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当前共找到 34750 篇文献，本页显示第 2361 - 2380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2361 | 2025-11-28 |
ScReNI: Single-cell Regulatory Network Inference Through Integrating scRNA-seq and scATAC-seq Data
2025-Sep-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf060
PMID:40591481
|
研究论文 | 开发了一种名为ScReNI的新型算法，通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据推断单细胞水平的基因调控网络 | 提出首个能够同时分析配对和非配对scRNA-seq与scATAC-seq数据集的算法，采用改进的随机森林推断非线性调控关系，并具备识别细胞富集调控因子的独特功能 | NA | 开发单细胞特异性调控网络推断方法 | 单细胞基因表达与染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 最近邻算法, 改进的随机森林 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 2362 | 2025-11-28 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671333
PMID:40894744
|
研究论文 | 本研究系统评估了整合单细胞和单核RNA测序数据以改进批量RNA-seq反卷积的方法 | 首次系统比较多种整合策略，发现过滤跨模态差异表达基因和使用条件变分自编码器可显著提升反卷积精度 | 研究仅基于四种组织类型，对于更广泛组织类型的适用性需要进一步验证 | 提高批量RNA测序反卷积的准确性 | 单细胞RNA测序和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 | 变分自编码器, 主成分分析 | 基因表达数据 | 四种不同组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2363 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomic data reveal the cellular heterogeneity of glutamine metabolism in gastric premalignant lesions and early gastric cancer
2025-Apr-23, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025061
PMID:40264416
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据揭示了胃前病变和早期胃癌中谷氨酰胺代谢的细胞异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘胃前病变和早期胃癌的谷氨酰胺代谢特征，并鉴定ERO1LB为关键调控因子 | 样本量相对有限，仅包含慢性萎缩性胃炎和早期胃癌病变 | 探究胃前病变和恶性病变中谷氨酰胺代谢的细胞异质性特征 | 慢性萎缩性胃炎和早期胃癌病变组织 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22511个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2364 | 2025-11-28 |
The immune checkpoint regulator CD40 potentiates myocardial inflammation
2025-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00633-1
PMID:40217124
|
研究论文 | 本研究揭示CD40激动剂通过激活CCR2巨噬细胞和招募效应记忆CD8 T细胞重塑心脏免疫环境并促进心肌炎症 | 首次发现CD40激动剂通过CCR2巨噬细胞与CD8 T细胞间的IL-12b/TNF/IFNγ信号正反馈环路驱动心肌炎症 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性需进一步验证 | 探究CD40激动剂引发心肌炎症的潜在机制 | 遗传工程小鼠模型的心脏免疫细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 细胞清除研究 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2365 | 2025-11-28 |
Multiscale Cell-Cell Interactive Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Jan-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5743704/v1
PMID:39801521
|
研究论文 | 提出多尺度细胞-细胞交互空间转录组学分析方法，整合多尺度拓扑表示与空间深度学习技术 | 首次在空间转录组学分析中考虑多尺度细胞-细胞相互作用，结合多尺度拓扑表示与先进空间深度学习技术 | NA | 改进空间转录组数据分析方法，更好地识别空间域和细胞间相互作用 | 空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 空间深度学习 | 空间基因表达数据 | 37个基准空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2366 | 2025-11-28 |
SLC16A3 is a Prognostic Marker and Affects Immune Regulation in Bladder Cancer
2025, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究系统分析了SLC16A3在膀胱癌中的表达及其与预后的关系，探讨了其通过调节代谢和m6A甲基化影响免疫浸润的机制 | 首次系统分析SLC16A3在膀胱癌中的预后价值和免疫调节功能，建立了可靠的预后模型 | 研究主要基于公共数据库和回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探讨SLC16A3在膀胱癌中的预后价值和免疫调节机制 | 膀胱癌患者和膀胱癌细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，逆转录定量PCR，免疫组织化学，生物信息学分析 | 预后模型 | 基因表达数据，临床数据，单细胞测序数据 | 412例膀胱癌患者和3,115个膀胱癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2367 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomics profiling reveals cellular origins and molecular drivers underlying melanoma brain metastasis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336502
PMID:41284647
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了黑色素瘤脑转移的细胞起源和分子驱动机制 | 首次识别出与脑转移相关的肿瘤细胞亚群MBMATCs，并开发了能够预测脑转移风险的MBM-Index生物标志物 | 样本量相对有限（26个黑色素瘤样本），需要在更大队列中进一步验证 | 探索黑色素瘤脑转移的细胞起源和分子机制 | 黑色素瘤患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 26个黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 2368 | 2025-11-28 |
Integrative Bulk and Single-Cell Transcriptome Analyses Reveal Mitochondrial Metabolism-Related Biomarkers in IgA Nephropathy with Experimental Validation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S565202
PMID:41287774
|
研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞RNA测序分析，鉴定IgA肾病中线粒体代谢相关生物标志物CYP27B1和PCK1 | 首次整合批量转录组和单细胞RNA测序分析揭示IgA肾病中线粒体代谢相关生物标志物，并确定近端肾小管细胞为关键细胞类型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 确定线粒体代谢相关生物标志物在IgA肾病中的作用 | IgA肾病患者的转录组数据 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 逆转录定量PCR | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2369 | 2025-11-28 |
Elevated ITGAV Expression in Seropositive Rheumatoid Arthritis: Diagnostic Potential and Immunopathological Insights
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S540469
PMID:41287769
|
研究论文 | 本研究探讨整合素αV（ITGAV）在血清阳性类风湿关节炎中的表达及其作为诊断生物标志物的潜力 | 首次系统评估ITGAV在类风湿关节炎中的诊断价值，并通过单细胞转录组分析揭示其在炎症免疫细胞亚群中的特异性表达 | 需要未来纵向和功能研究验证其在个性化疾病管理中的作用 | 研究ITGAV作为类风湿关节炎潜在诊断生物标志物的价值 | 类风湿关节炎患者、骨关节炎患者和健康对照者的外周血样本 | 生物医学研究 | 类风湿关节炎 | ELISA, 单细胞RNA测序, 转录组分析, ROC曲线分析 | NA | 血液样本, 转录组数据, 临床参数 | 类风湿关节炎患者、骨关节炎患者和健康对照者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2370 | 2025-11-27 |
CAP-CD56+CD271+ BMSCs exos-loaded PVA/SA sustained-release hydrogel attenuates chondrocyte senescence and ameliorates lumbar facet joint osteoarthritis
2026-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.10.027
PMID:41282412
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型CAP-CD56+CD271+ BMSCs外泌体-PVA/SA水凝胶缓释系统，用于治疗腰椎小关节骨关节炎 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定CD56+CD271+ BMSCs亚群，并开发了软骨细胞特异性抗原肽修饰的外泌体联合水凝胶缓释系统 | NA | 开发针对腰椎小关节骨关节炎的靶向治疗方法并阐明其分子机制 | 骨髓间充质干细胞亚群、外泌体、水凝胶材料和软骨细胞 | 组织工程与再生医学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 分子实验, 体外和体内实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2371 | 2025-11-27 |
Mechanically adaptive Mg-Ti composites guided by single-cell insights accelerate load-bearing bone regeneration via dual modulation of osteogenesis and osteoclastogenesis
2026-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.10.038
PMID:41282413
|
研究论文 | 本研究开发了一种机械适应性Mg-Ti复合材料，通过单细胞RNA测序指导，实现成骨和破骨细胞生成的双重调节，加速承重骨再生 | 首次结合单细胞RNA测序揭示Mg选择性促进MSCs成骨分化并抑制破骨前体细胞成熟的分子机制，设计出机械性能随时间自适应优化的复合材料 | 研究仅报告了8周内的实验结果，长期效果和临床转化潜力需要进一步验证 | 开发能够同时满足机械稳定性和生物整合性的承重骨修复材料 | 镁钛复合材料在骨再生过程中的生物学效应和机械性能 | 组织工程与再生医学 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序，3D打印技术 | NA | 基因表达数据，机械性能数据，组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2372 | 2025-11-27 |
HyperDiffuseNet: A Deep Hyperbolic Manifold Learning Method for Dimensionality Reduction in Spatial Transcriptomics
2025-Dec, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666251377097
PMID:40982255
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研究论文 | 提出一种基于双曲流形学习的深度几何学习框架HyperDiffuseNet，用于空间转录组数据的降维表示 | 首次将双曲潜在空间与变分自编码器结合用于空间转录组数据，通过图卷积网络学习多尺度空间依赖关系并整合扩散矩阵到双曲嵌入中 | 仅在多个ST数据集上进行了实证评估，未涉及更广泛的生物学验证或临床应用 | 解决空间转录组数据高维度和复杂空间层次结构分析挑战 | 空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 变分自编码器, 图卷积网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2373 | 2025-11-27 |
stPipe: a flexible and streamlined R/Bioconductor pipeline for preprocessing sequencing-based spatial transcriptomics data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf167
PMID:41278534
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研究论文 | 介绍了一个用于预处理测序空间转录组数据的灵活简化R/Bioconductor流程stPipe | 开发了首个全面模块化的预处理流程，支持所有主流测序空间转录组平台，提供统一的数据处理标准 | 仅支持测序空间转录组数据，不包含基于成像的空间转录组技术 | 解决不同空间转录组平台数据预处理标准化和简化的问题 | 测序空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seq, Stereo-seq | 支持所有主流测序空间转录组平台 |
| 2374 | 2025-11-27 |
An engineered human hepatitis A virus capable of rapid proliferation in vitro and causing hepatitis in mice
2025-Dec, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101582
PMID:41281447
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研究论文 | 通过理性诱变开发了一种能在体外快速增殖并能在小鼠体内引发甲型肝炎的工程化人类甲型肝炎病毒 | 开发了具有遗传可操作性的重组HAV-2m病毒，在体外复制效率高，并建立了能诱导急性甲型肝炎的小鼠模型，揭示了病毒2C蛋白中的新型毒力决定因子 | 研究使用Ifnar1基因敲除小鼠模型，可能不能完全模拟人类免疫系统对HAV的反应 | 开发遗传可操作的甲型肝炎病毒模型以促进发病机制研究和抗病毒策略评估 | 工程化人类甲型肝炎病毒(HAV-2m)和Ifnar1-/-小鼠 | 病毒学 | 甲型肝炎 | 单细胞RNA测序, 理性诱变, 反向遗传学 | 动物模型 | 基因序列数据, 病理学数据, 血清生化数据 | Ifnar1-/-小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2375 | 2025-11-27 |
Unraveling the Role of PTGIR in Atrial Fibrillation: Insights From Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization
2025-Nov-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501843RR
PMID:41292196
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法揭示了PTGIR基因在心房颤动发病机制中的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，系统识别心房颤动相关的关键基因和信号通路 | 样本量相对有限，仅包含47,565个细胞，需要在更大规模研究中验证 | 探究心房颤动的分子机制，特别是与心房纤维化的关联 | 心房颤动患者和对照样本中的细胞，以及大鼠模型 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 蛋白验证分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 47,565个细胞（来自AF和对照样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2376 | 2025-11-27 |
Investigating the impact of MCTP2 on immune suppression and drug resistance in glioblastoma
2025-Nov-26, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01738-3
PMID:41291342
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研究论文 | 本研究探讨MCTP2在胶质母细胞瘤复发中的关键作用及其对免疫抑制和耐药性的影响机制 | 首次揭示MCTP2作为胶质母细胞瘤免疫逃逸和耐药性的新型促进因子，并发现其与免疫检查点标志物PD-L1和CTLA-4的关联 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏大规模临床验证 | 探索MCTP2在胶质母细胞瘤复发和耐药性中的作用机制 | 胶质母细胞瘤样本和患者来源的类器官模型 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,Western blotting,集落形成实验 | 患者来源类器官模型 | 转录组数据,蛋白质表达数据 | 来自TCGA和CGGA数据库的原发性和复发性胶质母细胞瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2377 | 2025-11-27 |
Circadian Control of Neutrophils Drives Collateral Perfusion and Stroke Outcome
2025-Nov-26, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326438
PMID:41293815
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研究论文 | 本研究揭示了昼夜节律通过调控中性粒细胞功能和NETs形成影响侧支灌注和卒中结局的机制 | 首次阐明昼夜节律通过调控中性粒细胞功能和NETs形成影响卒中侧支灌注的具体机制 | 动物模型与人类研究存在物种差异，临床样本量有限 | 探究昼夜节律调控中性粒细胞功能对卒中侧支灌注和预后的影响 | 小鼠模型和540例缺血性卒中患者 | 神经科学 | 缺血性卒中 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，激光散斑成像 | NA | 基因表达数据，影像数据，临床数据 | 小鼠模型和540例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2378 | 2025-11-27 |
Mesenchymal Stem Cell-Derived Extracellular Vesicles Modulate the Course of Peritoneal Inflammation Through Metabolic and Epigenetic Regulation
2025-Nov-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508645
PMID:41293953
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研究论文 | 本研究揭示了间充质干细胞来源的细胞外囊泡通过代谢和表观遗传调控调节腹膜炎症过程的新机制 | 首次发现乳酸积累通过促进组蛋白H3K18乳酸化修饰激活CCL2转录，是腹膜纤维化的关键驱动因素，并证明MSC-EVs可通过重编程糖代谢抑制这一过程 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探索腹膜纤维化的发病机制及开发新型治疗策略 | 腹膜间皮细胞、巨噬细胞、间充质干细胞来源的细胞外囊泡 | 细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、组蛋白修饰分析、代谢重编程 | 动物模型 | 基因表达数据、组织学数据 | 小鼠腹膜纤维化模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2379 | 2025-11-27 |
TMEM131-Mediated Soluble TRAIL Triggered Type II Alveolar Epithelial Cell Senescence in Radiation-Induced Lung Injury
2025-Nov-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509973
PMID:41293955
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研究论文 | 本研究揭示了TMEM131介导的可溶性TRAIL通过抑制线粒体自噬引发II型肺泡上皮细胞衰老在放射性肺损伤中的机制 | 首次发现TMEM131介导TRAIL从内质网向高尔基体运输的分泌过程，并阐明其在放射性肺损伤中促进细胞衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证相对有限 | 阐明放射性肺损伤的发病机制并寻找治疗策略 | II型肺泡上皮细胞、TRAIL蛋白、TMEM131蛋白 | 分子生物学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 免疫沉淀质谱, 多色免疫荧光 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 小鼠肺组织样本和RILI患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2380 | 2025-11-27 |
Relevance of Clonal Hematopoiesis in Immune Cells for Degenerative Aortic Valve Stenosis
2025-Nov-26, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.044406
PMID:41294132
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综述 | 本文综述了意义未明克隆性造血在退行性主动脉瓣狭窄中的临床相关性及其对心功能的影响 | 首次系统阐述CHIP与AVS的关联机制，包括炎症通路分析和实验模型验证 | 主要基于现有研究综述，缺乏原始数据验证 | 探讨CHIP在退行性主动脉瓣狭窄发病机制中的作用 | 退行性主动脉瓣狭窄患者和实验动物模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 荧光激活细胞分选, 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据, 实验数据 | 约三分之一严重AVS患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |