单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 23361 - 23380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23361 | 2024-08-08 |
Metformin, Macrophage Dysfunction and Atherosclerosis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.682853
PMID:34163481
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研究论文 | 本文探讨了二甲双胍对巨噬细胞功能及动脉粥样硬化的影响 | 文章总结了二甲双胍通过多种机制调节巨噬细胞功能，并讨论了未来的研究方向，如单细胞RNA测序、中性粒细胞外陷阱、表观遗传修饰及基于二甲双胍的联合药物 | NA | 探讨二甲双胍如何通过改善巨噬细胞功能来扩展其多效性药理作用 | 二甲双胍对巨噬细胞功能的影响及其在动脉粥样硬化等疾病中的作用 | NA | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 23362 | 2024-08-08 |
Single-Cell TCR and Transcriptome Analysis: An Indispensable Tool for Studying T-Cell Biology and Cancer Immunotherapy
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.689091
PMID:34163487
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review | 本文综述了单细胞技术在T细胞研究中的应用，包括T细胞受体（TCR）和转录组分析，并讨论了其在T细胞介导的癌症免疫治疗中的重要性。 | 单细胞技术不仅验证了传统方法的观察结果，还为新发现铺平了道路，如先前未被识别的潜在影响自身免疫或癌症患者临床结果的T细胞亚群。 | NA | 探讨单细胞技术在T细胞生物学和癌症免疫治疗研究中的应用。 | T细胞及其在免疫反应、自身免疫、传染病和癌症免疫治疗中的作用。 | digital pathology | cancer | single-cell sequencing | NA | single-cell data | NA |
| 23363 | 2024-08-08 |
Cyclophosphamide Exposure Causes Long-Term Detrimental Effect of Oocytes Developmental Competence Through Affecting the Epigenetic Modification and Maternal Factors' Transcription During Oocyte Growth
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.682060
PMID:34164401
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研究论文 | 研究环磷酰胺暴露对卵母细胞发育能力长期负面影响及其通过影响表观遗传修饰和母源因子转录的作用机制 | 首次揭示了环磷酰胺治疗后卵母细胞质量下降的分子机制，并提出了通过LPA促进YAP1核定位来改善环磷酰胺修复胚胎发育能力的新策略 | 研究主要基于小鼠模型，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨环磷酰胺暴露对卵母细胞发育能力的长期影响及其分子机制 | 环磷酰胺治疗后的小鼠卵母细胞及其胚胎发育能力 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠接受单次环磷酰胺治疗（100 mg/kg）后47天的卵母细胞样本 |
| 23364 | 2024-08-08 |
Identification of Liver Cancer Stem Cell Stemness Markers Using a Comparative Analysis of Public Data Sets
2021, Stem cells and cloning : advances and applications
DOI:10.2147/SCCAA.S307043
PMID:34168465
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研究论文 | 本研究通过对比分析公共数据集中的单细胞转录组数据，识别肝癌干细胞的干性标志物 | 本研究利用公开的肝癌和肝祖细胞类型的单细胞RNA测序数据，通过EdgeR差异表达分析，发现了一些干性标志物在癌症干细胞中的显著上调表达 | NA | 旨在通过对比重分析单细胞转录组数据，深入了解癌症干细胞的特性及其在肿瘤发生中的作用 | 肝癌干细胞及其干性标志物 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了公开的肝癌和肝祖细胞类型的单细胞RNA测序数据 |
| 23365 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-seq Identification of the Cellular Molecular Characteristics of Sporadic Bilateral Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.659251
PMID:34168986
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了散发性双侧透明细胞肾细胞癌的细胞分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了双侧透明细胞肾细胞癌在单细胞转录组水平的转录组特征 | NA | 研究散发性双侧肾细胞癌的细胞分子特征，为临床治疗提供指导 | 散发性双侧透明细胞肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从左、右肿瘤组织分别捕获了3,575和3,568个高质量的单细胞转录组数据 |
| 23366 | 2024-08-08 |
High PYGL Expression Predicts Poor Prognosis in Human Gliomas
2021, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2021.652931
PMID:34177761
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析基因转录组和单细胞测序数据，探讨了高PYGL表达在胶质瘤患者中的预测价值 | 首次通过单细胞测序数据分析了PYGL在不同细胞群中的高表达，并揭示了其潜在的预测机制 | NA | 研究高PYGL表达在胶质瘤患者中的预测价值及其潜在机制 | 胶质瘤患者的PYGL表达水平及其对预后的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 595名胶质瘤患者和7,930个GBM细胞 |
| 23367 | 2024-08-08 |
Computational analysis of alternative polyadenylation from standard RNA-seq and single-cell RNA-seq data
2021, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2021.03.015
PMID:34183123
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研究论文 | 本文总结了分析标准RNA-seq和单细胞RNA-seq数据中可变多聚腺苷酸化（APA）的计算方法，并详细描述了两种先进的生物信息学算法DaPars和scDaPars | 介绍了DaPars和scDaPars两种先进的生物信息学算法，用于分析APA | NA | 总结和描述分析APA的计算方法 | 标准RNA-seq和单细胞RNA-seq数据中的APA | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 23368 | 2024-08-08 |
Identification of Monocytes Associated with Severe COVID-19 in the PBMCs of Severely Infected Patients Through Single-Cell Transcriptome Sequencing
2022-Oct, Engineering (Beijing, China)
DOI:10.1016/j.eng.2021.05.009
PMID:34150352
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了严重COVID-19患者外周血样本中的单核细胞特征 | 发现了两种与严重COVID-19相关的新型单核细胞亚群：Mono 0和Mono 5，这些亚群表现出促纤维化和促炎症特征 | 样本量相对较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探究严重COVID-19中单核细胞的免疫学特征及其与疾病机制的关系 | 严重COVID-19患者的单核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 6名健康对照和14名COVID-19患者样本 |
| 23369 | 2024-08-08 |
Cancer stem cells in TNBC
2022-07, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2021.06.015
PMID:34147641
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综述 | 本文综述了三阴性乳腺癌（TNBC）中癌症干细胞（CSCs）的作用及其在治疗中的潜在意义 | 利用单细胞分析技术，如单细胞RNA测序（scRNA-seq）和蛋白质组学，来揭示患者水平肿瘤内异质性，识别CSCs群体和CSC生物标志物 | TNBC在细胞系组成和分子特性上高度异质性，缺乏有效的治疗靶点 | 探讨CSCs在驱动TNBC发生中的作用及通过操纵分子信号对抗这一罕见细胞群体以控制这种致命疾病的疗法 | 三阴性乳腺癌中的癌症干细胞及其在肿瘤生长和转移中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 23370 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the M2 Macrophages and Exhausted T Cells and Intratumoral Heterogeneity in Triple-Negative Breast Cancer
2022, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了三阴性乳腺癌中的M2巨噬细胞和耗竭T细胞以及肿瘤内异质性 | 发现了在三阴性乳腺癌患者中极化的M2巨噬细胞和耗竭的CD8+ T细胞，并识别出潜在的免疫治疗靶点 | NA | 分析肿瘤微环境中的T细胞和巨噬细胞，以识别具有治疗潜力的靶点 | 三阴性乳腺癌患者的单细胞序列数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 来自GSE118389数据集的三阴性乳腺癌患者样本 |
| 23371 | 2024-08-08 |
Bayesian modeling of spatial molecular profiling data via Gaussian process
2021-11-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab455
PMID:34146105
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研究论文 | 本文提出了一种新的贝叶斯分层模型，用于分析空间转录组数据，通过高斯过程建模零膨胀和过度分散的计数数据 | 模型采用零膨胀负二项模型，提高了模型的稳定性和鲁棒性，并利用贝叶斯推理框架在参数估计中借力 | NA | 开发有效的计算方法来识别具有空间模式的基因 | 空间分子 profiling 数据 | 生物信息学 | NA | 空间分子 profiling 技术 | 贝叶斯分层模型 | 转录组数据 | NA |
| 23372 | 2024-08-08 |
REBET: a method to determine the number of cell clusters based on batch effect removal
2021-11-05, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab204
PMID:34131702
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研究论文 | 本文提出了一种基于批次效应去除确定细胞聚类数量的新方法REBET | REBET方法通过去除批次效应来准确确定细胞聚类的数量，并在模拟和真实数据集上表现出优于现有方法的性能 | NA | 开发一种新的方法来准确确定单细胞RNA测序数据中的细胞聚类数量 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类数量 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 32个模拟数据集和14个已发表的单细胞RNA测序数据集 |
| 23373 | 2024-08-08 |
Tumor cells in light-chain amyloidosis and myeloma show distinct transcriptional rewiring of normal plasma cell development
2021-10-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009754
PMID:34133718
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序，定义了正常浆细胞发育的转录图谱，并比较了AL、MM和MGUS中肿瘤浆细胞的转录程序 | 首次研究了AL和MM患者中肿瘤浆细胞的分化阶段，并提供了理解正常浆细胞发育和AL及其他单克隆免疫球蛋白病的转录重组的新资源 | NA | 旨在定义正常浆细胞发育的转录图谱，并比较AL、MM和MGUS中肿瘤浆细胞的转录程序 | AL、MM和MGUS中的肿瘤浆细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及AL、MM和MGUS患者的肿瘤浆细胞 |
| 23374 | 2024-08-08 |
Transcriptomic landscape of circulating mononuclear phagocytes in Langerhans cell histiocytosis at the single-cell level
2021-10-07, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009064
PMID:34132762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了朗格汉斯细胞组织细胞增生症（LCH）患者循环单核吞噬细胞的转录组图谱 | 首次在单细胞水平上揭示了LCH患者循环单核吞噬细胞系统中RAS-MAPK-ERK信号通路相关基因和转录因子的表达变化 | 研究样本仅限于217名儿科LCH患者，可能限制了结果的普遍性 | 深入理解LCH的分子生物学机制，为临床诊断和治疗提供新见解 | LCH患者的循环单核吞噬细胞 | 数字病理学 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 217名儿科LCH患者 |
| 23375 | 2024-08-08 |
The Prognostic Potential of Human Prostate Cancer-Associated Macrophage Subtypes as Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2021-10, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-20-0740
PMID:34131070
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，研究了人前列腺癌组织中巨噬细胞的亚型及其与疾病进展的关系 | 首次在人前列腺癌组织中识别出三种不同的巨噬细胞亚型，并发现这些亚型与患者的无复发和无转移生存期高度相关 | 研究仅限于前列腺癌组织中的巨噬细胞，未涉及其他细胞类型或整个肿瘤微环境 | 探讨前列腺癌组织中巨噬细胞亚型与疾病进展的关系，并开发用于患者预后评估的基因分类器 | 人前列腺癌组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 来自前列腺切除术样本的巨噬细胞 |
| 23376 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to elucidate intercellular tissue dynamics
2021-10, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-021-00370-8
PMID:34145435
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综述 | 本文综述了将单细胞RNA测序（scRNA-seq）与空间转录组学技术相结合的研究进展，旨在阐明组织内细胞间的动态关系 | 介绍了新兴的计算方法和现有技术的有效结合方式 | 目前尚无方法能像scRNA-seq那样全面地覆盖转录组 | 探讨如何整合单细胞和空间数据以更好地理解细胞间的相互作用 | 单细胞RNA测序和空间转录组学技术 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高复用RNA成像、空间条码技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 23377 | 2024-08-08 |
Interferon-Gamma-Producing CD8+ Tissue Resident Memory T Cells Are a Targetable Hallmark of Immune Checkpoint Inhibitor-Colitis
2021-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.06.025
PMID:34147519
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研究论文 | 本文研究了免疫检查点抑制剂相关结肠炎的发病机制，并发现CD8+组织驻留记忆T细胞是该疾病的关键驱动因素 | 首次证明CD8+组织驻留记忆T细胞在免疫检查点抑制剂相关结肠炎中的病理作用，并提出其作为新的治疗靶点 | NA | 识别免疫检查点抑制剂相关结肠炎的关键细胞驱动因素及其与特发性溃疡性结肠炎的相似性，并确定潜在的新治疗靶点 | 免疫检查点抑制剂相关结肠炎患者、接受免疫检查点抑制剂治疗但未发展为结肠炎的患者、特发性溃疡性结肠炎患者及健康对照 | 免疫学 | 结肠炎 | 多参数和光谱流式细胞术、光谱免疫荧光显微镜、靶向基因组、批量和单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括免疫检查点抑制剂相关结肠炎患者、未发展为结肠炎的患者、特发性溃疡性结肠炎患者及健康对照的多个样本 |
| 23378 | 2024-08-08 |
Cell type hierarchy reconstruction via reconciliation of multi-resolution cluster tree
2021-09-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab481
PMID:34125905
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Multi-resolution Reconciled Tree (MRtree)的树构建算法，用于从不同分辨率的平面聚类结果中生成细胞类型层次结构 | MRtree算法能够结合大多数scRNA-seq聚类算法，继承平面聚类的鲁棒性和多功能性，同时保持细胞的层次结构 | NA | 克服单一分辨率聚类结果难以比较和描述细胞集群演化的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型层次结构 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集，包括胎儿脑细胞 |
| 23379 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics and proteomics technologies for deconvoluting the tumor microenvironment
2021-Sep, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.202100041
PMID:34125481
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综述 | 本文综述了用于解析肿瘤微环境的空间转录组学和蛋白质组学技术 | 介绍了多种新兴的空间分辨高复用分子分析技术，如10X Visium、GeoMx DSP等，这些技术能够在保持空间信息的同时进行高复用蛋白质和RNA分析 | NA | 探讨如何利用新兴的空间技术深入理解肿瘤微环境 | 肿瘤微环境及其在肿瘤发生、转移和药物抗性中的作用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和蛋白质组学技术 | NA | 蛋白质和RNA数据 | NA |
| 23380 | 2024-08-08 |
Negative electroretinograms: genetic and acquired causes, diagnostic approaches and physiological insights
2021-09, Eye (London, England)
DOI:10.1038/s41433-021-01604-z
PMID:34127841
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综述 | 本文综述了负向视网膜电图（ERG）的遗传和获得性原因、诊断方法及生理学见解 | NA | NA | 探讨负向视网膜电图的生理基础、流行病学、成因及临床处理 | 负向视网膜电图及其在遗传和获得性疾病中的表现 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |