现有数据集进行分析，未来需要更多的临床试验来验证这些发现 | 探讨胰腺导管腺癌肿瘤微环境中各组分对患者预后的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基因集变异分析（GSVA）算法 | 基因表达数据 | 883名PDAC患者 |
| 23897 | 2024-08-09 |
NPC2 as a Prognostic Biomarker for Glioblastoma Based on Integrated Bioinformatics Analysis and Cytological Experiments
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.611442
PMID:33777094
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和细胞学实验，探讨了NPC2蛋白作为胶质母细胞瘤（GBM）的预后生物标志物的潜力 | 首次研究了NPC2与GBM的预后价值，并证实了其在GBM进展中的重要作用 | NA | 旨在通过生物信息学分析和细胞学实验，识别具有临床和预后意义的潜在基因 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其预后生物标志物NPC2 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 包括H3K27M-胶质瘤细胞、U87-MG和U251细胞系 |
| 23898 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identifies Ligand-Receptor Pairs Associated With BCP-ALL Prognosis
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.639013
PMID:33777800
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序数据分析，识别了与B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）预后相关的配体-受体对 | 本研究首次整合了单细胞和批量RNA测序数据，发现了影响BCP-ALL患者生存结果的配体-受体对，并构建了一个基于LASSO的评分模型 | 研究样本数量有限，且依赖于公共数据库的数据，可能存在数据偏差 | 旨在识别与BCP-ALL预后相关的配体-受体对，并构建预测模型 | B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）患者的预后 | 数字病理学 | 血液癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO | RNA测序数据 | 7个BCP-ALL样本和4个健康样本 |
| 23899 | 2024-08-09 |
Next-Generation Sequencing Reveals the Progression of COVID-19
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.632490
PMID:33777844
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研究论文 | 本文总结了基于下一代测序（NGS）分析的SARS-CoV-2起源和人类传播的当前知识，并探讨了其在COVID-19诊断和治疗目标发现中的应用。 | 本文通过NGS技术分析了SARS-CoV-2的ACE2表达水平、肠道微生物失调和COVID-19患者的免疫遗传学，为寻找新的中间宿主和阻断跨物种传播提供了新的见解。 | NA | 探讨SARS-CoV-2的起源、传播机制及其在COVID-19诊断和治疗中的应用。 | SARS-CoV-2病毒及其在人类中的传播机制。 | 数字病理学 | COVID-19 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 23900 | 2024-08-09 |
Connecting the Dots: Resolving the Bone Marrow Niche Heterogeneity
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.622519
PMID:33777933
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术研究骨髓微环境异质性的最新进展 | 整合了多个研究报告的数据集，提供了一个全面的骨髓微环境结构概述 | 不同研究之间在代表性和命名法上的不一致性阻碍了对这一研究领域的全面理解 | 深入理解骨髓微环境的异质性 | 骨髓微环境在稳态、化疗后、白血病发作和衰老等不同条件下的结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 数据集 | NA |