单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 23701 - 23720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23701 | 2024-08-08 |
MAAPER: model-based analysis of alternative polyadenylation using 3' end-linked reads
2021-08-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02429-5
PMID:34376236
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于概率模型的方法MAAPER，用于利用靠近多聚腺苷酸位点（PAS）的读取数据进行选择性多聚腺苷酸化（APA）分析 | MAAPER能够高准确度和敏感度地预测PAS，并能对不同类型的APA事件进行稳健的统计分析 | NA | 开发一种新的方法来分析APA isoform的丰度 | 选择性多聚腺苷酸化（APA）isoforms | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 概率模型 | 测序读取数据 | NA |
| 23702 | 2024-08-08 |
Using single-nucleus RNA-sequencing to interrogate transcriptomic profiles of archived human pancreatic islets
2021-08-10, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-021-00941-8
PMID:34376240
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研究论文 | 本文介绍了使用单核RNA测序（snRNA-seq）作为研究移植人胰岛细胞的替代方法，并与单细胞RNA测序（scRNA-seq）进行了比较。 | 引入了snRNA-seq作为研究移植人胰岛细胞的新方法，特别是在scRNA-seq不适用的情况下。 | NA | 探讨snRNA-seq在研究移植人胰岛细胞转录组特征中的应用。 | 人胰岛细胞的转录组特征。 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自同一供体的鲜活和冷冻人胰岛细胞样本。 |
| 23703 | 2024-08-08 |
Chronological genome and single-cell transcriptome integration characterizes the evolutionary process of adult T cell leukemia-lymphoma
2021-08-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-25101-9
PMID:34376672
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研究论文 | 本文开发并利用基于捕获的测序面板，结合深度DNA测序和单细胞RNA测序，研究成人T细胞白血病-淋巴瘤（ATL）的克隆结构，并分析其基因组和转录组特征 | 首次整合基因组和单细胞转录组数据，以研究ATL的进化过程，揭示了与亚克隆扩张和转换相关的特征性基因组和转录组模式 | NA | 研究成人T细胞白血病-淋巴瘤的克隆结构和进化过程 | 成人T细胞白血病-淋巴瘤（ATL）及其前驱个体 | 数字病理学 | 成人T细胞白血病-淋巴瘤 | 基于捕获的测序 | NA | DNA序列和单细胞RNA序列 | 从ATL患者或前驱个体收集的多个时间点样本 |
| 23704 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the dynamics of human immune cells during early fetal skin development
2021-08-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109524
PMID:34380039
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类胎儿皮肤发育早期免疫细胞的转录组动态变化 | 首次揭示了人类胎儿皮肤发育过程中免疫细胞的动态变化和功能成熟过程 | NA | 探究人类胎儿皮肤发育过程中免疫细胞的发育动态 | 人类胎儿皮肤中的CD45造血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13种免疫细胞类型 |
| 23705 | 2024-08-08 |
CoSTA: unsupervised convolutional neural network learning for spatial transcriptomics analysis
2021-Aug-09, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04314-1
PMID:34372758
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CoSTA的新方法，通过卷积神经网络（ConvNet）聚类学习基因表达矩阵之间的空间相似性 | CoSTA强调了空间模式而非像素级相关性，并提供了基因表达模式相似性的定量测量 | NA | 探索空间转录组学技术中基因调控的空间上下文，并提出新的分析方法 | 基因表达矩阵的空间相似性 | 机器学习 | NA | 卷积神经网络（ConvNet） | CNN | 矩阵 | 模拟和已发表的空间转录组学数据 |
| 23706 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of intramedullary canal tissue to improve methods for studying fracture repair biology
2021-08, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/btn-2021-0002
PMID:34374302
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研究论文 | 本文描述了一种从手术中刮取的骨髓腔组织中分离单个细胞进行单细胞RNA测序的技术，旨在详细说明收集和处理骨髓腔组织样本的挑战和解决方案，并展示了这种方法在预期研究中的可行性。 | 开发了一种新的技术，用于从骨髓腔组织中分离单个细胞进行单细胞RNA测序，以研究骨折修复生物学。 | NA | 研究骨折愈合失败的骨微环境，以发现骨折不愈合的生物标志物。 | 骨髓腔组织中的单个细胞。 | 数字病理学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 新鲜和再激活的样本 |
| 23707 | 2024-08-08 |
Measles virus exits human airway epithelia within dislodged metabolically active infectious centers
2021-08, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1009458
PMID:34383863
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研究论文 | 研究麻疹病毒在人类呼吸道上皮细胞中的复制过程，特别是其在脱落感染中心内的代谢活性 | 首次揭示了麻疹病毒在呼吸道上皮细胞中形成并脱落的感染中心，这些中心保持了代谢活性并可能通过咳嗽和打喷嚏传播病毒 | 研究主要集中在体外模型上，可能与真实人体内的病毒行为存在差异 | 探讨麻疹病毒在呼吸道上皮细胞中的复制机制及其传播方式 | 人类呼吸道上皮细胞及麻疹病毒 | NA | 麻疹 | 共聚焦显微镜、单细胞RNA测序、5-乙炔基-2'-脱氧尿苷染色 | NA | 细胞 | 来自肺捐赠者的良好分化的人类呼吸道上皮细胞（HAE） |
| 23708 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Elucidates the Structure and Organization of Microbial Communities
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.713128
PMID:34367118
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示微生物群落结构和组织中的应用 | 介绍了针对细菌特性的scRNA-seq新技术，克服了细菌细胞壁、mRNA半衰期短和低拷贝数等技术难题 | 目前scRNA-seq技术主要应用于真核细胞，对细菌的应用存在挑战 | 旨在更好地理解细胞群体异质性，特别是在工业发酵和传染病中的影响 | 研究对象包括细菌细胞的形态特征、生化性质和基因表达谱的异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 23709 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Complexity of the Tumor Microenvironment of Treatment-Naive Osteosarcoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.709210
PMID:34367994
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了未经治疗的骨肉瘤肿瘤微环境的复杂性 | 首次揭示了骨肉瘤中单细胞转录图谱，并识别了与生存预后相关的关键转录因子 | 研究样本仅来自六名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解骨肉瘤的复杂肿瘤微环境，以开发更精确的治疗方法 | 骨肉瘤患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 29,278个细胞，来自六名患者 |
| 23710 | 2024-08-08 |
Evidence for AJUBA-catenin-CDH4-linked differentiation resistance of mesenchymal stem cells implies tumorigenesis and progression of head and neck squamous cell carcinoma: a single-cell transcriptome approach
2021, Blood and genomics
DOI:10.46701/BG.2021012021106
PMID:34368804
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了间充质干细胞（MSCs）在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）发生和发展中的分子机制 | 首次揭示了AJUBA、β-catenin和CDH4在分化抵抗的MSCs中的上调表达，及其在HNSCC发展中的作用 | 研究仅限于细胞模型和临床队列的初步分析，需要进一步的体内实验验证 | 阐明MSCs在HNSCC中的分子机制，探索基于MSCs的治疗策略 | 间充质干细胞（MSCs）及其在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的作用 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 1780个差异表达基因 |
| 23711 | 2024-08-08 |
PD-L2 based immune signature confers poor prognosis in HNSCC
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1947569
PMID:34377590
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研究论文 | 本文研究了PD-L2在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | 首次揭示了PD-L2作为独立预测因子对HNSCC患者总体生存率的影响，并提出了基于PD-L2的免疫特征作为抗PD-1治疗的有效生物标志物 | NA | 探讨PD-L2在HNSCC中的表达及其作为预后生物标志物的可能性 | HNSCC患者的PD-L2表达及其对生存率的影响 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 生存树分析 | RNA | 62.7%的肿瘤样本和61.4%的PD-L1阴性患者样本 |
| 23712 | 2024-08-08 |
Retention of Prey Genetic Material by the Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum
2021, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2021.694508
PMID:34394035
|
研究论文 | 研究 Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum 是否保留捕食猎物的遗传物质 | 首次证明某些物种中捕获的叶绿体功能与猎物核的同时保留有关，并揭示了猎物核、核形态和核糖体的遗传物质在纤毛虫内可检测到至少5天 | NA | 探讨纤毛虫中猎物遗传物质的潜在保留 | Kleptoplastidic Ciliate Strombidium cf. basimorphum 及其捕食的隐藻 | NA | NA | 分子标记、单细胞转录组学 | NA | 遗传物质、转录本 | NA |
| 23713 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of MAIT Cells in Patients With COVID-19
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.700152
PMID:34394094
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了COVID-19患者和健康捐赠者外周MAIT细胞的转录组特征 | 首次探索了COVID-19患者中MAIT细胞的单细胞转录组特征，并揭示了其在SARS-CoV-2感染中的免疫作用 | 研究样本量较小，仅包括13名COVID-19患者和5名健康捐赠者 | 探究MAIT细胞在COVID-19患者中的免疫反应和转录组特征 | COVID-19患者和健康捐赠者的外周MAIT细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13名COVID-19患者和5名健康捐赠者 |
| 23714 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Retina:New Looks for Gene Marker and Old Diseases
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.699906
PMID:34395530
|
review | 本文系统回顾了单细胞RNA测序技术的发展历程，并总结了该技术发现的新型视网膜细胞亚型及一些特定基因标记，同时讨论了其在视网膜相关疾病诊断方面的进展。 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了视网膜的新细胞亚型和特定基因标记，有助于深入理解疾病的发生和发展。 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在揭示视网膜复杂性和相关疾病诊断中的应用。 | 视网膜细胞及其相关疾病。 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（sRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 23715 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals innate lymphoid cell lineage infidelity in atopic dermatitis
2022-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2021.07.025
PMID:34363841
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了特应性皮炎中先天淋巴细胞谱系的不忠实性 | 首次通过单细胞RNA测序展示了特应性皮炎病变皮肤中先天淋巴细胞谱系的不忠实性 | NA | 更好地理解皮肤先天淋巴细胞（ILCs）在生理和病理条件下的表型和分子特征 | 皮肤先天淋巴细胞（ILCs） | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞样本 | 来自特应性皮炎患者和健康个体的皮肤穿刺活检、减薄片和血液样本 |
| 23716 | 2024-08-08 |
Identification of HSC/MPP expansion units in fetal liver by single-cell spatiotemporal transcriptomics
2022-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00540-7
PMID:34341490
|
研究论文 | 通过单细胞时空转录组学技术，研究了小鼠胎肝中造血干细胞和多能祖细胞（HSC/MPP）的扩展单元 | 发现了新的HSC/MPP '口袋状'单元（HSC PLUS），并验证了巨噬细胞和生长因子在HSC/MPP扩展中的支持作用 | NA | 探索胎肝中HSC/MPP扩展的细胞和分子机制，为基于干细胞的血液恶性肿瘤治疗提供新见解 | 小鼠胎肝中的造血干细胞和多能祖细胞（HSC/MPP） | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胎肝样本 |
| 23717 | 2024-08-08 |
Advances and Challenges in Kidney Organoids
2022, Current stem cell research & therapy
IF:2.1Q4
|
综述 | 本文综述了肾脏类器官的最新进展、应用及面临的挑战 | 介绍了单细胞RNA测序、3D生物打印和微流控技术在肾脏类器官研究中的应用 | 目前缺乏针对肾脏类器官方法学的全面综述 | 总结肾脏类器官的分化方法、应用及挑战 | 肾脏类器官的生成及其在体外细胞培养系统中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序、3D生物打印、微流控技术 | NA | NA | NA |
| 23718 | 2024-08-08 |
A single-cell morpho-transcriptomic map of brassinosteroid action in the Arabidopsis root
2021-12-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2021.07.021
PMID:34358681
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研究论文 | 本研究结合数字三维单细胞形态分析和单细胞mRNA测序，探讨了油菜素内酯信号在拟南芥根中的作用 | 首次揭示了油菜素内酯信号对细胞分裂平面精确方向和细胞扩张程度及时间的影响，并发现了其通过非细胞自主功能对远距离细胞的正常化作用 | NA | 研究油菜素内酯信号在拟南芥根发育中的具体作用 | 拟南芥根的分生组织和成熟根段 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序 | NA | 图像 | 油菜素内酯信号缺失突变体和野生型拟南芥根的分生组织及成熟根段 |
| 23719 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of immune cells in human atherosclerosis revealed by scRNA-Seq
2021-11-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab260
PMID:34343272
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）在人类动脉粥样硬化斑块和外周血单个核细胞（PBMCs）中发现的免疫细胞异质性的最新数据 | 利用scRNA-Seq结合抗体测序揭示了已知和新发现的免疫细胞亚群，并识别了HIV阳性动脉粥样硬化患者PBMCs中显著上调的基因 | NA | 总结通过scRNA-Seq在动脉粥样硬化患者中获得的关于斑块和PBMCs的最新数据 | 动脉粥样硬化中的免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 涉及人类动脉粥样硬化斑块和外周血单个核细胞（PBMCs）的样本 |
| 23720 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics analysis of uterine gene expression in enhancer of zeste homolog 2 conditional knockout mice†
2021-11-15, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioab147
PMID:34344022
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研究论文 | 本文通过空间转录组学方法分析了增强型zeste同源物2条件性敲除小鼠子宫基因表达的变化 | 使用空间转录组学技术精确识别了EZH2条件性敲除小鼠子宫中上皮细胞和基质细胞基因表达的变化 | NA | 探究EZH2条件性敲除对小鼠子宫上皮细胞和基质细胞基因表达的影响 | EZH2条件性敲除小鼠的子宫组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 收集了卵巢切除的成年野生型和EZH2条件性敲除小鼠的子宫样本 |