单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28027 篇文献，本页显示第 23841 - 23860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23841 | 2024-08-08 |
Dissecting human trophoblast cell transcriptional heterogeneity in preeclampsia using single-cell RNA sequencing
2021-08, Molecular genetics & genomic medicine
IF:1.5Q4
DOI:10.1002/mgg3.1730
PMID:34212522
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的转录异质性 | 首次展示了子痫前期患者胎盘中滋养层细胞的发展轨迹，并揭示了其基因表达的改变 | NA | 探讨子痫前期胎盘在病理发生中的作用 | 子痫前期和健康妊娠胎盘中的滋养层细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自子痫前期和健康妊娠的胎盘样本 |
| 23842 | 2024-08-08 |
De novo generation of macrophage from placenta-derived hemogenic endothelium
2021-07-26, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2021.06.005
PMID:34197725
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠胎盘造血的转录组图谱，并验证了胎盘内皮细胞的一个亚群具有造血潜能，能够产生胎盘巨噬细胞。 | 首次发现并验证了胎盘内皮细胞的一个亚群具有造血潜能，能够产生胎盘巨噬细胞，为胎盘作为巨噬细胞来源提供了新的证据。 | NA | 探究巨噬细胞是否可以从其他胚胎部位产生，特别是胎盘来源的巨噬细胞。 | 小鼠胎盘内皮细胞及其造血潜能。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 23843 | 2024-08-08 |
Control of tissue development and cell diversity by cell cycle-dependent transcriptional filtering
2021-07-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.64951
PMID:34212855
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研究论文 | 本文探讨了细胞周期依赖的转录过滤在组织发育和细胞多样性控制中的作用 | 通过数学模拟细胞增殖，揭示了细胞周期过滤器作为调节基因转录表达、细胞多样性和组织中不同细胞类型数量及比例的机制 | NA | 研究细胞周期动态在多细胞动物中控制基因转录表达和细胞命运的作用 | 细胞周期、基因转录表达、细胞多样性、组织中的细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 数学模拟 | 基因组数据 | NA |
| 23844 | 2024-08-08 |
A Bayesian inference transcription factor activity model for the analysis of single-cell transcriptomes
2021-Jul, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.265595.120
PMID:34193535
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研究论文 | 本文开发了一种基于贝叶斯推理的转录因子活性模型（BITFAM），用于分析单细胞转录组数据，并整合了ChIP-seq转录因子结合信息。 | BITFAM模型能够从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性，并结合现有的转录因子结合位点生物数据，为理解细胞功能和命运调控提供新视角。 | NA | 开发一种新的方法来推断单细胞转录组数据中的转录因子活性，并揭示其调控机制。 | 单细胞RNA测序数据中的转录因子活性及其调控机制。 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），ChIP-seq | 贝叶斯推理模型 | 转录组数据 | NA |
| 23845 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: The triumphs and limitations of computational methods for scRNA-seq
2021-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01223-2
PMID:34194051
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23846 | 2024-08-08 |
A yeast-optimized single-cell transcriptomics platform elucidates how mycophenolic acid and guanine alter global mRNA levels
2021-06-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02320-w
PMID:34193958
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研究论文 | 本文介绍了一种优化用于酵母的单细胞转录组学平台yeastDrop-Seq，并使用该平台研究了霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞全局mRNA水平的影响 | 开发了针对酵母细胞优化的yeastDrop-Seq平台，解决了Drop-Seq技术在不同细胞大小和形态特征生物体应用中的挑战 | NA | 研究霉酚酸和鸟嘌呤对酵母细胞转录组的影响 | 酵母细胞的转录组 | 生物技术 | NA | Drop-Seq | NA | 转录组数据 | 多个同源酵母细胞 |
| 23847 | 2024-08-08 |
The amniotic fluid cell-free transcriptome in spontaneous preterm labor
2021-06-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-92439-x
PMID:34188072
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研究论文 | 研究分析了自发早产情况下羊水中的游离RNA转录组，并探讨其在预测自发早产中的价值 | 首次量化了羊水中游离RNA中的已知胎盘单细胞RNA-Seq特征，并应用随机森林模型预测羊水穿刺后的分娩时间 | NA | 探讨羊水中游离RNA在预测自发早产中的应用 | 自发早产情况下羊水中的游离RNA | NA | 早产 | RNA-Seq | 随机森林模型 | RNA | 共分析了38份羊水样本，其中10份来自24小时内分娩的妇女，28份来自24小时后分娩的妇女 |
| 23848 | 2024-08-08 |
NF-Y Subunits Overexpression in HNSCC
2021-Jun-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13123019
PMID:34208636
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研究论文 | 研究报道了NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的过度表达情况 | 首次分析了TCGA和细胞系中的RNA-seq数据，并利用单细胞RNA-seq数据进行了肿瘤亚型的划分和生存曲线的推导 | NA | 探讨NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其对肿瘤生物学行为的影响 | NF-Y亚单位在头颈部鳞状细胞癌中的表达情况 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA-seq | NA | RNA序列 | 使用了TCGA数据库和头颈部鳞状细胞癌的细胞系数据 |
| 23849 | 2024-08-08 |
A Literature-Derived Knowledge Graph Augments the Interpretation of Single Cell RNA-seq Datasets
2021-06-10, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060898
PMID:34200671
|
研究论文 | 本文通过自然语言处理框架量化基因与细胞类型之间的关系，并开发了一种增强型注释算法来提高单细胞RNA测序数据集的注释和解释 | 首次展示了如何系统地应用文献衍生的知识图谱来加速和增强单细胞RNA测序数据的注释和解释 | NA | 开发一种新的方法来增强单细胞RNA测序数据集的注释和解释 | 人类蛋白质编码基因与细胞类型之间的关系，以及单细胞RNA测序数据集的细胞身份预测 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 文本 | 2600万篇生物医学文献，133个细胞集群 |
| 23850 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Transcriptomic Heterogeneity and Post-Traumatic Osteoarthritis-Associated Early Molecular Changes in Mouse Articular Chondrocytes
2021-06-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061462
PMID:34200880
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了健康和受伤小鼠膝关节软骨细胞的转录组异质性及其在创伤后骨关节炎早期分子变化 | 首次对关节软骨细胞进行单细胞分辨率的分子水平全面分析，并识别出九种具有不同分子特征的软骨细胞亚型 | 由于从密集的软骨细胞外基质中分离软骨细胞的技术难度，可能存在一定的技术限制 | 阐明不同软骨细胞亚型的分子和功能特征，以及这些亚型与其他关节细胞类型之间的相互作用，从而加深对关节生物学和骨关节炎病理学的理解 | 小鼠关节软骨细胞及其在创伤后的分子变化 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和受伤的小鼠膝关节软骨细胞 |
| 23851 | 2024-08-08 |
Diversity of Rainbow Trout Blood B Cells Revealed by Single Cell RNA Sequencing
2021-Jun-09, Biology
DOI:10.3390/biology10060511
PMID:34207643
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研究论文 | 本研究利用10× Genomics单细胞RNA测序技术，首次在硬骨鱼中分析了外周血中单个B细胞的转录模式 | 首次在硬骨鱼中应用单细胞RNA测序技术分析B细胞的转录模式 | 研究主要集中在硬骨鱼中的彩虹鳟，尚未广泛应用于其他非模式生物 | 理解硬骨鱼B细胞的生物学特性并发现潜在的标记物 | 彩虹鳟的外周血B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数十至数千个单个细胞 |
| 23852 | 2024-08-08 |
Exploring Viral Diversity in a Gypsum Karst Lake Ecosystem Using Targeted Single-Cell Genomics
2021-06-08, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12060886
PMID:34201311
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研究论文 | 本研究利用靶向细胞分选结合单细胞测序技术，探索了石膏岩溶湖生态系统中感染绿色硫细菌的病毒的基因内容和基因组潜力 | 本研究发现大多数病毒基因和蛋白质序列与公共数据库中的噬菌体序列相似度很低或无相似性，揭示了先前未描述的绿色硫细菌病毒的巨大多样性 | NA | 研究石膏岩溶湖生态系统中绿色硫细菌病毒的多样性和分布 | 绿色硫细菌及其感染的病毒 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组 | 62个单扩增基因组中鉴定出82个病毒连接体 |
| 23853 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptional Heterogeneity of Lymphatic Endothelial Cells in Normal and Inflamed Murine Lymph Nodes
2021-06-02, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061371
PMID:34199492
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了正常和炎症状态下小鼠淋巴结中淋巴内皮细胞的转录变化 | 发现了淋巴内皮细胞在不同淋巴结窦中对皮肤炎症的个体响应，表明它们在病理条件下发挥不同功能 | NA | 深入分析淋巴结淋巴内皮细胞在正常状态和皮肤炎症中的转录景观 | 小鼠淋巴结中的淋巴内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及正常和炎症状态下的小鼠淋巴结中的淋巴内皮细胞 |
| 23854 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq landscape midbrain cell responses to red spotted grouper nervous necrosis virus infection
2021-06, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009665
PMID:34185811
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了健康和感染红点石斑神经坏死病毒（RGNNV）的石斑鱼中脑细胞的转录组响应 | 首次揭示了RGNNV主要攻击石斑鱼的中脑，并识别了35种转录上不同的细胞亚型，包括28种神经元和7种非神经元细胞类型 | NA | 探讨神经坏死病毒（NNV）感染对鱼类中脑细胞的影响及其免疫响应 | 红点石斑鱼（Epinephelus coioides）的中脑细胞 | 数字病理学 | 鱼类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 健康和感染RGNNV的石斑鱼中脑细胞 |
| 23855 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Breadth of Osteoblast Heterogeneity
2021-Jun, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10496
PMID:34189385
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了成骨细胞的异质性 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了成骨细胞的异质性，并识别出可能作为成骨细胞成熟阶段新标记的基因 | 研究仅限于新生小鼠颅骨中的Venus阳性细胞，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于其他物种或不同发育阶段的成骨细胞 | 探索成骨细胞的异质性及其生物学意义 | 新生小鼠颅骨中的Venus阳性细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 272个Venus单细胞 |
| 23856 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis as a Promising Tool to Study Pluripotent Stem Cell Reprogramming
2021-Jun-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22115988
PMID:34206025
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综述 | 本文综述了单细胞转录组分析技术在多能干细胞重编程研究中的应用 | 介绍了近年来积极使用的单细胞分析技术，并预测了未来的研究方向 | NA | 理解疾病和细胞活动在单细胞层面的机制 | 多能干细胞及其重编程过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 23857 | 2024-08-08 |
Dopamine Neuron Diversity: Recent Advances and Current Challenges in Human Stem Cell Models and Single Cell Sequencing
2021-06-01, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10061366
PMID:34206038
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综述 | 本文综述了多巴胺神经元多样性的最新进展和当前挑战，特别是在人干细胞模型和单细胞测序技术中的应用 | 利用人多能干细胞和先进的计算单细胞转录组学技术，有望解码人多巴胺神经元的成熟和多样化机制 | 目前尚未有系统性的分子分类方法在全基因组水平上对多巴胺神经元进行分类 | 探讨如何利用干细胞模型和单细胞RNA测序技术深入理解人多巴胺神经元的生物学特性 | 人中脑多巴胺神经元的多样性和功能 | 干细胞研究 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 23858 | 2024-08-08 |
Marker Genes Change of Synovial Fibroblasts in Rheumatoid Arthritis Patients
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/5544264
PMID:34195267
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了类风湿性关节炎（RA）和骨关节炎（OA）患者的滑膜成纤维细胞的标志基因变化 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质相互作用网络分析，确定了RA和OA的特定细胞亚群及其关键基因，并验证了这些基因在临床样本中的表达差异 | 研究仅使用了两个公开数据集，可能需要更多样本和数据集来验证结果的普遍性 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和验证RA患者的滑膜成纤维细胞中的关键基因，以作为诊断和治疗的新靶点 | 类风湿性关节炎和骨关节炎患者的滑膜成纤维细胞 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE109449和GSE56409两个数据集中的样本 |
| 23859 | 2024-08-08 |
Revealing immune responses in the Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis-infected THP-1 cells using single cell RNA-sequencing
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0254194
PMID:34214113
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人THP-1细胞在感染Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis（MAP）后的免疫反应 | 发现了由THP-1细胞分化出的新型细胞类型Mreg细胞，并揭示了不同细胞类型在相同条件下对MAP感染的反应差异 | NA | 探究MAP感染后人THP-1细胞的初始反应，以阐明Crohn's疾病的病理机制 | 人THP-1细胞在MAP感染后的免疫反应 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | THP-1细胞被分为七个不同的集群进行分析 |
| 23860 | 2024-08-08 |
Unsupervised Cluster Analysis and Gene Marker Extraction of scRNA-seq Data Based On Non-Negative Matrix Factorization
2022-01, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2021.3091506
PMID:34156956
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研究论文 | 本文提出了一种基于非负矩阵分解的多子空间细胞相似性学习框架MscNMF，用于无监督的scRNA-seq数据分析，包括数据分解、相似性学习和相似性融合三个部分 | MscNMF能够学习不同子空间的基因特征和细胞特征，通过多子空间突出细胞间的相关性和异质性，消除低维特征空间中的冗余信息和噪声，并合理计算细胞类型数量和非负矩阵分解的秩 | NA | 解决scRNA-seq数据中细胞异质性的识别问题 | scRNA-seq数据中的基因表达水平和细胞特征 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 八个真实scRNA-seq数据集 |