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当前共找到 37592 篇文献，本页显示第 2321 - 2340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2321 | 2026-02-20 |
Regnase-1-mediated regulation of neutrophils modulates SARS-CoV-2 pneumonia
2026-Feb, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013969
PMID:41662396
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研究论文 | 本研究揭示了Regnase-1通过调节中性粒细胞的干扰素反应影响SARS-CoV-2 MA10株感染抵抗力的机制 | 首次发现Regnase-1通过靶向Tsc22d3基因的3'UTR抑制干扰素反应负调控因子，从而调节中性粒细胞功能影响病毒性肺炎进程 | 研究使用小鼠适应毒株MA10而非原始人类毒株，且机制研究主要聚焦中性粒细胞，未全面评估其他免疫细胞的作用 | 探究Regnase-1在SARS-CoV-2感染免疫调控中的作用机制 | Regnase-1+/-基因修饰小鼠及其中性粒细胞 | 免疫学 | COVID-19肺炎 | 单细胞RNA测序 | 动物模型（小鼠） | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2322 | 2026-02-20 |
SpaLSTF: Diffusion-based generative model with BiLSTM and XCA-Transformer for spatial transcriptomics imputation
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013954
PMID:41666195
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaLSTF的新方法，利用条件扩散模型结合BiLSTM和XCA-Transformer，通过单细胞RNA测序数据增强空间转录组学数据的基因表达填补 | SpaLSTF采用条件扩散模型，结合BiLSTM网络捕获细胞状态间的上下文依赖，并设计XCA-Transformer机制高效计算基因表达间的注意力系数，以准确预测噪声 | 方法依赖于参考单细胞RNA测序数据，可能受数据质量和匹配度影响，且未明确讨论计算复杂度或处理大规模数据的效率 | 增强空间转录组学数据的基因表达填补，以克服稀疏基因检测和不完整表达覆盖的限制 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 条件扩散模型，BiLSTM，Transformer | 基因表达数据 | 十二个跨平台数据集，涵盖多种组织和器官 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2323 | 2026-02-20 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013956
PMID:41671295
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研究论文 | 本研究提出了一种基于广义估计方程（GEE）的统计方法，用于空间转录组学数据中的差异表达基因识别，并通过模拟和真实数据验证了其优于传统Wilcoxon秩和检验的性能 | 首次将广义估计方程（GEE）框架引入空间转录组学差异分析，通过考虑空间相关性解决了传统非参数方法假阳性率高的问题 | 研究主要基于模拟和有限癌症数据集验证，未在更广泛的组织类型或疾病中测试；方法实现依赖于R包，可能对非专业用户存在使用门槛 | 开发更稳健的统计方法以准确识别空间转录组学数据中的差异表达基因 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | 乳腺癌,前列腺癌 | 空间转录组学 | 广义估计方程（GEE）,Wilcoxon秩和检验,z检验 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2324 | 2026-02-20 |
CREB5 Inhibits Neuronal Ferroptosis via Transactivating ApoL6 to Regulate Lipid Droplet Metabolism After Spinal Cord Injury
2026-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70783
PMID:41700484
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子CREB5在脊髓损伤后通过调控ApoL6抑制神经元铁死亡的分子机制 | 首次揭示了CREB5通过增强ApoL6转录活性调控脂滴代谢，从而抑制神经元铁死亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类样本中验证，且具体信号通路细节有待进一步阐明 | 阐明脊髓损伤后抑制神经元铁死亡的分子和细胞机制 | 小鼠脊髓损伤模型和原代神经元 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2325 | 2026-02-20 |
Cytochrome P450 Cyp2s1 regulation of the intestinal metabolome and microbiome
2026-Feb, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.10.007
PMID:41120053
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研究论文 | 本研究揭示了细胞色素P450酶Cyp2s1在肠道稳态和炎症中的关键作用，发现其通过AhR信号通路调节肠道代谢组和微生物组 | 首次将Cyp2s1鉴定为AhR诱导基因，并阐明其通过调节代谢组和微生物组影响肠道炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人体中的直接功能验证尚需进一步研究 | 探究Cyp2s1在肠道稳态和炎症性肠病中的作用机制 | 小鼠结肠类器官、Caco-2细胞、IBD患者活检组织、Cyp2s1转基因和敲除小鼠 | NA | 炎症性肠病 | 非靶向代谢组学、微生物组测序、单细胞RNA测序、SCENITH检测 | NA | 代谢组数据、微生物组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种结肠炎小鼠模型和IBD患者活检组织 | NA | 单细胞RNA测序、宏基因组测序 | NA | NA |
| 2326 | 2026-02-20 |
The Effects of Hypertension on Signaling Dynamics in Rare Renal Cell Types
2026-Jan-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.23.701352
PMID:41659614
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压对小鼠肾脏中罕见细胞类型（淋巴管内皮细胞、髓系免疫细胞和支持细胞）信号动态的影响 | 首次在高血压模型中系统比较了肾脏罕见细胞类型间的基线信号传导差异，并发现了一种新型多能性支持细胞群体 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体样本中验证；信号网络分析为计算预测，需要实验验证 | 探究高血压对肾脏罕见细胞类型信号传导动态的影响机制 | 小鼠肾脏中的淋巴管内皮细胞、髓系免疫细胞和新发现的支持细胞 | 单细胞组学 | 高血压相关肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NicheNet信号网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但包含血管紧张素II诱导和盐敏感性两种高血压模型小鼠及其对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2327 | 2026-02-20 |
Single-cell transcriptomics uncover RNF130-mediated TNF-α pathway activation and worenine synergy with paclitaxel in breast cancer
2026-Jan-24, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-026-02057-5
PMID:41580768
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了RNF130在乳腺癌中通过激活TNF-α通路促进肿瘤进展，并发现中药成分沃瑞宁与紫杉醇具有协同抗肿瘤作用 | 首次系统性地揭示了E3泛素连接酶RNF130在TNBC中的具体功能和分子机制，特别是通过单细胞转录组学发现其在恶性上皮细胞群中的富集以及与肿瘤免疫逃逸表型的关联，并创新性地筛选了中药成分沃瑞宁作为RNF130的靶向抑制剂 | 研究主要基于数据库分析和体外/体内实验，缺乏大规模临床样本验证，且沃瑞宁的具体作用机制和安全性需进一步探索 | 探究RNF130在三阴性乳腺癌中的表达模式、预后意义、分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞、小鼠模型、TCGA和GEO数据库中的转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组数据分析、体外细胞实验、体内小鼠模型 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多个乳腺癌样本及其肝转移样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2328 | 2026-01-26 |
Single-cell sequencing analysis and machine learning model reveal aberrant TIM-3 expression in microglia during Alzheimer's disease progression
2026-Jan-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07621-w
PMID:41580850
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2329 | 2026-02-20 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Commensal Microbes Amplify Sex-Specific Immune Programming in the Murine Lung
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.22.700627
PMID:41648295
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了共生微生物如何放大小鼠肺部性别特异性免疫编程 | 首次探索了共生微生物在塑造性别特异性肺部免疫中的作用，并揭示了微生物暴露如何放大固有的免疫性别二态性 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果需在人类中进一步验证；未具体鉴定影响性别差异的关键微生物种类 | 探究共生微生物在塑造性别特异性肺部免疫中的作用机制 | 雄性及雌性小鼠的肺部免疫细胞 | 单细胞组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 雄性及雌性小鼠，分别在SPF（无特定病原体）和GF（无菌）条件下饲养 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2330 | 2026-02-20 |
zDUR: reference-free FASTQ compressor with high compression ratio and speed
2026-Jan-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06364-1
PMID:41578172
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为zDUR的无参考FASTQ压缩器，旨在高效处理来自不同平台和测序数据类型的新一代测序数据 | zDUR在压缩比和速度之间实现了良好的整体平衡，并在单细胞RNA-seq和空间转录组学数据集上表现出显著的运行时性能提升 | NA | 开发一种高效且可扩展的无参考FASTQ压缩器，以减轻存储和传输负担 | FASTQ数据，包括核苷酸序列、质量分数和读取标识符 | 机器学习 | NA | 高通量测序 | NA | FASTQ文件 | 15个代表性数据集，涵盖四种测序数据类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2331 | 2026-02-20 |
Integrative microRNA and transcriptome analysis reveals sex-specific molecular divergence in human bladder cancer
2026-Jan-23, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-026-00829-5
PMID:41578372
|
研究论文 | 本研究通过整合miRNA和转录组分析，揭示了人类膀胱癌中性别特异的分子差异及其调控机制 | 首次系统性地结合bulk mRNA/miRNA表达、生存模型和单细胞转录组分析，揭示了膀胱癌性别差异主要由常染色体基因的转录后调控驱动，而非性染色体剂量效应，并发现了与生存相关的性别特异性调控互作 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证所识别的调控机制；单细胞数据样本量相对有限 | 识别膀胱癌中性别特异的分子特征和调控互作，以阐明肿瘤生物学和临床结局性别差异的生物学机制 | 人类膀胱癌组织样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | bulk mRNA测序, microRNA测序, 单细胞RNA-seq | 差异表达分析, Kaplan-Meier生存分析, Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 生存数据 | 数据来源于TCGA、GEO和GSA数据库，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2332 | 2026-02-20 |
Senescence-induced endothelial-to-mesenchymal transition accelerates the subretinal fibrosis in neovascualr age-related macular degeneration
2026-Jan-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07707-z
PMID:41572339
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研究论文 | 本研究探讨了衰老诱导的内皮-间质转化在新生血管性年龄相关性黄斑变性中加速视网膜下纤维化的机制 | 首次通过单细胞RNA测序数据揭示了衰老脉络膜毛细血管内皮细胞在视网膜下纤维化中的作用，并验证了衰老与内皮-间质转化的关联 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未在人类患者中进行直接验证 | 研究衰老内皮细胞如何通过内皮-间质转化促进新生血管性年龄相关性黄斑变性中的视网膜下纤维化 | 脉络膜毛细血管内皮细胞、Brown-Norway大鼠、INK-ATTAC小鼠、C57BL/6J小鼠、人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 年轻（2-3个月）和老年（18个月）C57BL/6J小鼠，激光诱导纤维化模型的Brown-Norway大鼠和INK-ATTAC小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2333 | 2026-02-20 |
Identification of Lupus Immune Complex-Driven Pathogenic Pro-inflammatory Monocytes and Macrophages in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.21.700902
PMID:41648138
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了狼疮免疫复合物驱动促炎性单核细胞和巨噬细胞在系统性红斑狼疮中的异质性和功能 | 首次在单细胞水平上系统描述了狼疮免疫复合物刺激下促炎性单核细胞的转录组特征，并发现这些细胞在狼疮患者多个组织中的存在与扩增 | 研究主要基于体外刺激实验和已有数据集分析，需要进一步体内功能验证 | 探究系统性红斑狼疮中单核吞噬细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | 人类单核细胞、巨噬细胞、狼疮患者皮肤、肾脏和外周血样本 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 人类单核细胞体外培养样本及公开狼疮患者scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2334 | 2026-02-20 |
Single-Cell Mitochondrial Lineage Tracing Decodes Fate Decision and Spatial Clonal Architecture in Human Hematopoietic Organoids
2026-Jan-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518084
PMID:41560697
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研究论文 | 本研究开发了一种利用单细胞RNA测序中天然线粒体转录本突变作为内源性遗传条形码的方法，以追踪人类多能干细胞在早期胚胎发生中的造血谱系命运决策和空间克隆结构 | 首次将天然线粒体体细胞突变重新用作内源性遗传条形码，结合合成谱系追踪和空间转录组学，构建了多模态框架来解码人类胚胎类器官中的克隆动态和命运决策 | 方法依赖于线粒体转录本的突变检测，可能受测序深度和变异识别精度限制，且主要在人类干细胞衍生模型中进行验证 | 开发一种可扩展、非侵入性的多模态框架，以解析人类干细胞衍生模型中组织自组织的克隆动态和命运决策机制 | 人类多能干细胞（hPSCs）及其衍生的造血类器官 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 动态系统模型 | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2335 | 2026-02-20 |
Genetic and embryonic transcriptome analyses reveal the molecular and developmental basis of Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome
2026-Jan-20, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2025-110805
PMID:41233206
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研究论文 | 本研究通过基因和胚胎转录组分析揭示了Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的分子和发育基础 | 整合外显子测序/基因组测序与单细胞RNA测序数据，识别了新的候选基因并揭示了潜在的双基因遗传模式 | MRKHS的遗传病因仍不完全清楚，研究样本量有限 | 探究MRKHS的遗传病因和发育机制 | 727名MRKHS患者和2504名女性对照个体，以及人类和小鼠胚胎后肾组织 | 遗传学与发育生物学 | Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征 | 外显子测序，基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 727名MRKHS患者和2504名女性对照个体，以及人类和小鼠胚胎后肾组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2336 | 2026-02-20 |
Tissue-specific and sex-biased glycoproteomic landscape of Schistosoma mansoni
2026-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68400-9
PMID:41545360
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学，对曼氏血吸虫成虫进行N-和O-糖蛋白组学及完整糖肽分析，揭示了组织特异性和性别偏向的糖基化模式 | 首次建立了曼氏血吸虫的糖基化数据库，识别了未分类糖链和HexA修饰，并通过RNA干扰靶向四种糖基转移酶证明了糖基化对寄生虫生存的关键作用 | NA | 解析曼氏血吸虫的糖蛋白组学特征，以支持基于糖链和糖蛋白的血吸虫病控制策略开发 | 曼氏血吸虫成虫（雄性和雌性） | 糖蛋白组学 | 血吸虫病 | N-和O-糖蛋白组学分析、完整糖肽分析、单细胞转录组学、RNA干扰 | NA | 蛋白质组学数据、转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2337 | 2026-02-20 |
3D reconstruction of spatial transcriptomics with spatial pattern enhanced graph convolutional neural network
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag060
PMID:41686651
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Spa3D的新方法，利用抗泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络从多个2D空间转录组切片重建3D空间结构，以提升空间域识别、细胞通讯分析和发育轨迹建模的准确性 | 首次提出结合抗泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络进行3D空间转录组重建，克服了现有方法仅依赖2D坐标的局限，实现了在3D空间中的更精确分析 | 未明确提及方法在计算资源需求、处理大规模数据时的效率或对不同组织类型的适用性限制 | 开发一种能从2D空间转录组数据重建3D空间结构的方法，以更准确地分析空间域、空间可变基因、细胞间通讯和发育轨迹 | 空间转录组数据，特别是来自多个2D切片的数据 | 空间转录组学 | NA | 抗泄漏傅里叶变换，图卷积神经网络 | 图卷积神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2338 | 2026-02-20 |
SHEST: single-cell-level artificial intelligence from haematoxylin and eosin morphology for cell-type prediction and spatial transcriptomics reconstruction
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag037
PMID:41701097
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研究论文 | 本文提出了一种名为SHEST的多任务分析框架，利用H&E染色形态学图像预测细胞组成并重建单细胞分辨率的空间基因表达 | 开发了一个统一的可解释框架，通过四重瓦片输入捕获核与上下文信息，结合邻域感知聚类算法过滤模糊细胞信号，并采用多任务优化策略处理空间转录组数据的稀疏性 | NA | 整合组织形态学与空间分子图谱以全面理解癌症进展 | 人类肺腺癌组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 多任务深度学习框架（包含共享形态编码器与两个任务特定头：分类器与重建器） | H&E染色形态学图像，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2339 | 2026-02-20 |
Decoding Vascular Cell Diversity: Single-Cell Approaches to Mechanisms of Vascular Disease
2026-Jan-02, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326001
PMID:41481684
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术在血管细胞异质性研究中的应用，包括实验和计算方法，并探讨了这些方法如何揭示血管疾病的机制 | 应用单细胞或单核RNA测序技术识别罕见和疾病特异性细胞群体，结合CRISPR扰动与单细胞RNA测序数据，提供细胞类型特异性疾病机制的新见解 | NA | 概述单细胞分析技术及其在血管细胞和血管疾病研究中的应用 | 血管细胞和组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, CRISPR扰动, 染色质可及性分析 | NA | RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2340 | 2026-02-20 |
Computational identification of necroptosis-related hub genes and therapeutic targets in dilated cardiomyopathy via integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing public cohorts
2026-Jan-02, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046959
PMID:41496071
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序公共队列数据，计算识别了扩张型心肌病中与坏死性凋亡相关的枢纽基因及潜在治疗靶点 | 首次整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq公共数据，系统性识别了DCM中与坏死性凋亡相关的5个枢纽基因，并构建了诊断模型和预测了潜在治疗药物 | 研究完全基于公开数据集，缺乏实验验证；样本来源和数量受限于公共数据库 | 识别与扩张型心肌病相关的坏死性凋亡枢纽基因，并预测潜在治疗药物 | 扩张型心肌病患者的心脏组织样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO, 随机森林 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的公共队列数据集（GSE128095和GSE184899） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |