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当前共找到 37368 篇文献,本页显示第 2361 - 2380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2361 2026-02-13
Modeling cell-cell interactions to advance drug discovery in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种基于支架的人源共培养肺泡类器官模型,用于模拟特发性肺纤维化(IPF)的起始和进展过程 开发了首个利用健康与IPF患者原代肺成纤维细胞及携带家族性IPF突变(SFTPC 173T)的iPSC来源肺泡II型细胞构建的三维共培养类器官模型,以模拟纤维化过程中的上皮-间质细胞通讯 模型虽能模拟疾病进展的关键特征,但仍为体外系统,可能无法完全复制体内复杂的微环境及全身性因素 开发一种能有效模拟特发性肺纤维化(IPF)起始与进展的体外模型,以研究其发病机制并评估抗纤维化药物的疗效 健康及IPF患者的人原代肺成纤维细胞、携带SFTPC 173T突变(家族性IPF)或同基因校正对照的诱导多能干细胞(iPSC)来源的肺泡II型(iAT2)细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 三维共培养类器官模型 基因表达数据(单细胞水平) 未明确具体样本数量,但使用了来自健康个体和IPF患者的原代细胞以及基因工程改造的iPSC系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2362 2026-02-13
scPER: A Rigorous Computational Approach to Determine Cellular Subtypes in Tumors Aligned With Cancer Phenotypes From Total RNA Sequencing
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 提出了一种名为scPER的计算方法,用于从总RNA测序数据中估计肿瘤微环境细胞组成并识别与表型相关的细胞亚群 结合对抗自编码器和极端梯度提升技术,整合多个scRNA-seq数据集构建综合参考面板,有效分离混杂因素与真实信号 NA 开发一种计算方法来估计肿瘤微环境中的细胞比例并识别与癌症表型相关的细胞亚群 肿瘤微环境中的细胞亚型 机器学习 癌症 单细胞RNA测序,总RNA测序 对抗自编码器,极端梯度提升 RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq,总RNA-seq NA NA
2363 2026-02-13
Mapping heterogeneity in the tumor microenvironment of renal cell carcinoma through single-cell omics
2026-Feb, Trends in cancer IF:14.3Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术在揭示肾细胞癌肿瘤微环境异质性方面的应用与发现 整合多种单细胞技术(scRNA-seq、snRNA-seq、scATAC-seq、scTCR-seq和成像质谱流式)的系统性综述,首次全面定义RCC中CD8 T细胞亚群、耗竭轨迹及多种免疫细胞(如TAMs、DCs、NK细胞、CAFs)的起源、表型多样性和功能状态 作为综述文章,未涉及原始实验数据,结论依赖于已发表研究的整合分析 解析肾细胞癌肿瘤微环境的细胞与分子异质性,为精准免疫治疗提供依据 肾细胞癌的肿瘤微环境细胞(包括恶性细胞、CD8 T细胞、肿瘤相关巨噬细胞、树突状细胞、自然杀伤细胞、癌症相关成纤维细胞等) 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序、单核RNA测序、转座酶可及染色质测序、T细胞受体测序、成像质谱流式 NA 单细胞组学数据、空间多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
2364 2026-02-13
ADME Profiling of Quantum Dots and Immune Responses: Impact of Dynamic Inflammatory Mediator Changes on the Nervous System
2026-Feb, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
研究论文 本文系统评估了CdTe量子点在体内的分布、神经行为效应及细胞响应,揭示了其诱导神经毒性的多细胞机制 首次通过单细胞RNA测序技术,在单细胞分辨率下揭示了量子点暴露后海马组织中微胶质细胞、少突胶质前体细胞和内皮细胞在炎症、氧化和细胞应激通路中的协同作用 研究仅使用小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且仅评估了短期暴露效应,长期神经毒性影响尚不明确 评估CdTe量子点的神经毒性及其潜在机制,为纳米材料的生物医学应用安全性提供依据 小鼠(经尾静脉注射巯基丙酸修饰的CdTe量子点) 神经科学 神经毒性 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确样本数量,但基于小鼠海马组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2365 2026-02-13
Tissue-Derived Extracellular Vesicles Define Diagnostic Biomarkers for Renal Cell Carcinoma
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles IF:15.5Q1
研究论文 本研究通过分析组织来源的细胞外囊泡,鉴定出肾细胞癌不同亚型的诊断生物标志物 首次利用组织来源的细胞外囊泡作为肾细胞癌亚型分化的诊断标志物,并通过单细胞测序数据揭示了这些标志物的细胞来源 研究样本量未在摘要中明确说明,且外部验证队列的详细信息未提供 探索组织来源的细胞外囊泡作为肾细胞癌亚型诊断生物标志物的价值 肾细胞癌患者的配对肿瘤和正常组织及其对应的组织来源细胞外囊泡 数字病理学 肾细胞癌 单细胞测序 NA 生物分子数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2366 2026-02-13
Integrated transcriptomic analysis reveals mitochondrial dysregulation and macrophage heterogeneity associated with MTHFD2 in glioblastoma
2026-Jan-31, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合转录组分析,揭示了线粒体功能障碍和与MTHFD2相关的巨噬细胞异质性在胶质母细胞瘤中的关键作用 首次将MTHFD2鉴定为胶质母细胞瘤的诊断性线粒体枢纽基因,并利用单细胞RNA测序揭示了其在肿瘤相关巨噬细胞中的高表达和功能,关联了线粒体活性、巨噬细胞亚群分化状态与肿瘤进展 研究主要基于转录组数据集和体外实验,缺乏体内模型验证;单细胞分析的数据集可能有限,需要更多独立队列验证 探究胶质母细胞瘤中线粒体基因改变及其细胞特异性,特别是巨噬细胞异质性在肿瘤进展和免疫调节中的作用 胶质母细胞瘤患者样本(来自TCGA-GBM、GSE66354数据集)及体外培养的胶质母细胞瘤细胞和巨噬细胞 生物信息学与计算生物学 胶质母细胞瘤 转录组分析、单细胞RNA测序、Cox回归分析、功能富集分析、伪时间分析、体外功能实验(细胞增殖、侵袭、集落形成、迁移实验) NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 基于TCGA-GBM和GSE66354数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2367 2026-02-13
Insight into modulating osteoarthritis progression: lncRNAs and TGF-β/Smad signalling pathway
2026-Jan-28, Clinical and experimental rheumatology IF:3.4Q2
综述 本文系统探讨了长链非编码RNA通过TGF-β/Smad信号通路调节骨关节炎软骨修复的分子机制及其临床转化策略 系统总结了lncRNAs通过TGF-β/Smad通路调控骨关节炎进展的分子机制,并整合了基于lncRNA的纳米颗粒递送、基因编辑等新型临床转化策略 lncRNA疗法在靶向递送效率和特异性方面仍面临挑战 探讨lncRNAs通过TGF-β/Smad信号通路调控骨关节炎进展的分子机制及治疗潜力 长链非编码RNA、TGF-β/Smad信号通路、骨关节炎 NA 骨关节炎 单细胞测序、基因编辑 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2368 2026-02-13
4D multimodal wound healing atlas reveals organ-level controls of repair phase transitions
2026-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过构建一个4D多模态伤口愈合图谱,揭示了器官水平上控制修复阶段转换的分子逻辑 首次创建了器官尺度的4D多模态伤口愈合图谱,整合了snRNA-seq、scRNA-seq、CITE-seq和高清空间转录组学,克服了传统图谱的技术限制,发现了之前被遗漏的关键角质形成细胞亚群及其在协调修复中的核心作用 研究主要基于小鼠模型,虽然进行了跨物种验证,但人类数据可能仍受解离诱导的伪影影响 解码哺乳动物伤口愈合在器官尺度的系统级原则,揭示修复阶段转换的分子控制机制 小鼠皮肤伤口愈合过程中的细胞状态和组织系统 空间转录组学 伤口愈合障碍 snRNA-seq, scRNA-seq, CITE-seq, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 超过725,000个小鼠单细胞和空间转录组 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA NA
2369 2026-02-13
Unveiling cholesterol metabolism-related gene ACOX2: a multi-omics discovery of a novel biomarker in IgA nephropathy
2026-Jan-15, Hereditas IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过多组学整合分析,揭示了胆固醇代谢相关基因ACOX2在IgA肾病中的保护性作用,并探索了其作为新型生物标志物的潜力 首次将GWAS、SMR、贝叶斯共定位、scRNA-seq、分子对接和分子动力学模拟等多组学方法整合,系统性地识别了IgA肾病中胆固醇代谢的关键调控基因ACOX2,并发现其与疾病风险的负相关关系 研究主要基于遗传和转录组数据,缺乏直接的体内功能验证实验,且分子对接结果需进一步实验证实 探究胆固醇代谢在IgA肾病中的作用机制,并识别关键调控基因作为潜在生物标志物 IgA肾病(IgAN)患者及相关遗传和转录组数据 生物信息学 肾脏疾病 GWAS, SMR, 贝叶斯共定位, scRNA-seq, 分子对接, 分子动力学模拟 NA 遗传数据, 转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2370 2026-02-13
T-cell exhaustion indicator characterizes the tumor microenvironment landscape and predicts colon adenocarcinoma prognosis via integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-sequencing
2026-Jan-14, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq和bulk RNA测序数据,构建了一个基于T细胞耗竭相关基因的预后模型,用于预测结肠腺癌患者的生存和治疗反应,并验证了FAT4基因在COAD细胞中的功能作用 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据,构建了基于T细胞耗竭相关基因的预后特征,并验证了FAT4基因在COAD中的调控作用 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床研究验证 阐明T细胞耗竭与结肠腺癌预后的关系,并开发预后预测模型 结肠腺癌患者和COAD细胞系 生物信息学 结肠癌 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 流式细胞术, RT-qPCR GSVA, 单变量Cox, LASSO, 随机森林 转录组数据 来自TCGA和GEO数据库(GSE103479, GSE17536)的结肠腺癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2371 2026-01-16
stRGAT: identifying spatial domains in spatial transcriptomics via a relational graph attention network
2026-Jan-14, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2372 2026-02-13
A novel anoikis resistance-associated gene model for prognostic prediction and immune microenvironment characterization in lung squamous cell carcinoma
2026-Jan-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究构建了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的预后模型,用于预测肺鳞状细胞癌患者的生存结果并表征肿瘤免疫微环境 首次在肺鳞状细胞癌中构建并验证了一个基于失巢凋亡抵抗相关基因的预后模型,揭示了该模型与肿瘤免疫微环境特征及免疫治疗反应性的关联 研究主要基于回顾性队列数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床实用性 开发一个能够预测肺鳞状细胞癌患者预后并指导精准免疫治疗的基因模型 肺鳞状细胞癌患者及其肿瘤组织样本 生物信息学 肺癌 单细胞转录组学、通路富集分析、LASSO回归、Cox比例风险分析 预后风险评分模型 基因表达数据、临床数据 内部验证队列(TCGA-LUSC)和外部验证队列(GSE73403、GSE74777) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2373 2026-02-13
NR4A1 limits CD8+ T Cell effector responses and protection in tuberculosis
2026-Jan-13, Research square
研究论文 本研究通过小鼠、猕猴和人类数据验证,发现核受体NR4A1是结核病中CD8 T细胞免疫的关键抑制因子,并揭示了NR4A1-NKG7轴作为新的宿主导向治疗靶点 首次将NR4A1鉴定为结核病中CD8 T细胞免疫的负调控因子,并通过空间分析、ChIP-qPCR和药理学抑制验证了其作用机制 研究主要基于动物模型和体外实验,人类数据验证可能有限,且药理学抑制的长期效果和安全性未充分评估 探究NR4A1在结核病感染期间对CD8 T细胞效应功能和免疫保护的调控作用 小鼠、猕猴和人类数据集中的CD8 T细胞 免疫学 结核病 单细胞RNA测序、空间分析、ChIP-qPCR、药理学抑制 NA 基因表达数据、空间转录组数据 涉及小鼠、猕猴和人类数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2374 2026-02-13
Maternal Trypanosoma cruzi infection is associated with significant placental remodeling regardless of vertical transmission
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了母体克氏锥虫感染对胎盘微环境和全身生理的影响,及其与先天性传播的关联 将先天性恰加斯病的概念框架从以传播为中心转变为认识到感染驱动的胎盘损伤是一个病理谱,并确定外周血作为预测不良妊娠结局生物标志物的非侵入性来源 先天性恰加斯传播的机制仍不完全清楚,需要进一步应用单细胞分辨率方法来完善发病机制模型 探究母体克氏锥虫感染是否改变胎盘微环境和全身生理,以及这些改变是否与先天性传播相关 感染克氏锥虫的孕妇及其胎盘组织 空间转录组学 恰加斯病 bulk RNA测序, 蛋白质组学, 空间转录组学 NA RNA序列数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
2375 2026-02-13
A technical comparison of spatial transcriptomics platforms across six cancer types
2026-Jan-12, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本研究系统性地比较了五种商业空间转录组学平台在六种癌症类型FFPE样本中的技术性能 首次在相同FFPE肿瘤样本上同时评估基于测序和基于成像的空间转录组学平台,并首次比较Xenium Multi-Tissue与Xenium Prime在同一样本上的表现 研究主要关注商业平台的技术比较,可能未涵盖所有新兴技术或非商业方法 为空间转录组学社区提供FFPE肿瘤高通量空间分析的技术基准和设计参考 六种癌症类型的匹配FFPE人类肿瘤切片 空间转录组学 多种癌症类型 空间转录组学 NA 空间转录组数据、蛋白质数据 六种癌症类型的匹配FFPE肿瘤切片 10x Genomics, NanoString 空间转录组学, 空间多组学 Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium, CosMx Visium v1, Visium v2/CytAssist, Visium HD, Xenium Multi-Tissue (377基因), Xenium Prime (5,000基因), CosMx
2376 2026-02-13
Intracellular microbial signals in the gastrointestinal tract of dairy cattle
2026-Jan-12, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了奶牛胃肠道细胞内微生物信号的存在及其与瘤胃发育的潜在关联 首次在奶牛胃肠道上皮细胞中应用单细胞宿主-微生物互作分析(SAHMI),并识别出与特定微生物物种相关的细胞内微生物信号 研究样本数量有限,仅包括新生和成年奶牛,且微生物信号的功能验证仍需进一步实验 探究奶牛胃肠道细胞内微生物的存在及其对瘤胃发育的影响 奶牛胃肠道组织,包括十种组织类型,来自新生和成年个体 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,细菌荧光原位杂交(FISH) NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 来自新生和成年奶牛的十种胃肠道组织类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2377 2026-02-13
IL-25-ILC2-IL-13 axis improves traumatic brain injury by mediating CXCL-10-dependent regulation of blood brain barrier integrity
2026-Jan-12, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了IL-25通过激活ILC2细胞分泌IL-13,进而抑制CXCL-10和内皮细胞焦亡,从而改善创伤性脑损伤后血脑屏障完整性和神经功能的机制 首次阐明了IL-25-ILC2-IL-13轴在TBI后BBB修复中的保护作用,并确定了CXCL-10介导的内皮细胞焦亡是关键的调控环节 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性尚需进一步验证;机制研究主要在急性期进行,长期效应未明确 探究IL-25对创伤性脑损伤后血脑屏障完整性和神经功能的保护作用及其分子机制 小鼠创伤性脑损伤模型、脑微血管内皮细胞、第2组固有淋巴细胞 神经科学 创伤性脑损伤 酶联免疫吸附试验、免疫荧光染色、流式细胞术、细胞因子阵列、Western blot、单细胞RNA测序 NA 蛋白质表达数据、RNA测序数据、行为学数据、影像学数据 未明确说明具体数量的小鼠模型和细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2378 2026-02-13
Zebrafish radial glia orchestrate vascular regeneration: implications for bionic therapy of spinal cord injury
2026-Jan-09, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究利用斑马鱼模型,揭示了放射状胶质细胞在脊髓损伤后血管再生中的关键调控作用及其潜在信号通路 首次在斑马鱼脊髓损伤模型中,通过化学消融放射状胶质细胞,明确了其在调控血管再生中的核心作用,并揭示了Vegfa-PI3K/Akt-mTOR和Notch信号通路可能参与此过程 研究基于斑马鱼模型,其结论向哺乳动物(如人类)的转化应用仍需进一步验证 探究脊髓损伤后血管再生的调控模式,为仿生治疗脊髓损伤提供新思路 斑马鱼(特别是Tg(gfap: NTR-mCherry)报告品系)的脊髓血管系统和放射状胶质细胞 NA 脊髓损伤 活体成像、化学消融(使用甲硝唑或硝呋吡醇)、单细胞测序数据分析、抑制剂实验 NA 图像数据、表达谱数据、公开的单细胞测序数据集 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2379 2026-02-13
Disruption of bile acid homeostasis potentiates Paneth cell ablation by activating the intestinal Farnesoid X receptor in necrotizing enterocolitis
2026-Jan-08, NPJ biofilms and microbiomes IF:7.8Q1
研究论文 本研究揭示了胆汁酸稳态失衡通过激活肠道法尼醇X受体导致潘氏细胞丢失,从而在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用 首次阐明严重NEC中次级胆汁酸积累通过激活肠道FXR抑制Wnt/PCP信号通路,进而导致潘氏细胞丢失的具体分子机制,并发现通过下调FGFR4破坏肠-肝轴可改善这一过程 研究主要基于动物模型和单细胞测序数据,尚未在临床患者中进行大规模验证 探究胆汁酸稳态失衡在坏死性小肠结肠炎发病机制中的作用 坏死性小肠结肠炎模型中的肠道组织、潘氏细胞、肠道干细胞 单细胞组学 坏死性小肠结肠炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2380 2026-02-13
Organoid Modeling and Single-Cell Profiling Reveal Smooth Muscle Cell Migration in Moyamoya Disease
2026-Jan-07, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学、类器官模型和单细胞RNA测序,揭示了烟雾病中血管平滑肌细胞迁移的分子机制 首次结合血清蛋白质组学、iPSC来源的血管类器官和单细胞RNA测序,系统阐明了TUBA4A和TUBB4B通过GJA1/PI3K/AKT/KLF4通路驱动烟雾病血管重塑的新机制 样本量相对有限(40例患者和20例对照),且类器官模型可能无法完全模拟体内复杂的脑血管环境 探究烟雾病的发病机制,特别是血管平滑肌细胞在病理血管重塑中的作用 烟雾病患者血清样本、健康对照血清样本、iPSC来源的血管类器官、颞浅动脉组织 数字病理学 烟雾病 数据非依赖性采集蛋白质组学、ELISA、组织学染色、转录组学、单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据、RNA测序数据、组织图像 40例烟雾病患者和20例健康对照的血清样本,另加45例队列用于ELISA验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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