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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2321 | 2025-11-29 |
Childhood-onset lupus nephritis is characterized by complex interactions between kidney stroma and infiltrating immune cells
2024-11-27, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adl1666
PMID:39602512
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研究论文 | 通过空间转录组学技术构建儿童狼疮性肾炎肾脏组织的单细胞分辨率图谱,揭示肾脏基质细胞与浸润免疫细胞间的复杂相互作用 | 首次在单细胞分辨率下结合空间信息分析儿童狼疮性肾炎肾脏组织,发现了免疫细胞特异性定位模式和基因表达的空间依赖性 | 样本量较小(8例患者和4例对照),组织学评分与肾小球细胞转录特征相关性较弱 | 解析儿童狼疮性肾炎的免疫发病机制和分子异质性 | 儿童狼疮性肾炎患者和对照个体的肾脏组织 | 空间转录组学 | 狼疮性肾炎 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据,单细胞转录组数据 | 8例儿童狼疮性肾炎患者,4例对照个体 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2322 | 2025-11-29 |
Craters on the melanoma surface facilitate tumor-immune interactions and demonstrate pathologic response to checkpoint blockade in humans
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.18.613595
PMID:39345527
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼和人黑色素瘤模型发现表面凹陷结构促进肿瘤-免疫相互作用并预测免疫检查点阻断治疗反应 | 首次发现黑色素瘤表面凹陷结构是CD8 T细胞识别抗原和杀伤肿瘤的主要场所,并证明其预测免疫治疗反应的价值 | 研究主要基于斑马鱼模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索免疫治疗中促进免疫应答的肿瘤微环境结构域 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 长期活体成像、高分辨率空间转录组学、多重成像 | 斑马鱼肿瘤模型 | 图像、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2323 | 2025-11-29 |
Combinatorial Immunotherapy with Agonistic CD40 Activates Dendritic Cells to Express IL12 and Overcomes PD-1 Resistance
2023-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0699
PMID:37478171
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研究论文 | 本研究通过组合免疫疗法激活CD40使树突状细胞表达IL12,从而克服PD-1耐药性 | 发现CCL22+CCL5+ IL12分泌型树突状细胞亚群是三联疗法的关键早期效应因子,并证明新型IL12 mRNA疗法单独使用即可克服PD-1耐药 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据仅限于系统性细胞因子谱比较 | 探索克服抗PD-1耐药性的免疫治疗策略 | 小鼠黑色素瘤模型和人类患者样本 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,单细胞细胞因子分泌分析,微孔检测 | 小鼠黑色素瘤模型 | 单细胞RNA测序数据,细胞因子分泌数据 | 多数小鼠显示完全肿瘤消退 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞细胞因子分泌分析 | NA | 新型微孔检测法 |
| 2324 | 2025-11-29 |
Low TCR Binding Strength Results in Increased Progenitor-like CD8+ Tumor-Infiltrating Lymphocytes
2023-05-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0761
PMID:36787375
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研究论文 | 本研究探讨TCR结合强度对肿瘤微环境中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能分化的影响 | 首次在內源性多克隆T细胞反应中揭示TCR结合强度与祖细胞样表型分化的关联 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分 | 阐明TCR结合强度如何影响T细胞在肿瘤微环境中的功能分化 | 肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)和TCR转基因小鼠模型 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,MHC四聚体标记 | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2325 | 2025-11-29 |
Checkpoint Blockade-Induced Dermatitis and Colitis Are Dominated by Tissue-Resident Memory T Cells and Th1/Tc1 Cytokines
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0362
PMID:35977003
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研究论文 | 本研究通过多参数免疫荧光、空间转录组学和RNA原位杂交技术分析免疫检查点抑制剂引发的皮炎和结肠炎患者组织 | 首次揭示免疫检查点阻断相关不良反应主要由组织驻留记忆T细胞和Th1/Tc1细胞因子主导,而非传统认为的Th17通路 | 样本量有限,仅分析了皮炎和结肠炎两种不良反应类型 | 阐明免疫检查点抑制剂相关不良反应的免疫学机制 | 免疫检查点抑制剂治疗引发皮炎和结肠炎的患者组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤炎症和结肠炎 | 多参数免疫荧光、空间转录组学、RNA原位杂交 | NA | 组织图像、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2326 | 2025-11-28 |
Perfluorooctanoic acid disrupts splenic immunity and antiviral responses in the LCMV model: Insights from single-cell transcriptomics
2026-Jan-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.127367
PMID:41224070
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了全氟辛酸对脾脏免疫功能和抗病毒反应的破坏机制 | 首次在LCMV病毒感染模型中系统阐明PFOA通过细胞类型特异性机制导致免疫抑制 | 研究仅使用雌性C57BL/6J小鼠,样本量相对有限 | 探究全氟辛酸对免疫系统的影响及其在病毒感染中的细胞特异性机制 | 雌性C57BL/6J小鼠的脾脏免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 对照组5522个细胞 vs 高剂量组4741个细胞,共13个注释细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2327 | 2025-11-28 |
Unraveling Diabetes Mechanisms: A Computational scRNA-Seq Approach to Inflammation and Diabetes
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03398-7_50
PMID:41273592
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研究论文 | 本研究通过计算分析单细胞RNA测序数据探索营养、炎症与糖尿病之间的分子机制关系 | 采用单细胞RNA测序数据和先进计算方法揭示饮食条件如何影响免疫反应并促进糖尿病发展的分子通路 | NA | 探索炎症与糖尿病之间的分子机制,识别关键基因表达谱和分子通路 | 单细胞RNA测序数据集GSE161872中的基因表达数据 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2328 | 2025-11-28 |
Spatially resolved single-cell transcriptome analysis of murine Salmonella infection reveals the role of distal colonocytes in the inflammatory response
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2579909
PMID:41277366
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研究论文 | 通过整合多种转录组测序技术,揭示了小鼠沙门氏菌感染期间结肠的时空单细胞转录组景观,发现远端结肠细胞在炎症反应中的关键作用 | 首次结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间RNA-seq数据,系统描绘了肠道感染过程中的时空转录组动态,并鉴定出远端结肠细胞的关键响应作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证相对有限 | 阐明肠道对病原体感染的区室化反应的细胞和分子基础 | 小鼠结肠组织和人类肠道单细胞转录组数据 | 空间转录组学 | 肠道感染 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间RNA-seq | NA | 转录组数据 | 一周感染时间过程的小鼠结肠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2329 | 2025-11-28 |
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008
PMID:40339790
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠模型揭示了PRMT5在表皮发育中的关键作用,发现其缺失会导致基底角质形成细胞出现衰老样表型和表皮分层缺陷 | 首次在体内证明PRMT5通过抑制Cdkn1a(p21)防止基底角质形成细胞衰老,并鉴定出一群非典型的基底角质形成细胞样细胞群体 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类皮肤中验证;PRMT5的具体下游靶标和分子机制仍需进一步阐明 | 探究PRMT5在表皮发育和角质形成细胞维持中的作用机制 | 条件性敲除Prmt5的小鼠模型及其表皮组织 | 发育生物学 | 先天性皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 2330 | 2025-11-28 |
ENO1 promotes cancer metastasis via stimulating metabolism reprogramming in osteosarcoma
2025-Dec, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03182-3
PMID:40983627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示ENO1基因通过刺激代谢重编程促进骨肉瘤转移的机制 | 首次在单细胞水平揭示ENO1通过调控糖酵解促进骨肉瘤转移的作用机制 | 样本量较小(仅10例儿科骨肉瘤样本),需要更大样本验证 | 阐明骨肉瘤转移的潜在分子机制 | 儿科骨肉瘤患者组织样本 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 10例儿科骨肉瘤样本(分为原发无转移组、原发有转移组和转移灶组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2331 | 2025-11-28 |
Functional role of granulocytic myeloid-derived suppressor cells in CAR-T therapy: insights from single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2025-Dec, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2025.2585083
PMID:41198058
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者CAR-T治疗中粒细胞样髓源抑制细胞的功能作用 | 首次在CAR-T治疗背景下系统分析G-MDSCs的免疫抑制机制,发现PTGS1作为关键标志物并构建了高精度预后预测模型 | 样本量有限且患者间存在异质性,结果具有探索性,需要更大更多样化的队列验证 | 全面分析G-MDSCs在多发性骨髓瘤CAR-T治疗中的功能作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,体外功能实验 | 风险预测模型 | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,生存数据 | 7例多发性骨髓瘤患者(单细胞数据),713例多发性骨髓瘤患者(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2332 | 2025-11-28 |
Single cell RNA seq of the major cell types in the larva of the sea star, Patiria miniata
2025-Nov-27, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70100
PMID:41306072
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了海星Patiria miniata幼虫发育过程中的主要细胞类型及其基因表达轨迹 | 首次提供了海星幼虫发育的单细胞转录组图谱,发现原始生殖细胞与体腔囊细胞具有相似的基因表达谱,并揭示了外胚层上皮的高度异质性 | 研究主要聚焦于第3天幼虫,其他发育时间点的分析相对有限 | 研究海星发育过程中细胞类型分化和基因表达机制 | 海星Patiria miniata受精后1-4天的幼虫 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位RNA杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 海星幼虫发育1-4天的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2333 | 2025-11-28 |
The Dynamic UPR Rheostat Orchestrates Single-Cell Plasticity in Glioblastoma
2025-Nov-27, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02447-z
PMID:41307600
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析揭示了胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂的动态调控机制 | 首次在单细胞水平提出UPR变阻器概念,开发了臂特异性指标来量化三臂协调性,发现IRE1/ATF6紧密耦合而PERK相对独立的调控模式 | 研究基于转录组数据推断UPR臂协调性,需要扰动实验和蛋白水平验证 | 探究胶质母细胞瘤中UPR三臂在单细胞分辨率下是否作为分级控制系统运作 | 胶质母细胞瘤细胞 | 单细胞转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 随机效应模型,转录因子活性推断 | 单细胞转录组数据 | 发现队列871个细胞,验证队列11,877个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, SMART-seq | SMART-seq和10x Chromium单细胞测序平台 |
| 2334 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular and molecular changes in EGFR-positive lung adenocarcinoma before and after Furmonertinib treatment
2025-Nov-27, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01706-y
PMID:41307822
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示EGFR阳性肺腺癌在福莫替尼治疗前后的细胞和分子变化 | 首次在EGFR阳性肺腺癌中整合治疗前后配对样本的单细胞转录组数据,系统分析福莫替尼对肿瘤微环境的重塑作用 | 样本量有限,耐药机制仍需进一步验证 | 探究福莫替尼治疗EGFR阳性肺腺癌的细胞分子机制及肿瘤微环境变化 | EGFR阳性肺腺癌患者的肿瘤组织及癌旁组织 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | EGFR阳性肺腺癌患者治疗前后配对样本(数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2335 | 2025-11-28 |
Stem cell specification and niche formation in developing incisor requires actomyosin forces
2025-Nov-26, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf074
PMID:41296682
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序揭示了小鼠门牙发育过程中干细胞特化和生态位形成的时序关系 | 发现肌动球蛋白网络产生的收缩张力在限制Sox2+干细胞定位和维持其干性中的关键作用 | 研究仅限于小鼠门牙发育模型,未验证其他牙齿类型或物种 | 探究牙齿发育过程中干细胞特化与生态位形成的时序关系和机制 | 小鼠门牙发育过程中的上皮干细胞 | 发育生物学 | NA | 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | Sox2CreERT2/+; R26RmT/mG和Sox2CreERT2/+; R26RtdT/+胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2336 | 2025-11-28 |
DBP: Adaptive and Interpretable Factor Analysis for Single-cell RNA-seq Data with Deep Beta Processes
2025-Nov-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf117
PMID:41298306
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研究论文 | 提出一种基于深度Beta过程的单细胞RNA-seq数据自适应可解释因子分析方法 | 通过stick-breaking Beta过程实现因子数量的自适应选择,并采用对抗学习策略进行批次校正 | NA | 开发自适应且可解释的因子分析方法用于单细胞转录组数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度概率框架,Beta过程 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2337 | 2025-11-28 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses revealed the role of macrophage cholesterol metabolism in atherosclerosis
2025-Nov-26, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-025-02773-6
PMID:41299485
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk转录组分析揭示了巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,系统分析巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的异质性,并识别出三个关键特征基因 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证;样本来源和数量未详细说明 | 探究巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的调控机制,寻找诊断标志物和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者组织样本和巨噬细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习,细胞实验 | 逻辑回归,共识聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2338 | 2025-11-28 |
Differential expression of viral entry protein neuropilin 1 (NRP1) and neuropilin 2 (NRP2) in fatal COVID-19
2025-Nov-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01384-25
PMID:41159753
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研究论文 | 本研究分析了致命性COVID-19病例中病毒进入蛋白神经纤毛蛋白1和2的表达差异及其与SARS-CoV-2刺突蛋白的结合特性 | 首次系统比较NRP1和NRP2在致命COVID-19组织中的表达分布,并发现它们与SARS-CoV-2刺突蛋白片段具有不同的结合特性 | 样本量有限(n=20),且仅针对致命病例,可能无法代表轻中度COVID-19的情况 | 探究神经纤毛蛋白作为SARS-CoV-2辅助受体在COVID-19发病机制中的作用 | 致命COVID-19患者的尸检组织(心脏、肺和血液淋巴器官) | 病理学 | COVID-19 | 免疫组织化学,单细胞RNA测序,空间多重免疫荧光,免疫荧光显微镜 | NA | 组织图像,基因表达数据 | 20例尸检组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | CODEX | 空间多重免疫荧光表型分析 |
| 2339 | 2025-11-28 |
Single-cell RNA sequencing highlights the role of epithelial-immune dual features of proximal tubule cells in BK polyomavirus nephropathy
2025-Nov-25, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01394-25
PMID:41055342
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究BK多瘤病毒肾病微环境,发现具有上皮-免疫双重特征的近端肾小管细胞新亚群 | 首次发现IGKC+ PT细胞亚群具有上皮-免疫双重特征,可能通过T细胞耗竭机制促进BKPyVN进展 | NA | 研究BK多瘤病毒肾病的微环境特征,探索新的治疗和诊断方法 | BK多瘤病毒肾病样本和稳定移植肾样本 | 单细胞测序 | 肾病 | 单细胞RNA测序,共免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据,尿液样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2340 | 2025-11-28 |
Rheumatoid arthritis synovial fibroblasts modulate T cell activation
2025-Nov-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193054
PMID:41055954
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研究论文 | 本研究揭示了类风湿关节炎滑膜成纤维细胞通过IDO1介导的色氨酸消耗调控T细胞活化的新机制 | 首次发现滑膜成纤维细胞通过IDO1介导的色氨酸消耗诱导T细胞低反应性,并证实其在滑膜微环境中的主导免疫调节作用 | 未明确说明研究样本的具体数量及实验设计的局限性 | 探究类风湿关节炎滑膜成纤维细胞对T细胞活化的调节机制 | 类风湿关节炎患者的滑膜成纤维细胞和T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |