单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 23781 - 23800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23781 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Transcriptome and TCR Characteristics of pTregs and in vitro Expanded iTregs
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.619932
PMID:33868236
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了pTregs和体外扩增的iTregs的转录组和TCR特征 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了pTregs和iTregs的转录组和TCR特征，并揭示了它们在功能和表型上的差异 | 研究主要集中在体外扩增的Tregs，未来需要进一步验证这些发现在体内的有效性和安全性 | 探索调节性T细胞（Tregs）的转录组和TCR特征，以及它们在免疫耐受和肿瘤逃避中的作用 | 调节性T细胞（Tregs），包括pTregs和iTregs | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 从结直肠癌患者中扩增的CD4+CD25+CD127细胞 |
| 23782 | 2024-08-09 |
Cells of the Immune System in Cardiac Remodeling: Main Players in Resolution of Inflammation and Repair After Myocardial Infarction
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.664457
PMID:33868315
|
综述 | 本文综述了免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复和炎症消退过程中的作用 | 介绍了基于单细胞RNA测序的新型细胞表型分类方法，有助于更好地理解参与炎症消退的细胞表型 | 文章提出了一些未解决的问题，需要进一步研究以将免疫细胞在心肌梗死后组织修复中的作用知识应用于实践 | 总结不同免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复过程中的作用，并讨论免疫介导疗法在急性心肌梗死患者中的可能前景 | 免疫系统细胞在心肌梗死后心脏修复和炎症消退中的作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 23783 | 2024-08-09 |
Integration, exploration, and analysis of high-dimensional single-cell cytometry data using Spectre
2022-03, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.24350
PMID:33840138
|
研究论文 | 介绍了一个名为Spectre的R包，用于高维单细胞流式数据的综合集成和分析 | Spectre提供了一个端到端的分析流程，包括数据预处理、批次对齐、数据集成、聚类、降维、可视化、群体标记以及定量和统计分析 | NA | 开发一个全面的、可扩展的计算分析方法，以处理和分析高维单细胞流式数据 | 高维单细胞流式数据，包括流式细胞术、质谱细胞术或光谱细胞术生成的数据 | 生物信息学 | NA | 机器学习 | NA | 高维数据 | 大量样本、批次或实验 |
| 23784 | 2024-08-09 |
Leveraging Single-Cell Sequencing for Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapies
2021-12, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2021.03.005
PMID:33832782
|
研究论文 | 本文探讨了如何利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术来分析嵌合抗原受体（CAR）-T细胞疗法的基因表达特征，以优化CAR设计、生产条件、治疗组合及疾病结果 | 本文首次详细描述了单细胞RNA测序在CAR-T细胞疗法中的应用，为该疗法的发展和临床监测提供了新的工具 | NA | 提高CAR-T细胞疗法对癌症的治疗效果 | CAR-T细胞的基因表达特征及其在治疗中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23785 | 2024-08-09 |
Mutations in BRCA1 and BRCA2 differentially affect the tumor microenvironment and response to checkpoint blockade immunotherapy
2021-12, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00139-8
PMID:33834176
|
研究论文 | 本文研究了BRCA1和BRCA2基因突变对肿瘤微环境和免疫检查点阻断疗法反应的差异性影响 | 首次报道了BRCA1和BRCA2基因突变在鼠和人类肿瘤中对免疫检查点阻断疗法反应的差异性影响，并发现BRCA2截断突变相较于BRCA1突变更能增强对免疫疗法的反应 | NA | 探究BRCA1和BRCA2基因突变对免疫检查点阻断疗法反应的影响及其机制 | BRCA1和BRCA2基因突变对肿瘤微环境和免疫疗法反应的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23786 | 2024-08-09 |
Group-2 Innate Lymphoid Cells Promote HCC Progression Through CXCL2-Neutrophil-Induced Immunosuppression
2021-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31855
PMID:33829508
|
研究论文 | 本研究探讨了第2组先天淋巴细胞（ILC2s）通过CXCL2-中性粒细胞诱导的免疫抑制促进肝细胞癌（HCC）进展的作用。 | 首次揭示了HCC中ILC2s的特定亚群通过产生趋化因子CXCL2和CXCL8招募中性粒细胞，形成免疫抑制微环境，从而促进肿瘤进展。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证。 | 评估HCC中ILC2s在肿瘤进展中的作用，并探索潜在的治疗策略。 | 第2组先天淋巴细胞（ILC2s）及其在肝细胞癌（HCC）中的作用。 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术（FACS）、单细胞RNA测序、质谱细胞术 | NA | 细胞 | 涉及人类HCC样本和小鼠HCC模型 |
| 23787 | 2024-08-09 |
MicroCellClust: mining rare and highly specific subpopulations from single-cell expression data
2021-Oct-11, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab239
PMID:33830183
|
research paper | 本文提出了一种数据挖掘方法MicroCellClust，用于从单细胞表达数据中识别具有高度特异性表达谱的小亚群细胞 | MicroCellClust方法通过扩展最大和子矩阵问题，能够同时识别一小群细胞及其对应的特异性基因子集 | NA | 旨在从有限的单细胞表达数据中识别出罕见的细胞亚群 | 单细胞表达数据中的罕见细胞亚群 | machine learning | breast cancer | scRNA-seq | NA | expression data | 涉及人T细胞、乳腺癌样本和鼠胚胎干细胞的单细胞表达数据 |
| 23788 | 2024-08-09 |
How will artificial intelligence and bioinformatics change our understanding of IgA Nephropathy in the next decade?
2021-10, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-021-00847-y
PMID:33835214
|
研究论文 | 本文探讨了人工智能和生物信息学如何在未来十年改变我们对IgA肾病（IgAN）的理解 | 介绍了利用单细胞测序、下一代测序、蛋白质组学和复杂成像技术等新兴技术，结合先进的计算方法，来深入分析IgAN的复杂病理生理学 | NA | 探讨人工智能和生物信息学在IgAN研究中的应用，以提高对疾病的理解和患者护理 | IgA肾病（IgAN）的病理生理学 | 生物信息学 | 肾病 | 单细胞测序、下一代测序、蛋白质组学 | NA | 分子、细胞和器官尺度的数据 | NA |
| 23789 | 2024-08-09 |
Bayesian estimation of cell type-specific gene expression with prior derived from single-cell data
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.268722.120
PMID:33837133
|
研究论文 | 本文开发了一种贝叶斯方法（bMIND），通过从单细胞数据中提取先验信息，整合批量和单细胞RNA测序数据，以估计样本级别的细胞类型特异性基因表达 | 提出了bMIND方法，该方法通过结合单细胞RNA测序数据的先验信息，提高了样本级别细胞类型特异性基因表达估计的准确性，并增强了发现细胞类型特异性差异表达基因的能力 | 单细胞RNA测序数据通常来自相对较少的样本，这限制了其在某些分析中的应用，如基因表达数量性状位点的识别 | 开发一种方法，结合批量和单细胞RNA测序数据的优势，以提高细胞类型特异性基因表达分析的准确性和效率 | 批量和单细胞RNA测序数据，以及自闭症谱系障碍和阿尔茨海默病的相关脑组织基因表达数据 | 基因组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯方法（bMIND） | 基因表达数据 | 相对较少的样本 |
| 23790 | 2024-08-09 |
Critical downstream analysis steps for single-cell RNA sequencing data
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab105
PMID:33822873
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据的关键下游分析步骤，包括聚类、轨迹推断、细胞类型注释和数据集整合的方法 | 总结了当前广泛使用的分析工具及其优缺点，并提供了在不同情况下选择合适方法的建议 | NA | 为单细胞RNA测序数据分析人员和生物信息学工具开发者提供指导 | 单细胞RNA测序数据的关键下游分析步骤 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 23791 | 2024-08-09 |
Deep embedded clustering with multiple objectives on scRNA-seq data
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab090
PMID:33822877
|
研究论文 | 本文提出了一种基于多目标进化优化的深度嵌入聚类方法，用于在单细胞RNA测序数据中同时优化超参数和架构，以提高聚类性能 | 本文创新性地将多目标进化优化与深度嵌入聚类相结合，自动优化超参数和架构，提高了模型在单细胞RNA测序数据上的聚类性能 | NA | 研究目的是提高单细胞RNA测序数据在深度嵌入聚类中的性能 | 研究对象是单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度嵌入聚类 | scRNA-seq数据 | 研究使用了二十个合成数据和八个来自不同代表性单细胞测序平台的真实数据 |
| 23792 | 2024-08-09 |
WEDGE: imputation of gene expression values from single-cell RNA-seq datasets using biased matrix decomposition
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab085
PMID:33834202
|
研究论文 | 本文提出了一种名为WEDGE的新算法，用于通过偏置低秩矩阵分解方法从单细胞RNA测序数据集中 impute 基因表达矩阵 | WEDGE算法成功恢复了表达矩阵，重现了细胞间和基因间的相关性，并改善了细胞聚类，特别适用于稀疏数据集 | NA | 开发一种新的算法来 impute 单细胞转录组数据中的缺失值 | 单细胞RNA测序数据集中的基因表达矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩矩阵分解 | 基因表达矩阵 | NA |
| 23793 | 2024-08-09 |
iSMNN: batch effect correction for single-cell RNA-seq data via iterative supervised mutual nearest neighbor refinement
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab122
PMID:33839756
|
研究论文 | 本文提出了一种通过迭代监督互最近邻（iSMNN）细化的批效应校正方法，用于整合多个单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | iSMNN方法通过迭代监督互最近邻的细化，能够更好地混合不同批次的相同细胞类型，并有助于识别与特定细胞类型生物功能相关的差异表达基因 | NA | 解决在整合多个单细胞RNA测序数据时批效应校正的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 互最近邻（MNNs） | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 23794 | 2024-08-09 |
Perivenous Stellate Cells Are the Main Source of Myofibroblasts and Cancer-Associated Fibroblasts Formed After Chronic Liver Injuries
2021-09, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31848
PMID:33817801
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究者在小鼠肝脏中非实质细胞中鉴定出转录因子21（Tcf21）作为静止期肝星状细胞（HSCs）的独特标记，并利用Tcf21-CreER追踪这些细胞，发现它们在慢性肝损伤后成为主要肌成纤维细胞和癌症相关成纤维细胞的来源。 | 首次使用单细胞RNA测序技术鉴定出Tcf21作为静止期HSCs的独特标记，并通过Tcf21-CreER技术追踪这些细胞，揭示了它们在慢性肝损伤后的激活和转化过程。 | NA | 研究肝星状细胞在慢性肝损伤后的身份和病理生理学特性。 | 小鼠肝脏中的非实质细胞和肝星状细胞。 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23795 | 2024-08-09 |
A single-cell view of the transcriptome during lateral root initiation in Arabidopsis thaliana
2021-08-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koab101
PMID:33822225
|
研究论文 | 研究使用单细胞测序方法捕捉拟南芥侧根原基在启动过程中的转录组变化 | 开发了一种方法来选择性抑制目标基因在木质部极皮层细胞中的转录，并发现这些目标基因的表达对正常根发育是必需的 | NA | 研究侧根发育的早期步骤 | 拟南芥侧根原基的转录组 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 少量细胞 |
| 23796 | 2024-08-09 |
In silico analysis of the potential mechanism of a preventive Chinese medicine formula on coronavirus disease 2019
2021-Jul-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2021.114098
PMID:33831468
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、单细胞RNA表达谱分析、分子对接和回顾性研究，探索了预防性中药方剂XG-1对COVID-19的潜在预防机制 | 本研究结合多种分析方法，包括网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接和回顾性研究，以全面探索XG-1的预防机制 | NA | 探索XG-1对COVID-19的潜在预防机制 | XG-1中药方剂对COVID-19的预防效果及其机制 | 中医药 | COVID-19 | 网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接、回顾性研究 | NA | 基因表达数据、化学成分数据 | 47名密切接触者 |
| 23797 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomics for respiratory research and medicine
2021-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.04314-2020
PMID:33833036
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23798 | 2024-08-09 |
Systems Approach to Discovery of Therapeutic Targets for Vein Graft Disease: PPARα Pivotally Regulates Metabolism, Activation, and Heterogeneity of Macrophages and Lesion Development
2021-06-22, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究采用系统方法在老鼠实验中发现治疗静脉移植失败的治疗靶点，特别是PPARα在调节巨噬细胞代谢、活化和异质性以及病变发展中的关键作用 | 首次揭示PPARα在静脉移植病变发展和炎症中的作用，并提出pemafibrate作为新的治疗选择 | NA | 探索静脉移植炎症的潜在驱动因素并发现新的治疗靶点 | 静脉移植病变和巨噬细胞 | NA | NA | 蛋白质组学、高维聚类、代谢组学、定量聚合酶链反应、流式细胞术、代谢检测、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质、代谢物 | 涉及老鼠和人类巨噬细胞的多种样本 |
| 23799 | 2024-08-09 |
A CD44/Brg1 nuclear complex confers mesenchymal progenitor cells with enhanced fibrogenicity in idiopathic pulmonary fibrosis
2021-05-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.144652
PMID:33822772
|
研究论文 | 研究探讨了CD44/Brg1核复合体在特发性肺纤维化中增强间充质前体细胞纤维化能力的作用 | 首次揭示了CD44与Brg1和Zeb1形成核蛋白复合体，通过上调Sox2基因表达促进特发性肺纤维化中间充质前体细胞的自我更新和纤维化能力 | NA | 探究CD44在特发性肺纤维化中间充质前体细胞中的作用及其分子机制 | 特发性肺纤维化中的间充质前体细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及特发性肺纤维化患者的肺部间充质前体细胞 |
| 23800 | 2024-08-09 |
BABEL enables cross-modality translation between multiomic profiles at single-cell resolution
2021-04-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2023070118
PMID:33827925
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为BABEL的深度学习方法，能够在单细胞水平上实现转录组和染色质可及性数据之间的跨模态转换 | BABEL利用互操作神经网络模型，能够在只有一种模态实验数据可用时，计算合成配对的多组学测量数据 | NA | 开发一种方法，在单细胞水平上实现多组学数据之间的跨模态转换 | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据和单细胞染色质可及性测序数据 | 涉及人类和小鼠的多个配对单细胞ATAC和基因表达数据集 |