单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28289 篇文献，本页显示第 23621 - 23640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23621 | 2024-08-08 |
The histone acetyltransferase HBO1 promotes efficient tip cell sprouting during angiogenesis
2021-10-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.199581
PMID:34550360
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研究论文 | 研究探讨了组蛋白乙酰转移酶HBO1在血管生成中促进尖端细胞发芽的作用 | 发现HBO1和H3K14ac的缺失影响了发育中的发芽血管生成和病理性内皮细胞过度生长 | NA | 研究HBO1在血管生成中的作用及其对内皮细胞基因表达的影响 | 内皮细胞（ECs）和其在血管生长与重塑中的动态基因表达变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Hbo1缺陷的视网膜内皮细胞 |
| 23622 | 2024-08-08 |
Mitochondrial respiratory chain function promotes extracellular matrix integrity in cartilage
2021-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2021.101224
PMID:34560099
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序分析揭示线粒体呼吸链功能对成熟软骨中细胞外基质（ECM）稳态的重要性 | 首次揭示线粒体呼吸链功能与ECM稳态之间的关联，并展示了这种功能障碍对ECM结构和机械稳定性的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探讨线粒体呼吸链功能与软骨中ECM稳态之间的关系 | 软骨组织中的线粒体呼吸链功能和ECM稳态 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），质谱/基质分析，原子力显微镜 | NA | 基因表达数据 | 涉及1个月大的突变小鼠的股骨头软骨 |
| 23623 | 2024-08-08 |
The transcriptional characteristics of mast cells derived from skin tissue in type 2 diabetes patients at the single-cell level
2021-Oct, Acta histochemica
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.acthis.2021.151789
PMID:34560403
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研究论文 | 本研究旨在探讨2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征 | 首次在单细胞水平上描述了2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞的特征基因 | 样本量较小，仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者 | 探索2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征，为研究异常葡萄糖代谢下的肥大细胞行为提供实验数据 | 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的皮肤组织中的肥大细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞cDNA文库 | 共8888个细胞，来自两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者的皮肤组织 |
| 23624 | 2024-08-08 |
Transitions in development - an interview with Tom Nowakowski
2021-10-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200084
PMID:34568895
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访谈 | 本文是对加州大学旧金山分校助理教授Tom Nowakowski的访谈，他利用单细胞测序技术研究神经发育 | NA | NA | 了解Tom Nowakowski的职业发展及其作为研究组长的未来计划 | Tom Nowakowski的职业生涯和研究方向 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 23625 | 2024-08-08 |
Synthesized HMGB1 peptide attenuates liver inflammation and suppresses fibrosis in mice
2021-Sep-27, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-021-00177-4
PMID:34565478
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研究论文 | 本文评估了合成HMGB1肽对CCl诱导的肝硬化小鼠模型的治疗效果，发现其能减轻肝脏炎症并抑制纤维化 | 提出了一种新的无细胞治疗方法，使用HMGB1肽诱导抗炎巨噬细胞，用于治疗肝硬化 | 体外分析未能证实HMGB1肽对单核细胞/巨噬细胞的直接影响 | 评估HMGB1肽对肝纤维化的治疗效果 | CCl诱导的肝硬化小鼠模型 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织 | 小鼠 |
| 23626 | 2024-08-08 |
Single cell RNA-seq data and bulk gene profiles reveal a novel signature of disease progression in multiple myeloma
2021-Sep-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02190-6
PMID:34563174
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据和批量基因表达谱，揭示了多发性骨髓瘤（MM）发展过程中的新型分子特征 | 本文建立了一个20基因的特征，作为MM的独立生物标志物，并成功预测了接受硼替佐米治疗患者的临床结果 | NA | 揭示多发性骨髓瘤发展的分子机制 | 多发性骨髓瘤细胞的转录组 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 597个细胞 |
| 23627 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveal DHX9 in mature B cell as a dynamic network biomarker before lymph node metastasis in CRC
2021-Sep-24, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.06.004
PMID:34553035
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了成熟B细胞中的DHX9在结直肠癌（CRC）淋巴结转移前的动态网络生物标志物作用 | 首次发现DHX9在成熟B细胞中作为CRC淋巴结转移前的关键动态网络生物标志物 | NA | 开发预测性生物标志物，以检测CRC淋巴结转移前成熟B细胞的关键转变点 | 结直肠癌患者的邻近组织中的成熟B细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | 动态网络生物标志物（DNB）方法 | 转录组数据 | 725个来自结直肠癌的B细胞 |
| 23628 | 2024-08-08 |
Reconstructing and counting genomic fragments through tagmentation-based haploid phasing
2021-09-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-97852-w
PMID:34556684
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研究论文 | 本文通过基于标签化的单倍体分型技术，展示了通过新型生物信息学算法重建和计数基因组片段的概念 | 提出了一种新的生物信息学算法，用于检测基因组的离散性质，以准确确定基因拷贝数变化 | 该方法依赖于样本，调用敏感性因样本的倍性而异，并对测序数据中的噪声敏感 | 提高单细胞测序中基因拷贝数变化的准确性，以更好地追踪和理解肿瘤发生 | 癌症细胞的异质性和基因拷贝数变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 23629 | 2024-08-08 |
Epicardial differentiation drives fibro-fatty remodeling in arrhythmogenic cardiomyopathy
2021-Sep-22, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abf2750
PMID:34550725
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研究论文 | 本文利用人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的心脏培养物、单细胞RNA测序（scRNA-seq）和移植的人ACM心脏研究了ACM中纤维脂肪重塑的心外膜贡献 | 首次揭示了TFAP2A通过促进上皮间质转化（EMT）介导心外膜分化，从而在ACM中驱动纤维脂肪重塑的关键作用 | NA | 探讨心律失常性心肌病（ACM）中心外膜对纤维脂肪重塑的贡献及其分子机制 | 人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞、单细胞RNA测序数据和ACM患者移植心脏 | 数字病理学 | 心律失常性心肌病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 来自ACM患者和健康供体的人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞及ACM患者移植心脏样本 |
| 23630 | 2024-08-08 |
CCR2 deficiency alters activation of microglia subsets in traumatic brain injury
2021-09-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109727
PMID:34551293
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研究论文 | 研究探讨了CCR2缺乏对创伤性脑损伤中微胶质细胞亚群激活的影响 | 使用无偏倚的单细胞RNA测序方法揭示了创伤性脑损伤和正常脑中的25种微胶质细胞、单核/巨噬细胞和树突状细胞亚群，并发现CCR2缺乏的创伤性脑损伤小鼠与野生型创伤性脑损伤小鼠相比，微胶质细胞亚群的转录谱发生改变 | NA | 定义创伤性脑损伤中微胶质细胞和巨噬细胞表型的异质性，并探索CCR2缺乏对这些细胞的影响 | 微胶质细胞和巨噬细胞在创伤性脑损伤中的作用 | NA | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型小鼠和CCR2缺乏小鼠 |
| 23631 | 2024-08-08 |
Integrative Transcriptome Profiling Reveals SKA3 as a Novel Prognostic Marker in Non-Muscle Invasive Bladder Cancer
2021-Sep-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13184673
PMID:34572901
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研究论文 | 本研究通过综合转录组分析，揭示了SKA3作为非肌肉浸润性膀胱癌的新型预后标志物 | 发现SKA3与非肌肉浸润性膀胱癌的病理生理和不良生存相关，并可能通过抑制其表达来降低膀胱癌进展的风险 | NA | 提高非肌肉浸润性膀胱癌患者临床结果的诊断准确性 | 非肌肉浸润性膀胱癌及其向肌肉浸润性膀胱癌的进展 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个膀胱癌患者队列的公共数据集以及人类肿瘤组织的RNA测序数据 |
| 23632 | 2024-08-08 |
Inferring gene regulatory networks from single-cell RNA-seq temporal snapshot data requires higher-order moments
2021-Sep-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2021.100332
PMID:34553172
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研究论文 | 本文探讨了从单细胞RNA测序（scRNA-seq）时间快照数据推断基因调控网络（GRN）的方法，强调了高阶统计量的重要性 | 提出了一种基于高阶统计量的方法来推断基因调控网络，并强调了数据预处理对保留这些统计量的重要性 | 目前的数据预处理可能无法保留这些统计量，且需要计算密集型的最小化解算器 | 开发一种新的方法来从scRNA-seq数据中推断基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据和基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 时间快照数据 | NA |
| 23633 | 2024-08-08 |
Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions
2021-09-10, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62857
PMID:34570087
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研究论文 | 本文提供了一个全面的协议，用于准备人肠道类器官以感染肠道病原体，并考虑感染侧（顶端 vs. 基底侧）进行单细胞RNA测序，以表征细胞类型特异性的宿主/病原体相互作用。 | 本文创新地提出了在生物安全三级（BSL-3）条件下，通过考虑感染侧来准备人肠道类器官以进行单细胞RNA测序的方法。 | 本文未明确提及研究的具体限制。 | 研究肠道病原体感染的细胞类型特异性宿主/病原体相互作用。 | 人肠道类器官及其对肠道病原体感染的反应。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |
| 23634 | 2024-08-08 |
Identifying Lung Cancer Cell Markers with Machine Learning Methods and Single-Cell RNA-Seq Data
2021-Sep-09, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11090940
PMID:34575089
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研究论文 | 本文提出了一种基于转录组轮廓的计算方法，用于区分非小细胞肺癌不同病理区域的细胞亚型，并包括一组定性分类标准（生物标志物）和各种规则 | 利用单细胞RNA测序技术和机器学习方法，识别非小细胞肺癌的细胞标志物 | NA | 探索非小细胞肺癌的发病机制并区分其细胞亚型 | 非小细胞肺癌的细胞亚型及其生物标志物 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林分类器和决策树 | 转录组数据 | 720个特征用于随机森林分类器，1880个特征用于决策树 |
| 23635 | 2024-08-08 |
Single-Cell Omics in Dissecting Immune Microenvironment of Malignant Gliomas-Challenges and Perspectives
2021-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092264
PMID:34571910
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研究论文 | 本文综述了单细胞技术在解析恶性胶质瘤免疫微环境中的应用，并探讨了其面临的挑战和未来展望 | 单细胞RNA测序和时间飞行细胞仪技术提供了前所未有的肿瘤微环境解析能力 | NA | 总结单细胞技术在恶性胶质瘤免疫微环境研究中的发现，并探讨其对设计有效免疫疗法的重要性 | 恶性胶质瘤的免疫微环境及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、时间飞行细胞仪（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | NA |
| 23636 | 2024-08-08 |
Loss of Ubiquitin Carboxy-Terminal Hydrolase L1 Impairs Long-Term Differentiation Competence and Metabolic Regulation in Murine Spermatogonial Stem Cells
2021-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092265
PMID:34571914
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研究论文 | 研究探讨了UCH-L1在鼠精原干细胞中的作用及其对长期分化能力和代谢调节的影响 | 首次揭示了UCH-L1缺失对精原干细胞稳态和代谢的影响，以及其对精原干细胞分化能力的潜在作用 | NA | 理解UCH-L1在鼠精原干细胞中的功能及其对精原干细胞分化和代谢的影响 | 鼠精原干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 23637 | 2024-08-08 |
Pushing the Boundaries: Forensic DNA Phenotyping Challenged by Single-Cell Sequencing
2021-08-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12091362
PMID:34573344
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的应用 | 首次将单细胞测序技术应用于法医DNA表型分析，以改善混合物解卷积 | 单细胞测序在法医学中的应用尚不普遍 | 研究单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的潜力 | 从尸检血液中分离的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA | 20、10、5个细胞组以及20个单细胞 |
| 23638 | 2024-08-08 |
Modeling Notch-Induced Tumor Cell Survival in the Drosophila Ovary Identifies Cellular and Transcriptional Response to Nuclear NICD Accumulation
2021-08-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092222
PMID:34571871
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研究论文 | 本文通过建立果蝇卵巢肿瘤模型，研究了核内NICD积累对肿瘤细胞存活的影响及其细胞和转录反应。 | 开发了一种新的肿瘤模型，利用bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，揭示了NICD积累对肿瘤生长和细胞存活的分子机制。 | NA | 旨在理解NICD积累在肿瘤发生过程中的影响及其分子机制。 | 果蝇卵巢肿瘤细胞及其对NICD积累的响应。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 使用了bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，具体样本数量未明确。 |
| 23639 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Cisplatin-Treated Adult Stria Vascularis Identifies Cell Type-Specific Regulatory Networks and Novel Therapeutic Gene Targets
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.718241
PMID:34566577
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究顺铂处理后的成年鼠血管纹细胞，识别细胞类型特异性的调控网络和新的治疗基因靶点。 | 本文首次结合顺铂处理和单细胞RNA测序技术，揭示了血管纹细胞在顺铂暴露下的转录变化，并识别了独特的基因调控网络和可药物干预的基因靶点。 | NA | 旨在建立内耳电位功能障碍模型，进行转录分析和治疗测试。 | 成年鼠血管纹细胞在顺铂处理后的转录变化和治疗基因靶点。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年鼠 |
| 23640 | 2024-08-08 |
Inhibition of BCL9 Modulates the Cellular Landscape of Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment of Colorectal Cancer
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.713331
PMID:34566638
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研究论文 | 研究通过单细胞测序探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）细胞景观的影响 | 首次提出TAM-to-NK评分，评估肿瘤微环境中单核细胞/TAM细胞与NK样非功能细胞的动态平衡 | NA | 探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤微环境中TAMs细胞类型平衡和转录差异的影响 | 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |