单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 23681 - 23700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23681 | 2024-08-09 |
Irradiation-Induced Changes in the Immunogenicity of Lung Cancer Cell Lines: Based on Comparison of X-rays and Carbon Ions
2021, Frontiers in public health
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/fpubh.2021.666282
PMID:33968889
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研究论文 | 本研究通过比较碳离子和X射线在不同时间和剂量窗口下对肺癌细胞系免疫原性变化的影响，探讨了两者在诱导免疫效应方面的差异 | 首次全面比较了碳离子和X射线在不同时间和剂量窗口下对肺癌细胞系免疫原性变化的影响，并推测碳离子在诱导免疫效应方面可能比传统X射线更具优势 | 研究主要集中在特定肺癌细胞系和特定免疫标志物上，可能需要进一步扩大样本和标志物范围以验证结果的普遍性 | 探讨碳离子和X射线在不同时间和剂量窗口下对肺癌细胞系免疫原性变化的影响，以及其在诱导免疫效应方面的差异 | 肺癌细胞系A549、H520和Lewis Lung Carcinoma (LLC) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、ELISA | NA | 基因表达数据 | 涉及A549、H520和Lewis Lung Carcinoma (LLC)三种肺癌细胞系 |
| 23682 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome and genome analyses of pituitary neuroendocrine tumors
2021-11-02, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noab102
PMID:33908609
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组和基因组分析，研究了垂体神经内分泌肿瘤的特征和异质性 | 通过高精度的单细胞RNA测序和单细胞多组学测序，揭示了垂体神经内分泌肿瘤的新型肿瘤相关基因和基因表达模式 | NA | 深入理解垂体神经内分泌肿瘤的发病机制和异质性 | 垂体神经内分泌肿瘤及其亚型 | 数字病理学 | 垂体肿瘤 | 单细胞RNA测序，单细胞多组学测序 | NA | 转录组数据，基因组数据 | 2679个单细胞来自23个手术切除样本，238个单细胞来自5个患者 |
| 23683 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics applied to emigrating cells from psoriasis elucidate pathogenic versus regulatory immune cell subsets
2021-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2021.04.021
PMID:33932468
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术分析了银屑病患者皮肤迁移细胞的基因表达，以阐明致病性和调节性免疫细胞亚群的特征。 | 本研究首次应用单细胞转录组学于银屑病患者皮肤迁移细胞，提供了一个创新的研究平台，用于比较不同炎症性皮肤病中异质免疫细胞的基因表达谱。 | 先前的人类皮肤单细胞数据中，炎症细胞仅占总体细胞的一小部分，难以确定功能性亚群。 | 旨在通过单细胞转录组学技术克服上述限制，阐明银屑病患者皮肤中致病性和调节性免疫细胞亚群的体外基因表达谱。 | 银屑病患者皮肤迁移细胞的基因表达。 | 单细胞转录组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | 来自银屑病患者和对照组皮肤的人类迁移细胞 |
| 23684 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes reveal characteristic features of cell types within the human adrenal microenvironment
2021-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.30398
PMID:33934358
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了人类肾上腺微环境中细胞类型的特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了人类肾上腺微环境中细胞类型的特征，包括非免疫细胞的免疫激活和肾上腺皮质细胞的性别相关多样性 | NA | 揭示人类肾上腺微环境中细胞类型的特征，为肾上腺疾病的研究提供基础 | 人类肾上腺微环境中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 23685 | 2024-08-09 |
Analyzing master regulators and scRNA-seq of COVID-19 patients reveals an underlying anti-SARS-CoV-2 mechanism of ZNF proteins
2021-09-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab118
PMID:33907801
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研究论文 | 本研究通过分析COVID-19患者的调控因子和单细胞RNA测序数据，揭示了ZNF蛋白在抗SARS-CoV-2感染中的潜在作用 | 首次发现女性COVID-19患者表达更多的ZNF蛋白和更强的转录活性，这些活性与SARS-CoV-2载量呈显著负相关，并能激活靶基因参与抗病毒感染 | NA | 探究不同性别COVID-19患者预后差异的原因及ZNF蛋白在抗SARS-CoV-2感染中的作用 | COVID-19患者、ZNF蛋白及SARS-CoV-2感染 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3044例COVID-19患者 |
| 23686 | 2024-08-09 |
Inflation-collapse dynamics drive patterning and morphogenesis in intestinal organoids
2021-09-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.002
PMID:33915079
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研究论文 | 本文研究了肠道类器官中干细胞自我组织形成结构化组织的过程，特别是干细胞区（SCZs）大小的调控机制。 | 通过改进肠道类器官培养条件，实现了长期时间流逝成像，揭示了离子通道介导的膨胀和机械敏感Piezo家族通道对SCZs形状的调控作用。 | NA | 探索干细胞如何自我组织形成结构化组织的问题。 | 肠道类器官中的干细胞区（SCZs）。 | 数字病理学 | NA | 时间流逝成像，单细胞转录组学 | NA | 图像，转录组数据 | 多个肠道类器官 |
| 23687 | 2024-08-09 |
Gene signature extraction and cell identity recognition at the single-cell level with Cell-ID
2021-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00896-6
PMID:33927417
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cell-ID的无聚类多元统计方法，用于从单细胞测序数据中稳健地提取每个细胞的基因特征 | Cell-ID方法无需聚类，能够跨不同供体、组织来源、物种和单细胞组学技术重复提取基因特征，并用于自动细胞类型注释和跨数据集的细胞匹配 | NA | 开发一种新的方法来探索单细胞水平的细胞类型多样性 | 人类和鼠类的多种样本，包括血液细胞、胰腺胰岛、呼吸道、肠道和嗅觉上皮，以及全面的鼠细胞图谱数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 多元统计方法 | 单细胞测序数据 | 多个人类和鼠类样本 |
| 23688 | 2024-08-09 |
Novel therapeutic targets to improve IVF outcomes in endometriosis patients: a review and future prospects
2021-08-20, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmab014
PMID:33930149
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综述 | 本文综述了子宫内膜异位症患者不孕症的病理机制及现有治疗方案，旨在改善这些患者的体外受精（IVF）结果 | 探讨了子宫内膜异位症患者不孕症的分子机制，并提出了针对这些机制的治疗策略 | 尚未有明确的理论能完全解释子宫内膜异位症患者的不孕机制 | 探讨子宫内膜异位症导致不孕的病理机制及治疗方案，以改善IVF结果 | 子宫内膜异位症患者的不孕症及IVF结果 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 123篇文献 |
| 23689 | 2024-08-09 |
Bayesian inference of gene expression states from single-cell RNA-seq data
2021-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00875-x
PMID:33927416
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研究论文 | 本文提出了一种基于贝叶斯推断的单细胞RNA测序数据归一化方法Sanity | Sanity方法直接从原始的唯一分子标识符（UMI）计数中估计表达值及其误差范围，无需可调参数，并能有效校正生物学和测量采样噪声 | 文章未提及Sanity方法的具体局限性 | 开发一种新的单细胞RNA测序数据归一化方法，以提高下游分析任务的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | 文章未提及具体样本数量 |
| 23690 | 2024-08-09 |
Spatial Transcriptomics: Molecular Maps of the Mammalian Brain
2021-07-08, Annual review of neuroscience
IF:12.1Q1
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在神经解剖学中的应用及其对大脑分子图谱构建的影响 | 空间转录组学开启了神经解剖学的新时代，通过无监督和无偏见地探索组织结构的分子特征，推动新一代大脑图谱的产生 | NA | 探讨空间转录组学如何通过基因表达谱对大脑区域进行分子分类，从而超越主观的神经解剖学定义 | 哺乳动物大脑的分子图谱 | 分子生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23691 | 2024-08-09 |
Expression map of entry receptors and infectivity factors for pan-coronaviruses in preimplantation and implantation stage human embryos
2021-Jul, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-021-02192-3
PMID:33913101
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研究论文 | 本文分析了公开的单细胞RNA测序数据，研究了人类胚胎在植入前和植入阶段对多种冠状病毒的易感性 | 首次分析了人类胚胎中多种冠状病毒的进入受体和感染因子的表达图谱 | NA | 预测发育中的人类胚胎是否对多种冠状病毒易感 | 人类胚胎在植入前和植入阶段的细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 不同发育阶段的人类胚胎细胞 |
| 23692 | 2024-08-09 |
ChrNet: A re-trainable chromosome-based 1D convolutional neural network for predicting immune cell types
2021-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.04.037
PMID:33932523
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研究论文 | 本文介绍了一种基于染色体的可重训练一维卷积神经网络（ChrNet），用于预测免疫细胞类型 | ChrNet利用基因在染色体上的位置信息，提高了细胞类型分类的性能 | NA | 提高肿瘤微环境中免疫细胞类型的识别准确性，以改善癌症的临床预后和治疗管理 | 免疫细胞类型 | 机器学习 | NA | 一维卷积神经网络（1D-CNN） | CNN | 基因数据 | NA |
| 23693 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analyses of dairy cattle ruminal epithelial cells during weaning
2021-07, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2021.04.039
PMID:33933592
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研究论文 | 本研究使用10× Genomics Chromium Controller获取了断奶前后两个荷斯坦小牛瘤胃上皮组织的单细胞RNA测序数据，并分析了细胞类型及其标记基因 | 首次在牛中实施单细胞转录组分析，揭示了瘤胃上皮细胞类型及其在断奶期间的发展 | NA | 研究断奶期间瘤胃上皮细胞的类型及其发展 | 荷斯坦小牛瘤胃上皮细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 5064个断奶前细胞和1372个断奶后细胞 |
| 23694 | 2024-08-09 |
Heterozygous ANKRD17 loss-of-function variants cause a syndrome with intellectual disability, speech delay, and dysmorphism
2021-06-03, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2021.04.007
PMID:33909992
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研究论文 | 本文描述了由杂合ANKRD17功能丧失变异引起的神经发育障碍综合征，表现为智力障碍、语言延迟和畸形 | 首次详细描述了ANKRD17变异引起的神经发育障碍，并提供了蛋白质模型和单细胞RNA测序数据支持其致病机制 | 研究样本仅限于34名个体，可能存在样本量不足的问题 | 阐明ANKRD17变异在神经发育障碍中的作用及其分子机制 | ANKRD17基因变异及其对神经发育的影响 | NA | 智力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 34名个体 |
| 23695 | 2024-08-09 |
Single-cell molecular and developmental perspectives of sexually dimorphic circuits underlying innate social behaviors
2021-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2021.03.010
PMID:33915498
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综述 | 本文综述了在小鼠中，单细胞转录组学在揭示社会行为相关的神经回路中细胞类型的分子特征方面的应用 | 提出了使用多模态标准（包括基因表达、生理学和发育起源）来定义细胞类型，以深化对这些神经回路的理解 | NA | 探讨单细胞转录组学在理解神经回路及其在行为中的功能角色的应用 | 小鼠中与社会行为相关的神经回路中的细胞类型 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23696 | 2024-08-09 |
Evolutionary genetic algorithm identifies IL2RB as a potential predictive biomarker for immune-checkpoint therapy in colorectal cancer
2021-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab016
PMID:33928242
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研究论文 | 本文利用进化算法Atlas Correlation Explorer (ACE)分析TCGA数据，识别出IL2RB作为结直肠癌免疫检查点治疗潜在的预测性生物标志物。 | 首次采用ACE算法挖掘TCGA数据，发现IL2RB与免疫检查点基因在结直肠癌中的关联。 | NA | 旨在发现结直肠癌患者对免疫检查点治疗反应的预测性生物标志物。 | 结直肠癌患者的免疫检查点治疗反应。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | 进化遗传算法 | 基因表达数据 | 115个MSI-H结直肠癌组织微阵列样本 |
| 23697 | 2024-08-09 |
Human Adult Fibroblast-like Synoviocytes and Articular Chondrocytes Exhibit Prominent Overlap in Their Transcriptomic Signatures
2021-Jun, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.11255
PMID:33931959
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研究论文 | 本研究通过深度分析和比较人成体纤维样滑膜细胞和关节软骨细胞的转录组特征，揭示了它们之间显著的转录组信号重叠 | 本研究首次揭示了人成体纤维样滑膜细胞和关节软骨细胞之间显著的转录组信号重叠，并提供了数据资源以帮助进一步解析关节稳态和退化的机制 | NA | 测试纤维样滑膜细胞和关节软骨细胞是否参与完全不同的分化程序以构建滑膜和关节软骨，并维持健康组织 | 人成体纤维样滑膜细胞和关节软骨细胞的转录组特征 | NA | NA | bulk RNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新鲜分离的人成体关节软骨细胞、滑膜、初级纤维样滑膜细胞和皮肤成纤维细胞 |
| 23698 | 2024-08-09 |
Testicular germ cell tumors arise in the absence of sex-specific differentiation
2021-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197111
PMID:33912935
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研究论文 | 本文利用129.MOLF-Chr19小鼠模型和NANOS2报告基因等位基因，研究了NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的作用 | 首次揭示了NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的关键作用，并提出在缺乏性别分化的情况下，发育中的睾丸内的信号驱动生殖细胞转化 | NA | 探讨NANOS2在睾丸生殖细胞肿瘤发生中的作用及其机制 | 睾丸生殖细胞肿瘤的发生机制 | NA | 睾丸肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用129.MOLF-Chr19小鼠模型进行研究 |
| 23699 | 2024-08-09 |
Hierarchicell: an R-package for estimating power for tests of differential expression with single-cell data
2021-May-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-07635-w
PMID:33932993
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研究论文 | Hierarchicell是一个R包，用于估计单细胞数据中差异表达测试的统计功效 | Hierarchicell是首个明确模拟并考虑单细胞RNA-seq数据中层级相关结构（即样本内相关性）的单细胞功率计算器 | NA | 开发一个工具，用于准确估计单细胞RNA-seq数据中差异表达测试的统计功效 | 单细胞RNA-seq数据中的差异表达测试 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 用户指定的独立实验单位数量（如个体）和实验单位内的细胞数量 |
| 23700 | 2024-08-09 |
Synthetic single cell RNA sequencing data from small pilot studies using deep generative models
2021-04-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-88875-4
PMID:33931726
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研究论文 | 本文探讨了使用深度生成模型（如变分自编码器VAEs和深度玻尔兹曼机DBMs）从小型试点研究中生成合成单细胞RNA测序数据的可行性 | 本文提出了两种深度生成模型方法：单细胞变分推理scVI和单细胞深度玻尔兹曼机scDBMs，并探讨了它们在不同样本大小下的表现 | 所有方法在处理不同丰度的细胞类型时，存在过度表示高丰度细胞类型和遗漏低丰度细胞类型的问题，并且在处理双峰性问题时遇到困难 | 研究深度生成模型在单细胞转录组学中的应用，以支持scRNA-seq实验的设计 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | VAEs, DBMs | 数据 | 小型试点研究数据集 |