单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28196 篇文献，本页显示第 23741 - 23760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23741 | 2024-08-08 |
The Ratio of Exhausted to Resident Infiltrating Lymphocytes Is Prognostic for Colorectal Cancer Patient Outcome
2021-10, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0137
PMID:34413087
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据识别结直肠癌浸润淋巴细胞中的驻留和耗竭特征，并探讨这些特征与患者生存结果的关系 | 首次在结直肠癌浸润淋巴细胞中识别出CD4 T细胞和NK细胞的驻留和耗竭特征，并将其应用于患者生存结果的预测 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据和TCGA数据，未涉及临床试验验证 | 探讨结直肠癌浸润淋巴细胞的驻留和耗竭特征与患者生存结果的关系 | 结直肠癌浸润淋巴细胞，包括CD8、CD4和NK细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 两个独立的转录组数据集来自结直肠癌患者 |
| 23742 | 2024-08-08 |
Neuroinflammatory astrocyte subtypes in the mouse brain
2021-10, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00905-6
PMID:34413515
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠大脑皮质星形胶质细胞在急性炎症刺激后转录组的变化及其随时间和性别的异质性 | 首次在单细胞分辨率下分析了星形胶质细胞在炎症刺激后的快速转录组变化，并揭示了不同亚型的星形胶质细胞具有特定的转录组特征 | NA | 研究星形胶质细胞在急性炎症刺激后的转录组变化及其异质性 | 小鼠大脑皮质星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学, 原位杂交 | NA | 转录组数据 | 约80,000个星形胶质细胞 |
| 23743 | 2024-08-08 |
Hybrid material mimics a hypoxic environment to promote regeneration of peripheral nerves
2021-10, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 研究开发了一种模拟缺氧环境的复合材料，用于促进周围神经的再生 | 该研究挑战了缺氧仅参与周围神经再生的观点，并提供了一种潜在有价值的临床候选材料 | NA | 探索缺氧环境在神经再生中的作用及开发相关功能材料 | 周围神经缺陷及其再生过程中的细胞和组织结构 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 23744 | 2024-08-08 |
Quality control in scRNA-Seq can discriminate pacemaker cells: the mtRNA bias
2021-Oct, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-03916-5
PMID:34427691
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）中质量控制参数对心脏组织分析的影响 | 提出在心血管应用中应避免使用固定的5%线粒体转录本阈值，以防止对起搏细胞的错误排除 | 文章主要关注于质量控制参数的影响，未涉及其他可能影响scRNA-seq结果的因素 | 研究scRNA-seq质量控制参数对心脏组织分析的准确性 | 心脏组织中的起搏细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 文本 | 包括体外生成的诱导窦房体（iSABs）和从胚胎小鼠窦房结组织分离的细胞 |
| 23745 | 2024-08-08 |
Collection of cells for single-cell RNA sequencing using high-resolution fluorescence microscopy
2021-09-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100718
PMID:34401784
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研究论文 | 本文描述了一种使用高分辨率荧光显微镜收集细胞进行单细胞RNA测序的工作流程 | 介绍了VYCAP穿孔系统，该系统克服了FACS在测量亚细胞荧光分布和小样本量方面的局限性 | NA | 开发一种适用于小样本量和亚细胞荧光分布测量的单细胞RNA测序方法 | 人视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 小于1000个细胞 |
| 23746 | 2024-08-08 |
A monocyte/dendritic cell molecular signature of SARS-CoV-2-related multisystem inflammatory syndrome in children with severe myocarditis
2021-09-10, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2021.08.002
PMID:34414385
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研究论文 | 本研究通过多参数方法分析了56名疑似SARS-CoV-2感染住院儿童的血液细胞，以更好地理解与SARS-CoV-2相关的儿童多系统炎症综合征（MIS-C）及其导致的心肌炎。 | 单细胞转录组学分析揭示了一种独特的单核细胞/树突状细胞基因特征，与持续的核因子κB（NF-κB）活性和肿瘤坏死因子α（TNF-α）信号传导相关，并伴有NF-κB抑制剂基因表达的降低。 | NA | 更好地理解与SARS-CoV-2相关的儿童多系统炎症综合征（MIS-C）及其导致的心肌炎的病理生理机制。 | 56名疑似SARS-CoV-2感染住院儿童的血液细胞。 | NA | 心肌炎 | 单细胞转录组学分析 | NA | 血液细胞 | 56名儿童 |
| 23747 | 2024-08-08 |
Arhgef2 regulates mitotic spindle orientation in hematopoietic stem cells and is essential for productive hematopoiesis
2021-08-24, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2020002539
PMID:34406376
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研究论文 | 研究探讨了造血干细胞（HSCs）的细胞分裂轴协调及其对干细胞驱动的造血作用的重要性，并发现ARHGEF2在调控HSCs的有丝分裂纺锤体方向中起关键作用。 | 首次揭示了ARHGEF2在调控造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的有丝分裂纺锤体方向中的作用，及其对造血功能的重要性。 | 研究主要集中在ARHGEF2的功能缺失对HSPCs的影响，未探讨其在其他细胞类型中的作用。 | 探究造血干细胞的分裂轴协调及其对造血作用的影响。 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs）。 | NA | 骨髓衰竭综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 患者样本 |
| 23748 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of glycan and RNA in single cells
2021-Aug-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102882
PMID:34401666
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研究论文 | 本文首次将单细胞测序技术应用于同时分析糖链和RNA，通过scGR-seq方法揭示了细胞异质性和糖链在多细胞系统中的生物学作用 | 首次实现了单细胞水平上糖链和RNA的联合分析 | NA | 探索单细胞水平上糖链和RNA的联合分析方法及其在细胞异质性和生物学功能中的应用 | 人诱导多能干细胞及其分化为神经前体细胞过程中的糖链和RNA | 生物技术 | NA | 单细胞测序 | NA | 糖链和RNA数据 | 人诱导多能干细胞及其分化为神经前体细胞的单细胞样本 |
| 23749 | 2024-08-08 |
NANOS2 suppresses the cell cycle by repressing mTORC1 activators in embryonic male germ cells
2021-Aug-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102890
PMID:34401671
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研究论文 | 本文探讨了NANOS2蛋白在胚胎雄性生殖细胞中通过抑制mTORC1激活因子来抑制细胞周期的机制 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了NANOS2在野生型和KO小鼠睾丸中每个生殖细胞的细胞周期状态，并识别了NANOS2可能通过后转录方式抑制mTORC1活性的机制 | NANOS2调控细胞周期的详细机制仍不清楚 | 研究NANOS2在胚胎雄性生殖细胞中抑制细胞周期的机制 | NANOS2蛋白及其在胚胎雄性生殖细胞中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型和KO小鼠的睾丸生殖细胞 |
| 23750 | 2024-08-08 |
CeTF: an R/Bioconductor package for transcription factor co-expression networks using regulatory impact factors (RIF) and partial correlation and information (PCIT) analysis
2021-Aug-20, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07918-2
PMID:34416858
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研究论文 | 开发了一个名为CeTF的R/Bioconductor包，用于通过RIF和PCIT分析转录因子共表达网络 | CeTF包整合了PCIT和RIF算法，用于从微阵列、RNA-seq或单细胞RNA-seq数据中识别转录因子 | NA | 识别基因表达数据挖掘中基因-基因相互作用和主要的转录因子 | 转录因子在共表达网络中的作用 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA的胃癌RNA-seq数据 |
| 23751 | 2024-08-08 |
BCL9 regulates CD226 and CD96 checkpoints in CD8+ T cells to improve PD-1 response in cancer
2021-08-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00730-0
PMID:34417435
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研究论文 | 研究通过基因敲除和药物抑制BCL9，发现BCL9抑制可减少肿瘤生长，促进CD8 T细胞浸润，并增强对PD-1抑制剂的反应 | 首次揭示BCL9在调节肿瘤免疫微环境中的作用，特别是对CD226和CD96检查点的影响 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨BCL9在肿瘤免疫微环境中的作用及其对PD-1反应的影响 | BCL9在肿瘤免疫微环境中的作用机制及其对CD226和CD96检查点的影响 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠结肠癌模型 |
| 23752 | 2024-08-08 |
Using single-cell sequencing technology to detect circulating tumor cells in solid tumors
2021-08-19, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-021-01392-w
PMID:34412644
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术检测实体瘤中的循环肿瘤细胞 | 通过单细胞测序技术，避免了肿瘤异质性的干扰，提供了理解肿瘤生物过程的新视角 | NA | 探索循环肿瘤细胞的基因组特征及其在肿瘤生物学中的应用 | 循环肿瘤细胞及其在肿瘤类型、转移分析、进展检测和辅助治疗中的应用 | 数字病理学 | 实体瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 23753 | 2024-08-08 |
The MURAL collection of prostate cancer patient-derived xenografts enables discovery through preclinical models of uro-oncology
2021-08-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25175-5
PMID:34413304
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研究论文 | 本文介绍了墨尔本泌尿研究联盟（MURAL）收集的前列腺癌患者来源的异种移植模型（PDXs），旨在通过这些临床前模型加速发现和评估候选治疗方案 | 建立了包含59个肿瘤样本的PDX集合，涵盖了从初治原发性肿瘤到去势抵抗性转移的临床病理和基因组谱，并展示了肿瘤间的异质性 | NA | 建立一个重要的前列腺癌PDX资源，用于快速系统地评估候选治疗方案 | 前列腺癌的PDX模型及其在临床前研究中的应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 59个肿瘤样本来自30名患者 |
| 23754 | 2024-08-08 |
Single-cell evaluation reveals shifts in the tumor-immune niches that shape and maintain aggressive lesions in the breast
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25240-z
PMID:34408137
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和多参数成像技术，在乳腺癌小鼠模型中揭示了肿瘤-免疫微环境的特征，这些特征塑造并维持了乳腺中的侵袭性病变。 | 研究首次揭示了侵袭性肿瘤微环境中基底样细胞群的扩张、肿瘤亚群的特化以及可能作为腔内和基底表型过渡状态的混合谱系肿瘤细胞。 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类乳腺癌中的适用性需要进一步验证。 | 旨在区分乳腺病变中的惰性和侵袭性，以指导个性化治疗。 | 研究对象包括乳腺癌小鼠模型中的肿瘤细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 图像 | 研究涉及小鼠乳腺癌模型 |
| 23755 | 2024-08-08 |
Grafting of iPS cell-derived tenocytes promotes motor function recovery after Achilles tendon rupture
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25328-6
PMID:34408142
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研究论文 | 本文介绍了一种基于诱导多能干细胞（iPSC）的技术，用于开发治疗肌腱损伤的新方法 | 首次使用iPSC衍生的肌腱细胞进行移植，促进肌腱损伤后的运动功能恢复 | NA | 开发一种新的治疗肌腱损伤的方法 | iPSC衍生的肌腱细胞及其在肌腱损伤修复中的应用 | 再生医学 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型 |
| 23756 | 2024-08-08 |
DL4-μbeads induce T cell lineage differentiation from stem cells in a stromal cell-free system
2021-08-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25245-8
PMID:34408144
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研究论文 | 本文报道了一种无基质细胞的微珠基方法，支持从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞（PSCs）来源的CD34细胞高效体外分化为人类前T细胞和T系细胞 | DL4-μbeads与淋巴生成细胞因子一起，诱导从CD34细胞到CD34CD7CD5前T细胞再到CD3αβ T细胞的有序分化序列 | NA | 开发一种临床相关且易于扩展的系统，用于从造血干细胞/祖细胞（HSPCs）生成大量T系细胞 | 从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞（PSCs）来源的CD34细胞分化为人类前T细胞和T系细胞 | 再生医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从脐带血、GCSF动员的外周血和多能干细胞（PSCs）来源的CD34细胞 |
| 23757 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing of immune cells from anticitrullinated peptide antibody positive and negative rheumatoid arthritis
2021-08-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25246-7
PMID:34404786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的类风湿关节炎患者的CD45造血细胞，以揭示不同亚型的免疫发病机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细比较了ACPA阳性和阴性RA患者的免疫细胞亚群，揭示了不同亚型RA的细胞和分子通路的差异 | NA | 探讨抗瓜氨酸肽抗体阳性和阴性的类风湿关节炎患者的免疫发病机制 | ACPA阳性和阴性的类风湿关节炎患者的CD45造血细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自ACPA阳性和阴性RA患者的外周血或滑膜组织中的CD45造血细胞 |
| 23758 | 2024-08-08 |
Spatially defined single-cell transcriptional profiling characterizes diverse chondrocyte subtypes and nucleus pulposus progenitors in human intervertebral discs
2021-Aug-16, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-021-00163-z
PMID:34400611
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对来自年轻和成年健康人类椎间盘的三个主要部分（包括髓核、纤维环和软骨终板）的108个细胞进行了转录组图谱分析 | 首次在人类椎间盘中识别出多种软骨细胞亚型和髓核前体细胞，并揭示了细胞间信号网络在髓核微环境中的重要作用 | NA | 深入理解人类椎间盘的细胞异质性和分子机制，为椎间盘退行性变的临床治疗提供新策略 | 人类椎间盘的细胞类型和分子机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 108个椎间盘细胞 |
| 23759 | 2024-08-08 |
NGF-TrkA signaling dictates neural ingrowth and aberrant osteochondral differentiation after soft tissue trauma
2021-08-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25143-z
PMID:34400627
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研究论文 | 本文研究了软组织创伤后神经生长因子（NGF）-TrkA信号传导在神经纤维侵入和异常软骨骨化分化中的作用 | 首次揭示了NGF-TrkA信号传导在软组织创伤后异常软骨骨化分化中的作用，并提出了其在治疗中的双重用途 | NA | 探讨软组织创伤后NGF-TrkA信号传导对神经纤维侵入和异常软骨骨化分化的影响 | 小鼠的严重肢体损伤模型 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 病理样本和数据库分析 | NA |
| 23760 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals pre-meiotic X-chromosome dosage compensation in Drosophila testis
2021-08, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009728
PMID:34403408
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了果蝇睾丸中的X染色体剂量补偿机制 | 发现X染色体在体细胞和前减数分裂细胞中与常染色体具有相同的转录活性，而在减数分裂和后减数分裂细胞中转录活性较低 | 研究主要集中在果蝇睾丸的单细胞RNA测序数据分析，未涉及其他物种或其他组织类型的研究 | 探讨果蝇睾丸中X染色体剂量补偿的时机和程度 | 果蝇睾丸中的X染色体剂量补偿机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个Drosophila melanogaster品系的睾丸单细胞RNA测序数据 |