单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 23541 - 23560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23541 | 2024-08-08 |
IOBR: Multi-Omics Immuno-Oncology Biological Research to Decode Tumor Microenvironment and Signatures
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.687975
PMID:34276676
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研究论文 | 本文开发了一个名为IOBR的计算工具，用于免疫肿瘤生物学研究，旨在通过多组学数据全面解析肿瘤微环境和特征 | IOBR工具提供了批量分析特征及其与临床表型、长非编码RNA（lncRNA）、基因组特征和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据生成的特征的相关性，并集成了多种现有的微环境解卷积方法和特征构建工具 | NA | 开发一个有效的工具，用于全面解释多组学数据，揭示肿瘤发生和免疫治疗敏感性的内在机制 | 多组学数据、肿瘤微环境、免疫治疗特征 | 生物信息学 | 肿瘤学 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 多组学数据 | NA |
| 23542 | 2024-08-08 |
Capillarized Liver Sinusoidal Endothelial Cells Undergo Partial Endothelial-Mesenchymal Transition to Actively Deposit Sinusoidal ECM in Liver Fibrosis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.671081
PMID:34277612
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、谱系追踪和共定位分析，揭示了肝窦内皮细胞在肝纤维化过程中经历部分内皮间质转化，成为类似肌成纤维细胞的细胞，并主动沉积细胞外基质。 | 首次详细描述了肝窦内皮细胞在肝纤维化中的部分内皮间质转化过程及其对细胞外基质沉积的影响。 | 研究主要基于动物模型和患者样本，尚未在更大规模的人类临床试验中验证。 | 探讨肝窦内皮细胞在肝纤维化中的作用及其机制。 | 肝窦内皮细胞及其在肝纤维化中的转化过程。 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 动物模型和肝纤维化/肝硬化患者样本 |
| 23543 | 2024-08-08 |
Endothelial-Myocardial Angiocrine Signaling in Heart Development
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.697130
PMID:34277641
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综述 | 本文综述了血管内皮细胞在哺乳动物心脏发育中的多种亚群及其通过独特的血管分泌信号通路调控心脏发育的关键细胞和分子过程 | 近年来，通过单细胞测序技术阐明发育中心脏功能细胞类型之间的细胞间通讯得到了加速发展 | NA | 探讨血管内皮细胞在心脏发育中的作用及其通过血管分泌信号通路的调控机制 | 哺乳动物心脏中的血管内皮细胞及其亚群 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 23544 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis in Melanoma Using Network Embedding
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.700036
PMID:34290746
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算框架，利用网络嵌入技术进行黑色素瘤的单细胞转录组分析 | 首次采用网络嵌入技术（node2vec）学习细胞间相互作用网络中的细胞特征，并通过共识聚类识别细胞标记和与癌症相关的基因 | 未明确提及具体限制 | 探索黑色素瘤的分子机制 | 黑色素瘤的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序技术 | node2vec | 转录组数据 | 两个独立数据集 |
| 23545 | 2024-08-08 |
Characterizing the Metabolic and Immune Landscape of Non-small Cell Lung Cancer Reveals Prognostic Biomarkers Through Omics Data Integration
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.702112
PMID:34295900
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研究论文 | 本研究通过整合多层次组学数据，分析和验证了非小细胞肺癌（NSCLC）的单细胞RNA测序数据，以识别关键的代谢特征和预后生物标志物 | 本研究首次在单细胞分辨率下揭示了NSCLC的代谢特征和预后标志物，为癌症的分子生物标志物和特征提供了新的发现 | NA | 识别和验证与特定NSCLC表型相关的分子生物标志物 | 非小细胞肺癌（NSCLC）的代谢和免疫景观 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | t-SNE聚类算法 | 基因表达数据 | 4887个细胞的基因表达谱 |
| 23546 | 2024-08-08 |
Single-Cardiomyocyte RNA Sequencing to Dissect the Molecular Pathophysiology of the Heart
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1484-6_18
PMID:34302659
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研究论文 | 本文介绍了从分离到分析的成年小鼠心肌细胞单细胞RNA测序流程 | 建立了适用于心肌细胞的单细胞分析流程 | 心肌细胞相对较大、易受压力影响，难以用于单细胞分析 | 深入理解心力衰竭的发病机制 | 心肌细胞的形态学、生理学和分子特征 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 文本 | 成年小鼠心肌细胞 |
| 23547 | 2024-08-08 |
Correlation Imputation in Single cell RNA-seq using Auxiliary Information and Ensemble Learning
2020-Sep, ACM-BCB ... ... : the ... ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine. ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine
DOI:10.1145/3388440.3412462
PMID:34278382
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research paper | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序数据补全方法SCENA，通过集成学习和辅助信息来估计基因间的相关性 | SCENA方法通过模型堆叠和辅助信息来估计基因间的相关性矩阵，而不是直接补全数据本身 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的质量，改善下游分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达相关性 | digital pathology | NA | RNA-seq | ensemble learning | gene expression data | NA |
| 23548 | 2024-08-08 |
Immune cell profiling in atherosclerosis: role in research and precision medicine
2022-01, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-021-00589-2
PMID:34267377
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综述 | 本文综述了单细胞技术在动脉粥样硬化免疫细胞图谱构建及精准免疫治疗发现中的应用 | 探讨了单细胞技术如单细胞质谱细胞仪、单细胞RNA测序和细胞转录组及表位索引测序在动脉粥样硬化斑块细胞和分子组成图谱中的应用，并强调了这些数据在发现新型精准免疫治疗中的作用 | 需要进一步在相关实验模型中严格验证来自人类研究的单细胞数据 | 探讨单细胞技术在动脉粥样硬化研究及精准医学中的作用 | 动脉粥样硬化中的免疫细胞及其在精准医疗中的应用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 23549 | 2024-08-08 |
HieRFIT: a hierarchical cell type classification tool for projections from complex single-cell atlas datasets
2021-12-07, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab499
PMID:34255817
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研究论文 | 本文介绍了一种新的细胞类型投影工具HieRFIT，基于层次随机森林，用于从复杂的单细胞图谱数据集中进行细胞类型分类 | HieRFIT利用先验的细胞类型关系信息提高分类准确性，采用集成方法结合多个随机森林模型，组织成层次决策树结构，以改善分类准确性和减少错误预测 | NA | 开发一种新的细胞类型分类工具，以提高单细胞RNA测序数据集的分类准确性 | 单细胞RNA测序数据集中的细胞类型分类 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 23550 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analyses Reveal Diverse Mechanisms of Resistance to EGFR Tyrosine Kinase Inhibitors in Lung Cancer
2021-09-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-2811
PMID:34247147
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，分析了肺癌中EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性的多样性机制 | 首次鉴定出CD74作为EGFR-TKI耐药的关键基因，并揭示了其在药物耐受状态中的作用 | 研究主要基于细胞模型和临床样本，可能需要更多临床数据验证 | 揭示肺癌中EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性的多样性机制 | EGFR-TKI耐药的肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 23551 | 2024-08-08 |
Tumor cells generate astrocyte-like cells that contribute to SHH-driven medulloblastoma relapse
2021-09-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20202350
PMID:34254999
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研究论文 | 本文通过谱系追踪分析和单细胞RNA测序，证明了复发性髓母细胞瘤（MB）中的星形胶质细胞主要来源于肿瘤细胞的转分化，而非原发性MB。 | 首次揭示了髓母细胞瘤细胞通过转分化形成星形胶质细胞的机制，并发现骨形态发生蛋白（BMPs）通过诱导Sox9的磷酸化促进这一过程。 | NA | 研究髓母细胞瘤复发中星形胶质细胞的来源及其机制，探索预防和治疗髓母细胞瘤复发的新途径。 | 髓母细胞瘤及其复发中的星形胶质细胞。 | 数字病理学 | 儿童恶性脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 23552 | 2024-08-08 |
CD16+CD163+ monocytes traffic to sites of inflammation during necrotizing enterocolitis in premature infants
2021-09-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20200344
PMID:34269788
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研究论文 | 本研究利用悬浮和成像质谱流式细胞术结合单细胞RNA测序，揭示了早产儿坏死性小肠结肠炎（NEC）中的严重炎症反应，并鉴定了一种与NEC相关的新型炎症单核细胞/巨噬细胞亚型。 | 首次鉴定出与NEC相关的CD16+CD163+单核细胞/巨噬细胞亚型，并发现其在NEC黏膜中的特异性富集，可能作为NEC的潜在生物标志物和治疗靶点。 | NA | 研究早产儿坏死性小肠结肠炎中的炎症反应机制，并探索潜在的生物标志物和治疗靶点。 | 早产儿坏死性小肠结肠炎患者的黏膜炎症反应和单核细胞/巨噬细胞亚型。 | NA | 早产儿坏死性小肠结肠炎 | 悬浮和成像质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个NEC患者的黏膜样本 |
| 23553 | 2024-08-08 |
IDH Mutation Subgroup Status Associates with Intratumor Heterogeneity and the Tumor Microenvironment in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2021-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202101230
PMID:34250753
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研究论文 | 本研究通过外显子测序和批量RNA测序分析了14名肝内胆管癌患者的73个肿瘤区域，揭示了肝内胆管癌的多层面肿瘤内异质性（ITH）及其与IDH突变亚组状态和肿瘤微环境的关系 | 研究发现高ITH肿瘤与IDH突变亚组高度重叠，且IDH突变亚组显示出较低的T细胞浸润和T细胞毒性，表明其肿瘤微环境较冷 | NA | 探讨肝内胆管癌的肿瘤内异质性与IDH突变亚组状态及其对肿瘤微环境的影响 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 外显子测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 73个肿瘤区域, 17503个细胞, 来自14名患者 |
| 23554 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of CNS border compartment leukocytes reveals that B cells and their progenitors reside in non-diseased meninges
2021-09, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00880-y
PMID:34253922
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，揭示了中枢神经系统（CNS）边界组织中白细胞的特定位置组成和表达谱，特别是在硬脑膜中发现大量B细胞及其前体细胞。 | 首次详细描述了CNS边界组织中淋巴细胞的组成，特别是在硬脑膜中发现B细胞及其前体细胞，这些细胞在正常状态下具有慢周转和长期组织居留特性。 | NA | 研究CNS边界组织中白细胞的组成和功能，特别是B细胞及其前体细胞的分布和特性。 | 中枢神经系统边界组织中的白细胞，特别是B细胞及其前体细胞。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和大鼠的硬脑膜样本 |
| 23555 | 2024-08-08 |
Patterns of T-Cell Phenotypes in Rheumatic Diseases From Single-Cell Studies of Tissue
2021-Sep, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.11296
PMID:34255929
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综述 | 本文综述了从单细胞研究中获得的关于风湿性疾病中T细胞表型的关键观察结果 | 单细胞RNA测序分析揭示了T细胞状态的多个维度，并帮助揭示了炎症组织中的新效应子亚群 | 这些分析通常没有显示出典型的T细胞效应子亚群（如Th1、Th2和Th17细胞）的明显集群 | 进一步表征积累在目标组织中的T细胞群体，以更精确地靶向生物疗法并加速开发更具体的生物标志物 | 风湿性疾病中的T细胞 | NA | 风湿性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23556 | 2024-08-08 |
Forebrain Neural Precursor Cells Are Differentially Vulnerable to Zika Virus Infection
2021 Sep-Oct, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0108-21.2021
PMID:34272257
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研究论文 | 本研究使用了一种新型的小鼠模型，通过脑室内感染和细胞类型特异性电穿孔（IUE）来识别ZIKV感染的时间进程和在皮层神经发生期间最初感染或幸免的细胞身份 | 首次揭示了ZIKV在胎儿大脑中感染的时间和细胞细节，特别是发现一类优先表达假定ZIKV进入受体的aRGCs更易受感染 | NA | 探讨ZIKV感染对大脑前体细胞的影响及其机制 | 大脑前体细胞对ZIKV感染的脆弱性 | NA | 先天性Zika综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胚胎 |
| 23557 | 2024-08-08 |
Intrathecal activation of CD8+ memory T cells in IgG4-related disease of the brain parenchyma
2021-08-09, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.15252/emmm.202113953
PMID:34254741
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研究论文 | 通过单细胞测序分析脑脊液，揭示了IgG4相关疾病中T细胞的免疫病理生理机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示了IgG4相关疾病中脑脊液和脑实质病变的T细胞反应，并阐明了CD8 T效应记忆细胞通过MIF-CD74信号和CCL5介导的招募机制驱动自身免疫 | 研究样本仅为单一病例，可能限制了结果的普遍性和广泛应用 | 探索IgG4相关疾病的免疫病理生理机制，并寻找新的治疗靶点 | IgG4相关疾病的脑脊液和脑实质病变中的T细胞反应 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 单一病例 |
| 23558 | 2024-08-08 |
Systems vaccinology of the BNT162b2 mRNA vaccine in humans
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03791-x
PMID:34252919
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研究论文 | 本研究采用系统疫苗学方法，全面分析了56名健康志愿者接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗（BNT162b2）后的先天和适应性免疫反应 | 首次详细描述了mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫反应，并展示了加强接种后先天免疫反应的显著增强 | NA | 研究mRNA疫苗如何刺激人体免疫系统产生保护性免疫反应 | 56名健康志愿者接种BNT162b2 mRNA疫苗后的免疫反应 | 疫苗学 | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 免疫细胞和分子数据 | 56名健康志愿者 |
| 23559 | 2024-08-08 |
Innate-like self-reactive B cells infiltrate human renal allografts during transplant rejection
2021-07-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-24615-6
PMID:34272370
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了人肾移植中B细胞在移植排斥中的作用 | 首次揭示了人肾移植中B细胞具有类似先天细胞的转录状态，并能产生针对特定组织或炎症相关抗原的自反应抗体 | NA | 探讨人肾移植中B细胞在移植排斥中的作用机制 | 人肾移植中的B细胞及其在移植排斥中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23560 | 2024-08-08 |
YTHDF2 alleviates cardiac hypertrophy via regulating Myh7 mRNA decoy
2021-Jul-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-021-00649-7
PMID:34266473
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研究论文 | 本研究探讨了m6A阅读蛋白YTHDF2在心脏肥大中的潜在作用及其机制 | 首次揭示了YTHDF2通过m6A依赖的方式调节Myh7 mRNA来抑制心脏肥大的新机制 | NA | 研究YTHDF2在心脏肥大中的作用及其分子机制 | YTHDF2蛋白在心脏肥大中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 免疫沉淀, 质谱分析, 基因本体论分析, KEGG通路分析 | NA | mRNA, 蛋白质 | 使用横跨主动脉缩窄手术构建的心脏肥大小鼠模型, 以及通过异丙肾上腺素或苯肾上腺素刺激分离的心肌细胞 |