单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 23781 - 23800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23781 | 2024-08-09 |
Actuation enhances patterning in human neural tube organoids
2021-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22952-0
PMID:34045434
|
研究论文 | 本文开发了能够驱动类器官的设备，并展示了主动机械力如何增强源自单个人类多能干细胞（hPSC）的神经管类器官的形态发生和模式化 | 首次实现了通过主动机械力动态协调的机械操作来增强类器官的模式化，而不仅仅是依赖于对机械力做出反应的细胞外基质 | NA | 研究主动机械力如何影响类器官的生长和模式化，以及这种影响的分子机制 | 源自单个人类多能干细胞的神经管类器官 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组学和免疫组织化学 | NA | 细胞 | 单个人类多能干细胞（hPSC） |
| 23782 | 2024-08-09 |
Comparison of the major cell populations among osteoarthritis, Kashin-Beck disease and healthy chondrocytes by single-cell RNA-seq analysis
2021-05-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-03832-3
PMID:34045450
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，比较了骨关节炎、大骨节病和健康软骨细胞中的主要细胞群体 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了大骨节病和骨关节炎中软骨细胞群体的异质性，并发现了新的细胞标志物 | NA | 旨在识别大骨节病、骨关节炎患者和健康对照组中软骨细胞的主要细胞群体及其转录程序，以区分这三组中的软骨细胞 | 大骨节病、骨关节炎患者和健康对照组的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23783 | 2024-08-09 |
A top-down measure of gene-to-gene coordination for analyzing cell-to-cell variability
2021-05-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-90353-w
PMID:34040065
|
研究论文 | 本文应用一种新开发的计算方法来测量全局基因协调水平（GCL），以系统地研究基因调控数值模型中的细胞间变异性 | 本文提出的方法能够评估和比较具有相同细胞间变异性的群体中引入的生物变异性和技术变异性之间的比率，并且对小样本大小或数据组成性引起的虚假相关性具有鲁棒性 | NA | 区分细胞间变异性中的生物变异性和技术变异性，并研究其对基因调控的影响 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术测量的基因表达谱 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23784 | 2024-08-09 |
A potential role for somatostatin signaling in regulating retinal neurogenesis
2021-05-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-90554-3
PMID:34040115
|
研究论文 | 研究探讨了生长抑素信号在调节视网膜神经发生中的潜在作用 | 首次在体内证实了生长抑素受体2（Sstr2）信号对视网膜神经发生的负向调节作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞RNA测序分析，体内实验数据较少 | 探究生长抑素信号在视网膜神经发生中的作用及其机制 | 视网膜神经发生过程中的神经肽及其受体 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人类胚胎视网膜组织 |
| 23785 | 2024-08-08 |
scDesign2: a transparent simulator that generates high-fidelity single-cell gene expression count data with gene correlations captured
2021-05-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02367-2
PMID:34034771
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scDesign2的透明模拟器，能够生成高保真的单细胞基因表达计数数据，并捕捉基因间的相关性 | scDesign2是首个能够同时保留基因、捕捉基因相关性并生成任意数量具有不同测序深度的细胞的模拟器 | NA | 解决单细胞转录组学中基准测试实验协议和计算方法的挑战 | 单细胞基因表达计数数据 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 基因表达数据 | 任意数量 |
| 23786 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of pancreatic ductal adenocarcinoma identifies a novel fibroblast subtype associated with poor prognosis but better immunotherapy response
2021-May-25, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00271-4
PMID:34035226
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了胰腺导管腺癌（PDAC）中的肿瘤间异质性，发现了一种新型癌症相关成纤维细胞（meCAFs）亚型，该亚型与不良预后相关，但显示出更好的免疫治疗反应 | 首次在PDAC中发现了一种新型癌症相关成纤维细胞亚型meCAFs，并揭示了其在PDAC进展和免疫治疗反应中的关键作用 | NA | 探索胰腺导管腺癌的肿瘤间异质性，并评估新型癌症相关成纤维细胞亚型在治疗选择中的潜在价值 | 胰腺导管腺癌中的癌症相关成纤维细胞、导管癌细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个PDAC患者样本 |
| 23787 | 2024-08-08 |
A 3D system to model human pancreas development and its reference single-cell transcriptome atlas identify signaling pathways required for progenitor expansion
2021-05-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23295-6
PMID:34035279
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研究论文 | 本文报道了建立一个7至10周胎儿胰腺的单细胞转录组图谱，并开发了InterCom R包用于识别受体-配体对及其下游效应，同时建立了一个从胎儿组织或人多能干细胞开始的3D人胰腺培养系统，用于长期维持胰腺前体细胞。 | 本文创新性地建立了3D人胰腺培养系统和InterCom R包，用于研究细胞间相互作用和胰腺前体细胞的扩展。 | NA | 研究人胰腺发育过程中的细胞间相互作用和信号通路。 | 人胰腺发育过程中的细胞和信号通路。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 7至10周胎儿胰腺样本 |
| 23788 | 2024-08-08 |
Characterizing the tumor microenvironment of metastatic ovarian cancer by single-cell transcriptomics
2021-05-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109165
PMID:34038734
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了转移性卵巢癌肿瘤微环境的细胞组成和细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了转移性卵巢癌肿瘤微环境中9种主要细胞类型的转录特征，并揭示了不同免疫细胞亚群在肿瘤微环境中的分布和功能 | 研究样本仅来自6名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解肿瘤微环境的细胞组成及其在癌症免疫治疗中的作用 | 转移性卵巢癌患者的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 9,885个细胞，来自6名患者 |
| 23789 | 2024-08-09 |
Dissecting the microenvironment around biosynthetic scaffolds in murine skin wound healing
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf0787
PMID:34039601
|
研究论文 | 研究了三种不同表面形貌（随机、对齐和格子状）的静电纺丝膜对小鼠和大鼠皮肤伤口愈合及免疫调节特性的影响 | 通过单细胞RNA测序揭示了微环境中不同的细胞异质性，并发现对齐的支架能促进适应性免疫反应 | NA | 探讨生物材料结构特性对细胞行为和免疫反应的影响 | 静电纺丝膜在皮肤伤口愈合中的作用及其对免疫细胞的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和大鼠的皮肤伤口样本 |
| 23790 | 2024-08-09 |
Shared transcriptional profiles of atypical B cells suggest common drivers of expansion and function in malaria, HIV, and autoimmunity
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg8384
PMID:34039612
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研究论文 | 本文通过无偏倚的单细胞RNA测序技术，揭示了在疟疾、HIV和自身免疫疾病中非典型B细胞（ABCs）的转录谱相似性，并探讨了其功能和扩张的共同驱动因素。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了疟疾、HIV和自身免疫疾病中非典型B细胞的相似转录谱，并发现干扰素-γ在这些疾病中驱动ABCs的扩张。 | NA | 探究非典型B细胞在慢性传染病和自身免疫疾病中的扩张和功能。 | 非典型B细胞（ABCs）及其在疟疾、HIV和自身免疫疾病中的转录谱和功能。 | 免疫学 | 疟疾, HIV, 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 23791 | 2024-08-09 |
Isolation of Nuclei from Mammalian Cells and Tissues for Single-Nucleus Molecular Profiling
2021-May, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.132
PMID:34043278
|
研究论文 | 本文描述了一种高效、经济且时间有效的方法，用于从哺乳动物细胞和组织中分离核，以进行单核分子分析 | 该方法提高了整体效率，消除了污染物暴露的风险，并减少了昂贵试剂的用量 | NA | 开发一种新的方法来分离哺乳动物细胞和组织的核，以便进行单核RNA测序和单核ATAC-Seq | 哺乳动物细胞和组织的核 | 分子生物学 | NA | 单核RNA测序（snRNAseq），单核ATAC-Seq（snATAC-Seq） | NA | RNA | NA |
| 23792 | 2024-08-09 |
Bile acid synthesis, modulation, and dementia: A metabolomic, transcriptomic, and pharmacoepidemiologic study
2021-05, PLoS medicine
IF:10.5Q1
DOI:10.1371/journal.pmed.1003615
PMID:34043628
|
研究论文 | 本研究通过代谢组学、转录组学和药物流行病学的方法，探讨了胆酸合成、调节与痴呆之间的关系 | 首次综合代谢组学、转录组学和药物流行病学方法，揭示胆固醇分解代谢失调与痴呆发病机制的关联 | 研究样本量较小，且初级医疗环境中痴呆亚型的临床诊断可能存在不准确 | 探讨胆固醇分解代谢失调通过转化为初级胆酸与痴呆发病机制的关联 | 初级胆酸（胆酸和鹅去氧胆酸）及其主要生物合成前体7α-羟基胆固醇在痴呆中的作用 | 代谢组学 | 痴呆 | 代谢组学、转录组学、药物流行病学 | NA | 血液、脑组织 | 包括141名参与者的脑部淀粉样蛋白积累、134名参与者的白质病变和脑萎缩，以及29名参与者的脑组织样本 |
| 23793 | 2024-08-09 |
Author Correction: Single-cell RNA sequencing technologies and bioinformatics pipelines
2021-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00615-w
PMID:34045654
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23794 | 2024-08-09 |
[Application prospects of single-cell transcriptome sequencing in traditional Chinese medicine research]
2021-May, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组测序技术在中药研究中的应用前景 | 单细胞转录组测序技术能够分析单个细胞层面的转录组表达特征，发现个体细胞中被“稀释”或平均化的基因表达异质性 | NA | 探讨单细胞转录组测序技术在中药研究中的应用前景 | 单细胞转录组测序技术及其在现代药物研究中的应用 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 23795 | 2024-08-09 |
Methods for Characterization of Senescent Circulating and Tumor-Infiltrating T-Cells: An Overview from Multicolor Flow Cytometry to Single-Cell RNA Sequencing
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1507-2_6
PMID:34053052
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综述 | 本文综述了从多色流式细胞术到单细胞RNA测序等多种方法在衰老循环和肿瘤浸润T细胞表征中的应用 | 提出结合多色流式细胞术、基因表达阵列和单细胞RNA测序的综合分析方法，以揭示衰老CD8+ T细胞的确切分子标志，并探讨免疫衰老与人类衰老的关联 | 现有表征方法可能不足以区分真正的衰老细胞和耗竭T细胞，且衰老个体或肿瘤微环境中T细胞亚群的高度异质性增加了复杂性 | 开发针对特定T细胞亚群的治疗性调节干预措施 | 衰老的循环和肿瘤浸润T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23796 | 2024-08-09 |
A Cancer-Specific Qualitative Method for Estimating the Proportion of Tumor-Infiltrating Immune Cells
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.672031
PMID:34054849
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Tumor-infiltrating Immune Cell Proportion Estimator (TICPE)的癌症特异性定性方法，用于估计肿瘤浸润免疫细胞的比例 | TICPE方法基于基因对的相对表达顺序（REOs），对批次效应不敏感，且在估计免疫细胞比例的准确性上明显优于其他方法 | NA | 开发一种新的方法来估计特定类型癌症中肿瘤浸润免疫细胞的比例，并探讨免疫细胞浸润对免疫治疗效果和癌症预后的影响 | 结直肠癌（CRC）和黑色素瘤 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | mRNA混合物数据、免疫组织化学数据和模拟的批量RNA测序样本 | 使用了公共表达数据和模拟样本 |
| 23797 | 2024-08-09 |
GPCRomics of Homeostatic and Disease-Associated Human Microglia
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.674189
PMID:34054860
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研究论文 | 本文通过分析公开的RNA测序数据，研究了人类和小鼠大脑中微胶质细胞的G蛋白偶联受体（GPCRs）表达情况 | 首次系统性地揭示了微胶质细胞中GPCRs的表达模式，并探讨了其在脑疾病中的潜在作用 | 研究主要基于公开的RNA测序数据，可能存在样本选择偏差 | 探讨GPCRs在人类微胶质细胞中的表达及其在脑生理和病理过程中的作用 | 人类和小鼠大脑中的微胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和小鼠大脑的批量和单细胞样本 |
| 23798 | 2024-08-09 |
Updating the pathophysiology of arthritic bone destruction: identifying and visualizing pathological osteoclasts in pannus
2021-Dec, Immunological medicine
IF:2.7Q2
DOI:10.1080/25785826.2021.1913883
PMID:34010590
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序和活体成像技术在关节炎骨破坏病理生理学中的应用 | 应用单细胞RNA测序技术揭示了炎症滑膜中成熟破骨细胞前体的异质性，并使用活体成像技术实时观察破骨细胞和免疫细胞的动态 | NA | 探讨破骨细胞在关节炎骨侵蚀中的作用及其前体细胞的异质性 | 破骨细胞及其前体细胞在不同组织环境中的起源和特性 | 数字病理学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、多光子显微镜活体成像 | NA | RNA序列、图像 | NA |
| 23799 | 2024-08-09 |
Interfacing Seurat with the R tidy universe
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab404
PMID:34028547
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研究论文 | 本文介绍了tidyseurat，一个轻量级的适配器，用于将Seurat对象与tidyverse生态系统接口，以便用户可以使用熟悉的语法进行单细胞RNA测序数据分析 | 开发了tidyseurat适配器，使得Seurat对象能够与tidyverse生态系统无缝对接，提高了数据操作和可视化的效率 | NA | 提供一个面向tidyverse的Seurat接口，以便数据科学社区的用户能够使用熟悉的语法进行操作 | Seurat对象与tidyverse生态系统的接口 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | NA |
| 23800 | 2024-08-09 |
Deep cross-omics cycle attention model for joint analysis of single-cell multi-omics data
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab403
PMID:34028557
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研究论文 | 本文提出了一种深度跨组学生命周期注意力（DCCA）模型，用于单细胞多组学数据的联合分析 | DCCA模型结合了变分自编码器（VAEs）和注意力转移技术，能够利用一种组学数据来微调为另一种组学数据训练的网络 | NA | 旨在解决单细胞多组学数据集成分析中由于稀疏性、异质性和维度差异带来的挑战 | 单细胞转录组学和表观组学数据 | 机器学习 | NA | 变分自编码器（VAEs） | 深度跨组学生命周期注意力（DCCA）模型 | 多组学数据 | 涉及模拟数据和来自不同平台的真实数据 |