单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 23701 - 23720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23701 | 2024-08-09 |
miRNA activity inferred from single cell mRNA expression
2021-04-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-88480-5
PMID:33911110
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研究论文 | 本文通过利用miRNA结合已定义的序列基序并通常下调目标基因的特性，展示了从单细胞RNA测序数据中通过基序富集分析推导miRNA活性的方法 | 本文创新地反向利用基序富集分析，从miRNA种子站点推导单细胞中miRNA的活性测量 | NA | 展示如何从单细胞RNA测序数据中推导miRNA活性 | miRNA活性在单细胞水平上的估计 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 9679个TCGA癌症样本，以及人类和小鼠的单细胞RNA测序数据集 |
| 23702 | 2024-08-09 |
Differentiation reveals latent features of aging and an energy barrier in murine myogenesis
2021-04-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109046
PMID:33910007
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析年轻和老年小鼠肌肉单核细胞的肌肉干细胞（MuSCs）和纤维脂肪前体细胞（FAPs）在分化过程中的变化 | 研究发现分化过程揭示了衰老的潜在特征，并发现老年MuSCs在分化过程中接近命运决定时停滞 | NA | 探究年龄相关变化在分化轨迹中的表现 | 肌肉干细胞（MuSCs）和纤维脂肪前体细胞（FAPs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉单核细胞 |
| 23703 | 2024-08-09 |
Investigating Cellular Trajectories in the Severity of COVID-19 and Their Transcriptional Programs Using Machine Learning Approaches
2021-04-24, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12050635
PMID:33923155
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本，通过机器学习算法推断细胞变化轨迹并识别其转录程序 | 本研究首次应用深度学习算法DrivAER识别COVID-19发病机制中的潜在驱动通路和转录因子，并发现巨噬细胞相关的功能与疾病严重程度的相关性更高 | NA | 探究COVID-19发病机制在单细胞层面的转录驱动因素及其动态变化 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本中的细胞变化轨迹及其转录程序 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度学习算法DrivAER | 基因表达数据 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 23704 | 2024-08-09 |
Retinal glial remodeling by FGF21 preserves retinal function during photoreceptor degeneration
2021-Apr-23, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102376
PMID:33937726
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研究论文 | 本研究探讨了纤维母细胞生长因子21（FGF21）在视网膜色素变性（RP）模型小鼠中对视网膜功能的保护作用 | 首次发现FGF21能通过调节Müller胶质细胞的形态和功能，保护视网膜在光感受器退化过程中的功能 | NA | 探索FGF21在视网膜退化疾病中的治疗潜力 | 视网膜色素变性（RP）模型小鼠 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | P23H小鼠 |
| 23705 | 2024-08-09 |
Connectivity Map Analysis of a Single-Cell RNA-Sequencing -Derived Transcriptional Signature of mTOR Signaling
2021-Apr-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094371
PMID:33922083
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据构建疾病转录组特征，并应用于连接图（CMaP）分析，以识别mTOR信号通路的抑制剂 | 开发了使用scRNA-seq数据进行疾病转录组特征构建和CMaP分析的新方法 | 传统的CMaP分析使用来自大量疾病组织的特征，缺乏分辨率以有效识别有效的治疗药物 | 开发和应用新的方法，利用scRNA-seq数据进行疾病转录组特征构建和CMaP分析，以识别有效的治疗药物 | 淋巴管平滑肌瘤病（LAM）患者的肺组织scRNA-seq数据 | 数字病理学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自未经治疗和西罗莫司治疗的LAM患者的肺组织样本 |
| 23706 | 2024-08-09 |
Single Cell Gene Expression Analysis in a 3D Microtissue Liver Model Reveals Cell Type-Specific Responses to Pro-Fibrotic TGF-β1 Stimulation
2021-Apr-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22094372
PMID:33922101
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术研究了3D微组织肝脏模型中细胞类型特异性对促纤维化TGF-β1刺激的反应 | 本文首次应用单细胞测序技术揭示了3D微组织肝脏模型中细胞类型特异性对TGF-β1刺激的分子反应，并识别了新的细胞特异性潜在纤维化标志物 | NA | 研究3D细胞培养系统中细胞类型特异性对促纤维化TGF-β1刺激的反应 | HepaRG、hTERT-HSC和THP-1细胞组成的肝脏微组织 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 三种细胞类型的单细胞 |
| 23707 | 2024-08-09 |
Intratumoral Cellular Heterogeneity: Implications for Drug Resistance in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer
2021-Apr-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13092023
PMID:33922215
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综述 | 本文综述了非小细胞肺癌（NSCLC）患者中肿瘤内异质性的生物学作用及其对获得性耐药发展的影响 | 利用单细胞测序技术深入分析肿瘤，揭示了肿瘤内异质性由遗传、表观遗传和蛋白质修饰驱动的多样性 | NA | 探讨肿瘤内异质性在非小细胞肺癌患者治疗中的作用及其对耐药性的影响 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤内异质性及其对药物耐药性的影响 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 23708 | 2024-08-09 |
Activation of Blood Vessel Development in Endometrial Stromal Cells In Vitro Cocultured with Human Peri-Implantation Embryos Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2021-Apr-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11050367
PMID:33919335
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了体外共培养的人胚胎和子宫内膜基质细胞中血管发育的激活 | 首次揭示了子宫内膜基质细胞在植入阶段启动血管发育的分子机制 | 研究仅限于体外共培养模型，未涉及体内环境 | 探讨子宫内膜基质细胞与胚胎共培养后的转录组变化及其在植入过程中的作用 | 子宫内膜基质细胞和胚胎共培养后的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 24个非共培养的子宫内膜基质细胞和57个共培养后的子宫内膜基质细胞 |
| 23709 | 2024-08-09 |
[Research Progress of Single Cell Sequencing in Lung Cancer]
2021-Apr-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在肺癌研究中的进展，重点关注其在肺癌肿瘤异质性、肿瘤微环境、侵袭和转移、治疗反应及耐药性方面的应用 | 单细胞测序技术能够解决传统测序技术在分辨个体细胞差异方面的不足，有助于深入理解肿瘤微环境中的细胞类型、状态及细胞间通信行为 | NA | 进一步理解肺癌的发生发展机制，发现新的诊断标志物和治疗靶点，为未来肺癌患者的精准治疗提供理论依据 | 肺癌的肿瘤异质性、肿瘤微环境、侵袭和转移、治疗反应及耐药性 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 23710 | 2024-08-09 |
Cannabinoid Receptor Type-2 in B Cells Is Associated with Tumor Immunity in Melanoma
2021-Apr-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13081934
PMID:33923757
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研究论文 | 本研究探讨了大麻素受体2（CB2R）在B细胞中的作用及其对黑色素瘤免疫反应的影响 | 首次证明了CB2R在黑色素瘤中通过B细胞介导的保护作用 | NA | 研究CB2R在黑色素瘤免疫反应中的作用，并探索其作为癌症治疗新靶点的潜力 | 大麻素受体2（CB2R）在B细胞中的表达及其对黑色素瘤免疫反应的影响 | NA | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 包括人类黑色素瘤样本和鼠类黑色素瘤模型 |
| 23711 | 2024-08-09 |
From Oncogenic Signaling Pathways to Single-Cell Sequencing of Immune Cells: Changing the Landscape of Cancer Immunotherapy
2021-Apr-14, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules26082278
PMID:33920054
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综述 | 本文综述了肿瘤发展中的关键信号通路，并探讨了单细胞测序技术在免疫细胞中的应用，以改善癌症免疫治疗 | 结合单细胞测序数据与免疫检查点抑制剂，提高抑制剂的响应率，减少免疫相关不良事件，并促进肿瘤细胞的消除 | 免疫检查点抑制剂在不同癌症患者中的响应率不一，且增加自身免疫疾病的风险 | 旨在回顾肿瘤发展的关键通路，并探讨单细胞测序的应用，以解决免疫检查点抑制剂的不足 | 肿瘤发展中的信号通路及单细胞测序在免疫细胞中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 23712 | 2024-08-09 |
A new era for plant science: spatial single-cell transcriptomics
2021-04, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2021.102041
PMID:33915520
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在植物科学中的最新进展及其应用 | 强调了空间转录组学方法在植物科学中的核心作用 | NA | 探讨如何通过空间转录组学技术全面理解生物体功能 | 植物细胞及其空间关系 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 23713 | 2024-08-09 |
An Integrative Single-cell Transcriptomic Atlas of the Post-natal Mouse Mammary Gland Allows Discovery of New Developmental Trajectories in the Luminal Compartment
2021-03, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-021-09488-1
PMID:33913090
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研究论文 | 本文通过整合三个基础报告中的单细胞RNA测序数据，研究了小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性 | 本文通过整合大量单细胞RNA测序数据，提供了对先前检测到的Procr干细胞样亚群的更好分辨率，并识别了一组新的表达免疫样标记的乳腺上皮细胞 | NA | 研究小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性 | 小鼠乳腺在出生后发育过程中的细胞和转录异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 53,686个单细胞 |
| 23714 | 2024-08-09 |
A single-cell atlas of mouse olfactory bulb chromatin accessibility
2021-02-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2021.02.007
PMID:33926839
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研究论文 | 本研究利用单细胞转座酶可及染色质测序技术，对小鼠嗅球中的9,549个单细胞的染色质可及性进行了全基因组分析 | 首次对小鼠嗅球的单细胞表观遗传景观进行了详细研究，揭示了不同细胞群特有的潜在调控元件及其功能 | NA | 旨在深入理解嗅球在单细胞水平上的调控机制及其治疗潜力 | 小鼠嗅球的单细胞染色质可及性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 染色质可及性数据 | 9,549个单细胞 |
| 23715 | 2024-08-09 |
Single-Cell Atlas Reveals Fatty Acid Metabolites Regulate the Functional Heterogeneity of Mesenchymal Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.653308
PMID:33912565
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了脂肪酸代谢物在调节间充质干细胞功能异质性中的作用 | 首次发现脂肪酸代谢物通过调节间充质干细胞的谱系承诺和功能异质性，影响其自我更新和分化潜能 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的临床研究验证其治疗潜力 | 探讨代谢物如何调节间充质干细胞的功能异质性 | 骨髓间充质干细胞及其代谢物 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 23716 | 2024-08-09 |
CBA: Cluster-Guided Batch Alignment for Single Cell RNA-seq
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.644211
PMID:33927748
|
研究论文 | 本文提出了一种基于聚类的批量对齐方法（CBA），用于单细胞RNA测序数据，通过自动编码器将两个批次的数据嵌入同一空间，并使用特定的损失函数保持细胞间距离，以实现细胞类型的匹配 | CBA方法考虑了细胞类型的身份，通过无监督的方式定义细胞类型为原始批次中的聚类，从而进一步约束了不同批次间的细胞匹配 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题，提高数据整合的准确性和生物学意义 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 基因表达数据 | 使用了胰腺和鼠细胞图谱数据集 |
| 23717 | 2024-08-09 |
Gene Expression Analysis of T-Cells by Single-Cell RNA-Seq
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1311-5_22
PMID:33928560
|
研究论文 | 本文提供了一种优化的单细胞RNA测序技术用于T细胞基因表达分析的实验方案 | 采用滴液数字技术（ddSEQ）进行T细胞的分离和RNA测序文库的制备 | 该技术需要专业设备和专业知识 | 提供一个从样本制备到数据解释的单细胞实验框架 | T细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23718 | 2024-08-09 |
A Partial Picture of the Single-Cell Transcriptomics of Human IgA Nephropathy
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645988
PMID:33936064
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了IgA肾病患者的肾活检样本，揭示了IgA肾病中细胞表达谱的变化 | 首次展示了IgA肾病系膜细胞中多个新基因的高表达，这些基因与细胞增殖和基质积累相关 | 研究结果基于有限数量的细胞和患者样本，需要在未来研究中通过更大规模的细胞和患者样本进行验证 | 旨在揭示IgA肾病的分子机制并识别新的治疗靶点 | IgA肾病患者的肾活检样本 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 4名IgA肾病患者和3名健康供体的肾组织 |
| 23719 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis of the Immunometabolic Rewiring and Immunopathogenesis of Coronavirus Disease 2019
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.651656
PMID:33936072
|
研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，揭示了外周血单个核细胞（PBMCs）中的代谢重编程，以阐明可能导致严重COVID-19进展的代谢机制。 | 研究发现严重COVID-19患者中的单核细胞表达更高水平的糖酵解相关基因和PPP相关基因，可能导致超炎症反应，并且增强的糖酵解或OXPHOS与记忆B细胞向浆母细胞或浆细胞的分化正相关。 | NA | 研究COVID-19中的免疫代谢重编程和免疫病理发生机制。 | COVID-19患者的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 23720 | 2024-08-09 |
Comprehensive characterization of tissue-specific chromatin accessibility in L2 Caenorhabditis elegans nematodes
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.271791.120
PMID:33888511
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研究论文 | 本文利用sci-ATAC-seq技术在L2阶段的秀丽隐杆线虫中收集单细胞染色质可及性数据，通过改进的潜在狄利克雷分配算法识别了37个细胞簇，对应于线虫的不同细胞类型，提供了新的细胞类型特异性基因调控位点图谱 | 本文采用sci-ATAC-seq技术和改进的潜在狄利克雷分配算法，首次在单细胞分辨率下探索了秀丽隐杆线虫L2阶段个体细胞类型的调控DNA | NA | 探索秀丽隐杆线虫L2阶段个体细胞类型的调控DNA | 秀丽隐杆线虫L2阶段的单细胞染色质可及性 | 基因组学 | NA | sci-ATAC-seq | 潜在狄利克雷分配算法 | 染色质可及性数据 | L2阶段的秀丽隐杆线虫 |