单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28126 篇文献，本页显示第 23241 - 23260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23241 | 2024-08-08 |
NRG1/ErbB signalling controls the dialogue between macrophages and neural crest-derived cells during zebrafish fin regeneration
2021-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26422-5
PMID:34732706
|
研究论文 | 本文通过结合三重转基因斑马鱼胚胎的活体成像和单细胞RNA测序，详细绘制了斑马鱼幼体再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了NRG1/ErbB信号通路在调控巨噬细胞与神经嵴来源细胞间对话中的关键作用 | 本文首次详细绘制了斑马鱼再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了foxd3阳性神经嵴来源细胞在再生过程中的作用及NRG1/ErbB信号通路的关键调控作用 | NA | 研究斑马鱼尾鳍再生过程中细胞多样性及特定细胞群的作用 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的细胞类型及其相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞图谱 | 三重转基因斑马鱼胚胎 |
| 23242 | 2024-08-08 |
Dissecting mammalian spermatogenesis using spatial transcriptomics
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109915
PMID:34731600
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研究论文 | 使用空间转录组学技术Slide-seq，生成小鼠和人睾丸的空间基因表达图谱，揭示了精子发生过程中的细胞类型定位和基因表达模式 | 首次利用Slide-seq技术在近单细胞分辨率下捕捉小鼠和人睾丸的空间基因表达模式，并开发了一种计算框架来精确地定位睾丸细胞类型 | NA | 揭示哺乳动物精子发生过程中的空间基因表达模式及其在糖尿病诱导的男性不育中的潜在机制 | 小鼠和人的睾丸组织 | 空间转录组学 | 糖尿病 | Slide-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人的睾丸组织样本 |
| 23243 | 2024-08-08 |
Patch-seq of mouse DRG neurons reveals candidate genes for specific mechanosensory functions
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109914
PMID:34731626
|
研究论文 | 本文通过结合机械敏感电流记录和单细胞RNA测序，研究了小鼠DRG神经元的机械感觉功能相关候选基因 | 本文首次将机械敏感电流记录与单细胞转录组测序相结合，实现了机械电特性与转录组定义的神经元群体之间的一一对应 | 本文的敲降实验排除了Tmem120a和Tmem150c作为感觉神经元中机械敏感电流的介导因子，但未进一步验证其他候选基因 | 揭示特定机械感觉功能的分子机制 | 小鼠DRG神经元的机械感觉功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种机械感觉神经元亚型 |
| 23244 | 2024-08-08 |
Pancreatic beta cell neogenesis: Debates and updates
2021-11-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.10.007
PMID:34731654
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研究论文 | 本文探讨了成年胰腺中胰岛素产生β细胞的内源性再生来源 | Gribben等人（2021）通过谱系追踪和单细胞RNA测序方法，报告了Ngn3表达的导管细胞可以作为成年胰腺中新β细胞的前体 | NA | 寻找成年胰腺中胰岛素产生β细胞的内源性可再生来源 | 成年胰腺中的β细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 23245 | 2024-08-08 |
Integrative analysis methods for spatial transcriptomics
2021-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01272-7
PMID:34711969
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23246 | 2024-08-08 |
Skin inflammation activates intestinal stromal fibroblasts and promotes colitis
2021-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI147614
PMID:34720087
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了人类和小鼠的炎症性肠病（IBD）中的成纤维细胞，揭示了肠道炎症促进部分肠道基质成纤维细胞分化为具有先天抗菌宿主防御活性的前脂肪细胞，并且这一过程在皮肤炎症时加剧 | 首次揭示了皮肤炎症通过激活肠道基质成纤维细胞和改变粪便微生物组，促进过度的反应性脂肪生成和增加结肠炎症，这一发现为皮肤炎症与IBD之间的关联提供了新的机制解释 | NA | 探索皮肤炎症与炎症性肠病之间的关联机制 | 人类和小鼠的成纤维细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的成纤维细胞样本 |
| 23247 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis revealed that IL4I1 promoted ovarian cancer progression
2021-10-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-021-03123-7
PMID:34717685
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了IL4I1在卵巢癌进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析，构建了包含10个预后特异性基因的风险评分模型，并验证了IL4I1在卵巢癌进展中的重要作用 | NA | 探讨卵巢癌的遗传异质性及其对预后的影响 | 卵巢癌及其相关基因IL4I1 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归算法 | RNA测序数据 | 2397个恶性上皮基因，2个验证队列 |
| 23248 | 2024-08-08 |
A preliminary study of KAT2A on cGAS-related immunity in inflammation amplification of systemic lupus erythematosus
2021-10-30, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04323-1
PMID:34718330
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研究论文 | 本研究探讨了KAT2A在系统性红斑狼疮（SLE）炎症放大中与cGAS相关免疫的作用 | 首次探索了KAT2A在SLE中的作用及其与cGAS通路的关系，并揭示了KAT2A调控cGAS的机制 | NA | 研究KAT2A在SLE炎症放大中的作用及其与cGAS相关免疫的模式 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | RNA测序、单细胞RNA测序、RT-PCR、Western blot、免疫荧光、免疫组织化学、ELISA、质谱 | NA | RNA、蛋白质 | 涉及SLE患者的外周血单个核细胞 |
| 23249 | 2024-08-08 |
Ectopic expression of Irx3 and Irx5 in the paraventricular nucleus of the hypothalamus contributes to defects in Sim1 haploinsufficiency
2021-Oct-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh4503
PMID:34705510
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了下丘脑室旁核（PVH）神经元的分子特征，并探讨了Irx3和Irx5基因异位表达在Sim1单倍体不足中的作用。 | 首次揭示了Irx3和Irx5基因在PVH神经元中的异位表达对Sim1单倍体不足引起的缺陷的贡献。 | NA | 研究Sim1单倍体不足引起的PVH神经元功能障碍的分子机制。 | 下丘脑室旁核神经元及其在能量稳态调控中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23250 | 2024-08-08 |
Over 1000 tools reveal trends in the single-cell RNA-seq analysis landscape
2021-10-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02519-4
PMID:34715899
|
研究论文 | 本文更新了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析工具数据库的状态，并展示了该领域的演变趋势 | 本文首次记录了超过1000种scRNA-seq分析工具，并分析了该领域的演变和焦点变化 | NA | 研究scRNA-seq分析工具的发展趋势和领域焦点变化 | scRNA-seq分析工具及其在科学实践中的应用 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | 超过1000种工具 |
| 23251 | 2024-08-08 |
BAMboozle removes genetic variation from human sequence data for open data sharing
2021-10-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26152-8
PMID:34711808
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研究论文 | 开发了一种名为BAMboozle的工具，用于从人类序列数据中移除敏感的遗传信息，以促进生命科学领域的开放数据共享 | BAMboozle工具能够有效地移除样本中的遗传序列变异，同时保留原始序列数据的其他重要方面，如基因表达特征和剪接动力学信息 | NA | 旨在解决人类遗传数据在开放共享时可能带来的重新识别风险问题 | 人类序列数据中的遗传变异信息 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 23252 | 2024-08-08 |
Characterization of hormone-producing cell types in the teleost pituitary gland using single-cell RNA-seq
2021-10-28, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-021-01058-8
PMID:34711832
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对硬骨鱼脑下垂体的激素产生细胞类型进行了特征描述 | 首次通过单细胞测序技术详细定义了雌性和雄性硬骨鱼脑下垂体中的15和16种不同细胞类型 | NA | 揭示硬骨鱼脑下垂体中激素产生细胞类型的特征及其调控机制 | 硬骨鱼脑下垂体的激素产生细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2592个雌性样本和3804个雄性样本 |
| 23253 | 2024-08-08 |
Smoking Modulates Different Secretory Subpopulations Expressing SARS-CoV-2 Entry Genes in the Nasal and Bronchial Airways
2021-Oct-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-887718/v1
PMID:34729557
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研究论文 | 研究探讨了吸烟对鼻腔和支气管通道中表达SARS-CoV-2进入基因的分泌亚群的影响 | 首次全面分析了鼻腔和支气管样本中SARS-CoV-2进入基因（ACE2、TMPRSS2和CTSL）表达的相似性和差异性 | 研究仅基于肺部筛查或诊断工作中的个体样本，可能存在样本选择偏倚 | 探究吸烟如何影响鼻腔和支气管通道中SARS-CoV-2进入基因的表达 | 鼻腔和支气管通道中的SARS-CoV-2进入基因表达 | 数字病理学 | 肺部疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 793个鼻腔样本和1,673个支气管样本 |
| 23254 | 2024-08-08 |
Myeloid cells in COVID-19 microenvironment
2021-10-27, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00792-0
PMID:34707085
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综述 | 本文综述了COVID-19患者外周血、肺组织和脑脊液的单细胞测序结果，并描述了患者中髓系细胞的分化轨迹及其异常分化促进疾病进展的功能和机制 | NA | NA | 探讨髓系细胞在COVID-19微环境中的作用及其在疾病进展中的机制 | COVID-19患者的髓系细胞及其在疾病中的作用 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 外周血、肺组织和脑脊液的单细胞数据 | NA |
| 23255 | 2024-08-08 |
Structural and compositional diversity in the kainate receptor family
2021-10-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109891
PMID:34706237
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研究论文 | 本文研究了kainate受体家族的结构和组成多样性 | 首次解析了GluK1同聚体的结构，并利用单细胞RNA测序数据和单分子荧光技术研究了KAR亚单位的组合多样性和受体复合物的组成 | NA | 探讨kainate受体家族的亚单位组合和结构多样性 | kainate受体家族的亚单位及其组合 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单分子荧光技术 | NA | RNA序列，荧光图像 | NA |
| 23256 | 2024-08-08 |
[A review on integration methods for single-cell data]
2021-Oct-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi
DOI:10.7507/1001-5515.202104073
PMID:34713670
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综述 | 本文综述了单细胞数据整合的基本原理、方法及其应用 | 探讨了现有方法的优缺点，并对未来的发展进行了展望 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序实验中无法全面捕捉所有细胞和基因信息的问题 | 单细胞RNA测序数据和多模态单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 23257 | 2024-08-08 |
Integrating single cell sequencing with a spatial quantitative systems pharmacology model spQSP for personalized prediction of triple-negative breast cancer immunotherapy response
2021-Oct, Immunoinformatics (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.immuno.2021.100002
PMID:34708216
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研究论文 | 本文通过整合三阴性乳腺癌患者的全外显子测序和单细胞RNA测序数据，构建空间定量系统药理学模型（spQSP），用于个性化预测免疫治疗反应 | 首次将单细胞测序数据与空间定量系统药理学模型结合，用于预测个体化免疫治疗效果 | NA | 开发一种新的方法来预测三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 定量系统药理学模型 | 基因组数据 | NA |
| 23258 | 2024-08-08 |
Identification of Key eRNAs for Spinal Cord Injury by Integrated Multinomial Bioinformatics Analysis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.728242
PMID:34708039
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研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析，探讨了脊髓损伤（SCI）中关键增强子RNA（eRNAs）、转录因子（TFs）、信号通路和小分子抑制剂的作用。 | 构建了13个差异表达转录因子、6个差异表达增强子RNA、7个差异表达目标基因的调控网络，并发现了与SCI相关的潜在药物Trichostatin A。 | NA | 研究脊髓损伤中关键增强子RNA的作用及其调控机制。 | 脊髓损伤中的关键增强子RNA、转录因子、信号通路和小分子抑制剂。 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 微阵列数据分析、CIBERSORT算法、基因集变异分析（GSVA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、转座酶可及染色质测序（ATAC-seq） | NA | 微阵列数据、scRNA-seq数据、ChIP-seq数据、ATAC-seq数据 | 27名健康志愿者和25名慢性期脊髓损伤患者的周围血单核细胞（PBMC）样本 |
| 23259 | 2024-08-08 |
Blood Immune Cell Composition Associated with Obesity and Drug Repositioning Revealed by Epigenetic and Transcriptomic Conjoint Analysis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.714643
PMID:34712134
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研究论文 | 本研究通过表观遗传学和转录组联合分析，探讨了肥胖相关的血液免疫细胞组成，并识别了用于肥胖管理的新型潜在药物。 | 本研究首次通过表观遗传学和转录组联合分析，揭示了肥胖患者中CD8+ T细胞和NK细胞的显著降低，并发现了11种具有肥胖控制潜力的药物。 | 研究样本量较小，仅包括35个肥胖样本和37个对照样本，可能影响结果的普遍性。 | 分析肥胖中的免疫细胞组成，并识别新型有效药物用于肥胖管理。 | 肥胖患者和健康对照的血液免疫细胞组成及药物靶点表达。 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化分析，mRNA表达微阵列，单细胞RNA测序，qPCR | NA | DNA甲基化数据，mRNA表达数据 | 72个样本（35个肥胖样本和37个对照样本） |
| 23260 | 2024-08-08 |
TNFSF13 Is a Novel Onco-Inflammatory Marker and Correlates With Immune Infiltration in Gliomas
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.713757
PMID:34712225
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了TNFSF13（APRIL）在胶质瘤中的表达及其与患者预后和靶向治疗的关系 | 首次证实TNFSF13与胶质瘤中的免疫浸润和炎症反应相关，并可能作为新的诊断标志物和免疫治疗靶点 | NA | 探索TNFSF13作为胶质瘤的新诊断标志物和治疗靶点的潜力 | TNFSF13在胶质瘤中的表达及其与免疫浸润和炎症反应的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |